SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000370_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase 3 (TR3)
SpeciesCallithrix jacchus (Marmoset)
Transcript IDSPT00000370
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000273_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000370_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase 3 (TR3) # Marmoset (Callithrix jacchus) # Full length # Forward
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CCACCTTCTGCGTTTCCGTTTGTGAGCGGGCCCGGCTTGGCCGGGAGCGAGAGCGAGATC
CTGGAGCAGTCGCCGAAGTCGCCGGGGCCAGGAAAGGCAGGCGATGCCCCCAACCGCAGA
CCGGGCCACATCCTCGGGGCGCGCGTGGAGTCGCCGCCTGGGCGCCGCGCACGCCTGGCG
TCCCCCAGGCCCAGCAGCTCTTCCGAGGCCCGCGAGGAGCTGCGCCGCCGCCTTCTGGGC
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GTTGGTCTATTTCTGGGGTCTGTTTTCTATGTATATTTTTTATGAGTTGTCCTTTGTAGT
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GTGTTTTTCTTGCTTGGCTGACCAATCTGCTTTCTTACATGTCTGTCTTTACATGTGGCC
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TGTATCCCTCAAAAGTAGACACCATATTCCACATGTCCTTATCCTTGCAGAGTCAAGGAG
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TGTTACAGAGACACAGAAATGAATAATCTTTTGTTTTTCCTCCCACAAACTCATAGTCTA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCCCAGGCTAGAGTACAACAGCTTGATCTTGGCT
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CCTCCTTCTCTTAGCCCCTGACAACCACCGTTCTATTTTCTGTCTCTGTGAATATGACTG
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TCACTTAGAATAATGTCCTGAACATTCAACCATGTTGTAGCATGTGTCAGAATTTCCTTT
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GGGTGTACAAATATTTATTTGAGTCTCTGCTTTCAATTCCTTTTGGTATATACCTAGAAA
TGGAATTGCTTGATTATAAGATATTTCTATTTGTAATTTTTGAGGAATTGCCATTCTGTT
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GTGAAGTGTTATCTCATTATGGTTTTGATTTGTGTTTCACTAAAGATTAGTGATGATGAA
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TGCTTTGCCCATTTTTAAATTGGGTTTTAACTTTTTTGTTCTTGAGTTTTAGGAGTTCTC
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TGCTTGTGCCTTCAGGATCATATTCATAAAATCATTGCCAAAGCCAGTGTTGTGATACTT
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AGGCTTTATTTCTGTGCTCTATAGTCTCTTTCTTGGTCTGTAAGTTTGTCTTTATTACAG
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CCCACTTTGCTCTTCTTTACAAGATTGTTCTGGTTATTCAGGGTCCTTTGAAATTCCATA
TGAATTTTAGAATGGATTTTTCTATTTCTTAGAAAAGATCATTGGGATTTTGACAAGGAT
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AATTCTTCTTCTTGCTATTATAAATAGAATTTTTTCCTCAATTTCCATTTTTGATTGTTC
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GAAGGGTAAACCCAGAAATCTCATTACTGGGTATATGCTCAAAGGAATGTAAATCATTCT
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AGCAAACTAATTCTGGAACGAAAAACCAAATACTACGTGTTCTCACTTTTAAGTGGGTGC
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GGCACAGCTTCTCCCTGTTTTAATTGAGATTTAGTAGATTTTCTTGAATAAGTATTTATT
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TTCCCCAGTGTTCCCTGCTCACACTTCCATTCTGGAAATGAAACCTCTGGATCTTACCTT
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TGCTGTAACAATCTGCTTTATTAATCCTAGAATCTACAACCCAGTTCATATAGTGGTAAG
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ATGAAAAGTCATGATAAAATATGCTGATAATGCATAAAAATTTTTTCAAAATGAAGACTA
GCATCATGAGCAAGGATCTTGAAAAATGATACTTGGTATTCCACTGCTCTTAACTATAAC
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ACACTTGGCCGGGCTTGGTGGCTCACGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTG
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GGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGAT
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CACTTTGGTATAAGTTCTAATGAGTTAGACCCTATTTTTAAATAGCATCCAGATAAATTT
ACAGTTCCAACTTAGATAAATTATAGATTGTTCCTAAGATTTTTATAAAAGAAATCCATA
CCAATTGAACATAGGATATACATAAACAGTTGTAAAACTTTAAATTCTGCAGTGTTCTTT
CTCCTGTAATTAAACTGTAGGCATATCAGAGTGGTTCGTTGCAGAAGCTCCTTCAGGAAG
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CAAAGGTATGAACATAGAAATGAAATTCATGGATAGTCTTCCTGGTGATTGCCATAGGCA
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TAGCTGGTGTAATTAAGGTAAAAGATTGTGTGTCACACAAAAAGAGTCTTTTAGAGAAGA
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TGTTCATTTGTAGGAAGCTGCAATTTTGGGAAAGAAGGTTATGGTGCTAGACTTTGTTGT
CCCGTCACCTCAGGGCACATCCTGGGGTAAGCTGTTTTTCTCTGTTGTTCCTCTATGCTC
TTTACATATGTTGTTTGCTTTATGTAATCTCATTTAATCCTCACCACAATCTCAAGAGGT
ATAACTTACCTGTTTCTTAGATAAGAAAACAGGCAAGGCTAGGCCAGACCCGGAGGCTCA
TGACTGTAATCCCAATACTTTGTGGGGCTCAGAAGTTCCAGACTAGCCTGGATAATATAG
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GTATTTTTTTGCATGCATGTCGTGTAGTTGAGGTCACAGTGTATATACTGTGTTGTGGTC
ACATAAGTTTGCAAGAAACACATTTCTTTGTTTCTGTGTCAGTTTCATAATTGACTATAT
TAGCAGCACAGTAGCTGATGGAGTGAGTGTATGTAATCTTTACAATTTAGCTTAACAAGA
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CTTTAAATGCAGTCCCCCTCTGTGTCTGCCCTGCTCTGTGCCCCATAAGACTGATCTGTT
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CAGAGAGATAGTGGAGTTGGGATTTTACTCCCCTGGCTCCTTCCCTGCTGGGTCCCTGCA
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GGAACTATTCTATCCCTCTTTGCAATTCCTGCTTGCACCTTTGTGATAATTTCTCTGTTA
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ATACAAAAGCTAATCTACCTTGATTTTTCTCATAATATTCTTGTGGTGTATGTATACTTG
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AGAGTACAAGGCTGGGAACTGAGTTTCTCACCCTTTCTCACCCTTGATGTAGTACATATC
TAGTTAATCTCAAATCATTCTGATCACTGTGGATCAGACTCAAGTGAAAGTTTTGGACTC
TGTGTCCAGAAAACTTCTCACATGAATGTCTGTATTTTTAGGCATCCTTGGGTCTCCTCT
GTGGAACCATGGTCAGAAAATTTGGGGTAATCCCTTGTGTCTTATTTTGGGGTGGGGTGT
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TGTGAAACTAGACACACACAGAAGAGGCATTAAAACTTATTTTCTTTCTCAGGTCTTGGT
GGCACTTGTGTAAATGTAGGTTGTATTCCTAAGAAATTGATGCATCAGGCTGCCCTTTTG
GGGCAGGCATTACATGACTCAAGGAAGTTTGGCTGGGAGTATAATCAACAAGGTGAGTAA
TGTATATAAAGTATAGATTGAGAGAAAAGAAAAAAATGAGTTTTTTAGATAAAGACTTGC
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TGTGTAAGCCAGGCATAGAGGATGCAAAGAGGGTCCCACTCTTATGGGCCTCACCACCTA
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TTGAATTTTATCTGTTACATTTTTTTCTCAGTGGTTATATGTATCTTTGGTTAATGAAAG
GTGGAAAATAAATTCATCCAGTAAACATGTATTAGCCAGGCTCTGAGGATACAGATGTGA
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TCATTCAGTGCACTCAAATTAGCTGTGCTGCTTAGAGTATTGGCTCCATGTAGCCTTGAG
GGTGGTGGGGGAGTGTCAGGGAAAGCTCTTCAGACAAGGTGACCCTTGAGTTGCATCTGG
AAGGTCACAGAGGAGTAGGACCTTTAACACAGGAAGCAGCTTGATGAACACTATGGAGAT
GTGAGGAAACATGATGTTTTTTGGGGGGGTTAGGAGCAGCTGGAGTGAAGAGTAGATGAA
GGGAGTTGAAACAGGAGAGGAGATGAGCCATGGGCTGTGATTCCGGATCCTTTTGTCAAG
CTAAGTAGCAAGCAGAGAGAAACTCCCTATTGAAAATGAGGCTTATTTCTGAATTGGGCA
CTGCAGCTGGAATATGTGTGCCATAGTAAATGATGTGCATGTTCAGGGATGTAAAGGAAG
ACAAGGGTTTCCTAAGCAAAAATGAAGATGATAGGATTGAAATGATTATCCTTGGCTACA
AGGATCAATAACTAGGGTGACTCAAGTCCAAGGTGGACAGGCAGTTGCTGGGCAGATGTC
CTGGAAGATGTATTTTTATGTAAGGTTATGATGGCCTTTGGGCAAGTTTGTGGCCTTTGC
AGTCTTTGTGATGATTATGTTATCAGGCATAAACCCAGAAAACGCTTTCTTCATGGCCTT
CCCCAGCTCTGTTTGTCAGAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAAACACACAAGTTAC
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GGAAAGGATAGGGAAGTGGGGGCAAGAAATGACAGAGGCCTGAGCAAAGACTGAAGTCAG
GTTGGAGGGCAGTTGAAGGCATAGAATTGACCAGACGTGGTGACCAGTTGGATGTAGACT
TGGCTGTGAATCAGAATGTCTTGGGGGGTTTAAGAAAAATTACAAACCACTTGTCTCTTT
TTGCAGATATTTTGATCTGGTAGATGTGGGCAGTGAATGTGCACATTTAAAGGATCATGT
ATGATCCTGGTTCTAACCATAGACAGGTGATTATGACAGGTCATCCAGGTCATGGTAGGA
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TGATGCTGGACCCATTTCTCCAGTCAGCTCAATGGAGAGCTTTAGGTCAAGCTAGGATTA
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TGCTTGGATCTGGGAGGCCGAGCCTGCAGTGAGCTGAGATTGTGCCATGGCACTCTGGCC
TCAGCAAGAGGGTGAGACCCTGTCTCTTAAAATATCTATGTGGGTGTGTGTGTATGTATG
GGTATATATGCATGTATTGTGTATGTGTATGTATATGTGGTGTGTTGATATATACATATA
TATATACTCACATGTATAATTGAAAATTGTAACAAAAAATGAAAATAACTTGAAATAAAT
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TATGATTTTAGAGAGGATGTCTCAATATTGTGAAGACATTATCTCAAAAATTATTTGTAA
ATTTTATATAAGTCTGGTAAGCTCTCCATGAGACATTTTTTTCTGTTTGGAGATTGACTA
ATTATTTTAAAATTTGTATTGAAAAATACATATGTGAAAATAGCTAGGCAACCTTTGAGA
AGGTATAAAGGGTGAGCTTTCTCAGTATTTAAAAATGTTGTACTATTGCAGGACTAAGCA
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