SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000258_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesBos taurus (Cow)
Transcript IDSPT00000258
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000161_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000258_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Cow (Bos taurus) # Full length # Forward
GATATTTTGGACCTTGATTTATCTGTCTCAGAAACAGATGATTTTATCCAGCTTGTAAGT
GGTGGAAAGATAGTATTTGGATCCATTCCATTGGCTCACAGATATGGCGGCCACCAGGTA
AGAATAGTACCAGGACTCTCCTGGTGGTGCAGTGGCTAAGACTCAGCACTCCCAAGGCAG
GGGGCCTGGGATCGAAGCCTTCTTAGGGAACTAGATCCCACACACCACAACTAAAAGATT
CCGCAGCCACAACACATTGAATATCCCAAGGGCCTAAGACCTGGCACAGCCAAATTTATT
AATTACAAAAAATAGTACCAGTATCACTTCCTTATGCAAATATAAGCAGCTGGTGGAAAT
GCTATCCCATTATAGAAATGTGTGCATGCTAAGTCACTTCAGTCGTATCCGACTCTCTGC
AAGCCCATGAACTATAGCCCATCAGGCTTCTCTGTCCATGGGATTCTCCCAGCAAGAATA
TTGGACTGGGTTGCCATTTCCTTCTCCTTGCATTAATTTATCTAATATTAGTATATTGAA
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GATTTCCTAAGTTTCTCTGATAAAACTGAGGAAACTGAGGCAGCACAATATAATAGCTGT
GTGAATTACTGCAAAAAAACTCATTCTGTGGAGCTCTTGGCAAGAGATTTAAGTGAAGTC
AGGTTGCATGATGCATCAGTATAAAAGCCTCAGAAGGACAAATAGAATACAATTTTGCCA
GAATCGCTGTAAAGCAAAGTTTTAGAACTGCTTTTAATAGAAACTGGTAGAAATTAAATC
GGGATTAATTGGGGATGTTGTACATGCAAAAGCAATTGGAAATAAAGCAAAGATGTTGCT
TTATATCTAATGTTGTCTTCTAGAAGTAAAGCAAGATGTTGAAGCAAGTTCAAGGTGTGC
AATCTGACTGATTTAAAAAAAAAAAAAGGAGGACACAGAACCAATTGTTGAAATTGCTGT
GACTTTCTTGTGAGTTTGATTAATTTAAGAAAATAGAGTGATCTTTAACTTAGCAAGTAA
CCATTAGCAATAATAATAATTACCATTTTTTGAGCACTTGGGTGCGTTGGACATAGTGCA
AGACATTTTTCATATATTAATATTCATTCTTACAACAATCTGGCAAGGGTTTTCCCATTT
TATGTAAGTGAAAAGTCAGTCTCACTGAGATTAAGTAACCCAAACAAATTTCCACAGCTA
GTAAGTGGCATAGCTGGGAGCTGAACAACCACAAACAAATCTTAATGCAGAAGTCTGGAA
ACAGTTAATCATGTCCATTCAAAAGCAATTTTTTCCAGGTACAGTATGTTCCTGGTTTTA
TATTGTATATGTATAGTACAGGCAAATTTTCTACTGACAATTATTACTAGTTCATGTTCT
GGAATTAAATAGGTCAGTTGTCAGTATTCTACCAAACAAGCTTGAGCTCAGCTATAAAAT
GATGAAGAAATTAATTATATGTCTTAAATTTATAATTTTAAAATGAATTTGACTTATGGA
TTGAATTTTATTTTCACCTTTATTCAGGTTGTTGATTATTATAATCTTAAAAATGCACTG
TTCCAGTATCATTTGACAAAGTAACTTTGAATATAAGATTACAATAAACACTTTAAAGTT
TAATAAACATGAATAATTTTCTCTTTTCCCTTTTAGTTTGGGATATGGGCAGATCAGCTT
GGGGATGGAAGAGCCCATCTTATTGGAATTTACATGAACAGGTACTGCATGTTTTCTTGT
AGAATAGCTTTTCTGCTAAATATTAACACAAATCTTCTAATTATTAGTTTTTTTTTTTTC
CCTAAGGCAAGGTGAAAAATGGGAGCTGCAATTAAAAGGCTCAGGAAAGACCCCATATTC
CCGGTACATTTTGGTTTTGTTTTTTTTTTTTCTTTTTTAAATTTTAGTCATCTAAGTAAA
AATTAATGTTATCTGAATTATAACTGAAAATCTTTTTTATCGTTTTACCCATAGAAATGG
CGATGGCAGAGCCATCCTTCGTTCCTCTCTGAGAGAATTTCTGTGTAGTGAAGCTATGCA
TTATCTCGGAATTCCCACCAGCAGAGCTGCAAGGTAATTCCTTTCCTGTAAGCTAACTTT
CAGCACTGCGTCACATTACCTTCAGAAACACATCAGTGAAGTGAGCAGATAAACCCCCAA
GAGCGTGACTTCTCATTATTTCTTACAGTTTTCAGTTCAGTTCAGACACTCAGTTGTGTC
TGACTCTTTGCGACCCCATGGACTGCAGCACGCTAGGCTTCCCTGTCCATCACCAACTCC
CAGAGCTTGCTCAAACTCATGTCCATTGAGTCAGTGATGCCTTCCAACCATCTCATTCTC
TGTCATCCCCGTCTCCTCCTGCCTTCAACCTTTCCCAGCATCAGGGTCTTTTCCAATGAG
TCAGCTCTTTGCATCAGGTGGCCAAAGTATTGGAGTTTCAGCTTCAGCATCCGTCCTTCC
AATGAATATTCAGGACTGATTTCCTTTAGGATGGACTGGTTGGATCTCCTTACAGTCCAA
GGGACTCTCAAGAGTCTTCTCCAACATCACAGTTCAAAGGGATCAATTCTTCAGCACTCA
GCTTTCTTTATGGTCCAGTTCTCACATCCATACATAAATAGGTATAGCTTATAACTTGAT
AGCTTGCTAGCAGTTAAAAGTATAACTTGGATGGTTCTCTTACCTTTCAGTCTGGTTGTG
AGTGATGATGTGGTATGGAGAGATCAATTCTACAATGGAAACCTTACAAAAGAACGAGGT
AAGACAGTTCTTAGAATGCTTACATAAAATCACTAACTTCTTCGGGAATAACAGATATTG
GGCATCTCAGCAGTCTTCGTAAAACATGGCCTGTGGGGACTTCCTGATGATTTAGTGGTT
AAGACTTCGCTTTCCAGTGCAAGGGGTGCAGGTTCAATCCCTAGTTGGGGAGCTAGGATC
CCACATGGCTTGCAGCCAAAAAGCCAAAATATAGAAAGCAATATTGTAACAAATTCAGTA
AAGACTTTAAAATACTAAATAACAAAAGATCAAAAACTTGAGCTGTGGATCGTCATGATT
TAAGTTCAGGGTTATGATATTATAATAGAATATCCTTTCTCATATGCTTATATCACTAAG
CCATCCTTTTGAAATAGCAAAACATCTGGGAAGTGAACATGGGAAATTCATGGACAACCA
ATACAAAACATCCCAGAACGTCACAAAGCCAGTGCACCAACATTCATACACTTCCTTCCC
AGAAGACGCCCCCAACCCCCAATTGCTCTTACTTCCTGTTTACTTCCAGTAAGTTTGGTT
ACCTTTCCCTCAGCTGTTAGCAGGTCAGAAGTAAAAAATCAGAAAGTGCCATAGAGCAGT
AAAAAGAGAAAGAGCAAGGGAAACCTTGTCTCTAAATCTCTGGCGAGGGAGGAGACCTGA
AAACCAATAATAAACATATTTAACTAGTTATAAAGCAGAGCTATTGAGAACGGCTGACAG
CATTACTTGCTTTATTAGGTAAAGAAAGAGATAAAAGCCTTGGCCCTTTGTAGGATGTAA
ATTAATTGTTTTTCTGATAAATTCAATCACTCTATTTTTTATTAAAATAATTTCATTTTT
AAGAAGAGCATGTTATGCTGTATTTGCACTGTTTAAAATAGTTTATGCTAAAATAAATGT
TTCTTTTCCAGGCGCAGTAGTGCTGCGTGTTGCAAAATCCTGGTTTAGAATTGGATCATT
AGAAATTTTGACTCATTCTGGTGAACTGGATTTACTAAGGTTAGAAAACCACTTTTGTTT
TTTTTTTAATGGTAGAAGACAGTGGAAAGAAATGCTTGTTTATGTGCTGTGAAGTTAAAA
TATTTTTGGTTTTCTTGTAAGACTTCAAATTTCAATTAATAGATATTTTTAACATCTATT
AGATACGTGTGTGTCTACTATCCTGTGGGTTTCTAGGAGGCTGAAAAAGATGTGTTTAGA
CTCAGTAGACTCTCTTCTCAAGAAGTGTTTTTATCTAGTATGAAACCCAGTTGGAACTGA
GGGCCTCTGTGCCACCCAGACACCAGGTGGAAGCAACTCGAACTCCTGAATTCTGCAGCC
TCACGAGGTTCCAGAGCTCTCCTCCAACATCAGGGGTTCCCAGGATGAGTGCTCTGGCTC
ATGTGTCTTCTTTCCTGGGCTCCAGTTTTGACATGTGTGTGATGCCTGTTACATACTGGG
TTGACCCAGTCCCTTCAACAGGGCGAGAGCAAACAAACGGTAGACTGAAACTGCACACAG
CATTTATGAACAAATCTTACTGAAGATTTCTTCAGGTAAGACAGAGGAACAATGCCCTCA
AAAGATCAAAAGCTCTCCCCCTTGTGTCACGCAGCGTAGCTTCCACCAAACTCCAATGTC
TTGGGGCCTACGGAATCAGCACTCACAAAATTCTGTCTTCCTCAAAGCTGACTTAGCAGG
ATGTTTCTTCAAACACAAACATTTCCTCCTTTAAGAGGAATTCTGTTTCCATTTGTTAAG
ATCATACAGTTTTAAAAAGCCACTAGAAATAATATAAGAAAATTCTCTTGGACAAACTAG
AATCATTTGGATCATGAATCCTCACTGTAGTTATCAGCTTGAAAGTGAAGTGAAAGTGAA
AGTCCCTTAGTTGTGTCCAACTCTTTGCGACCCCATGGACTGTAGAGTCCATGGAATTCT
CCAGGCCAGAATACTGGAGTGGGTAGCTTTTCCCTTCTTCAGGGAATCTTCCCAATCCAA
GTATTGAACCCAGGGCTCTTGCATTGCAGGCGGATTCTTTACCAGCTGATCCACAAGGGA
AGCCCAAGAATACTGGAGTGGGTATCCTATCCCCTCTCCAGCGAATTTTTCCAACCCAGA
AATCGAAAACCAGGGTCTCCTCCATTGCAGGCGGATTCTTTACCAACTGAGCTATCAGGG
AAGTTATCAGCTTAGTAAGTCCAAATTCCTGGTCCACGAAGAGTATGGGGAGAGAGAAAA
GCAGAGAAGTCATCACCATTGTCATGACTCTTCTCCCAAGTCTCTTTAGCAAGTGTTTAC
TGGACTCAGTGGTGCTGGAGAAGACTCTTGACAGCCCTTTGGACTGCAAAGAGATCAAAC
CATGTCAATCCTAAAGGCAATCAGTCCTGAATATTCGTTGGAAGGACTGCTGCTGAAGCC
GAAGCTCCAATACTCTGGCCACCTGATGCAAAGAACTGACTCATTGGAAAAGAACCTGAT
GCTGGGAAAGATTGAAGGCAAAAGAAGGGGACAGTAGAGGAGGAGATGGTTAGATAGCAG
CACTGACCTGGTGGACATGAATTTGAGCAAATCCCAAGAGACAGTGAAGGACAGGGGAGC
CTGGCACGCCTCAGTCCATGGGGTCTCAAGAGTCAGACTAGACTTAGTGACTGAACAACA
ACACTGAACTGAGGGTCATCCGAGCTTATTGAGAGAGGAGTCTCCTCTCAAAGGGCGCTG
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AATTGTTCCATCTGGTGTTCATACTTCAATTATATCTCACTTACTCACTCTGACATTTGA
TGTATACTGGTGACCAGTTTATCCTGAAAATGCCTATGTTGGCTACCACAACCATGTATA
TATTCCGTTTTGTTTCCCAAGTGCCTGAAGCAGGTCTCTAATCCACTCTAAATAAACTCT
AATCCACTCCTATTGTTTTGTTTTTTTTTTCACTCCTATTGTTTTGAATGGGTTTTAATA
ATTCCCAAATCATATCTGCAGTCCCCAGCTTTTTTTCAGGATTCTCTCTCATCCAGTGCA
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GCCTTACATGACCTTCTATACATAAATAATCATTCCCTACTCTGTTATCTTTGTCCTTTT
TATATATTTCTATGATTGCATGTATTAGACAGTGAGGTCATTATTTCTTTGGATGTTTTT
CTCCCCAGTAGACTCTGCTCTTTAATGTCTGGGTTTGGCTTTTGTCATTTTTCCTAGCAC
TTGGAGTTTCTCCATAGATGTTTGCTGAACCGATCTGAGTTGCATCATAAGATGGCATCT
AATATGATCTTAGAAACGTATTTCCAGTTGTGATTGGCATTGAGGAAATATTTCTCTGTG
GCTGGGCATAAAATCTTATTTAATTTTTAAAATGATAAGCATGCATTCTAATGAATTCAT
GAATGTTGGGAGTGGGCTGAGATGATTGATATTCGATACTGTATTCTGAGGAACACTGAT
GGCTATCTCCCCTTATCTCTAGGATGTTATTAGACTTCATCATACAGGAGTACTTCCCCT
TAGTAGATGTCAAGGAACCTAACAGATATGTGGTAAGTTTGTTTTTAAAACAAAGGGCAA
TACTCTTTTTCTCTATTGCCTGGCCACCATCAAGGTTACAACCTAGCGCTTAAAAAACTA
AAGTTAAAAAGGAAAACGTAGAGCACTTTGAACATGTTGTGAAAGGAAAAGATGATGAAC
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CAAAAAAGCAAAATGGCTGTCTGGGGAGGCCTTACAAATAGCTGTGAAAAGAAGAGAAGC
GAAAAGCAAAGGAGAAAAGGAAAGATATAAACATCTGAATGCAGAGTTCCAAAGAATAGC
AAGAAGAGATAAGAAAGCCTTCTTCAGCGACCAATGCAAAGAAATAGAGGAAAACAACAG
AATGGGAAAGACTAGAGATCTCTTCAAGAATATCAGAGATACCAAAGGAATATTTCATGC
AAAGATGGGCTTGATAAAGGACAGAAATGGTATGGCCTAACAGAAGCAGAAGATATTAAG
AAGAGATGGCAAGAATACACAGAAGAACTGTACCAAAAGGATCTTCACGACCCAGATAAT
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AATGCCAAAGAATGCTCAAACTACCGCACAATTGCACTCATCTCATACGCTAGTAAAGTA
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AGTGAACTCAGGGAGTTGGTGATGGACAGGGAGGCCTGGCGTGCTGGGATTCATGGGGTC
GCAAAGAGTTGGACACCACTGAGCGACTGATCTGAAGTGTGACTACATCCTGACTACATA
TGTTGTTTTTTGTAACTTGTCACATATATTCTTTTCTCACACATTTGATATATAGATATT
TCTATAGTAGTGGCTGTAAAAAAAAATACATACATCATATGCAAATGAGATTTTCTATTC
ATATGGAATTTTGATTTATTCATATGGAAATTTTTTGATCTGCATAATCTTTTTCTTTTA
ACAGCTACAAAGAAATTCCATTATTTTTCTTGGTGACTTATTTCAAAGTTTAATAACTCA
TTTTGTTTACATTTAACTCCATGTTTACATTTAACTCAGCATAAAACTTTATGCTGAATT
CTAATGTTTTTCCTTTTCTTACTGTGCATGGAGAAAATCTGATCATAATACTGTGCCTGA
GCCTTTTATATGTTATTTCTGGGTCAATAATTCTATGTTCTTCCGTTGTTTTCTTACACG
TACTAATTTCCATCCCTTTAATCATCTTTTGGCCCACCTTTGAGGGGATCTTTCCGTGTT
GGAAACAGAAAGATCCTAAAAGCATAGACACTACTGAGGAGTCTGAAAATTTTCTAAATT
TTATTTTAGGATTTCTTTTCTATTGTGGTGTTTGAGACGGCACAGCTCATTGCCTTGTGG
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TCATGTTTAAAATGATTTTGAATGGAACAGATACACAAAATAGAATAAGCATCCTTGATT
TGATGGGGGTATTGTTACCTGTAAAGCTTTTTACCCTTGTGAGTATATATTATATTAGGT
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TTGATCTTCCAGGATCATTAGTAATGATTTCATCTCAATTCTTCTAGACTTTTTTTGGAT
GGTATTCATACATCTATAAAAACAGGGCTGGCTTGTGTGTGTTGTAAGCCATTCACTGTG
TGGGGTTACACTGGAAGGAATATCTGCCTGAACTGAGAATGCTATGCTATGCTAAGTTGC
TTCAGTCGTGTTTGACTCTGTGCAACCCCATAGACGGCAGCCCACCAGGCTCCCCTGTCC
CTGGGAGTCTCCAGGCAAGAACACTGGAGTGGGTTGTCATTTCCTTCTCCAATGCAGGAA
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CAGCCCACCAGGCTCCTCCGTCCATGGGATTTTCCAGGCAAGAGTACTGGAGTGGGGTGC
CAAAAGCAAATCATATATATACTAAGATCTCTGGCTAAATACCAAAGAGGGTTCTCACGT
TGCAAAACCTCTTGAACTCTGCCTTAATTACATACTCACTATGTCTCACTTGGGATGGGT
TGGGGTGGTGAGCAGGGAGGTGTTTCAGAGTTTTTGCTTTTACGAATTATGCTGCAGTGA
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GCTGGTATATGCACGCCCAGCCTCCCTCCTTCCCCGCACTCTGCCATGACCCCCTCCCCT
AGGAGGTCACACTCCCTCCCCACTCTGCTGGTGGTCTGCAGCTAAGGACTGTTAGTTATG
GGGTACATGGATATGTACCAATATGGATATTTTTACCTTTCCCCCACTCTTACAACTTTT
GAAACTTAATGTTACTTTAGTAGTCTCAGTTGCATTCCAAACTACATATATTTTCAAATA
AATGCTAGAAATTCAGGACAAATGAGAGGAACTTTTATTTCTTGGGGCTTTTATTCCTGT
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TACAGTTTTAATATATATTAAGCTACTTGACTTCACCAGTTAAACTTTCAATTGATAAAC
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TTATACAGTTAAAAATGCTTTATTATTTTATTATCATGCTTTTGGCATTTTGTTGTTGTT
GTTAGGTGTTTGTAATACTGATAACTTCAGTTTGTTATCCATTACAATTGACTATGGTCC
ATTTGGTTTTATGGAGGCCTATAATCCA
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