SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000367_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein W (SelW)
SpeciesCallithrix jacchus (Marmoset)
Transcript IDSPT00000367
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000270_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000367_2.0 # Transcript # Selenoprotein W (SelW) # Marmoset (Callithrix jacchus) # Full length # Reverse
CAGCCCCAGCCACCATCAGAAAAGGACCTCACTTAGCAACATTTCAGTCCTTCTCATCAT
CCTGCTGAGGTTCCTGAGATGGGAGAGAAGAGAGAAAAAAATGTAAAATAACAAAAGCAA
TGACAGCTCTGTAAAAATAAGTGTTTATATAGGGTTTACCATGCCTCAGGCACTGTTCTA
CAGTTTTCTATGGACTATAATGCCCACTCTAGCTTCCTCATTATTTTTTTTTCTTTTAGA
GACAGGATCTTGCTCTGTCACCCAAGCTGGAGTGCAGTGGCCCAGTCAGACAGAGCTCAT
GGCAGCCTCTAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCACCTAACTCAGGCTTTCAAAGTGCTGGG
ATTACAGGCACGAGCCACTGTGCCTGGCTAATTTCTTTATTATTATTATTTTGTAGACAC
AAGTCTCGATATGTTGGCCTGGCTGGTCTCAAACTCCTGGACTCAAATGATCTGCCATTT
CAGCCACCCAAAGTGCTAGGATTGCAGGTGTGAGCCACTGTGCCCTGCCTCCTTGCTGTT
TTTCAAACTCACTGAACACAGTCCTACCCCAGGGTCTTTGCACTTGCTATTCCCACCACC
TGGAATACTTTTCCCCAGAATATCCACATGATTCAATCCCTCACTTATTCCAAGTATTCA
CTTTGTCAATGAGGTCTTCTCTGCACACTGTTTAGAGTTGCAAAAAAAACTCTCAGGACT
CCCCACCCCTATTGATTTTTCTCCTTAGCAGGTATCACCTCCTAAAATGCGGGGTTTTTT
TTGTTTTTTGGGGGTTTTTTTTGAGACGGAGTCTAGCTCTGTCACCCAGGCATGATCTTG
GCTCACCACAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCTCCTTCAGCCTCCGGAATA
GCTGGGATTACAGGCGCCTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGCTGGTCTC
GAACTTTAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCCCCACACCAGGCCAAATGCCTTCTAT
TCACCTAAGTATCCTGTTCATTGTCTGTCTCCCAGAATAGAACATCCGTTTCACTGGGGC
GGGGGTTTGTATTTGTTTTGTTCACTGCTGTAGCCCCAAGGCCTAGAACAGTATCAGCAC
ATTGTACATACTCAGCAAATATGTGTTGGGTAAGCCACAAGAATGAGCCCATGCCTCAAG
ACTGGCCAATGAGAGCACCACAATCTTTCAGGGATGGACATGTGACCTAATGTAGGCCAG
TGAGAACCTTCTGCAGGATATATGCTACCAGGACTGAGAATAAAGCCAGCCCAGGAAAAA
AGCACAAACTAAAGGAAGCGTGAGATTCCCAAAAGCACCCTTTTGATGCCTGGATCCAGC
CATGCCTGAAACCAACAAAATTATGCCCTAGACTTTCCCATGTGTCCATATTTTTATGTC
TAAAGCCGGTTTGAGCAGGATTTTCTTTTACAATCAGCACCGTCCTGATTCTAGTAACAA
CAGCTGTTACTTACTGAAAAAGGTCTTGGAAAGCTCTTTACCTCACATCAACTTCACCCT
GCTTAGGCTGTAATGGCTGGTGCATCCAGGATTTGAACCTCAGTCTCCGTGGCCCTGAAA
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GGCCATCACAGCAGGACCCTGTTTGTAAAAAAAGAAAAAGAAAAATTAAACCCTACCCAG
GGCATGTTGGCATGTACCTATAGTCCCAGCTACTGAAGAGGCTAAGGCAGGAGAATCTCT
TGAGCCCAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCTATGATGGAGCCATCGTACTCCAGCCTGGG
CAACAGAGTGAGACCCTGACTCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGTAAACGTGCCATTGGAA
TATCCTGAGCCCTGCTCTGAGCCATGTACTATTTATTACCTGGTATGAGTTGTCTCATAG
AATCATCACAACAAGCCCATCTTACAGATGAGAAAACTGAGGCTCAGAAAAGTGTGTAGG
TGTCTCGTCATGATTCTAACAGCGAGGACTGGCTGAGCTAGGAACAGGACAGACAGTGCC
CTGCCCTGTCCTCCCACCCTGCCCCCACCCCTCCCACTGCAGCCTTGAGAGCTCCACAGC
TCACCTCCAGCTCCACCCCTTGCCGGCTACCTTTTCTTGATCTCCTCATCAATAACGCTC
ACAATTTTCTGCAGGCTGGCCTCATCCACAAAGCCATCACCCCTCTGGGCAAAAAGAGGA
GAAAGCACACAGGTCTTTCACCCCCAGGACTTCAGCACCACCCCGCTCCCTGTCCCGGCC
CCTTACCCAGAATCACCTTCTTAGAATGGACCAGTCTCCCATCTACAAACACTTCAAAAT
CCCCTGTAGCCTGAGCAGCTCTGTCTCCTCCTGGGAGGAAATGGTGGGGGTAGGGGGAGG
CCAAGACTCGGATCACTGACCACCCCTGTCTTTCCCAGTCCCCCACACACTTACAAAGAG
TAGGCAATCTGGAAATCGCTGCTCCAGGCTCTTTTTCAGTAGAATGTACTGAGGGGCAAA
GATGGGGTCATGGGGTTGCAGGGGAGGAGAATCAGGGACTCCTCCCAGTCTTCATGCCTC
AGGCTCCTCTACCTCCAAAGCCAAAACTACTCACCCGAAGGCTATAGCTTCAGAGGCCAC
TGGAGGCCAAGAGCAGGAGGAGAAAGGCAGAGAGAGACCAGGGAAGACACTGCATCAGTA
TCGTCCCCAGCTCAGGGCACCCTATGAACCCCTAAGTTAGACCATGTTCCTCCCCTGTTC
ATAACCCTGAAGTAGTGCCATCTCACACGGGAAAAAAACAGTCTTTCCTGTGGCCTCCAA
GCCACCACAGGATCTGCCTTCTCAGCCCTCTGTCCCCTCTCCTCCCACTCTCCTCCAACT
CATTCACCCTGTGCCAGCCAGAGACCCCTAGCTCAACTTTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGAGACAGAGTCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAG
TGGTGCAATCTCAGCTCACGGCACCTCCTGGTTTCCAGCAATTCTCCACCTCAGCCTCCC
CAGTAGCTGGGATTACCAGTGCAGGCCACCACACTGGGCTAATTTTCGAGTTTTTTATTT
TTATTTTTTTGAGATGGAGTATCACTCCATCACCTTGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATCT
TGGCTCACTGCAACCTCTGACTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAG
TAGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCACACCCAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAG
ACAGGTTTTCTCCATGTTAGCCAGGCTGGTCTTGAACTCTCTTGGCATCAAGTGATCCAC
CCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAAGTCCTAGCTGCTAGTTCATCTGTCAACAC
CCCAGGTATGCCCTGCCTCAGGGCCTTTGCACTGGCAGTTCCCTCAGCTGAATGCTCTCG
GGGCAGTATCCACACAACTCCTTCTCTCTTTCCTTCTGGGGGGCTTTGCCCATATATCCC
CTTCTCAGTGAGGCCTTCCTAATCTCCCCAGCTAAAACTGCAACCCCAAAAATGCCTTTT
GTTCACAGTGTACTGATCACCTCCTCACATACCAGATCACTTTTTTTTTTTTTTTTCGTT
TTCTTTTTGTTTTTTTTGAGACAGAGTTTCACCCTTTTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGG
CATGATCTCGGCTCACTGAAACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTTTCCTGCCTCAGC
CTCCTGAGTACCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATACTCAGCTAATTTTGTATTTTTA
GTAGAGACAGGGTTTCTAGAGATGGGGATTCCCCTCATGATCCCCGTCCTTGCACTCCAG
CCTGGGCAATAAAGCAAGATCCTGTCTGAAACAAAAACAAAACAGAGAGACAGAGTGAGG
TGGGGAGACAGAGAATGGGAGAGACTGCCTGCCTGGGCAGAGACAGAAGACAAAGTGAGA
GAGGCTGGGAAGGGAAGCCAGAGCCCCCAACATGAGCACTGTCTTTGGGTTTGTCTTGCT
GGGGAGCGAAGCAGGTCGCTTTGCTGAGCACCTCATCCCCAGCACAAGCCTGGCAGTTAG
CCGGCGGGGCACTCAGAAACGAATGAATAAATGAAGCTCAGATCCAAAGCACGGATTTGA
ACCTGAAGCTCTCCGGCCCCAAAGAGAATGAGAGACAAGAGTGAGTTCCCAATCTGGGAA
CTGGGACTCTGGGGCTCTACCCGAATCCCTCCCCTCGCCCTATCCCAACCCTGACCTCCA
CGTCCCGGAGCCCCAGCCCCCACCGCTGGGTCTGTCCCCAGGGGTTGGGAGAGGCGGGTG
TGAGGTCCTCACCAGTAGGTCACTCGAATAGGGACCCTCTTGTCCAGCGCGAAGTTCTCA
CTGGCGGAGAGGAAGCTTTCAGTAGAATTCAGTAAGGAGGCGGCCAACGGGATGGTCCCC
AGGATAGGCGCAGGGACAGAGCCGGGAATGGTGGGAACCGCCAGCTCAGTGGCCGACGAG
TCTGCCGTGAAGTCCAGCGTGGGCTCGGGTGGATTCGTGGCCAGCGGGGTGCACGCGGGA
AGGGGCCCCGGGGCGGGCCCAGTCTCGCCAGAGACCGACGGGACAAGCTTCAGGCTCGGG
GCCGGCTCAGGGTCCTCCTCGGATGACACTGACACAAGCGGCTCCGGAACAGGTTCCGGG
GGCGGATCCCAAGGTAGGGCCAAGGCCGGGTAGGAGTCCAAGACGGGGAGCGTGGCCCGA
ATCCCGGCCGGGACCAGAGCTGGGGATGGGGCTGGGGCCGGGGCGGGGGCGGGGGCCGGG
GCTGGCGCTGGGATCCGGGCGGGGGCTGGGAGCGGGACTGGAGTCAGGGTCCGAACCAGA
GTCGGGATCGGAGTTGGGGTCCGGGCCGGAGCAGGAGTCGGGACCAGACGGGAGATCCGG
GCGGGAGTGGGAGTCGGGACCAGAGCGGGAGTCCCAGCCAGAGACGGAGTCAGAGTCCGG
ATGGGGGTCCGAATCCGGACCGCGGTCGGAGTCCGGACTGGAGTCGGTGTCCGGGTCGGG
GTAGAAGCCCGGACCGACGTTGAGGTCCGGGCCGAGGAGGGGGCGGGGGTCCGCGCCTGG
TTATTCAT
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