SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000160_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein K (SelK)
SpeciesAiluropoda melanoleuca (Panda)
Transcript IDSPT00000160
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000063_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000160_2.0 # Transcript # Selenoprotein K (SelK) # Panda (Ailuropoda melanoleuca) # Full length # Forward
ATGGTTTACATCTCGAACGGTGAGTTGCCGTGTCGTCGGGGGCGGCCGCTGGCCTGGGAG
GCCGGACCTGGGTTTCTTCCATCCTCTCCCGCCGGCTCTGCGCGGCTTTCGCGTAGTCGG
TCGGTCCTGCGCCGCGTCAGCCGAGCGTCCCTGAGCCCGTAGGCGGGGGCCGAGTTCCGG
GTGGTGACGACGGTGCTGGCTGCCCGGCGCCCTCGCCCACCTTCTGATTGTGGGTGTTGC
CAACGTGGTCTTTGCTCTCGGGCGCCCGTGTGCTTAGCTAGTGATGACAATAGGGTTAAC
ACCGTCTGTCTGCGTAGCGCCTGTGTCTGGGGCGCTGTTTTAACTTTTTCGCTATCAACC
CATTCAGTCTCTACAGCAGCCCTGTTCAGGGAGTTTTGTTATCCCGTTTTAGGGGCGGAG
ATTCTGAAGCGCAGCTAGGTCCAGTGGGTTGCCTAGCATCATTAAGGTAGTTAATGGTTC
AGTCGGGTTCTGAGCGGGGGTGACTGTTGTCAGCGTCCTTGCTGTTATCTACTAGACGGT
CTTTCTCTGTAATGTATAAGGAGAATTAAATACATAGGATAGGCTTCCCTTCCCCCTCCC
TCGCCCCCAGGAGTAGGTAGCTAGTCATACACGTAATTTTTTTTTGCCCTAATTCCAGGG
GGCACAGGAAGAAGCACCGCCCCCTGTAGGAACAAGGTAAACTTCCTGGAGAGAATCTGA
GAGTGACTTAATTCAGTGACTCCACAAAGAAAGTGTGTGGCGGGGCCTGGGTGGCTCAGT
CGGTTGAGCATCATCGGACACTTGGTTTGGGTCAGGTCATCATCTGGGGGTGGTGGGATC
TGCCCCGCCGGGGGCTCCGCGCTCAATGGGGGAGTCGGCTTGGAATTCTCGCTCCCTTTG
CTCCTACCCCCTGCTCGCGCGCCCTCTCTCTCTCCAAAACAAATAAATAAATCTTAAAAA
AAAAAAACAAAAAACAAACAAAAAAAACACCTGTCTGGGAAAGGACGACACAATATGGGT
CAGACCACTGCCAAAACTGCCCACCTGTTTGACTCAGCTGGAATCAATGCCTTGATTGGC
AATCTGTATGAATAGGATTGTTGGAGCTAGGTGCTTGTCCTATTTGAATCATCTGTTTAT
CTTCAGAGAGGATTAAGGTGATGAGTGAGAAGTCTTCTGAGTGCACTTTGCATTTCTTTG
CACTTCAGAATGTCTGCCCTCGTCCTCATCCAATTAAAAATCTTTGAAACAAGTAGGTTG
ATGGACACTACACAAAAGCATAAAAGTTTCTTCTTATTTGGGGGCACTTGCAGACTTTGT
GTTATCCTTTATGGCTAAGGCTGGCAGCTTCTATTTATGCATTATTGAGTAATTCTTATT
AGTACGTCTTCCTGTGTATGCATTGTCATAGTGAAGTGGCAGAGTGAGGTTCTTGTCTCA
CCAAGTTGAAAAATGAATCTCTCGGACAGAGGAGAGTGAGTAAAGCGAGAGTTTTTTTTA
AAGATTTTTATTTATTCATTCGACAGAGAGCCAGCCAGCCAGTGAGAGAGGGAATGCAAG
AAGGGGAAGTGGGAGAGGAAGAAGCAGGCTCCCAGGGGAAGAGCCTGATGTGGGGCTCCA
TCCGAGAACGCCAGGATCACGCCCTGAGTGGAAGGCAGACGCTTAAGGACTGAGCCACCC
AGGCGCCCCAGCGATAGACTTTTTTAAGTGAGGATACAGAAAAAGCTCTCAGAAGTGAGA
GGGCTGGGATAGGGCTGCTACTGAGGGCCTCCACGGTTGGTCTTTTATAGAAAGCTAACC
AGGCAACTTAAATCCTTTTAACATCTCTATTGATAGCACCATTGAGTAAGGACTAGTGAT
AATATCTTCAATGGCTTACTTCCTTTTTAGGGTCCAGTAATTCTTTGTTGGTCTCAAGCA
GCTGTTACCCCACCTCTGACACCTAGGGCAGGATGGTCTGGTTTGCTCCCTTATCTCTGG
TTTCCTTACACCTCCACATTTTTGTAATTTTTTGAGCCTGATGCAGTAGCCCCCACCTAT
CTCCTTACCTAGCCTCCTTGTCTCTTACTCAATGGGGGATCCACATGAATAACGTAAAGT
TCCTATTAGGCCTTTTATCTCACTTTTATAGTTGAGAAATGCCAGTTACATCCAAGCAAC
TTATTTTCCTCTGTAGATATTGGAAGGGGAGGTTTCTGCCTTCAGAAAGTAGGAGGGAAA
AGTGCTAAAAAGCAAGACAGAACAATGCAAGTGCACGCAAAAGGTTCTTCAGAGTCACGA
AGGACTTGATGTGTTCTAGTTAGGTCTCTTTTGGAAGGGTTGAATTGATCAGCACTTCAC
AGTTGATGAAACATTTTTGTCACATGATTTTTTCTTCAGCAATCCTAAATGATGACTAGC
CTTGAAATACTTTTTCTCAGAGCAGGAAAATATCGCATCAGCCAATGAAGCAGAGCTAGT
AAGAGGCAGAACCACGCGTGTCACCCACGCTCTGTCTTGAAGTGTACCCCTTTTTTGTTA
ATAGCTCTATTGAGAGCTCAGGGCCAAGTGGATCTTTGAAAGTAAGGCAGTCAAAGAAAG
GAATTGTAGACCCTGACTGAGGGGGTGGAGGTGAGTGTGTGGTGAAGCCCTTGAGAAAGC
GGAGAGGAGAGGTGGTTGACAGCTCTTCTCCCAAAATATTCTGACCTCTTAATTCTCAAG
GCAAAAAAACTCTAGAGCATTAACTTTTCATGTTGTAGCTTCCATTATTTAGTGGTTTGA
AAAACAGATCCTCATTTGTGCTTAAGATAAAGCTGGAGTCCATAGGGGCGCCTGGGTGGC
TCAGTCAGTTAGGCATCCGGCTCTTAAAATCAGCTCAGGTCATGATCTCGGGGTCCTGGG
ATTGAGCCCAGTGTTGGACTCTCTGCTCAGTGGGGAGTCTGCTTGTTCCTCTGTCCCTTC
TGCCCGCCCCCCCCAGTGTGTGCATGTGCTCTCTCCCCCTCTCTCCCTCTCTGTCTCAAG
TAAATAAATCTTAAAAAAAAAAAAAAAACTGGAATCCATAATTAGAATCAACAGCATCCC
ATTACAGTGGAATTACAGAAAAATAGTGGTTATTTTAATAAACAAGGCAAATTCTCTTCA
GTACTTAGAACACCCAGACTCTTGATTTATGGAAATTTTAACATAATTGTAAGGATTTTT
AAAAGTGTGTATAAACAACTTTTTTTATACAGGACTTTGCAGGTGAAAAATATTTTCACA
TTTAGGGAAGTGCAAGTGGTGTGAATATTATTTTATATTCACTCATTCCATTTGTTTCCT
CAAAATACTTGAATACAGAGATTCGTGCTTCATAGCATGACTTACTGTCATACTTCATAG
CCAGTGGGTGGAAGCAACCCAAGTGTCCAGCAACAGATGTATGCATAAACAAAATGTGGT
GTATATACACACGAGGGAATATTAGCCAGCCTTAAAAAAGAGGGAAGTTTGACACATTTA
CAACATGGATGAGACTTGAAGACATAAGCCTGTCATCAAGTAAGCGTACTGTATGATTCC
TCATATGAGGTTCCTAGAGCAGTCAAATAGAGACAGAAAGTAAAAGGGTGGTTGCCAGGA
AATAGGGGAAGGGAGAAGAGGGGAGTTAGCTTTGAATGGGTACAGAGTTTCAGTTGGGGG
GAGATAAAAAGTAGTTCTGGAGATGGATAAAGGTGATGGTTGTACAACAGTGTACAACAT
TAAGTACATACTTAATGCCATAGACCTGTACACTTAAAAATGGTTAAAATGGGGGGCGCC
TGGGGGGCACAGTCATTAAGTGTCTGCGTTCGGCTCAGGGCGTGATCCTAGCGTTATGGG
ATTGAGCCCCACATCAGGCTCCTCCGCTATGAGACTGCTTCTTCCTCTCCCACTCCCCCT
GCTTGTGTTCCCTCTCTCACTGGCTGTCTCTATCTCTGTCAAATAAATAAATAAAATCTT
AAAAAAAGGTTAAAATGGGAATTTTTTAACGTATATTTTACCGCAATTTAAAAAGAAAAA
AAATACTTGAATTGTCACCAAATTAGGAACATAGGAAAACATTTGACATACTGAAAGAAT
GACCCCTACGTCATAGAGCTTTACTTCCCTGAACCCTTCTTTAGAAGGATGCACACCTAA
CAAATCTTTCCTTGTGTTGGCCATCTGCAATAGTGAACAAGTTGAAAACTGAGTTTTATG
GTTCCCTAAGTGATTAATTGTAATACATCTCGTGTCAGGGATTTGTAGCACTAACTGAAG
TTTCTTTTTTCTTGTCTGTAGGACAAGTGTTGGACAGCCGGAGTCAGTCCCCATGGAGAT
TATCTTTGATAACAGATTTCTTCTGGGGAATAGCAGAGTTCGTGGTTTTGTTGTAAGTGT
TACCAGTGCTCTTCATAGGCCTTGTAAGTTCACAGAAGTTCATGAGGTACATTACGTTGA
GGTTCTTAAACAAACGGAGCTTTTCCAAAACAGTTTTTAATTTTTTTTTTTTTTAATTAG
CTTGGCTAAGGGAAATGAAGACTTTTGTGGTGGTAAAGCTGCCCCAAACATCTGACAAGT
ATGAATATGATAGTTGAGTTATGTAGCTTGGCTGTGGCTTAGCCTTGGTGGTAATCATTT
CAGTCTGCATCTATGGAGCCAGGCCTCCCTGTTTTAATGCCAAATGACAGTGACTCACTT
TCTCTTGCTGTTTCAGCTTTAGTGTGTATGTGCAGTTTTTTTAAATTATTGGAATTGACG
CAGGAGATGAAGATTTAAACTTTACCATAATTTCAAGCAATTCTTAGTTAAATGCATCTT
TTGGTCTTTCCCATGCTGTTTGTTTTGTGAAAACTGTTAACTAGTCTTACATGCTAAGTT
TGAGAATATATATATATTTGAATGTCACATGGCAGAGAACTGCAATGATGCAGAGATGTG
GGAGACTGCTCCTCCCTTCATTGACTTTAATTCGTATTACAGTGGGTATTGGGCTGGGCA
TGATTGTGGGAAGTGGACATCAGAGGAAGTTACTCCAGGTGGAAGAAACACAGGAAAGAT
GGCAGAGAAGTTTGAATAGCAGACTGTGATCTTTATACTTAATTGGATTGTTGCTGTGAT
TTAAAAAGATTAATATGATGGCTGCATGTAGCATAAGTAGAATGGGGGGAAAAATGGAAG
AGATGGTTCTGGAGAAAAATACAATGGGACAGAGGGGCCTTACATTCCCCAGTGCAAAAC
TCCCTTAAAGTCTCACATATTTCACCTACTTACTCCCTATTGTTTTTTTTTTTAATATTG
TTTTAACTTAAATTCTTCCCCCTCCACAAGTAAAGAAAATTCCATTCAGATGGATTCCTA
GAAGCCCTGTGCCTCTGGCACACCACCCTAGGCGCTTCCCTCAGCAAGGTAACATTAGGT
AGGCTGTTGGCAGGAGAAATGTGGGGGAAATAAATGTGCAATGCTGTAAAAACAGACTCT
GAGGCTTTTCGGCTGATATAGAGTGGAGGAAGGAAGTTGGGGATGGCTTTGGTTTCAGAG
TCACTCCTAGACACTGTTAGGGAGAGTTACTAGCATGTAAGAAAGACAAGGAATGGTGGC
TTTGGCCCAGAACATAGCACCTGTATAGACATGTGCTACATGGTGTTGTCCAGCTGGCTT
CGAGAAATGTGGGGTTGGAACTAAGTTGGTTTAGACATCTGCTCACAAACATAACTGAGA
CTATGGAAATACATTTTATAATGTTGAAAGTGGTATTTTTGTTTTTTGCCGCTTGTTTCA
GTTTCAAGACTCTGCTTCAGCAAGATGTGAAAAAGAGAAGAGGCTATGGAAATTCCTCTG
ATTCCAGATATGATGATGGAAGAGGGTATAGCTTTTTAAAATTGATAATAGATATTTTTA
CCACTCTGTAATTTTAATTAAGTTAAATATTATAGATGGATAGACATAGGCTAATGGAAA
TAAAAGGTTTAAATTCTGTTTCACAAAATTAATGCATTACTGTAAATTAAGTCAAGTTGC
CTCTGATTTGATAATTAGAGTCAATTTGACAAAGCTAAAATGTTTATCAAATATCCTATA
GGAAAAGTCTAAATTAGAGACTGAAAACTGATGACCACCATTAAATCTAGAGATTTCACT
TTAGAATCTGGATTCCTACTGCTAAAGAAAACCAGAGAAGATCAAGCAGCATGGGGTTGG
GCTTGCATTTCCATGGTGCTGGGTTTCAGTTGGGCATTTATTTACAGGAAGTACTGTTAA
GGTCATCACAATTCCTTGCTTGACTCACTTTTCTCAGTGCATTAAGTGTCTGGTCCCTAT
AAGTATTTGAATTTTCTCAATTTTTGACCTAATTGGTAGTTCCTATTTTAGATAAAGCAA
AGGGTCTAGTTGAGTGTTTGAAAGGAACCACTTGATGTCTATTAAACAGTAGAAATTAAA
TTTTTCTTTTATTAGGCCACCAGGCAACCCTTCCAGAAGAATGGGTCGAATTAATCATCT
ACATGGCCCTAGTCCTCCTCCAATGGCTGGTGGATGAGGAAGGTAATTTAAAATCTGAAA
TTACTCTGCAGAGATTTTCATTTTGAAAATATCTTCTTAGGGAAGTTTTCTTTAGGAAAA
GTTACCCAATATTTTGTTATTATTCAGATGTGTTATTTGGAAAAACATGTATATCTTAAC
CCTTGAAAAACTTACTGAATTTTATTATCAAAGTGTCTTTTGAAAAAAGGTTTTAAAAAA
TGATTGTTGGATTTTTTTGGTGTAGGTCTAAATTAAAATAACTAGTAACTGATTGTTATA
ACACTTTCTTTCAGGTAAATGTCTGCTCTAAGAAGCAGACAACTGGACATGCACATTCAT
AACAGAGGGAAACCATGAAGAAATAGAGCGCTGACCGTGCTGGACAAGGAATTGAATGTG
TATGCCTGAACAAGGATTGCTCTGTGTCCTTGCAGACGAATGAGGTCGTGCTGGGAATTC
CCTCCCCAGGGATCTGGCATGACCGACATGCAGTTCTATAAATGC
Chart Advanced