SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000195_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesAnolis carolinensis (Anole lizard)
Transcript IDSPT00000195
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000098_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000195_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Anole lizard (Anolis carolinensis) # Full length # Forward
AAGAATGTGAAACTGTCTGCTGAAGTAGAACCATTCATTCCTCAGAAGAAGGGTCCAGAT
TCACTTATGATGCCTATGGCGCTACCTAATGAGAATGGAGGTGTTAATGGCGTAGAAGCA
GCTCCTATTCCCAGCTACCTGATTACTTGCTACCCATTTGTTCAAGAAAACCAGTCCAAT
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GTCCAGATTTCCCTTCGAAGTCATTGTTCAGGTTCTATATCTGCCAAAGAAATGAATTCA
GTTGCTTCTCAGTCACATAACATTTATCAATATTTATTATTTGCTTTTCCATCCTGAATA
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ATAATAATACTTATTATTATTATTTTATTTTTATATCCTGCCCCATCTCCCCGAAGGGAC
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CTCTCATTTGATCCTGCAAAGGGTCTTTTGCAAAGGGTTGTCTTAGGCAGCCATTTAGGA
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GCAGTGGTTTCTCAATTATCCTTTAACTATTGCCTTTCAGACTTCCCCTCAGAGATAGCA
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CGGTCCTCCCATCCTGCCGAGTCTTCTAGCGAGCAAGGGGCCAGCGAAGCAGACATTGAC
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AGTGTTGAATCTGCTGCAGGAAATGTAGGTAAACATGGCTGGAACATAGAAGTCAGTCCT
GAAATAATAAACATTGAAGATGGCACAAAATAAGCAAAATTTTAAAATAATCTTTGCAAC
TTTTTTTTCATTTTCAGATCTTGGAACCTTCAGTACATCCAGGTAAAGTTACTATATTAA
TTGGTCAAGATTATAAATTTAATTGAAGATTAGCTTGTCTCTTTCTCAGTTTCATTCCTC
TTTGTTGTATAGTAGCCATGTTAGAAAATAGAGTGCATCAAAAAATTTCAAAAGAAAATA
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GTCATGTTTAGTAGAAAACAAATGGAATTGTAGTTGCTGCTATTGCAGAATGCATTCTAG
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TTTAATATTTTATCTTTTTTCTTGACATTTTGTCGTCTTTCCCATATGAAACATTTTCTT
AAATGTCTTCTTTCAGCTGGTGCCACTTGGGCAAATGTGAGCTCCCAAGCAACTCAGAAA
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AATAGTTCACAGGTATTATTTCACTTATTTATTTTAAGCATTCCTCTGCTCTTCTCCCAG
AACAACTAAAATAGCACGAAAAAAATTCAGAAGTCTCCTCCCTCTCAACACACAAAGAAA
TGATGAGGAAAGAAGAAAATATGCGAACACCTGTTCCTAATTTTATACAGTTGATACAGT
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GTCATGTTAGCGTGTAATTTGTGCTTTTAAAAATAAAATTATATGCCAAGATAAAAAGAA
ATACATTCATTGCAAATGTATATGTTTAGTATAGTTGCATTAGTTTAGTTTTGCTGGTGA
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TATTAGTGAACTTGACTCCATGTCTCAGCATTATATTCAGTCCATGTCTATGTACTTAAA
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GCTGATGAATTCTAATTAATTCCCATTCATTCCAAGTCTGCCCCAGGTTAAAACTCAGAT
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GTGCATGGTTTCAATTTGTTTTAGCTTTATCTTTTAAAGCCATTCAATTGTTTGATGTTT
TTGGAATATTTAAATAGTTGTAAGTTATAATTTTGAAATGATTTGAACTGAATTTGTTGT
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AAGACACACTTTTTGCCTTGTATAAATGTATTTAAAATAGAATTGCAGGTGTATCTTATG
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GGACACAGTACATCTTCAGAAAGAAGACAGAATTTGCAGAAGAAACCCGAGAAACCTGTC
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TTGTTGTTCATTTTGTTTATGATCATTGCAATGTCTTTCAAAATCATTATACTGTTAATT
TACTTGCTTTGTTATTATTCTTTAGTTCATATCTACTTGTCTCCCAGTATGAAATCTAAG
GCTGATCACAATATATTTTCAAACGAAATTCAGTGAAAACATTGCACTTTGCCATCTTGC
TATCATTATTTTCTTCACATTAGTTGTAGCATAATGAACAGTTAACATCTCATTATAAAT
GGTTTGCTTTAACCATTCAAGGCTGACATTGCTGATTGCTAGTTCAGGTGATGCCTTGTA
TTTTAATGCTTCCTGAATTACTATTTTTTATTACTTGTTATTGGCTAATTAGGATGAAGA
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AAATGCACCCAAAGTGGTAAGAAATGCTACAGGACTCTTAAAATGTAAATGAATTTCTGA
TTTGGATAATTACCTGGGTTTTTTGGCAGATTATATTCACAAGCAATCATAATGAATAAT
GGTGTTTGGTGGGAGAAGACTGGAGACTCTGAAAGTTATATGCATGATTCTTGTGCATAT
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AAGGCTAGGTATTTGAAATGTGTGTGATGCCAACTAAAATTTCAAAATGTATAGGTGTGG
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TGCCTTGCATCCTTAGACTAGCCTACTTCTTTCAGGTTTCTGTTCCATCAAACAGTGATG
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AAAAATGTTTTGGGCCAGTCCTGGTTAGTTCAGATAGGCACGTTGCTGTGTGCCTTCAGG
TTCTTTTCGATAAGGCAATCCTGAAGTGAATCACTTACTGCCTTCCTCTCAGGCTGAAAG
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ACATAACACTGGCTTTTCCTTAGATAAGCATGATATGCCTTTATAGCCCCATGAAATTTC
ATAGTCGAATAATTCAGTGGAATACTGGCTAGTCAATTCATTACAAACTTGTTGGGCTTA
ATTTGCATTTGAATATACAAAGTCCAAGCATTGGTTTAATATGGTTGGACTAGTCAAAGA
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TTTTTCCATGTTGTTTGTAGTTGGACGATTTACCTGAAAACTCTCCAATCAACATTGTAC
AGACCCCAATTCCAATCACCACATCAGTTCCTAAAAGGGCAAAAAGTCAAAAGAAGAAAG
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AACTCCAGGTCTGTTCTTAATAATGTGGTAGTTGTGATGAATGGTTTATTTAAGTCAGAG
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ATTCCTGTAATTTGACTTCTAAACAAAAAAAGGTAAAGTTTCAAGTTGTAAAATACTTTT
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TGAAATATCATGCTGACAAGGAAGACTCTGCTCTGAAATAGAGTAAATATGCTCTATATC
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TTCTCTGAAAATATAATGATGCCTGCTGAGAAGATGCTGAAGATATAAAAGTTTGGTTCT
GGTGAAAGTGCAGTGCCTTGCCTGCCATAGACTGGCTATATAATGTAATGCAAGTAATGT
ACCAAACCAGTAAAAAGTCTGTGTTTCTCTTTTTCTGTGCAGCTGTGTTTGTATATTTGT
GATTTCATATAATAAGTAACATTTTTATTATTTACTCTAGGAAGCTGTTTCAAAAGCAGC
GGGGAAGAAAAGTAAAACACCGGTGCAGTTAGACCTGGGAGACATGCTGGCGGCGCTTGA
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AGGTAGGTACATTTTATTTGTCTTTTTCTTGCTATATACTTTGCAGATTTTATTCAGTCC
AGTAGCTAATGCATTAAGACTAGACACAGTGAGTTTTAACATGGAGCATAAGTGTTACAT
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TGATACAGAATGAGATTCCCCATTTGAAAACATTGGGAACAGGGAATTGTTCTTTCCACA
GCATTTAGCGCCACACTGCCAGATCCCCGATCATTCTAGCAACTTGCTCTTTGTTTAGTG
CTGCTAGCTCTGTATCTTCAGTGAAAGAAAGAGATTTTAACAGTTTCCTAATGAACTCTG
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GCTTGCTGGAAATGTTATGTAAATTGCCTACTGTTAATGAAATAAGAACTTTGATTGCCT
CCAGCACTTAATTATTTGGAATGAGTTTGCATTTTCAAAAAAAGAATTTATCTTTTCTCT
GAGGATTATTTGCTTGTGCCTTTCTAATCCAGTCTGAAGCAGCTGAGAGTAGCAATGAAA
CATTTGTTTTGAAGATAGTGGTTGTTGGAAATTGAAAAAAAAAACCCTTTAGTATACTCA
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AATGAAGCTGCAAACAGATATTTACTTTTTACGGCCAGTGTGTAACATGACTCTATTTTT
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CCTGTTCCTGTACAGTTGGCAACGCTGCTCCTTTTCACACCAAAGAATCCACTAACCGGA
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CAAAAGTGAAACGAGGAAAGGAAAGAGAACTTTCAAAGCTGAAGCGTCCAACAGCACTTA
AAAAGGTAAACTGCCTTTAAATATTGCTTCTAGGTTTCCTAAAGCCTCCTTTGATTATGC
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GAATTGCACAGATACTTGTCTCTTTTTTCAGTTTCCAAAATTCAGTCCCCCATGTTTTAG
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ATAATGTCACTCAGCTTGTGCATTGGTTGTAAAATCTATATGGTTAAATAGTGCTCCCAG
GTGCTAAAGTGCTCTGTTTCTTGGTTGTGTAAATGATTGCTTGTTTCAAGAATTTGGACC
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TTTGGCAGCTACCAATCCCTATGGGTGCTGATTAAATGAGAGCCTGCTGTAAAACAATAG
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CAGTGACCTTTTGTAGATCTCTTAAGTGTAATCATTATTTATGTGTGATTATTTTTCTGT
TACAGAACCTGGCCTGAGTGTACCAAGTGATACCTCCCTCTCTCCAGCAAGCCAGAATTC
TCCATATTGCATGACTCCGGTGTCCCAAGGTTCACCAGCAAGTTCAGGGATAGGGAGTCC
GATGGCATCTTCTACTATCACTAAAATTCACAGCAAGAGATTCAGAGAGTAAGAATTTTT
TTAAAAAGAAGTTACTTCCTGCTAGATTTATATTCCTGATCTGTTCTGTTACTTTATATA
TAGACCATGTTTTTGCCAAAACTGGATTTAAAGTTAACGTGACTCCCAATAGAATGGGAG
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GAAGAAGGGAGATATTATCTTGTATCAATAATGTGATGTTTACCTGTGTTCATCTATTCT
GTTGAGTATTTAATTTGATTTGGTTCAGCATTGTCTACTGCTATACACTCAAAGCAACTT
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AAAAACAAGTAAGTCAGATTTTCTCAAAGTTGCAATGAGTATTTACCAAATGTAAGCATA
GCTATGTGTAGAAACTGTGAGCAGGATAGTTGAGGAACAGAACTCTGGGAAGTCGCCCAT
TCATAGGACTGCCATAAGCTGAAGTTGACTCGATGGCAAAAAATAACAAAAAGTGTGAAG
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TTACTTCAGGAAATAATCCTTCTGTTATTGTCCTATATATTTAAATTCCCCCTAAAATAT
GAAGGGTCCAGCCTGTTTAGGATTTAAAGAGTTTAACACCAACAGGGTGAATTGAGATTG
AAAATTGTTTGCTAGGGCATAGAGCATGCCCTGTGGCCTGCCACCTTTAACAAAATTACC
CTCCTGCAATTTTGCATCAGCATAGAAAGAACTTTATCAAAGGGCAACTAAGGTAGCTTG
AAAACACACCTCGGTTACGGCAAATGATTTAGCGATCAAATGTTAGTTTGGATGTCAGTT
TCTTTTAATCAAATGAGAGGCAATACAATTTTTCCTTACTAGATTTCCCTTCTGAATCCA
CAGATACTGCAATCAGGTTCTAAGTAAAGAAATAGATGAGTGTGTGACTCTCCTGCTACA
AGAGCTGGTCAGTTTCCAGGAACAAATTTATCAAAAGGACCCCATGAGAGCTAAAGCTAA
GAGGAGGCTTGTGATGGGTCTCCGTGAGGTGACAAAGCATATGAAGTTAAGCAAGATCAA
GTGTGTCATCATTTCTCCCAACTGTGAGAAAATCCAGTCAAAAGGTATGAATGGAGGCTA
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TACTGCGTACTGAACTATTTTTTCTGTCAAATTTGTTGTATAACATGTTTTGGTGCTTAA
CTTGTAAAATCATAACCTAATTTGATGTTTAGTAGGCTTTTCCTTAATGCCTCCTTATTA
TCCAACATATTCACTAATCCAACATTCTGCCGGCCCGTTTATGTTGGATAAGTGAGACTC
TACTGTAGAAGGAAGAAGGAGCAGGCTTCATTTCTGCTGGATAAGTGAGACTCTACTGTA
TCTACATAAGACCTTCAGGCATCTTAACATGGCTTTTCTTTAAATATTTGCCTGGGGGAT
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CTTTAACAAAATTTGATACATACAATTCAGTTGAAGAAAATATGTGCTTAAATTTAAATA
TTTGAACAGTGACAGAAGGTGAACTGTTTTAAATAATTTTTGGCTAGTTATGAGAGATTT
TTTTGTTCACGCTTAATTCTCTCCTGTTGTCTTTCCTGGCCTACAACAAGGTGGGTTAGA
TGAAGCTTTGTACAACGTCATAGCCATGGCACGAGAGCAAGAAATCCCTTTTGTCTTTGC
ACTCGGACGCAAAGCGCTTGGCCGCTGCGTGAACAAGCTGGTCCCTGTCAGCGTGGTGGG
CATTTTCAATTATTCTGGTGCTGAGGTAAGAACTCTGTCTTTCTGGTATACGTTCTTGAT
ATTTCAGCATAATCATGGCACAAATGTGCTCTGAGTGTGTGTGTTTTAATGACTTTGTTG
AGCATTGGGATTTGTTCCTGCTTGCACCTTCATAAAATTCAGTTTACTCAAGAAGTCTTT
TTGAAAGCAAGGCACTGTTGACATTTGGATGTGGTCTATACTCAATTAGAACAGACATTA
GAGTGAAAACCAGGACTGTTCGGATACTGTTAAACTGGCACTGCTTCTGTTTTGTAAAAA
CATTATGAGTCATTGTGCTTAATATTTAATGAATTCTTCCCAGTCAGCCAAGAGACTCTT
CATTTTATTGTACTTTTGTCATGCAGTGCAGGACATAAACATCTGAAACGTCAAACCAAC
CTCCGTAATTGAAATATAATCAGAAGAACTTTATTTCTTTTTAGCAAAGATTATGTTAAT
TTACACTAGAATTTCATCTGTTGCGAAATTAGAATGGTTCTTGCTGCCATAAGAACAATT
CATTAATTAAAAACTATGCACATATAAAATGAATGCTATGGGAGCACAAAATGGTAATTT
CATATTTTCACCATTTATAGTACTGGCTATTGGGTACCTAGCAAATTAGTTCACAAATTC
TGGATGCAGGTCAAACTGCTGCTTGCAACTGTTTCCTTCTGAATGTGTGTGTTCAAATCC
CTTGGTTGCAAAATGAGATTTTTTTTTTGGGTTTATTTTATTTATTTAGATTTTTTTACT
CCATCACAAATGCACTCAGAGAGGCTCACAGAATGTTAATTTGCCACGAATGATGGCTCT
TTCTTCATTGCTACATTTCTAGTCATCTATAGTATAAAGAAGATAGTCTTTCGGGGCATA
TTTGCCCAGTGAACGTTGAGCGTGAAGCACAAGATTTTCAAATAGCAGGAAGCAGAGCAT
TCTCTCAGAAATCTTTTCAACTCAGTGGAATCTTCTCTTTTAGAACCTCTTCAATAAATT
GGTTTCACTGACTGAGGAGGCCAGGAAAGCCTACCGTGATATGGTGGCAGCCATGGAACA
AGAGCAGGAAGAAGCCTTGAAGAATGTGAAGAAAGTCCCGCACCATATGGGCCACTCCCG
GAACCCTTCCGCAGCGAGTGCCATTTCATTTTGCAGTGTTATTTCAGAGCCCATTTCGGA
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AGATTGGAAATTCCTTCATTCTCTGCCCTTTTCTATTGTTTTGGTATTTTATTTCTTCTT
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ATGCTGGGATTTGTTGTTTAGGAAGACACCCAGGATTGATGCAATGGCTTAAATGTTTTA
TGTTGTGCCTGTGATTGCTATCACAGTGTTATAGTTTTAATGGTTTTTATTCTATTGTTA
TATATTGTTTGATATTTGATGTTTACATATGTGAGGCATTGAATTTTGCCTTTGATTATA
CTGTGAACTACTTTGAGTCCCTGCCCAGGGGTGAAATAAGCAGTATATAAATGCAATAGA
TAGGAAGGGGTATTTGGAATTCTTAGCTAAAGTGCTGTAATTCCTCGTCATGCTACAAAC
CCCATCATTCTGTAGGTTGTTGCCATGGCATGAAAAGTGGGATCATAGTGCATAGTGTGA
AAAGGCCATAGATCATTTCCATGTTCAACTCAGCCATAAATATCTACGTTTCTCTAAATA
TAAGGGTGTTGGATGCTCATCGTTCATTTAGATTACTCCCCTATTCCAGAATACTCCTGT
ATTATGAAATAGGCCTTAGCACAGCAGTAGACAATGTCCTGTGCTTGCCAAAAGACCTTG
CCTGATCTGTTTATTTGATTTCATGCATTTATATTGTACTCTTCATCCAGTTAGTTGCAT
GAGTAGTTCACGTTTAGAAAAATAACAGTACAGTAATGACAATGTAAGATAGATTAATAG
ATCAGTGTGATTAAAATGGGTGCAATAGCAGTCCTTACTTTGATCTGCATTCAGCAACTG
TATGGTTTCAAATAAATGCTCTCCTCATGGGAACAGCACCTGTTTTTAAGTAACTGTATT
TATATCAAATAACTTTTTAAAAATAAGTAATTCCTCATATTTTGTTTATCAACCTTTCCC
AAATTTTTATTCATTTTCTCCCCAGAAACAAATTGGAGGAGCATGGTGGAAACCTCTGAT
GGACTTGAAGCCTCTGAAAATGAGCGAGAAGCCTCTTTCAAGAGTGCTGTTCCAGAAAAG
CCTGGCAACAGTAATAAGGTTATTGTTAACAAGGAGCTATCTCTAGCTGCTGTTGGGGTT
GTCACCGTCTCGGCTCAAGTGAAAGCACCAAGCGGGAAAGAGGAAGTGAAGCCGGATGAC
AACCTGGAATGGGCCTCACAGCAAAGTACGGATACAGGATCGCTGGATGGCAGTTGCAGG
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GAGGAAGATGATGAAGAGGATGAGGATGAGGATGACTACACCCATGAACCTATATCTGAA
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Chart Advanced