SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000246_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesBos taurus (Cow)
Transcript IDSPT00000246
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000149_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000246_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Cow (Bos taurus) # Full length # Reverse
AGAATCCTGGCATGTGTCAAGACATACATTATCTAGTTTTAAAGCCATTTCTTCTATATC
CACATCTTCAGTTTTGTCATTATTGTCAACTCCAGATATGTCACTCTCTTTATTTTGTTC
CTTTCTGACTGTCTTTAAACACTTGTCAAGTCTCTTTATGAACAAGTCCACATCCTGTGT
CTTCATTCCAATGGCTGACGCAGCATTGAGGTAAGCACAAGGGTAATTATTTGTATGTGA
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TTTGCAACTGGCTTATTCCATGGAGATAGCACTTTTTATTCATTGTCTCATGGCACCATT
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ATTCTTTCCTTTGCCACAATATAGTAAGATTCAGAGCTGCCAGAATGATCTGAAACCACA
GGATTTAAAGGTAAAGAACCAGAACATTTCCTGCTCAGGTGCTATCACATATCTATCAGA
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CTCCCCTGGACCACAGCAATAGATTCTAAATGACTTCTCTGCCTTCTTTCCCGCCTTTCT
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TCCTCCCAACTTCCTCCTGTAAGTATTAAAAACAAAAACAAACAAAAAAAAACAACTCTT
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CCCTCCACTTACTACGTGCCAGCCACATCAGCCTCCTTTTCTGATCCCTGGACACGTCTA
ACCTTTGTGCCTGCTCCTCCAGGACTGGGAAGGCTCTTCTCCCAGATCATGCCATGAGTG
GTCCCTTTTGTCACAATCTAAGGAGACCTTATCTCTTCTCTATTAAAGTAACTGTAGACC
CTGCCTACCTCCAGCTCCTAATCTCCCTCCAACACCACTGTCTATTTTGGTTCCTTCACT
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CCCACTAGAATGGAAAAACTTGAAAGCTGGGACTCCTTACCTTCTTCACCACTGTTTTCC
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AAAAATTAATTTCCTTTAATATTATAAACTTAAAATTAACAATTTCCTTTTAACTCAATT
AAAAAAAAATATAGCAGCTAACAACTAAAAACTGTACTGTTGATCCTACTCTGAAAAGTA
TATCTGGTAGTAAAAAGTAAAAATACATATTATTTTACAAGTACAAAATTTCATGTGCAC
AGGCACATTTGAGAATTTAATGAAGTTACAAACAAATATTAAGTTGGCAACTATTTGACC
TAAAATTGTTTTTTCTTCTCCTAGTAAGGACTTTAAAAAGTGTTGAAATGAATATCTGAC
CCAGTAAGTCTGCAGCTGAACAAACCCATTTGCAATGACCTCCTCCAGCCATAGTCAAGA
CATATAAATTCTAATGATGTACCAAAGAGCCAAGGGCCAACAGAGTACCTAAGTGAAGAC
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AAGGATTGGCGAGTCTGAGCCCACACTGGGACCCAGAGTAGCTTTTTCATGTCTAAAGCA
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TACCAGGTTTATGAATTATGAATGAGTCTCCTTAAGACCACAAGCATTTTTATCCTTGTC
AACACAGTATATTTTATATTCTGACCTAAAAAAACTTTAATACTCATTCTTAAATTTTTA
GGATCTTTTAAGATCAATTCTCAGCATGCCAGAATTATGAAATCTTAGATCACTAAAATA
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TAAGTAAACATACTGTTATATTTAATAAATTTTTCTCTTCTGTCATTAAAAAAAAAAGTG
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GCATCTTTTCTTAGACATATAAAGATTTCCTGGCCCTTCCGTCTTAAACTAATATTTTGA
TGTTCACTAGGTGAAATTATAAGAAAATCAAATGAAATTTTAAAATCAAGAGTTTTTCCT
ATAACTGGAATAATTTAATATCTTTTAGGTACCATGCCAGTGTTAATGAAGAGCAAAATT
CCTGGGTTTCATTTATGTATTTCCCTTTACTATAAAGTAACTAGGTCACTATCATAATGC
TCAGTGTTGGGAATTCCCCTAGAGGTCCAGTGGTCAGGACTTGGTGCTTTCACTGCCAAT
GGTCTGGGTTCAATCCCTGGCTGGGGAACTAAGATCCTACAGGCCAAAAACATTAAAAAT
AAAATTTTAAAAATGTTCAGTGCTGTTTAAAAAAGGAAAAAAAAGTCATATATTTTAATT
TAGATGTTAACTGCTGATTCTTCATATTATACATTAAAGTCTTAATGGGAATCTAATTCT
CTCTTACTGTCAAATTCATTAACTTCCCATGCTGCTGCTAAGTCACTTCAGTCGTGTCCG
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GCAAGAACACTGGAGTGGGTTGCCATTTCCTTCTCCAATGCATGAAAGTGAAAAGTCAAA
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CCTCCATCCATGGGATTTTCCAGGCAAGAGTACTGGAGTGGGGTGCCATTGCCTTCTCTG
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CCCTAACACTAACAACAAAAAACTTATTTCAATTGTGAGGGCCAAATTTAAAATATTATT
CTCTCTAGTATGACTGCCACAGTTATCACCAATGTGATCACACTTGTAGAATAAAAAGAA
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CTCCCATTAATATCACTACACTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TATTTAACTTAATTTTAAAAGATTCTTCACCAGAGATAAGCTGAACTGTACACCTGAATG
CTAATGTCAGCTACATTTCTAGAATAAAAATATAGAACTTTACACCATAACTCAAGATGT
TAATGGAAGAGAAGTTGAATTACATTAAGCATTATCTTTCATATAGCCTTTTGCAAATTG
ATTTGCAGTTGTGAAGCCCAACATCTAGCTTATCTGTTCCCATAATCCAAGATGTACATA
ATTCACTAAATTTTAAAGAAAAGGGTCTTAGGTAACCACGTCTTTCGAAATAACTATTTC
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AAAATCTGACACTTTCGTTGGGATTCAACTACTCTACCTTTAGGGCTACAAAGTTTGTTT
GAGTTATATGTCTAACGCTCTCCAAGTTTCAGCAAACAAATTCCAGTCACTGAAGCAGCC
ATTTTGTCATTCCTTTTCTGCAGATATTCTCTTTCCCAAATCAGCAGATATTTGCAACAA
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TCTTTTGCATAGAGCAACTCAAAGAAATAGTTTCTGCAATTTTCATCCCTGTTCTTAAAG
GCCTCTTCAGTTAAACTTCCTGGTCACTTCTCCCCTCAATGAAGCAGACATGTTGATCAG
GAAGGGGCTAAGGGCGAACAGGTTCAATTCACACACACAGTTCCACTCTCTTAGATCCTT
TCACTCTTCAAAAAAGAAGGCCTGAGAAGGAATGGCTTCAAGCTGAGTTCTTGTCTGCTT
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ATAAACTATCACGATTAAATTTTCACAGTTCAAAAGCAAGTCCATTTAAACAAAAGAGGG
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GGGTAAGTGCGTAACTTCTCCTAACCTCAATTTCATCTGTAAAATGGGCATGATATTTAC
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TTCTCTTAGCCTAACAGTTTTCAGACTAAAATAATTAACATTAGCTAGCAGGACTCATAC
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TGACACCTAAAGTGGACTCATCCAATTCATAACACTAAAAAATAAAATTTCCCCACAAAA
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CTCAGCCCTCTTTATGGTCCAACTCTCACATCCATACATGACTACTGGAAAAATCATAGC
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CTCCTCCTGCCCCCAATCCCTCCCAGCATCAGAGTCTTTTCCCTGAGTCAACTCTTCGCA
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GGCTGATCTCCTTCAGAATGGACTGGTTGCATCTCCTTGCAGTCCAAGGGACTCTCAAGA
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TTCCAAGGAGTAAGCGTCTTTTAATTTCATGGCTGCAGTCACCATCTGCTGTGGTTTTGG
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CTTTCACTTTCATCAAGAGGCTTTTTAGTTCCTCTTCACTTTCTGCCATAAGGGTGCTGT
TATCTGCATATATGAGGTTATTGATATTTCTCCTGGCAATCTTGACTCCAGCTTGTGCTT
CATCCAGCCCAGCGTTTCTCATGATGTACTCTGCATATAAGTTAAAAAAGCAGGGTGACA
ATATACAGCCTTGACATACATATACAGCCTTGACATACTTGACATACTTTTCCTATTTGG
AACCAGTCTGTTCTTCCATGTTCAGTTCTAACTGTTGCTTCCTGACCTGCATAGAGATTT
CTCTGGAGGCAGGTCAGGTGGTCTGGTATTCCCATCTCTTTCAGAATTTTCCACAGTTTA
TTGTGATCCACACAGTCAAAGGCTCTGGCATAGTCAATAAAGCAGAAATAGATGTTTTTC
TGGAACTCTCTTGCTTTTTCCATGGTCCAGCAGATGTTGGCAATTTGGTCTCTGGTTCCT
CTGCCTTTTCTAAAACCAGCTTGAACATCTGGAAGTTCACAGTTCTCATACTGTTGAAAC
CTGGCTTGGAGAATTTTGAGCATTACTTTACTAGCATGTGAGATAAGCACAACTGTGCGG
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ATGGCATCATCTTTTATGACTGAAATAGCTCAACTGGAATTCCATCACCTCCACTAGCTT
TATTCGTAGTGATGCTTCCTAAGGCCCACTTGACTTCACATTCCAGGATGTCTGGCTCTA
GGTGAGTGATCACACCATCGTGATTATCTGGGTCATGAAGATCTTTTTTGTACAGTTCTT
CTGTGTATTCTTGCCACCTCTTCTTAATATCTTCTGCTTCTGTTAGGTCCATACCATTTC
TGTCCTTTATGGAGTCCATCTTTGGATGAAATGTTCCCTTGGTATCTTGAATTTTCTTGA
AGAGATCTCTGGTCTTTGGCATTTTATTGTTTTCCTCCATTTCTTTGCACTGATCACTGA
GGAAGGCTTTCTTATTTCTCCTTGCTATTCTTTGGAACTCTGCATTCAAACGAGTATATC
TTTGCTTTTTTCCTTTGCCTTTCACTTCTCTTCTTTTCACAGCTATTTGTAAGGCCTCCT
CAGACAGCCATTTTGCTTTTTTGCATTTCTATTTCTTGGGGATGGTCTTGATCACTGTCT
CCTGTACAATGTTACAAACCTCTGTCCATAGTTCATCAGGCACTCTATCAGATCTAGTCC
CTTAAATCTGTCTCTTGCTTCCACTGTATAATCGTAAGGGATTTGATTTAGGTCATACTT
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TTCATGATCTGAGCCACAGTCAGTTCCTGGTCTTCTGCCCTAATTTCAGGTACTGGTTTT
TTGCCTGAAATACTCTTCTCCATCATACACTTGATGGAGTATACTCCCTCAAACTTCTTC
AAGTCAACTCAGAAGTCATGTTCTCTATGAGGCCTGCACTAACCACTGTATTTTAAAAAT
CAGTTCTCACCATCTCCCCCCTCACATCAACCCTAACCCCCCTTATTTTACTCTGTTCTT
CTTTTCCACAGTGCTTTCACCTGTATAATTTATGTATTAAACAAACTTTATAATTTATAT
TTTATGTTATTTGTTTACTGCTGGTATCCTTCATACAAAATGTAAGCTCCACAAGAGCAG
GTATCTTTTGTCTATCTTATTGGTTATTATATCAATATTATAGGCTTGACACATAATATA
TGCTCAACAGATACTTAGTAAATTATTTACTCAGTGAAACTTATCCTACAATCAAAGTTC
TCCACTATTTATTTCTATTTCATAGAAATACTGGTCCATATGTTAGACCATGCTGTTTTA
AATGAGCTTGTCACTGTTCAGACTGGGGGAGGGGGTGGGTCAAGAGGGCTTAACAGGGGT
GGAAATGGATATGAGATACCATGAAATTCAAGAGATCATCTTAAAAATTTCAAACTTAAA
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CAGGCCAATTCCCATGATTATAATACCCAAGGCCCAGAAAGCAGCTATTTCATTTTAAGA
AATATTCTATAATCTTTCAGAATTAGAAATGGCCTAGATGTCAATTGTTTCTTTCATAAA
TAAGGGAAAAAAATTTGTGAGTTCAAGTACCTTTACCATAGTGAAACAACTAGGGACAGG
AGAGCTAAGACCCCCGGTGTCTGATACAACTTTCACATATACAGGTGATGGTTTTCCTCA
GTCAACAGTCTCCATCTGTCCTATGGGGAAGGAGCGTTGAAAGATTCTGCTGAGGTTTTC
TCTCTCAAAACAAGATGATTATTTCTTGGAGTTCATCAAACTGGAGTTTTAGTCTAATCA
TCTAGAATTTCTTTTCAGGGCTATTGAGGCATAATTTACACACAGTAAAATTTCAGGTGT
CCACTTCTGTGAATTCTGACAAACATACAGTCATGGAACTACTTCCACTATCAAGATACA
AAACATTTCACTACCATTAATAATCCCCTCCCCAACCCAGGCCTCTAGCATCCACTGATC
TCTTTTCTGTCCTGATATCTTTTTGCCTTTTACAAAAAGGATGGCTACATACAATATGTA
GCCTTTCAAGTCTGGCTTATTTCATTTAGCATAATGCACTTGAGAGTTATTATGCTGTTG
CATATGTCAGTAGTTGGTTCCTTTTTATTGCAGAGTATGTATGTATCAGTTTGTTTATAC
CCCAGATGATGGACATTTGAGTTGTTTCCAGCTTTTGGCAATTATGAATAAAATCACCAT
GAACATTCACATATAAGTTTTTGTACACATACAATTTTTCATTTCTCTTGACTAAATAGC
TAAGAGTGGGACACTAGTTTTTGTGGTAAGTATACAAGAAACTGCCAAAGCGTTATCAAA
GTTGCTGATTAGTTTTTTATATTAGTTTTTGTTTTTTATATTAGTGACATCTCACTTTAA
TTTGTATTTCCCTAAAGACTGAGGTTGACCATCTTTTTCCTATATCATGTAAATCTTAAG
AGATGTCCTAACAATAAAAAGTAAGCAATTACTTTCCTATGGGTTGAATTAGTGGGAAGA
AAGGGACTAGGAGAAAACAGGGCACAGAAGTTTTAAATTTCTGTTAGATATTCATAAGGC
TGTTTGTTGAGAGGATCTATCAGATGATATACATGAAAATATTTTAAAATATGTAAATTA
ATATGATAAATCTTAGGGACTGTAACTGCTACTAAGTATTAGAAAGTTATAGATACAAAA
ATGATACCAGGAACCTCTAGCCCTCCCAGATTGGAGATGAATAAAACATCTTAATCTGAC
CTGCCCTAGCAACACTGTCTCTGACTACAATTTTGAAGCTGCCCTGAATTAAGCTAGCTT
TTAGTGTTGAAGATAAAGTTCAGTTTTCAAGCACAAATGTCACTTTTCATAATCAACATA
ATCAATGAGTTCAGCATTCCAGTAACAGCAAAAGATGGATTTATTACTTAGAAAGAGAAG
CTGGTCAACTTCTACCTGTATTTTTCCTCCTGCAAATGACATGTCACATCTAAACAAGTC
TTCCAAAACTAAAAAGAAAAAAACTTGTCCATCTGTCTTTTAAGAGCTTCTATTTACCTA
TAAGTGATAAATGAATTAAATTTTACTGAACTAATAGAATCCCTGATACAGGACTTTCTC
AAAAAAAGCAAACACAAAAACAAAATTGCTTTTCCAAGATTTCTCAGGATATCTGAATAG
ATGGGATAACAATGATTAATTGAAAACCAAATCAAAGTCAATCCCCTAGGACTGTGCTAG
GTATCTATATCCCAAATTGATAAACCAATAGACAGAAACACCAATACTCTGGAGTACTGT
TTTAGTCAAGGATATTATTTTATACCTACAGGGAAAGCTTACCTTTCTTTCTTTTAATAG
CTTCTTGTAGCCATTTGATCCAAGTGATAATAAAGTAATAAGGACATCTAAAGAAGGTGA
AGCTGAAGCTCTTCCTAAAATAAGGATGATATGTTACATTAGGGAGAAAAAGCTTTGTAA
AGTAAGATTTATTACAGTAGCCTAATACACAAATGGATATTTGTTTGTTAGTTACTTTTT
CTGAAGAGCAACTGATTTATTTACCTGGATACATCTTGCTGATTTCCTGAATGAAGGAAT
CATTAAAGCCAGCAATTATAGCACCACCTACTGGAACCATAAAATTTTTGTCCAAGCTCT
GAACGAAAGCATCTATTCTACCAACACGAGCTCCCTAGAACAGAATAACAAGCAATATTA
CATTATTAGTTTCCAGAAGAAAGGACAGCAACTGCTGTTAATAAATGTCATTAAAACAAT
GCACAGAAATAAAAACACAGATCAAATATTTTCTTTGTATAAACACCAGTAAAATATTTT
TTAGTATTAAACAGTTTTTAAATGCTGCTTCTTATAACTGGAGGGCTTCCCTCATAGCTC
AGTTGACAAAGAATCTGTCTGCAATGCAGGAGACCCCAGTTCAATTCTTGGGTCAGGAAG
ATCCCCTGGAGAAGGGATAGACTAGCCACTCCAGTATTCTTGGGCTTCCCTTGTGGCTCA
GCTGGTAAAGAACCCACTTGCAATATGGGAGACCTGGGTTCAATCCCTGGGTTGGGAAGA
TCCCCTGGAGAAGGGAAAGGCTACCTACTCCAGTATTCTGGTCTGGAGAATTCCATGGAC
TGTGTATAGTCCAGGGGATTACAAAGAGTCGGACACGACTGCGCGACTTTCACTTTCTGC
TCCTACCACCACTTGGATAACAACAGAGAAAAGAAAGATTCTATTTTTAACATCAACTAA
TGGAATTTTTTGGAAGTATACTGTTGGCAATGGTTCTACGTAACTTTGTTTCCTAATGTC
ATAATCTTGGATGATCCTATTCCATTGCAAATGAACTTCAAGTGAAAATTTCATATTCTG
GTGAAAAATGGAATACTTGCTAGAAATGTAAAACTAAGTTCTAGTCCCATGCAACACAGT
CCATGACCTTCTGCCTAATGTGTTTCAATTTTCTCCTCTTAAAAACTGAGATACTATCTA
AATTTCAGCTAAGATGGTTTTTCTTCTTTATCTATAGCCACCGATTTTCAATCTGTATTC
ACAATCTACATTCCTATTAATATTGTAACCACATTTGACCTTCATCTTCCCACTTTATAT
CCACATCCATATCTCAGGGAGAATAGAAGGAGCAGATAGGTAGCCTAATCTGAGAGACCA
GATCCTGGCAATAGGGAGAAGCAGCAAAATCAGAAAAAGGGCACAGACCACTCTGGAGGC
TATCCTGTGATTGTTTCAATCGTAACCTTCCCCATCATTCTCCTTTCTAATTTCCTCATA
AACCATGATCAGAGAAAATCTCATCTTACCACAGGAAAACAGAGAGAAGCATATGAGACT
AACTGAATAAATAACTGAAAACCATGCAAAGTCACTGAACAAATAACTGAAAACTATGCA
AGGTAGTAGCCATAAAAAATAAAGTGGAACGGAGTTACCTTTTCATCAACATTTAAGTAC
TGCCCAAGATGTCCCAAGAGAAATCTGAACTTAAATTGGGAGCAGGAGTACTAAGAGGGC
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Chart Advanced