SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000171_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein T (SelT)
SpeciesAiluropoda melanoleuca (Panda)
Transcript IDSPT00000171
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000074_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000171_2.0 # Transcript # Selenoprotein T (SelT) # Panda (Ailuropoda melanoleuca) # Full length # Forward
CTGGTGGCGGCGTCGGCGGTGAGCCGGAGCGATGCCTCGGCCAACCTGGGCGGCGTGCCT
AGCAAAAGATTAAAGATGCAGTACGCCACGGGGCCGCTGCTCAAGTTCCAGATTTGGTGA
GTATGTGCGCCGGGCCCCGGCAGCGCCGCCGCATCTCTGCGAGGCCCCTGTCGCTACGCG
ATGCGCCGGTTTCGCGGCCTAGCGGGCTGAACCTCCCCCGGCCCGGAAGAACGGCGCCAG
CAGCCTTCCGTAGCTTGCCGCCTCCGGGGTCCTTCCCGGGACTGCCAGGCCGCCCTTCTT
TCCTGCAAGCATAACCGTTCACTTGGCTCAATTCTTTTCTGCCTCCTAGAATGGTGGGAG
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AGTACGGAGGACCGGTCGGCGGCGTCACGCCATGGCCACCCCGGCTGCCTGCGGAGGTGG
GCATGAGTCGGCGCAGCGTCGGCGGAGGAGCTCGAGTGTTTGCCACCCGGTGCCCCTTTC
CTCTCCCCTTTCCCAGGGTTATGCCAGGCGCCCTCGTTGCCCCCCTGGGCGAGGGTTAAT
TTGGCTCGTTGGAGGAGACCCGCGACTGACAGGCGCCTCTTCTCCAGGACCTCCCGGGGT
GACTGTTGAATGAGGGGGTGGGGATTCTGACAGCGGGAGGGCGAGGAGAGGTCCAGGGAG
GCTGATTCTCAGTTTGCAATTTCCAAAATAAAAAGGAGCACGTTGCTCTTCTGACAAGGG
TTCACTTCCAGACAACTCTTATCTTTTCGCCCAAACCCCCTTACACCCGCCTCCCAGGAG
TTGTCTGTACTGGCATGTCTTTTCTTTGCTACCTTTCAAATCTCCTGTGCATTCGGAGAA
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AAACTTTGCGCTTTCCTCCTGACTAAAACAAAACAGAACAGAACAACTCCCTGTATTGTT
TGCTATGTGGCCAGCATATATCATTTTCATATAATACTGTAAACAGGAGTTCATTACTTG
ATCTTTCCGATTTTTTGCACATATATATTTTTTTAATTAGAAAGTGTTATTTTTCACCCT
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CCAAATTACTCTTTTATAATTGCTTCTATTGGAATACTTGTCACAATAATTTAACAAGTG
TACCTTCCAGTGAGGATGTTCATAGCAAAGTTTTCCAAATGTGTAAACAAATATAGGGAA
GGGCATTTAGCTCTTCAATTAAAAAGTCTTAAATACTTCAGTTGAGCTTCTGACATATAG
TTTCTCATTTCATTTTTTCTTTTCCTCTTCTTTTTTTTTCCCCCCTGTAAGCACAAACTT
GTCAGGGAAGTCTGACGAGAGTCGTCTTTTGCAGTAACCTGGAGCATATTACATACCAAA
GTTCTTCAGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATCTTAGATGGGAGATAATTTTATTAGTA
TGCCCTCCATATACAGGTAAATTTAGCTTGTTGTTTGTTACTTTTTCCCCCAGAGATTAA
TCTGTATATAGTAAATTTAATATTGGGTGTCTGGTTTTGGTAGAATCTCTTGGACATTCA
TTTGCGAGTTTGGGAAAGAAGAGGAAGCTAAAACAATTGAGGATAAATATGTGAAAATTC
TTTTAATTCTGTTTGAAATCTGAGTGCTCTAAAATGAAGTTTTTTTTTAATTACCACTGT
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TGAGTGCTCTTTATTTAACGGTAGCTCAATATGTCATCTATTAATTATACCACTTTTATA
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TCTGAGTCCTAAAGGCCATGTTAGTTACTGTAGACTTATATTTGCATATTCAAATATTTG
AGCACCTACTCTGTGCGGGCACTTTGGTGCTTGGAATTCAATTCAATTTTCTCATAGACA
TCATAGGCAAGAGTGGAAAGGCAGTCATTAATCCATAGACAACATATAAAATTACACTTA
AGTGCTGTAAAGGAAAGGTTATATGGTAGGAGAGAGACCTAGTCAGGGCATTAGGGGGGT
TTCCATGAGGAAATCAACTTTGAACTGAGATCTAAAGGATACGATTTATTGCTGGAGAGC
TTTCAAGCTATGGGAATAACATTGTCAGTGGCCTTGGTAGTAAAGAGAACATAATTGTTT
GAGGAGGCCAAGGCTACTGACCTCAAAGACCAAAGAGAAGGTGGCACAGATCCTGGAAGA
TCTGGCAGGCCATGAGGAAAGATCAGTTAGCGTCACTGGGAAAAGACATTAGAGGGGACA
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TACAGTGGTGGTGGTAGAAGTAGAATGTAAAGGAACAGGTTTAATGGATCTTTAGGAGAT
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AGGAATCCTGAGTTTTTAAAACAATAACAGGGAATATCCTACAAAGAAATTTTCATCTCC
CCAAAATAGCCATAGTAACTAAAACTAAAAACTTACTTTTTTACTTTTATTTATTTATTT
TGAAGATTTTGTTTATTTCTCAGGGAAAGAAAGAGCACAAGCAGGGGGAACATTAGGCAG
AGGGAGAAGCAGACTCCCTGCTGAGCAAGGAGCCTAATGCAGACTCAATCCCAGGACCCT
GGGATCATGACCTGAGCCAAAGGCAGAGGCTTAACCCGCTAAGCCACCCAGGCGTCCCTA
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AAGATACACCATTATTTTATATACCACTCAGAGGGAGAAATATACTGCCATTTAAACTGT
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AATGCTGGCTGCTACACCTATCACTATGTTAGATTTTTAAAGTTTCTGTAATTACATAGA
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TGACTTTCCGGAAATTATTGAATCTCTTAGCTCTCAACTTGTTCATCTGTAACATGATGA
TGTTGGTTGCATTCCAGTTACCTCTAATAATTCTGTTACTGTTTTATACTGTAGGAAGCT
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AGAAAGGGAAATCAAGTCATGTTTTCCCATATCTTACCTTGATTGGGGTGCAGCCTAGGA
TTGGTGAGGAAGAAGTCTTGCCATGTGGGTTTTAGCAAGAACTGCTGATGAAATCGAGTC
CTTGTTTTTTATGCCTTTTTTTACATGCCACTTATTTTCCCCTTTGTCCAATATTTAGGA
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AGAGACATGTTAAACAATATTATAGTAAGGCATTCTGTCTGTTCAAGTGTTCTAAAAAAG
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GAAAGAGCTTTATAAGTAGTGGAAGATCATATGTAAATGAAGCCTGACTCAGCACAGAGA
AAGGGGAAGGGACAGGAAATAAAGCCAGAGTCAGATAATCGATTAAAAACTAGCACCGCA
TAAATGCTATCATTTATGAAGCTTCATTGTACTGTGTTATTTTTATTGTCTTTAATGTTG
TGATGAGAACTTTGGTAAATAAACCCTTGAAAACTTTACTCTGAGACTTTCATCTTTTAA
AAAAACGAAATTAGCTTTCTGGCTCTAAAAATAATGCAGGTTTCTTGTAAAAATAATTTA
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TGAGCTAAGGAATAGTATGGGGTCTGGGGCTTCAAAGGGGAGGAGGGTAATTCACTGCAT
AATAAGAAGAGCAGATGTTTGGTTAAATACATGTTTGTCCTGCCACACTACTGTTTCAGA
TAAAAAGTTACCCCTGATAATAGCTTTCTGTTTGGGCCTATCCAAATTCTTTTAAGTAGT
TAAGGAAGTTAAGTGAGTTTTTTTTATTTTGTTTGTTTGGTTGTTTTTGTTTGTTTGTTT
TTGTTTTTTTGGAGTCCATTTGGTCTAAATTGCCTTCAGCTCAAAATAAGCCACATGCCA
AAGTGGCATATTTTGGGGTCACATATATTGCTCTCCACTAACATTTTGAAGAACCTCCTT
CAAGACAACTCTGCTCACATATACTGTATTATGTAATTTTACAGAAGTGATCATGTTCAT
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TGTCAGTAAATACAGATATGCATCAGCAGGCATACTATTATGAAAGATGAGTGTTCCTTA
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TACTTTGCTAAGGTAAATATCCTCAAATATGTTGTATACTTGTCCAATAATTTCTGTAAA
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TCTACTGTAATCAGTATATGACATTGGCTATTTTTACTTACTGGGCTTTCTTTGTGATGT
AACGTGGTCAGCTGTTACAGATGTTCTTTGGGCTACCAGAGGTTTCTCTTATTGAAAATA
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ATCTTCTATCACTTGATCAGTTTTCTACCCATCAGTTTTTTTAGGGCCTCATGTATATTT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCGAAGGCAGACGCTTAACG
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TCTTGTAGTGCTTCTGATGAGGGAACGGAAGGCAAGCTGAGAACAAAGCAGAAGCTGACA
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ATGACTAAGGTTTTGTTAGACTGTAATAAATGACCTTTTCCCAAAAATAGCTAGCCCCCT
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TCCTCTTGTTCTAGGTTCTATCTCTTTTGACTGTCATCAGTAAATATTTATTGACTACCT
GCTATAGTCCACTGTGGTTTGCCGTCAAATAACCGAACTGCCCTCCCTGTGCCCCCCCTT
TTATATTCCTAACTGGAGTATAGATAGATATCACCTAATTATTGTTCATTTCTGGTAGGT
TTTTACCTGGTTGGCTTCTGTTCAAATTTGTTAGCTCTTAGGCATAGAATGTAATCATGT
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GTATTGAAAAGAATAAAAGCTCGGCATCATATGCGAAGTATTTTAAGATGAAACAAAGAA
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TGACTGTATACCTTATAAATCTATTAATAAGTGTTTTCCAGAGTAAACAGATAAAATTCC
TTCCCCAGCAAGAGCTGGAGGAACTAAGCAGTTCATAAATTTTTGGTGGAATACTCTAGC
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TGCTGCTTTTGCAGCTTCTTAAAAAACAGCAAATTCTGGGCCACATTTTGATCTTTGAAG
TGCGTAAACCCTCCTGTTTGCAATTTTTAAAAATATTTATCAGTTTAGTCTGTTTTTCAC
TCCCTGAATACCTTGTTTTTGTGTGATTTATAGAACATGCTGCAGATTTCATTCCTTAAA
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ACCTTTTTGAACTGGTTTGAACAATACATTTGGAAATGTATTTTAAAATTATTGAGAGAA
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GGTACTTTATCTTTGTTTCTCTGAAGATTCACTTACCTTCTCAGTCCTTTGAAAGATTAA
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TTAGAGAGGGAGCTCAAGCCTTCTTTTGAAAGGTTTGCATTTTTCTGGACTGTCAACGAT
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GCTTTTAGAAAAGTACTGTGAAAAATACTTAAAGTGAGCCATTGCAAAAGTTGACTCTAT
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GAAGAGGCAGGCTCATAGCAGAAGAGCCTGATGTGGGGCTCGATCCCATGATCCCATAAC
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ATGGTTTTAGCATGTTTCCCTGTTTATGTGTTGGGGGTGTACCGGCCGCCATAGTTTCAC
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TGACTGGCTCCTCAGCATGTGTGCCTTGAATTTCACATTTTGTCCACCTCAGTAAACATT
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TGTCAGTATTGTAAAGTTCATCTTTCAGAAGTAAAATAGGTACAGTTTTTTTGTTTTGTT
TTTGTTTTTTGTTGAGGTATAATTGACATATGAGTTTCAGTTGTACAACATAAAGATTCA
CTATTTGTATGTAGTTCAAAATGATTGCCACTACAAGCCCAGTTAACAACGATCACCATA
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AAATATGGCATATGCTATTAACTATAGTGACTGTGCTGTACATTCCATCCTCATGATTTA
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TATTTATTCGACAAAGATAGAGACAGCCAGCAGGAGAGAGAGAGGAAGAGGCAGGCTCAT
AGCGGAGGAGCCTGACGTGGGGCTCGATCCCATAACGCCGGGATCACGCCCTGAGCAGAA
GGCAGACGCTTAACCGCTGTGCCACCCAGGCGCCCCTAGGGTACAGTTTTAAAGTCCTTT
TTGGATTTCAAGACTATGGGCTGATTCCATTTGGAGTTTGGTCCAAAGGTCTGAGACCAT
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GAAAAGTAGGTGGCTAGGAGGAATCTGACCCAAAGTGTTGCTTGCACAAAGATACACCTC
TCTTGCTGGGCCTCTTAGGGCTTCCCCTGGCAAAGGATTGGAACTCCCAGAGCAAATATG
AGGGACTTCTGGGGGCCCACAGGTTTTTAGTTCTCCCAGAGGAACAATCTCCAGGTCTTC
ATCATAGAAGAACCTCGGAGATCTCTGCTGTCAAGAGGTCAACTGTGTGGGTACTTGCTT
GTGGCATTTTGGCCAAAGGGAACCTATTTCCTGGACAAAGGGAAGAATAGCTCTTGCATC
GTCTAACTGTTTTATTGGGGTTTAATGGAAAGGGCTAGGGTCTCAAATCACAAAGTACAT
GTTCTAGTCTCTCAGCCCTGACTAAAGGCAGGGACCACATCTGTATCACTCATCACTACA
TACCCAGTGTTTCATATAGTGCTTGACAGGCAGTAGGCTTTCAGTAAGGATTTGAGTGAG
TGAATTAATAAGTAGTATATATGGATGTATAACCGTGGAAAAGTCACTTCATCTCTTTGG
GCTGCATATTTCCCCCTTCATCTCTAAAAAAAGTTTTAACTCAATTAACTTTGTCTCTAG
CTCTCACAATATTTCATTAAAAGTTAGAGAACATCATTTTAAGTAATTAACTCCATTGTA
AACACTGATGCAAGCTTGAGGGCATTGAAATCAGTTGCCATTTCTTGGTTTCAAGGTAGT
TAGGCATATAGGTATTATTTTTTGTAATATCCTCAAAACAAAAGCAACATTAAAAATTTT
CTTATACAGAAAGTAATTGTGACAAAATACTATTTGCTAACTCTAACAACAGTAATAATA
AAATATTAGATAAGGTGAATGTTTACTAAACAAAATATGTGGAGATTCGATGTTCTTTTA
AGTATTTAGCTGTAGAGATTTGTTTCCCTTTGCAAAAATTTCATACTTTTTAGGGACTTA
ATCTCTTGTGAAATGTTTATTCTAAATGTAGAGGAAGTATTAATTGTAAAGAAAACTGGT
GACTCTCTCTCTTTCTCTCTCTTACTCCCTCCTTTCTTCCCCCCAAAAAGTGAGTTTTCT
TAAATTGAGATCTACTAATATTTGGACTGTTACACCCTGCCAGATATAAACCTGATGCTG
GTGGTTGGTATGTTTTTCCTTGATGACAGTGTGATCAACAAAGTTGGCGCCTTGGGTTTT
ACGTTACTATTACTTAGTTACTGATTCTGCTTCCTCTGTACTTTCCTTGCTTTGTGTGTT
ACTTAACTTAAAATTTAATGTAGTTAAGTGCTTAACAATCTTACGTGAATTTGTAAGCTC
TTCTGTTGATTTGGTGGTACCACCTCCTTTTTTTCTCTCAGCGTTATTTAACTATGGTTG
ACAAATAGAAATTATGTATATTTAAGGTGATGATTTCATATACATGATATTGTGAAATGA
TTCACAGTAAGTATAGTTAACACATCCATCACCTCATATAATTACGTTTTTTTATTGGGT
GAGAACATCTAATATTTATTCTTTTAGCAACTTTCAAGTGTACACTACAGTATTGTTAGC
TACAGTCACCTTGCTGTGAATTAGATCCCTAGAATTTGTTTTACAATTGGAGGTTTGTAT
CCTTCCACCAACATCTCCCCATTTTGCCTATTCCACAGCCCCTGGCAGCCACCAGTCTAC
TCTCCATGTCTCTGAGCTTGGCTTTCTTAGATTCCATGTAAAATGAGATTATACAATTTG
TGTTTCTCTGTCTGATTTATTTTACTTAGCATAATGCCGTCAAGTTTCATCCATATTCTT
TCAAATGGTAGGATTTTTTTTTTTGCTGAATAATATTCCTATGTGTATTTATGCCACATT
TTCTTTATCCATTCGTCTGTCGATGGACATTGCAAGTAATGCTAAAATGAACATGGGGTT
GCAGGTACCTCTTAAAGAGAGCGATTTAATTTCCTTCAGGTGTATTTAGAATTGGGATTG
CTAGATCATATGGTAGTTCTATGTTTAATTTTTTGAGGAATTTCCAAAATGTTTTCCATA
ATGGCTGCACCGTTTACATTCCCACCAACAGTGCACAAGGATTCCCTTTTGTCTACATCC
TTGCCAACAGTTATTATCTCTTGTTTTTTTGATGATAGGCATCCTAGGGAGCACTTTTTC
GTGTATCTGTTGGCCATTTTTATGTCATCTTTGGAAAAGTGTCTGTTCGGGTCCTTTTGC
CCATTTTTAGTCAGCTTATTGACTTTTGGCTGTTGAGTTGTATGGGTTCCTTATATCTTT
TGGATATTAACCCCCTTTGTCAGATATCTAATTTGCAAATATTTTCTCCCATTCTGTAGG
TTGCCTGTTTATTTTGTTGATGGGTTCCTTTGCTATGCAGAAACTTTTTAGTTTGATGTA
GTCCCACTTGTTTATTTTGCTTTTGATACCTTTGCTTTTATGGTCAGATCCACAAAATCA
TTGCCAAGACTACTGTCAGGGTGCTTACCCTCTGTGTTTTCTTCTAGGAGGCTTATGGTT
TCAGGTCTTATGTTTAAGTCTTTAATACATTTTGAGTTGATTTTTGTGTATGATATGGGA
GATAGTTGGTCCGTTTTCATTCTTTTCATGTTGGTGACAGTTTCCCCAACACCATTTGTT
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TGTGGGTTTATTACTGAGCTCTTGATTCTGTCCCGTTGATCTATGTGTCTGTTTTTGTGC
TACTACTATATAATTTTGATTACTGTAGCTTTGTAATATAGTTTGACATAAGGAAGCATG
GTGCCTCCAGCTTTGTTCTTCCTTCTCAAGATTGCTTTGGCTATTCTGGGTTTTTTGTGG
TTCCATACAAATTGTAGGATTGTTTGTTCTAGTTCTGTGAAAAATGCCACTGGAATTTTG
ACAGGGATTGCATTGAATCTGTAAATTGCCTTTGGTAGTGTGGACATTTTTAACAATATG
AATTCTGATCCATGAACTCCATGAACACAAGATATCTTTTCATTTATTTTTGTCTTCAGT
TTTTTTCATCTGTGTCTTAAAGTTTTCAGTGTATTCTCCCCCTATATATGCACTCTGGTG
GCCTTTTCCCCTTTTCTTGGTGGGGAAACATATATCCGCACTATAGTTGTTCAGACATTT
TAATGGAGATATTTAATGCTGTTGACTTAATTTCTGGAGTAATGTTATAGATTGCTGTCA
TACTGCTGAAAATTATCTTCCCAATCTTTGTTTTCCTTTGCAAAGTAGAAGCAAATTTTA
GAGTCAGAAGGGATGTAAGAGTTCTTTAAGTTCCCTTTACTGTGATTGAGCAGGCATGGT
TGCCCAGCTAGGGGCAGAGTAGGAGTAAGAACCAAAGTTTTCATGTCTCATGCCTTGGTA
TTTTTTAAGCTCTCTGTGCCCCACTTTTGAAAGCCCCTATTTCAGATGTATGAGAGTTGT
TTTCATTTCAGTATATTCATTGATAACCCCTGCAAAAAGCGAGTTGATTTGAGAGCTCCA
AATACGCTGGCATACATGAATAGGTATTTGCTGCTGCCCAACAATAATCCAAATCTATAA
AGTTTAATGTTCTAACAGATGAATATATGTGGTGGGGACGCAATTTAAATATGTGAAATT
AGTGGACAAACCTCCGTGTTGCCATCATCCAGCATGGGTTGTTACTACTTTGTCACTGTG
AGAAACACTTTTTTCATCTTGGCAATTTTTAGGCTTTGTATAAATGCAAAATAAGTGTAA
GGTATTCTAAATCACTTAACAGAAGCACTTTCATTTTTCTGCAGTGTTTCCTGAGGTTAT
AGGCGGGTGTTTGAGGAGTACATGCGGGTTATAAGCCAGCGGTACCCAGACATCCGCATT
GAAGGAGAAAATTACCTTCCTCAACCCATATATAGGTAAGTAAATTTCAGTAACTTAAAA
GGAATTTTTTAAAGTGAATTTTTTTACTTTTTTGAGTAAACTTTTGTGAATTGGCTCAAT
TAACTTTTCTTGGTTATTATAATTTCTTAGTTGGTTACAGTAAACAGAGAACACTGTTTT
ATAAGTGGCAAGTTTATTTGATCCAAACATGGAAGAATTTTTTCTGTAAGAAGGAAAAGA
GGAGGATTGTTTCAGAGGTGGCAACCTTCTAAGGATGTGTTTTCTTATATAATTTTTACT
GTGGAAACAGACCAAGAACTCCCAAATTTTTATACAAAGTCAATGGTATGAAATTCTGTA
CTGTTAAAATAATATTTTTAAAGGCTAATGCTATATAATTTTACAAGTTAATTTTTGATT
GATGTAAAAGATATTAAATATATTTGTGTTAAAATTCCACAATAAACTTTGGTTACTGTC
TTTTTCACTACTTGTAATTAATTAGTAACCTTTAGATTTGGTGTCTAGAAAATGTCTATA
CACATACACTTGAGTTATGAAGTTTCGAATTAGGTGAGAAATTGTGGCTTCTGATGAATT
TTTTTTTTTTCTTTCAATAGACACATAGCATCTTTCCTGTCAGTCTTCAAACTAGTATTA
ATAGGCTTAATAATTGTTGGCAAGGATCCTTTTGCTTTCTTTGGCATGCAAGCTCCTAGC
ATCTGGCAGTGGGGCCAAGAAAATAAGGTATGTAACCTAATCGTTTTGATAGTTGTAGAT
TTTTAGGTTGTCAGTGAAAATATTTTAATGGATTATTTGTTTTTTTTAAGTACTTGTTGC
TGATTCACCTGTTCGCTTGTATTATTTCAGCTTCAGTCACTTTTTAATCTTTGGGCATGG
CACTTAACCTTTCTTGGCCTCAGTTTTTTGTTTGTGATTTTTTTTCTTGGCCTTAGTTTT
TATAATTATATATTAAGAATGATTGGGTCTTATCTTTTTACTATTTGAAGGATAGGGAGG
TGTGACTAGTAGAAACTGGGCACAAAATAATTTAATACCTGATATTGATTATGTAGATTA
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