SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000341_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein K (SelK)
SpeciesCallithrix jacchus (Marmoset)
Transcript IDSPT00000341
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000244_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000341_2.0 # Transcript # Selenoprotein K (SelK) # Marmoset (Callithrix jacchus) # Full length # Forward
ATGGTTTACATCTCGAACGGTGAGTTGAGGGCGGGCTGTGGCTTCGACCGCTGACCTGGA
AGGTCGAACCCTGGGTTCCTTTCATCGTCGTTCGCTGAGTCCTGGGCCCGGTGCGGCTTC
ACTGGACTTAGTGCCCCAAGGCCGGGCGGAGCTACGTGAAGTCGCCGCAGTTTGCGGCGC
GTCAGCCGATGGTCTCCGAGCCGGCAGTCGGGGGCCGAGGTCCCGCTGGCCTCACGCTGA
GTATTGGGAGCCTAGCAACCCCTCCTTCGTACAGCACGCGTTTGATTGTGGATTCGCGAG
GGTGGTCTTTCCTCTCGGGCGTCGGTATCCTTAAAACGACGTAAGGATACCGACGTAAGG
ACAACGACGCAGACGCTGTACACGTAGCGCTTGTGCTCTGGGCACTGTTTCAGTTATTTC
CTTATCGTCACATTCAATCATGTTTTACGGGTGGAAAGCCTGAGGCGCAGATAGATTAAA
TAGCTTGCCCATGATCACAGAGTTAACAGTTAATGGCTGAGTCGGGATTCGAACCCAGGT
AGGCTGTCGTCAGCATCCTTGCTATCGATTATGCTGCCTCTTTCTACAACGTTTAAAAAG
ACCGAGCCGACCTAGGATGGTAATTAGATGAAAGCTTTGCATAGGCTTTTCCCCCAGGAG
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TGGATCACTGGAACTAGGTCTTGGTTCTATTTGAGTCGTCTGTTTTTCTCCAGAGACGAG
GAAGGTAGCAAGAAGCATTCTGGCTAAGCGCACTTTTGTATTTCTTGACATTTCAAAATC
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GTGGCGCACGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACC
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AACAGCGAAACTCCTTCTCAAAAAAAAAAAAATTCTTTGAAACGAGTAGATCAATGGACA
CTACAGAAAAGCATCAAAATTTCATCTTAGTTTTAGGCGCTTTCAGACTTGTTTGTTTTA
GAGCCTGTTTTATAGCCTTTTTGATGAAAGCTTAAGGCTGGAAGCTTCTGTATGAATTGT
TGAATGATTCCTTGTATTTGTTATCTTACCGTGTGTTCATTATTTTATTTGGTCCACAAA
AGTAGCCGATTAGGGCCCTTTATCGCACTTAAGAGTTGAGAAATGGAACTGCATTCCAAC
ACCTTATTTCTCTCTCAGATATTGGTGGAAGGGAGATTCTGCCTCCAGAAACTAGGAGGG
AAAGTGGAAAAGCAAGATAGAATCACAGGAAGAAATGACAGTTTCCAGTTAGATACACCT
TCTTAGGGTTGTATTATCAGCACTTAATGAATAAAATCTTTTTCTTACTATCAGATGACT
TTTGTTTTACAGCAATCTTATGTGATGTCTAGCCCTGGAATACTTTTTGTCGGAGAAGGA
AAAATGTCACATCAGCCAACTAGCAGAGCTAGTAAGAGACAGAGAACTAAGCCTGTCATC
CACCCTCTAACTTTTGTAGCCCCTTGCTCTCAGTAGCACAGTGAGAGCTTAGATCCAAGT
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AGAAGTGAGTGGGGTGAAGAAGCCCTTGGGATAATGGAAAGGAGAGGTAGTTGACGTTAA
TCTTCCCCCCAAATATTCTGATGTCTTGATTAGCAAAGCTGAAATTACAGTGTACCAGCT
TATGTTGTAGCATCTATTAAAGTGATTTGAAAAATAGATCCAGTTTGCTTAAGATAAAAC
TAGAGTCTATTATTAGAAACAAGAGTATGCTATTATAGAAAATGTTGGTTATTTTAATGA
GGAACAAGCCAAATTCCCTTCAGTACTGAGAGCATACACACTCTTTAATTGGTAAGAATT
TTATCAAAATAACCAATTCCAAAGTCTTGTAAGAGTATGAATAAGTGATCTTTTTATATA
GGCCAGAGACTTTGCAAATGAAATACTCAACACATTTAGGAATATGGAAGTGGTGTGAGC
ATTCCTTTATATTCACCCGCCCCATTTGTTTCTTCAAAGTAATTGAATAAAGAGATATTT
TTACACCCACGTAGATAGCAGCATTATTCACAGCCGTCAGAAGGTGAAAGCAACTCAGAT
GTCCATCAACTAAACAAAATGTAGTATATACATACAAGGAAATATTCAACCTTCAGGAAG
GAGATTTTGACACATGCTACAACATGGGTGAAATTTGAAGACATGCCAAGTGAAAAGCTG
GTCACTAAATGACAAAAATTTTACAATTCCTTTTTTGAGAGGGAGTCTCGCTCTGTCGCC
CAGGCTGGAGTGCAGTGGCTAGATCTCAGCTCACTGTAACCTGTGCTTGCCAGGTTCAAG
TGATTCTCCTGCCTCAGTCTCCCAAGCAGCTGGGACTACAGGCATGCGCCACCATGCCTG
GCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGCCGGCCAAGCTGGTCTCGA
ACTCCTGACCTTGTGATCCACCCTCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTATGA
GCCACCGATTCTTTTATGAGTTCCTAGAGTAGTCAAATTTGTAGGACAGAAAGTAGAATG
GTGGTTGCTGGGGCTGGGTGGAGAAGGTAATGGGAGTCAGGGTTTAATGGGTACAGAGTT
TCAGCTGGAGAAGATGAAAAAGTTCTAGAAGTGGATGGTGGTGATGGTTGTGCATCAATG
TAGAATGTACTTGATACCACAGAACTGTACTCTTTAAAATGGTAACCATTGGTAACCATT
GCTACATTTTTTAACCATGGTAAATTTTTGTTATATATTTATAGAAAGAGAGAAAATACT
TAAATAAAATGAAGTCACCAACCAAGATTATAAATTGCAATAGGCTTTTGACATACTAGA
AGAATGTCCCTAGATAACATGGAACATTACTTCTCTGAACCTTTCCTTAGAATGATGCTC
GGATTTCTTCTGGTGTTGGCCATTTGGAACAATGGGCAACCTGAAACCCAAGTCAATCAT
TGTTACCTCACCAATTAAATGCAATGCCTCTTGGGTTAGGGATTGGTAGCACTCACTGAA
GTTTCTTTAATTCTTGTCTGTAGGACAAGTGTTGGACAGCCGGAATCAGTCTCCATGGAG
ATTATCTTTGATAACAGATTTCTTCTGGGGAATAGCTGAGTTTGTGGTTTTATTGTAAGT
ATAGAAGTGCTCTTAATTGTCCTGATATTTAAGTTGACAGGAGTATATTGTGTGCATTAT
GTTAGGTATCTTAAGTAAACCCAACTTTTCTGAAGCAGTTTTTTTATTGCAATTTAAAAA
ATAGCTTTACAAAGAGAAATAGACAAAGCTGCTACCACCAGACATCTTATGATTATGAAT
ATATGTTAGTTGGATTGGTAAACTTGACCATGTCTTAACCTTGGTGGTAACCATTTCAAC
CTATGGTTGGGTCTGTCCATTCTAATGCTAAATGACTGAGCCTCACTTTCTCTCTACTAT
TCTTGGCGGGGGCGGAGGGGAGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGC
GCGCGCGCGCGCATGCGCGCAACTTTTATTCCATATTATAAAATAAAGAGTTTTATATCC
TAGTTTTTAAAAATATTCCTAAGTAGTGAACTTTTTTATAATGAAGGGTTAGAATTGGTA
AAGAAGACAAATATTTAAATGTTTTCATAATTGTAAGCAGTTATTAAATGCATTTTTTGG
TCTTTTGCATGCTGTTTGTTAGAATTGTTCATTAACAATTAAGAAGTCTTACCTATTCCT
AAATTTGAACATATATTTCAGTGTCTCATGATCTGAGAACTGTAGGGGTTCAAAGATGTG
GGAGACAGACCCTTTTTTTTACTGACTTTACGATCAGTAAATATCCTCATGTGCACGGGT
GGGCAGGACTGTGGGAGGTGAAAATCAAAGGAAGTTATGCCAGATAAAGGAAACCAAATG
AAGGATGGCAGAGAAGTTTTGAGTATCAGGCTGTGGTCTTTATGCTTAATTTGATCTTAG
CTGTGGTTTAGAAAGTTTAATTTTATGGCTGTATATAGCATAAATTAGATGGCATAGAAT
GTAAAATGGAAGAGATGTTTCCATAGAAAAATACAAGGCACAAGAGAGGCCCTGAGTTAC
CCAATGTAAAACTTAGTCTTTTACATACAAATTTCACCTACTCCATGTTGTTTATAAAAA
TACTTTGTAACCTCAGTTAAATCCATGTCATTTTACATATCACTTTTTAAAAATTCCATT
TAAATGGATTCCCAGAAGCCCTGTGCCTCTGCCATACCACCCTCAGTGGTATGGCATACC
TCCTTCCCCAAGATGTTAGGTAGACTTTTGCAGTGGAAATGAACATGAGACGCTGTAAAA
ACCTGATGGCTGATTTAAAGTGGAGGTAGGGGATGACTCTGGTTTCATGCTTTGTCTAGG
GGAGTTATTAGCAAATAAGAAATACAAAGAAGGGTAGATTTGGTGCACAACATACCACAT
TCAGCTTATGGACACATGCTTAAGTTAGATGGTATGGTCCAGTTGGCTACAAGAAATGTG
GGTTGGGAGCTAAATGGGTTTATAATCCTCTCATAGGGATGACAGTTAAAAACCACAGAA
ATATATTTAGAATGTTGTCAAAAGTGATACCTTTGTTGTTTCTGCCCCTTGTTTCAGTTT
CAAAACTCTGCTTCAGCAAGACGTGAAAAAAAGAAGAAGCTATGGAAACTCATCTGATTC
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TTGTATATCTTGATTAAATTAGATATTTTAGGTAGAGTTAGATTTGTGGAAAGCAAAAGT
TTAAATTCTATTTTACAAAATTATTGTTATTGTAAATTAAAAGTCAAGTTGCCTCTGATT
TGAGAATAATCAGTTAATCTGACAAAGCTAAAATATACATAAAATATCCCATGGAAAAAA
GTCTAAATTAGAGGATGAAAAGTGATGGCCAGCATTAAGATCTAAAGACTTCATTTTAAA
ATCTGGATTTCCAGTTGCTAATTAAAAACTTAAAAGATCAGGTACCACTGGGCTAGGCTT
ATGTTTCCATGAGGCAAAAATCAGCTGGAGCTGGATTTCAGGGGGTCATTACTGGAGGTG
CTGTTCAGTTCATCACAGTCCTTTCTTGACTCAGTTCCTTGTGTACGATATGTGTTTGGT
CCCTTTAAGTGTTTGAATTTTTGCCTCCTGACCTAAAATGGTAGTTTTTATTTTAAATAA
TGTTTTAGTGTCATGCGGGTGCTGAAAAAGAATAGGGTCTAGTTGAGTGCTTTTGAAAGG
ATGCAGTTAAAGTCGTGTCTATCAAAAAGTAGTTACTTTTTATTTTGTTAGGCCACCAGG
AAACCCTCCCCGAAGAATGGGTAGAATCAATCATCTGCGTGGCCCCAGTCCTCCTCCAAT
GGCTGGTGGATGAGGAAGGTAACTTCAGATCTGAAATAATTTTGTAGGATTTTGTTTTGA
AAATGCTTCTATAGTAATGTATTCTTTAAGAAGTTACCCAACAGTTTATAAGTACTCAGA
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TGTGTTTTGAGAAAGGTTTTATAACATGTAATATGTTTGGCTTTTCACCCAGATCCAAAT
TAATAACCAGTAACCAATTATTATAACATTTTCTTTTAGGTAAATGTCTGCTCTAAGAAG
CAGACAACTGGACATGTGCATTCATAGCAGAAGGAAACCATCAAGAAGTGGAAGGCTGAT
CATGCTGAGAAGTGATGAATGTGTATGTCTAAACAAGGACTGTTCTGTGTCCTCACAGAT
GAATGACGTCATGCCAGGAATTCCCTCTGCAGGGAACTGGCCTGACTGACATGCAGTTCC
ATAAATGTACATGTTTGTCTCATTACCTTTTTGTATAGTTTATTAATAAGTAAATTTTTA
GGTTGCACAATGGACTCCTCATCTTTATATTAAATTCATGAAAAAACTGAAGAAAATTAA
AGCCTGTGTATTTAGCACTGTTAGTGTCACCTTTTCAACTTCTGAAATACCGTTCATTGT
TAACTTTTTCTCATTTATAAATCACATTGTATTTATTTTGGTAGTATGCATATCATCTGT
GCTCTTGAATTAATTTTTTAATATATTTGTCTCATGAATCTTTAATACATTTTGTCTGAT
TTGCTACAAAATATAATGATCCAGGGTATTTATAAAGTCATAGCTAACAAAACTGAGCTA
CAAAAATGAAGATTTACTACATAGTCTTTAAACTCTTGGACTTGGGTCAGGTGTGGTGGC
TCACGCCTATAATCCTAGCACATTGGGAGGCTGAGACAGGCAGATTACTTGAGATCAGGA
GTTCAAGACCAGCCGTACCAACATGGTGAAGCCCCATCTCTACTAAAAATACCAAAATTA
GCCATATATGGTGATGTGTGCCTGTAATCCTTGCTACTCAGGAGGCAGAGGCAGGAGAAT
TGCTTGAACCCAGGAGGCTGAAGTTGCTGTGAACACAGCACTGCACTCCTGCCTGGGCGA
CAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAATAATAGTAATAAAATAAAATCATGGTCTTCAATG
TTATCTTGACAAATTTGAACTCTATACAGCTGCTCAAAATACTGCCTATTGGCTTTAAAC
TCCATTTTAATACTGATAACTTTCACTTTCTTTCACTAGAATGGAAGCTCTTAGACTAGA
AATTTTGTTGGCAGTCCTTTGAATAGTGATTACATGTGAGATAGTCATGTAGTATTTACT
GGAAATAAATATTGGAAAAATGAATACAGATAATTCTAGTGTTTAACAGGCTTTGAAACC
AAGTATTCAGGTGAAAGCCTTTTTATATTGATTTATCAGCATTTATTCAACCCTGTTTGT
CAGGAAATGGGATATTGTGGCATAAGATACCAGTGTTCAGGATAAATTATAATGCAAGTT
TCAGGATAAGGATAACAGTTTGTTGGCCACTTCAGTTATGTATCAGATTTTTTTTCTGGT
GACAGTGTCTCACCCTGTTATCTAGGCTGGAGTACAGCGGCTGCTCACTGTAGCTTCAAC
CTTTTGGGCTTAAGTGATCTCCTGCTATGGCCTCCCAAAACGGTGGGATTACAGGTGTAA
GCCACTTTGCCCAGCCTGTAATTTTTTATACATTTTAAATTCTGACAATGGGAGGTATAT
GTATAACGTATACATATATACAAAGTGAGGTAAATGTATAATGACATTTGCATTATACAG
ATACATGCAAGGGTTCAGTAAAGTTTGGCAGTTTCCTAGATTGTATGGCCAGTGAATCGC
AGAGGCATTATTAAACCTCCATCTGACTCTAGCAGGGAGACCATGGTAATCTCAGTAGGT
GGTTGGTTGGTGTTACTGATGGCTTTGCCCGAGCATCTGAACCATGGTCCTCCTCTACCT
TCTAACACTGCCACTGCTGCAGGACTTGTTCTTCGGGTCTTATCCCAGAGTCCTGGCTGC
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AGGAAATAGGATGATGAGAGGTTAACTGCAGAAGGCCTGAGGTGACATTTGACTTAGGAG
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TGATGATGGGAAGGGCTTGGCATGTCAGAAAGATAAACAAGTATAGCTGGNNNNNNNNNN
GGAGGAGAACCCTAACCCCCAACCTTCGGGAAGCCTGAACAGAACCATGAGGGACATACC
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ACTCAGCGGCGGCCATCTTGACGGTGGGCAGCCGGCCGTGCGCCTGCGTGGTGACCTTTC
CCGGCAGTCCGCGCTCGGTCGCTGAGGCGACAGTTTGGTGGGTGTCGGCGGCCACGATGA
CCCAGGCTGAGAAGGGTGACACGGAGAACGGAAAGGAGAAGGGCGGGGAGAAGGAGAAGG
AGCAACGCGGCGTGAAGCGCCCCATCGTGCCCGCGCTGGTGCCGGAGTCGCTGCAAGAGG
TGCAGCTCGGGGCGGGTTTGGGTTAAAACCCTGTACCCTTGCTTTGGTCCTCCGCTGCTG
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GGGAGTGCGGAGGTGGTCGTTCCTTCCCGGGTCGTGGCGCGCCGGGACGTCGAGGACTAC
TAGGAAGCGCGGAGCGCCAGGAATCAGGCGGAGCCCCCACAGGGAATCTGCTGCGACTTC
CCGCCCTCCTGCCCCACCGGCTGGCTGTGTTCGCTTCGGCCCGAGCTCTGGCCCCAGCTT
TCCCGACCATGAAAAGACCACGGTGATACCTGCCGCCCCGCAAGTTGCCATGAGGCTTAA
ATGGTGGCAGATAGAGTTTGGCACCAGGCTGGTTCACTGGGAGCGTCAGCCTGTAGTTGT
TAAGAAATCGTTCGGGGTTCAGGTCTTTTCCTTTGTTAAGGAAATTTCAGATAACGGAAG
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TGTGTATCAAAAACAACCCAATTAGTCCAAACTAAACTAATCAAAAAAAAGTATTTGCAG
TAGCATGCCAGGCAAAGGACCTTAGACGTATACATGCACACACACCCCTACCGATCAGTA
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GACATAAGGAGGCATAAATTGCTCGGAACTTCATGTAGGACATCTCTGAGCAAGCTTCCT
CACCAGTAGATGGATTTAGGATAATACCTAACCAGTAGGGCAGCTAGTTAGCTATCAGTA
GTGTGACGGTGCCTGGCACACAGTAAGTCCGGAGTGGCCATTACTATTGCACAGGCCTGG
TTTCTCCATCCATCTAGTTGAGAAGACTGCTTGGATGGTCTGGTCTATAAGGGCCTTGCT
CAATCCCTTCCTCTAGGTTTCTCCCACTCTGTCAGGGGTGATTAGGAGGGGAGAGTTCAC
ACTTGGACATAGGACAACAGGTATCAGAGCATGGCATGGAATGGTCTTGTGCAGAGGGAA
TTATTGGACCCTCAAGCAAGGGCCCTCAAACCCTCCATCCCTGACAGGGAGGGTTTCTTC
AAAGGAGGTGACATCTGAAGAGAGACCTGAAGGTGATTAGGAGCTAGCCACAGGGAGGGG
GGAATCTCAGGGAGGAAGAACAGTGTGGAAGAGACTTGTGCCAAGAGAAGATAAGAAGTG
TTGGAGGCACAGCCAGTGGATTACGATGTCTGGAGTTAAGGAAGAGGACTGAAGATCTTA
GCAGGGGCCATATCATGAGGGTCATGTAAGCCACAGAGTCTGACCTCTTGTGAAGGCAGT
GGATTACCTTGAAAGGCTTTACTGTATTAAGAGCCAGCATTCCTTGAATGCTTCCTGTGG
CCCAGCTCTGAGTTACATGATTAACTCATTTAAACCTCACAGTAACTGTGAGTTAGGAAC
TTTGTCCAGAGCAAGG
Chart Advanced