SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000196_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesAnolis carolinensis (Anole lizard)
Transcript IDSPT00000196
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000099_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000196_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Anole lizard (Anolis carolinensis) # Full length # Forward
TCTCAGGGCATCAAGTTATCAGCAGAGGTCAAACCGTTTGTCCCCAAATATGCGGCGGTA
ACTGTGGCATGGTCAGAACCCTCAGAAGCATGTGTCTTTCCTAGATATTATACTACATGC
TACCCATATGTTCAGGATCCATCCGTGGATAAGTATGTACCCTTCTACATCTCATTTCTT
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CATGCTTTGGATAGCATAGGGAAGGGTTAACACCCCTGTGGTGTTTACTTTGCTGTCAGT
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TGTTTTTAAGCAAAAATAACTAATACAACATATATGCAATTAATCAATACAGAGAAGGAC
TCAGATTGGTGTCATATTTTTTTACTTTTCACAGAGACGACCCAGAGATTTTGAACCCAA
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CCTCTATAGTTGGCTGGCAAAATAATCTTATATTGCAGTTATTGGAAGCTTGCTTCTACT
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TCAGCTTTGGTGACCAAAGAGGTTTGTATTTGGTAACTTTTGGAATACTGAACAACTTTA
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TGTGCGCGCACACAAATGTGCATGCCCTCAAGTCATTTCAAGCCATAGAAGCAAAACCTA
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TTGGGAGATAATTTTACAATAGTAACAAAAGATATATCTTGTATGATATTAGCTAGCATA
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GAGTAGGGTAATATTAAATAAATAAAGCGGAGAATAAAATAACTTCAGTGATGTTAAATC
TTGGCTTTTTGACATGCTGATGTAATTTTTGTGTGGGGCCACTTTGTGATAATTCAGTGA
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AGCAACTCACTTTATATAGATCAGATACAAATGCTTGTGTTTATAGTTTTAAGATGTGAA
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TTTCAGAACAGTTTTGCTTGACTTGGTTATAACTCTTTTTTCTATATTTATTAGTTTATT
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TGCACTGTGGATGATTCACATCTTAACATTCTTAATTTTTGTATACATGATTTAATTCAT
TTGTTCTGTTTTGTATTGTGCCATGGTTGCTGTTAACTGCCTTGAGTCCCTGTTTTGAGA
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CAAATTTCCTTTGGAAGATAACTATGTCTGCTACTGAGAAAGCCCTGTTTTATGTACTTT
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CTTGTCTCCCTATGGAGTACATGCAATCCCCTAAACCACCCTGGCCCCAAGATATTGCGT
GCACCAGTTATTTTTCAAACTTTGGTCCTCTACTTAATTTGGATTTCAACTTCTGGAAGT
CCTGGCAACCTGATTAATTATCTGGATTCTGGAGCTGAAGTCCAAAACATCTGGCCCAAG
ACATGTTAGTATACAGATATAATATGCAGTACTTAAGAATATCATCTAGGTCTACTTGTT
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ACATCAGATTTAAAGGTTGAAGATTTTCACAAAATCTGAGCGGTGTGTTCTATCAATTAT
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TGTCACAAACTCCAAAGAGAACAGTTTCAACTCCAGCTGCAAGTCCTTCTACCAACCACT
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GAATTTAAAGATGGAAAAAATCAACAGAGGAGTGGTGTTTTAGTCTTGGATAATAAGCCT
GTTTCTTTAAGCTCATTTGTTTTCTTTTTCTCCTCAATACTTTTTTTGTACTTCCTTTTC
CAGTCTGCCTTTTTCTTATTCAAGCCATCCATCTTTTTCTTCAATCTCTTTATTGGTTTT
TTCTGAATATACTTTCTAAGCATGTGTTCTTCCTTTTCATTTTTTCTGTGCTAATAATTT
TATGAATTCCCATTCTTTTTAGGCTCTCTTATTCTTTTTGACATGTACTGAGATCATGTT
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TTTTTCCTAATTGCAGCATTCATACTTGCCTCTAACAGACAAAAAAAAAATCAGAAATAT
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GCCCACATCTATGGCAGGCATCCTCTGAGGTTGTGAGGTCTGTTGGAAACTAAGCAAGAG
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CTGGCTGATTCCTACCTGTGGGAATCCTTTGTTGGGAGGTGTTACCTGGTTGTTTCATGT
CTGGAATTCCCGTTTTCAGAGTTTGTTTCTTTATTTACTGTCCTGATTTTAGAGTTTTAA
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CTGCGGCCGCGTCCAGGAACGAAGGGAGGTTTGGGCGATCTCTGCTGTGGCGCTATGGGC
TGCTGTCGACGCCTCGACAGCGCCCCTAGCGGCCAGCGCCCGAGGCCGCCGCTTCAGCAG
CCTCATATGTCCAACCGGCCCTGGTTGGCTTGCAAGTAAATACTGATCCTGAACTCTTTC
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CCTCTTGCCCCATTACAGTATGTACTTTTGATATAAATATATTATTCTACCTTAAAAACA
TTTTCTTTGGGTTTTTTCTTGTTTAATAAAAATTTGAACATTTTATTTTCATTCAGTGTC
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TTAAAGGTAATCTTATCTTTTTGTTCCCTTTCTCATGTGAAATTTGTCTTGGGTGCAGTT
TTTTTCCCTTCCCTCGTTCTTTTTCTCTTAGCCCCATTATTTGTGTTTTTATTTGTGTTA
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TTGTCTGGGCCTACTTTTCTTGTACCTCTGCTTATTTTGCTGCTATTTCTGATTGGATGA
CTTTTTTAAAACTCAGATTTATCTGAAAGTTGGCCTATACACCTTTTTCTGGGTTTGTGC
CCTTCCCCTTTTCTCTCATTTGCCTTTTCTTAACCTCTATTTTTCCTGGTACATAATTAC
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TTTAATATTGTTAAAATTGTATTATTTCCTCTAGCTTCTAAACTACAGCTTTCCCTCTCC
TTCCTCATTTCACAATGGTCACTCTTTCCAGTCTGATTGTCCCTTCTCCATTTTTTCCCC
TGCTACCCGTTAGCTTTGGCTTCTGGACTTTGTTTTGGCAACATTCCTCTTCTTTCCACT
TTGTATTTCCTTTTCAGATTAAGTGATTACTTTGGCCAGGATCCAGCAGTATACATCTAC
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AGATTATTCATCAGCCCTTTGGTTCAAACAATGATGCTGTTCAGAGACTTTGTGGATAGA
GGAGCCACATTGTTCTGGATATCTTCTGTCATCAGGAGTGTATTGTAGGATCCTGGTCTT
TTCCTTTAAGAGCTCTTTACTTTTCATTCCCTTTTTCTATCACTTCTCTCTCTACTAGCT
GTTAGGGTTTCTGTTGAGGAAAGCCAAGAAAATATAAAAGCAGGATTCGAACTGAACATG
ATGAAAACAAAAGTAGCAGCCACTGATAGAATGACTGTGGATAATGAAGATATTGAGATA
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GACTGATATATCATTGAAAATCAAAGTCATGGTCATCCATGCCATAGCATTTCTGATTTC
TATGTATGGTTCTAAAAACTGGACTGTAGAAAGCTGACTGACTAGAATCAACTCATTTGA
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AGCCTCCCCGAAGATTGAGTGAATTCAGTCGGGTGTCCCCTGGGCAACGTTTCTTGTAAG
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AACTATTAGCCAAAATGTCTGAGGACATTTCGTGTGACATCCTATGTATACAGGAAACAC
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CCCTCCCAGACGTGAACAACATTGAAATCTTATCTGTGGAACTTGATAGTTGCACCGTAT
CATCACTCTATAAACCACCTGGGGCTGATTTCTATTTTACACCCCCAACCAGCTGCCACA
ATCATGAAGCCCATTTTGTTGTGGGAGATTTCAATAGCCATAGCTGTGTCTGGGGCTCTG
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ACCCAATACCTAACACACAACACAGACCAATATGCTGCGTAGCATATGCAGCTGTAAGAC
CGAAAAGTGTCCCATTCTGCAGAAGATATAACTTCAATAAAGCTAACTGGACAAAGTTTA
CAGAGACCTTGGAAGCTGCTATTTCTGATATAGAACCTTCTATAGAAAACTATGACCTGT
TTGTAGAAGCTGTGAAAAGATCCTCGAGGCTCTCAATCCTTAGAGGCTGTCGCACAAGCT
ACCTACCAGGCCTAAACGAAGAATCACTAAATCAGCTACAAGAATATCTCAGATTATTTC
AAGAGAACCCATATAGTGATGGGACTATAGCAGCAGGCCAAAAACTATCTACAGCCTTAG
CTAATGCTAAGAAAGGCCGTTGGATAGAGCTGCTTGAGAACCTGGACATGTCCAAGAGTA
GCCAAAAAGCCTGGCAATTGCAGAGACGCCTGGATAGTGACCCTCTGGTCAACCCTGGAC
ACGCGAACGTGACACCAGATCAGATAGCTCACCAGCTAATTCAGAATGGGAAAACCAACT
GCAGCAGAATAAAGATGAAAATCAACAGGGTGCCAGAACTTGAAACCCACCAGTTGTCTT
CTCCTCTAAACCTGAAAGAACTCAGAGAAGCCATCAAGCGATGTAAGACTGGTAAAGCAC
CTGGCCTAGATGACCTGATGATGGAGCAAATCAAACACTTGGGCCCCAAAGCTGAAAACT
GGCTTTTGAAATTCTACAATCAATGCCTGGCACACAAACAGATTCCCAGAGCATGGAGGA
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GCAGGATGTTGATGTTTTAAAAGGTGCTTTTAGGATGTTTTAAAGATTTTTTTAAATGAT
GTTTTTAAAATGTTTTTTAAATTGTTGATTTTAGCCGGTTCTTGTAAGCCGCTCCGAGCC
CTAGGGGAGTGGCGGCATATAAGTTTGAAAAATAAATAAATAAAATAAATAAATGTTTGC
CCACAAGAATTCAGCCAAACAGGCCTTGGGCAGAACTCCCCCCCCCCCCCGTTTTCCAGG
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GCTGCCAAACAAATGGCTGATTAGGTCTGCTTCCCTTGGGAAATTCTAAGGAGTCATGCA
TCTGGACAGAGTTGGGTTTCGCTTCTCGTTCTCTAGGGAAAGAGTTCTGTTGGCGGGAAA
ACGAGACCCGATATAGGTGCTTGGCGCGAGGGATACTTTGCGGAGTCAATTGATCAGCTT
GAGGAGAGAGATCGTGTGTGGACTTCGTAATCCCCGTTCCTTGCTTCCCGGATCAAGCTT
CAAGCCTAGCCTTGTCTCACGGTTTTACCACGGACTCTGTTTCATGCTTCATGTTCGTCT
TGCCTTAAGTCACGGATCTAGTCGAGAATCAAGTTTATTTCCAGCCTTGTTGTCAAGCTT
CATTGGACTTTAAAGACTCTGTTATTTCCCCACACTATTGCTTGGCAAAGTGTGTGTTTC
GGTCAAGTGGATTAAAACTTTGAACTCTAATATCTTATATTGGACAATACATTTCTGGAT
TATAATTGACCTTATCTGAAAGGTCTGCTTCTGAACTATATTCTTCACTTGTTTTTATTG
ATTTTATATATTTCTTTAATAAAGATATTAGATAGAGACTGGCCTCTGTGTAAGGTTATT
GGTGCTCTGCAGCCTGGATCCTGACAGATAATTGCCATCTTAAAACCTGGTAAAGATGCC
TCCAATGCCAGGAACTATCGACCAATCTCCCTCTTATGTCATCTATATAAAGTCTATGAG
AGGATGCTATTAAATCGACTAGGACCTGTTATGGAACCCAAGCTTATTCCACAACAAGCA
GGTTTCAGACCAGGGAAAAACTGTACAGGTCAAATTCTTCATCTGACTGAACATATCGAG
GAAGGCTGTGAGAAAGGCTGCATTACGGGAACAGTCTTTGTGGACCTTACGGCAGCCTAT
GACACGGTGCAACATAGAAAAATGCTGCATAAAGTCTACCACATCAACCGGGACTTTGAC
TTTACAAAAACTGTCCAGACCCTCTTAGAAAACCGCAGCTTTTATGTGGAGTTTCAGGGC
CAGAAAAGCAGATGGAGGAGGCAAAAGAATGGTTTACCCCAAGGCAGCGTTCTTGCACCG
ACCTTATTTAATATCTTCACGAACGATCAGCCACAACCTCCACTCACAAAGAGCTTTATA
TATGCTGATGACCTTGGCCTTACAACACAAGCAAAAGATTTTGAAACAGTTGAAAAGCAA
CTCACCAATGCCTTGAAAGATCTCTCCAGCTCTACTACAAAGAGAACCACCTGAAGCCGA
ACCCTTCCAAGACACAAGTGTGTGCTTTCCACCTACGTAACCGCGAAGCCAACAGGAAAC
TGAAAGTTACTTGGGAAGGCCAAGAGCTCGAACACTGTTTCCATCCTAAATACCTTGGTG
TCACCTTAGATCGAACACTAACATATAGGAAACACTGCATGAACACCAAGCACAAAGTAG
CTGCACGCAATAACATCCTGCGGAAACTGACTGGCAGCGCATGGGGTGCAGACCCACAAG
TAGTAAGAACATCAGCCCTGGCCTTGTCTTTCTCAACTGCAGAGTATGCCTGTCCTGTTT
GGCACAAGTCTGCCCATGCAAAGCAGGTGGACATAGCACTGAATGAAACATGCAGAATCA
TCACGGGATGCCTTAAACCTACACCTGATAAACTCTACAAGTTAGCTGGCATTGCCCCTC
CTGACGTGCGACGGGAAGTTGCTGCTAATGGTGAGAGAAAAAATGTCGAACATTGTGAAA
GCCACCCACTGCATGACTATCAGCCTCCTCCCACCAGACTCAAATCAAGGAAGGGCTTCA
TGAGAACCACCACTCCTCTTGATGTTCCTCCAGCAGCAGCAAGGGTGTCTCTCTGGGCAG
CTAAACCTGGCAATTCTAACTGGATGGCCCCCCAAGAGGGTCTTCCTCCAGGGGCAAACC
AAGAATGGGCAACTTGGAAGTCCCTGAACAGACTCAGAAGCGGAGTGGGCAGATCTAAAG
ACAACTTGGCAAGGTGGCACTACCTGGAGGAATCCTCCACCTTGTGTGACTGTGGAGCTG
AACAAACAACTCAGCATATGTATGCTTGCCCACAATGCCCTGCCTCATGTACGGAGGAGG
AGTTGTTTAAAGCTACAGACAATGTGGTTGCTGTTGCCCGCTTTTGGTCCAAAACTATTT
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