SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000325_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesCallithrix jacchus (Marmoset)
Transcript IDSPT00000325
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000228_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000325_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Marmoset (Callithrix jacchus) # Full length # Reverse
TGTGTAATTAGAATCAGAGTGCTCTTTGATGAGTGAGCTGCAGTTGCTGGACTTCTGCTG
CCCATGACTGGCCTGCTGATCAGCAGTCCATGCCTCACTGTCCATCCCTGGCTCCAGCAC
CTCAGGCGCCTCTGCTTCCTCTTCTCCACTTTGCTCTACATTGTCTTCCTCAGAACCATT
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CCATTTTTTGTTATACTTTTTATTCCTATTATCTGTAATAAATACCTCTACTGTTTGTTT
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TGCTTTAGGATTCACCTACATAAATCTTTTCCACTACTAAAAAAGGAAATGTAATACTCA
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TGTTCTTGTGTCAGTTTGCTGAGAATGATGGTTTCCTGCTTTACCCATGTCCCTGCAAAG
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TCTTCTTGCGGAGTAACTTTTTGGTGTTCTCAGTATTTCCTGAATTTGAATGTTGGCCTG
TCTTGCTAGGTTGGGGAAGTTCTCCTGAAGTGTTTTCCAACTTGGTTCCATTCTCTGCAT
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GGAGGCTATGTTCCTTCCTTTTCATTCTTTTTTCTCTAATCTGGTCTTCACGATTTATTT
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TGTTCTTCTCTAAACTGGTTATTCTAGTTAGCAATTCCTCTAACCTTTTTTCAACGTTCT
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TTGCTGGTGACAAGTTCCGATCCTTTGGAGGAGAAGAGGCATTCTGGTTTTTGGAATTTT
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TTTGATGACCTTCAGATGGGGTTTTTGTGTGGACATCCCTTTTGTTGATGTTGATGCTAT
TCCTTTCTGTTTGTTAGTTTTACTTCTAACAGTCCCCTCTGCTGCATATCTTCTGGATTT
TGCTGGAGGTCCACTCTAGACCCTGTTTGCCTGGGTATCACCAGCAGAGGCTGCAGAACA
ACAAAGATTGCTGCCTGTTCCTTCCTCTGGAAGTTTCGTCCCAGAAAGCTACCCGTCAGA
TACCAGCTGGAACTCTCCTGTATGAGGTGTCTGTTGATTCCTGCTGGGAGATGTCTCCCA
TTCAGGAGGCACAGGGGTCAGGGACCCACTTGAGGAGGCAGTCTGTCCCTTAGCAGAACT
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TTTACTGAAGCTGTGGCCACAGCTGCCCATTCCCCCAACTGCTCTATCCAAGGAGATGGG
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TAAAGAGATAATAAAGATGCTTCTCGTAGGAAAGAAATACAATTTCTACCTGAATGTCCT
ATTACCACCAATTCCTCCTCTGAGCTTGAATAGATTTCTGGGCCCTGGCTTTCTCAGTCA
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CTATGGAGGATGAACTCAATAATTAAACTGAAACAAAAATCAAAGAGGTTGTGAGGTAAA
AATCACATGCCTTTACATCACACAAAGCAAATGAATAGGGCTCTCTGTGAGACTATATAT
TACTATAATGTGAGAAACAGAAAGGCAGTGTGAGGCCACTACAGTACTTAATTCCTGGGA
TAAAGAAGTCATCTACGACCGGGCATGGTGGCTCACATCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA
GGCTGAGGCAGACAGATCACCAGAGGTCGGGAATTAAAGACCAGCCTGACCCACATGGAG
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CCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGAAGGTGAATCACTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAG
TGAGCTGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCTGTCTCAA
AAAAAGTCATCTAAGTATATACTTCTCATGTATACTCTTTCCATCTTTTCTAGTAATCAT
CCCTCATGTCTACCATACGCAGGCACTTAATAAGGAGAATTAGTATCATTTCTTATCTAT
GAATAACCAAGGCAAGCAAATTTCTACTTTCAAATTATATTATATAGTGGGAAAACTTGT
GCCTGTTCTTCTTTGGAGCAAAAAGTTTATCAGGAGAATTTTTTGTGATTCTGTGGAAAA
TGCTTAAGTAAGTACAACACTACTTCAGAATATAAAAATGGGGACATATGCTTTAGGAGG
TTGAGGATTCTTTAAAGAAAAAAAATGGGGCATTAAGGAATGTTTAACTGTCAAAGTAGG
CAAAACTGAAGAATGCAATCAAACACTAAAACATCCCAAAATGCAATTTTCTTCATTCTT
TTTTCCTTCAAGCTGTTCATTTCCTACATATGAAACATTTTATCCCCCAAGTGTTTCATT
TGCTCCACATCTGTGATTTGACATTTAATTAACTTTCCAAAGCTAGGCAAGAAGTAATTT
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TCATCAACATAAATGTTAAAATCTTAAAATCCTTCACAGTAATAACTGTTAATAGCAACT
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ATTCCAGAACTAGCAGGAGAGCCTTGTGACACAGGTGTCATACAGTATGGAGAGTTCTGA
CTTGCTGGAGAGAGCGAAGTATCACTGGGCATGCTCAGTCCAGTATCTGTGGAGATGCAG
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CCATTGTCTTTTGGGCCTTTTCCAAATTTTTCAGAAGCTAATAAGCTGGGTATTTTAATT
TTTCCTTTTCTTTCTCTATCTGGTCTTCCTTTGTGGCATTTTTCTTATCACAAATAAACA
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