SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000366_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein W (SelW)
SpeciesCallithrix jacchus (Marmoset)
Transcript IDSPT00000366
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000269_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000366_2.0 # Transcript # Selenoprotein W (SelW) # Marmoset (Callithrix jacchus) # Full length # Forward
ATGGCTCTCACCGTCCGAGTCGTTTATTGGTAAGCGCAGCGGGCAGCGGCGCCCCTGTTC
CCGACCCCCTCTGGGACCGGATCCTCCGCACGCTCGGAGCCGGGGTCTGGGGGCGTCTGG
GCGAGGAGCCGTGGGGACCCCTCTGTGGGAAAAGCGATTCCTGCGTGGGTGGGGTGGGCG
TGCGGAGGGGCGAAAAGCAGAGGGCGGTGGTCCCCGGGCCGCCTCTTCGGCTTGTGACAC
GCTGGGCACCCGGCGTTCCAAAAGGTGGCGCTGAGACGGCTGCGTGTCAATTTCCAGCTC
CCGACTCCCGGGCTGCGCTGGGGGAAGGGGCTGGCGGTCAGCTTTGTAAAGGGACCTCAG
GCTCCTCCACCCTAAGTCTTCTCCTCCCCAAGTATCCAGAACAGTCGCGGGGTGGGGACG
GTGAGAGCCCAGAAGGTTCGAGAATGTCTCAGCCCGTGTTTCGAAAACACTTGAATTGTG
GGCCTCTGCCCAACGGTTTCCTTTGGCCACGAACCCCTCTCCGTTTCTGGCCTGGGTTTT
CCTGTCTGTGGCGAGAGGGAGGCTGCGCGTCGGCACCGAACACGTTTAATTTCTCCAAGT
CTCAGGAAGGATGTAATAGGATGGGATATAAATTACTTTACATTCTCCCCACTCCCCAGC
AGCAAATACTATGCTGGCGTTCACTTAGGTATTTAATGAACACATGTTCAATGAATTTAC
CCTCCCACAAATCCCTTGAGAGGGGAATTTTAGGCCAGGTACGGATCACGCCTGTAATCC
AAACACTTTGGGGGGCCGAGGCGAGTGGATCGCTTGAGCCCAAGAGTTCAAGGCCAGCCT
GGGCAATACAGGGGGATCCCCATCTCTACAAAAACTTAGAAAGTTAGCCGGGCGTGGTGG
CATGCACCTGTAGTCTCAGCTACTCCGGAGGCTGAGTTAGGAGGATCGCAGGAGCCTGGG
AGGTGGAGGTTGCCACGAGCTGAGAACGCAGCACTGCACTCCAGCCTTGGCGGCCGAGCG
AGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAGAGGGGAATTTTAGTTCTGTCTTACAGG
CGAGAAAACTGAGGCTGGAGCTGGGGTGGGGTCAGGTCAGTAGCTTCAAGTCTGGACTGC
AGGTGACGGGGGTAACTGGAACCCGGGTCTGCCAGCAGCTTTCGAATGTCTCTGCCTGCT
CGACAAAGCAGAGGCAAGAGTGACATTTTGAGACGCCCACCAGGCCTGTGCAGCAGATTC
CAGTCCCAAAATAGCCCGCTGTGGGGGTGTGGGGGTCGGGTGAGCTTGTATTTCATCCCG
GGGACTGGGAAGGTGTTCAGAATCCTGGAGCCGCTGGGCCGTGGCTCCTGCCTGTAATCT
CAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCTGGCTGATCCCCTGAGGTCAGGAGTTTGAGAACAGCCT
GGGCAGCAGGGCGAAAATACAAACATTAGCCAGGCGTGGTGTAAGAATCCAGCAGCCGCT
AGGTTTTCCTTGGAGTGCTCCAACGGCTGTGGGTGGGGGCCGTGGGCACAGTGAGTGGGT
GGGGACATTTGCGCTGTTCTCCTAATCCAGTTCTCCTGGTTTTTCCTCTCTCCCCATCTA
TCTCACCCTTGTGGTGTCCCTGTCTCCTCTCTCTCCCCTTCTTCCCCTCCCCCTCTCCGT
CTCTTGCTTGGTGTTGGTTTTCTGTGTGTGTCTGTGTGTCCTGGTGCCACCCCGTGCTGT
GTCCCCAACACTCTGCCTGGCTGGTGCCATCTGTCACCACCTCTGCTTGGTCATCTGTGT
TCCTCTTTATTTCTTCCTGGCCCCACTTTGCTCCCCGCCACACTGCCTGTCTCTCCCCTT
TTCCGGATCCCCCACTTCACCCTCTCTCCCCTGGGCCCTGCTGTCTTGGACTCTTCCACC
AGTGGCGCTTGAGGCTACAAGTCCAAGGTAAGCAGGTGGGCCTGGGGGGTGGGAGGGATT
CCTGGAAGCTGGGGACGGGGAGAGCGCCTATCAGGAGGGAGGCTAACTGGTACGATGGCT
GCCGTGACCTCCCACCCCATTTTCAGTATCTTCAGCTCAAGAAGAAGTTAGAAGATGAGT
TCCCTGGCCGCCTGGACATCGTGAGTCTTGAGCACAGGCAGTGTTGGTCCCTTAGGCCTG
GATGGCATTGGGGGTGGGGGGTGTTAGGTAACCCCCTGGGAAAGGGAGGGTCTCCCCAAG
AGGATGTCTCAGCGCCTCCAACATCCTCTCTCCCTTCCTCAGTCCGGCGAGGGAACTCCC
CAAGCCACCGGGTTCTTCGAAGTAACGGTAGCTGGGAAGTTGATTCACTCTAAGAAGGTT
TGTCTGTCTGTCCGTCCGTCCGTCCGTCCGTCTGTCCTGCCTCGTTTTGGCGCTAGCGTG
GGTTGCAGCTGAGGTCGGTGTCTTGGTCCCAGCTCATCCCTTCTTTCTTCTTCCCCTCCC
TAGAAAGGCGATGGCTACGTGGACACGGAAAGCAAGTTTCTGAAGCTGGTGGCCGCCATC
AAAGCCGCCTTGGCTCAGGGCTAATGTGCCCTGAAGGCAGAGGTGAGAGGGAGGGGCCCG
CTAGACAGGGAACCACCCTTCCAATCTTCTCCCAGCCCCATCCTCTGACTCCTTGACCCA
GGGTGGAGAGCTTGGGAGATGAGGGGGACATATTGTGTCCCCAGAGCAAGCAGGGTGAAG
TTAGACAGAGCTGGGTGATGAAGGATGACAACTGAGATGGAGTCAGAGGTGTGCAGGGTG
ACAGCTGAGATGGTGATGGGTTAGAGGTGTGCAGGGTGACAGCTGAGATGGTGATGATGG
GTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGACGGTGATGATGGGTTAGAGGTGTGCAGGGTGA
CAGCTGAGACGGTGATGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGG
TTAGAGGTGTGCAGGGTGACAGCTGAGATGGTGGTGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGAC
AGCTGAGATGGTGGTGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGTGGTGATGG
GTTAGAGGTATGAGGGTGACAGCTGAGATGGTGATGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGAC
AGCTGAGGTGGATGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTA
GAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGA
GATGGATGATGGGTTAGAGGTGTGCAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTAGAGGT
GTGAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTAGAGGTGTGCCAGGGTGACAGCTGAGAT
GGATGATGGGTTAGAGGTGTGCAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTAGAGGTGTG
AGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGTGG
TGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTAGAGGTGTGAGGG
TGACAGCTGAGATGGTGGTGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGATGAT
GGGTTAGCGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGAC
AGCTGAGATGGTGGTGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGT
TAGAGGTGTGCAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGC
TGAGATGGTGGTGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGCTTAG
AGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGTGGTGATGGCTTAGAGGTGTGAGGGTGATCCACT
CTTCTCCATCTCCCGAAGTGCTGCGACTACAGGCGAGATCCTCTGCCTCGCCTATTGATT
TATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGATTTTCAGAAGGACTCCTCCG
CCTCCTGTATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTA
GAGGTGTGCAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTG
AGATGGTGGTGATGGGTTAGAGGTATGAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTAGAG
GTGTGCAGGGTGACAGCTGAGATGGTGGTGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGA
GATGGATGATGGGTTAGAGGTGTGCAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTAGAGGT
GTGCAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATG
GTGATGGGTTAGAGGCGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGGTTAGAGGTGTGAGG
GTGACAGCTGAGATGGTGGTGAATGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATTGTGGT
GATGGGTTAGAGGTATGAGGGTGACAGCTGAGGTAGTGATGATGGGTTAGAGGTGTGAGG
GTGACAGCTGAGATGGTGGTGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACATCTGAGATGGTGGT
GAATGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGTGGTGAATGGTTAGAGGTGTGAGG
GTGATAGCTGAGATGGATGATGGCTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGTGGTGA
ATGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGTGGTGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGT
GACAGCTGAGATGGTGATGGGTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGTGGTGATGG
GTTAGAGGTGTGAGGGTGACAGCTGAGATGGATGATGGCTTAGAGGTGTGAGGGTGACAG
CTGAGATGGATGATGGCTTAGAGGTGTGAGGGTGANNNNNNNNNNTTTTTTTTTTTTTTT
TGAGACGGAGTTTCGCTCTTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCGGCTCAC
CGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAGGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGG
ATTACAGGCACGCGCCCCCATGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTCAGTAGAAACGGGGTT
TCACCATGTTGACCAGGATGGTCTCGATCTCTTGACCTCGTGATCCACCCTCCTCGGCCT
CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCGGCCTATTTATTTAGTTTTTT
GAGACAGAGTGTCGCTCTGTCACCAGGCTGGAATGCAGTGGCATGATCACTGCTCACTGC
AACCTCCGTCTCCCGGGTTCATGTGATTCTCCTGCTTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATT
ACAGGCGCCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTAACTCCTGACCTCAAATGATCCACC
CACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGCGATTACAGGCGTGAGCCACCAACCCTGGCTGTTTTT
TTTTCCCCCCCAGACGGAGTCTTACTCTGTTGCCCAGGCTAGAGTACAGTGGTGTGATCT
CTGAAACCTCTGCCTCCTGGGTTCATGAAATTCCCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGG
GATCACAGGCACGTGCCACCACACCTGGCTAATTTCTGTGTTTTTCTGTAAGATGGGGTT
TTACTCTGTTGGCCAGGCTGGCCTTGAACTCCTGGACTCGAGTGATCCACCCGCCTCAGC
CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCGCGCTTGGTCCAACCAGGTCCAGTC
TGAGGCAGGACACTGCAAGGTCTTACAGGGGACCTCCCAGGAGCTGGGCAAGGCGCAGAT
CTTTGGCCGAGGTGAGCCTTCTCCTGCACAGTGATTAAACCAGGCAGTTGATGAGGAACA
CAGAGGTCCCTGTGGGGGGACCGCCTGATACCCAGGGGGACCGCCTTGGGTATCAAAGAA
AACAGTGTCTGTTGGCCGGGCAAGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGTAGGC
TGAGACAGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATGGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACC
CCATCTCTGCCAAAAACATAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGGGCACCTGTAATCCCA
GCTACTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGATTGAACCTGGGAGGTAGAGATTATAG
TGAGCCGAGATGGGGCCACTGCACTCCAACCTGGGCACAGAGCGAGACTCCGCCTCAAAA
AAAAAAAGAAAACAATGTCTATTGTTTAATAGGTCTCTGGAAACCAGATTTGACTATGTG
CGGGGGTGGCTAGCAAGGCTTTCTGTGAGGTCCGTGGCTGGCTGCCCCTCAGCACCATCA
CACCTGCCTCAGTTTCCTCATCAGAATTCCTCACCGCAGAAAACTGAGAACTAGGTTTTA
GCCAAACTCACTTTGTGGAGTTACAATTTCTTTCCCTCCTGGGTGTTTCATTTCCTTGTG
CCTCAGTTTTTCTCTGCATCTTAATTTTCCTCCGACCCTTCCTTATCCTTATTGTGTTTA
TTTTTTTGTTGTTTTGAGTTGGAGTTTCGTTCTTGTTACCC













Chart Advanced