SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000427_2.0
Identity
TranscriptIodothyronine deiodinase 2 (DI2)
SpeciesCavia porcellus (Guinea Pig)
Transcript IDSPT00000427
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000330_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000427_2.0 # Transcript # Iodothyronine deiodinase 2 (DI2) # Guinea Pig (Cavia porcellus) # Full length # Forward
ATGGGTATCCTCAGCATAGACTTGCTGATCACACTGCAAATTCTGCCAGTTTTTTTCTCC
AACTGCCTCTTTCTGGCGCTCTATGACTCGGTCATTCTGCTTAAGCACGTGGTTCTGCTG
CTGAGCCGCTCCAAGTCCACTCGCGGAGAGTGGAGGCGCATGCTGACCTCAGAGGGACTG
CGCTGCGTCTGGAAGAGCTTCCTGCTTGATGCCTACAAACAGGTGAGCTGTGAGCACGAG
GGCTTCACCCAGCTCAACCAAGCAGAGCTTTTGCAGGCTGGGAAGTGGGGGTCCTGGGAG
GAGTTTGGGGGGCAAGAACAGTGGAGCCTTCTTTGGGGGCCTGCCTAGTGCGTATGTCCA
AGTGAGCCTCTATGTTTACTCCTACACCTGTTGCACAGGTTAGTTTAGGAGTGACATATC
CAGCCATAATTACGCTGTGGGACCTAATCAGGAAGCTTTTAGAAATAAAGCTTATACTAT
ATTTTGTCATAGAGCGTTTGTACCTGTAGCATAACTGGGCAAAGACAGAAAAATTAGAAG
GAAGAGATGTTTATTTTGCCAGTTACCTGGAATTTTGACGTTTTGCTTGCTGGGAGGTTA
GGTGAGGTGCATCAGAAAGGACAAATGAGGTAGCATTTTCCCTTTTCTTGCTGAAAAGAG
AGGGTCACTTGAAACAGAAAGTTCACAAAGGAACAGGCACAGCAAGTGTGCCTGAGCACT
GTCCGCGCTTCCTCTGTTTCTGGGAGAGCTGCGTGAATAAAACCCAGGCTAAGGTGCAGC
CTCCTCTACGCTGGTCTGCTGTGAGTCATTAGTTATTAGACATCATTTTGCAAACTGGCT
ATCAGGAAACCAGGCTTTCTAAGGAGAGCCAGAGGTATTTTGTTTCTCCAAGTAAAAACA
AGTTGTTTTAGGAAGAACTAATGGGTCTTATCATTGCAATCTCCTGCCTTGAGCACTGAG
CCTGGCTTACCTGTAGAAGTTGTCCCCTCATTTGATCTCCAAAAACCAGTAGACGATCTT
TGTTTCTAAGTTAAAAATTCTGGTGTTTAGTCTTTTTGCTGCTTGGACGTGCTAATACAG
CAGTTCCAGCCGAGACCTTCAGCTGAGAGGCAAAGAACAATTTGTCACCAATCTTTTGCC
AGTCTGTGCCCATCCCCCCTAGTGCCACATGATTCCTGAAGACTCCCTGGGGTTAGGAAG
AATGAACTCACTCTGCAAAACGTTGCTACCAAAGGAGAAGATCTTAGTTTACTGTCACCA
TAGTGGGTAACCTTGCAAATGACCCCAAGGAAAGGGGTTTTAGAGGAATATTGGAGCCAG
GTGTTTAATGAAGTGGCATCTGTTCAACAGACAAGCTCAGAAACAAGAGATAGAAACTCA
GAATAATAGAGGGGAAGGGAGTGAGTTCTCTTTAACTAAACACTAGAAAAATAGAGGTTG
TTCTACTGAAAATCAAATATTCAAGAAGAAAGTGTCTATGGTAAACTAGCTGTAATTCAT
GTCTTTCATAGAAAAAGCAACGTGCAAGGGGTCTGCATTTATTATCCCAAAGTCATGTGA
ATTGTAAGGAATCTTAGTCAATGGACTTTTTTCATGAGAAAATGAATGGGCAGTCAAAGT
CCCATTAATGAAATCTCATTTATGGTATGTATGTAAAGGCAAATAAGAGTTATAAGCAAG
GGGGTCCCTCGAATGATCATTCCATTTCCACAAATGTGTATACTGAATGTGAAGTTTCTA
TGTTGTAAGAATAAGAAATTCAGAGGCTAGAAGAATACAAAAGTGTATATAACTATAATT
AAGAAGTTTCCTCATTTACATTTGCATCTTGTATATTTTAGCAGATTATACGGAAATGTT
GAAGCTTGATCTCAGTATTCAACTATTATTTTTTTGAAAGACAATTGGCTTTCACTTATG
GAGGAAAAATCACTTCTTGGGAGAATTTTACTTATATGCCTATATGTCTAATATAAATGT
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CCCATTAAGCAACTTACTGAAATAGAAATGGAAAAGCAAACACATGTGCCTGTAACTTTT
ATTATTTACTTTTTCACTAATGTGTAGTGTTTCACGTGTTGTAAGAGTTTGTTATTCACA
TTCCAGGAAGTTGGGAAAGACGAGGGATTGTTTTTTCTTTGTTCTTTTTTTTTTTTTTTA
ACAGCATGTGGTTTGTATATTCTCCTCCGCCTTTCTTTGTCTCTGCCTACTGACTTTATC
GGTGACCAAGTTCTTGACTGACATTATATTTGCTGTAATGATTTATGTGATGCTGCCATC
AGCATATGCAAACTCAGAAACCGTATATCCAGAGAAAAGGGTGGGATGATTGTGTAATGA
ATGGAAACCCTGAGGATGCTGGATTTTGCTTCCTTTCTGTCTCTAAGTGTGGTTAGGTTA
GTGGTCATTGTGGCGGCACTTGAGGGGTCACATGACACCTCTCAAACAGGTTGAATCACC
TCATTGAATGCTGCTGTCATCTGTGCCACTGTCTTTGGGCGTGGGCATTTCTAGAGGCAC
TGGAGGAGGTTCTGCCTGAGATGGCATCACAGATTTCATAACCTTGACTTGCAGGCTTTG
GAGGCTGCTACTTCAGAAACAGAGTTTTCCAGGATGAGGGTGTGTCCACGTGTAATATAA
TTAGAGCTGTCATTTGTTGTTCTTACTTCTCCTAGTTGTTAAATGCCAGAAACTTGGAAA
GAGATTTAGACAAATTGGAATAAAAGGATGATCTTTGTGTTTTACCTAGACAAGAGCAAC
ACTGAAGTTAAAGAGCAAAATGAAATGCTAACATAACCTTTGTCCATTAAAATATTGAAA
GGAATTTGAAATTGTGGTGAAACTTTTAAAACTCATGGGGGTTCTGGGTATACATTCGAC
TGCAAACAGTCTGTTAGAAACTTGTGAGATATTCTGAGGCACACACCAGCTATTTTTTAA
GTCTCTCAGCCAGTGTCATTGCATCTAGACACTGCATCCCTGTGCTGGTGTTCCAAGACT
CAAAAACACAACCAATAAGCAAACTGCCCTGTCTGGGAGCCTGGCTCTTACCTAAATGAA
GTGTAAAGGTAAACACAAGTATAGATGCTGACAAGCAGTTTAGTTTCTGCATGGTTAATA
TTGCGCTGGCATCGAAAACATATTTATTTGAACGTATAATTTTGGTTTTTGAAAGGGTCT
CTTTAACATTCTCCTTCTTCTCTTCATTCACCTCAAGCCTTTTAACACTAGTTTCTACAA
TGGAAAAATGGCTCTTTTAAGAGAGAAACTGTCCCAAAAGGAAACAAAGAAGGCCACAGC
CAGAACTTGTCTGTCACTTGGATAAAACATTGGGGAATGATAGGGCTTTGGGCTACGTTT
TCAAGGTACAAATCAAACAGAGAATAGCCAAAAAGCAAGTGGAGCTTAGAAAGAGGAGTA
GGTAGCTTGTTCTTCTACTCTGATTTATTTGGCCAGTCTGAATGCAGATGGTTAAATCTC
TGCTTAATGATTGTTTGGCCATGTTTCTAAGGACATTGATGTAGCCTGGTCATTATGTCA
AAGAATCTGACACTTCCTGATAGTTAATAAAGGCACTTCCAGGGCTTTGGATAGCAAGAA
GTGTCTGTAACTCTCTGCCACACGCTCATCTCCCATTTTTTGTCACTTGCTTTGCTTTTT
AATCCTGAGATTGTATTTTATCCAAAAGCTTTTCTCAGGCTGTGGAAAAAAAAAAAGGTT
AGTAGTATATGCTCTATTTCCAGCTTCCCTTGATGAATGGTTCTTTTTTTCCCTCCTTGC
CCTGCATTTCACAGTCCACATGTAAAGCAGCATTATCCTTTTGCCTGTGCACCAGGCACT
ATCAGTAAAACACATCCTATCGTTAAGAAATCACACACTTTGGAGATGTGCTGCCTTCAT
GCTCAAGTTCGTATTTATAAACATGTCTACTGCAACTTACAAACTTGGCTCAGAGACGCC
CTCTTATAAAGATGAAAGTCCTTCATGTACCACCTTTGTTGATGCTGTTTTCATGTTGAT
TGCAAAAACATAGGAAAGGACAATTGCAGGAGGGCAGATGAGAGAGAAAAGTTAGTGATG
ACGATTATCACATTTTACGTATGTCCTTTCTGATCCTTGCAAAAGAAAGGGACCCTTTGG
GAACATCGGAACTTCAAGACCAATTAGTGGAAATGACGCTTCTTGTGTTTGGGCATTAAA
TACTGGGCAAGGTTCTCTTTAGAACGGCTAATGCTGGCAGGGAAAGAGGTACCGACCTAA
TTACTCTTCCGCAAGAGTAAAAAATGCCTTTTGAATGCCTCTTTGGCAAATATGTCTCAT
TAAGGACAAAAAACCAAACACAAACCCTCTAAGAAGAAGAAATTAAGATGATAGGTAACT
TGTGGCCAGGAGACTTTGTGTGCCACTGTGGGAAATTAAAACAAAGTTTGAGAGTACCAG
GGGATAACTTGTTTTTGTTGAGCTGCTTTTCTGCAGCCTAAATGTTATTATGGGACTCTC
TTTATTTTCCTCGTCATTTTGGCTCTATGTCAAGGAATGCTTTGCTCCTGGGGTGAGCAA
AGACTCTTCCATGTTGAAGACAATGGTGATTCTCCCATTCCATCTCAGCAGGATTGTTAA
CTGAGCAAACCACGAAATTCTCCCTCTGAAACTCTATTCTAACAGGAATTTAGAAACTCT
GGTCTAATAGAAATTTTGTCTGTTTAGTTTAAAGTAAATTTGCATGTTTTTTTCTCCTCT
GTTTTTGCTAGATTGTTCTCCATTAGGTTTAGCAAAAATAGACAGATTTATTAGTTATAT
TATGCTTATAAAAGCAGACTATTGCTCTACTCATATTTGGACTTGGGAAACATGGGTGTT
TGTTTTTTGCTTAGTTTTCTTAAGAGCATCAATCCTATCTGTGCTTTTTTTCCTACCTGG
TTGCCTTTAAAAATAAGGATATCCATCTATGACAATCAAGTCTCTATTAGGGGTCTACTA
CCACTCAACAAAATAAAGAGAATTGGCCATAGCTCTTTTATTTACTAACCTGTTGAGATA
ATCAAGATCAGATCAACAATACTGGGTGCTAAGCATGGCAGGAAGCTACAGGAGAGTCCA
AGATTTATGTTTCCAAATTTACCTGTAGCAGCAACAAGCTTATCTATCACCTAACTATAA
TATATTCAATGCAAATCAAGATTATTAATAATTATAAATTCTTTACTGACCTACAATTAT
AACCACTAGTGTTTAATCAATGATTCATTCAACAAATTTTGAAAAAGTGTATTTTGCTAA
CAAACAAAATGTCAACCCTGTGCTCCAAAGGGTGTTATGTTTTTGGCAACTTTCCTAATT
TTGAACTGTATTGTACTGATCTTAAATTGTCCGAGGCAATTGTTCACGGTTTCTAAGGAA
AATGAGCTTTAACTTTCCAGGAAAATTGACTGCAGGTAATAAGGGATCACCTGTACCTGA
AGCATTGAATTAGATTATTCTGTTGAACTGTCAGGAATAACACAGGATTGACAGGATTTC
TTGGGTGAGAATCTGGCAGGCAGAGGCCAATTTATCAAGACTACACAGTAGTTCATGGGT
TCCAATAATGACTCCAAAGTGCAGGAGGATGTTCTCACCTGCCGCGAATTTATCAGTCTG
CAGTGCAGAGATTATTTTACAGGTTACATACCTAACAAGAAGTCTCTGTGTAGCAGACTC
ATCCAAATGCAAATCTTATTACCGCATGTTTATGAATGTAGCACATACAATATGGTTAAA
AGGAAATCTTCTACAATCATTAGCATTGTCATAAGTCACAAAGTTCTTTGTGCACAAAGA
ACTACAAAGAAGTGTCAAAAAGAAGCCATCTATGAGGAGGTTTATGCCTTTAAAATCTGT
GTGTTTAAGTGTGAAATATATCTAAGGGCCTCAAAGGCCAATGTAGTTCACATAAAATAA
TCCAATGAAAGGTGGGTTAAGGGATTTCTTCATCTGGTGTCACTTGTAAATTAGCCAAGA
AAATTCCAATTTCACCCTGGTGGTGACTGAAATCAAATAACATCAACAGTTTGCTTTTCA
AAGGAAGATTACTTTAAGATTTCTTTTTAGAAAACTAATAGTACTTGTTTCAAACCTACC
CTGCTAGGTCTTGGCAGAAGAAATAGGAAAAAACTTTACTTCTCTATTATTATAATTAGT
TGTGAATTAACATTAGTAGAAACTTCTGAAAAAAATCTTTGAGGGTTTTATATCTGTTTG
GATTGTTGCATCTGCAATGATTCACTTGAGTTAATAACAGTGTTATATGTGGATATTTAT
ATGAGCAAAATAAGTCGATCTAGTTGAAAGTGTTTTGTAATAGGAAGAGCAGTGTGTAAA
AATCAATTGTACTGTGGTAAGTTGTCCCTAATGTTTTTGACTTTGATTAAACCATTCTAA
GCGAAGATCCAATTGTGTTAATTCAAACTGATGCAATTGGTTCTTTTATGCTGCCTGAGT
TTTATTATCAATTTATAGATATAAAGGCCACAAAATTTTTTTCAGTATTCTGTGTTCAAC
TGCTTAAACCATGTTCAAAGGAGGCACATAGGAAATTGCTCTCTATACTTCTTGTGCCCA
AATATTTCATCATTCAAAGGAGTTCGCTAATAAATTGTATGGTAGAGAAATATATGGTTT
GTGACATCTTAGATAAAAGAAGGAAAAGAAACAAAAAATCATGTAAAATAAGAAAATGAC
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GTCATTGGAACCATAATATAAGCAATAGTGGCAGAAACATACAGGATAGTCACTGCACTG
TGAGACGCTCAAATGTCTTTTTAGGAAAATTTATTATTTTAATTAATTTATTTCTTGGTA
CAAGGAGTCAAACTCAGGATCTTATGCTTACTAGATAGGCACTTGTGCCAATGAACTATA
TCCCTGGATATTAATTTATTTTTAGTACAGTTTCCCAGAGAAAGATACATTCTGTTTCAT
GAGGTGAGATGGGCTGTTCAGTAACAACAGAGGATAGGTCCAGATAATGATCCTTTTCTT
TTCTGTTAGTCTGTAATAACCACACAGTATAAGAAGACAGGTCTCCTTATCACGATCTTA
TATATGAGAAAGCATAGGAAAGGCTGAATGGGATGAATTCTCGTAAATAGTGGATTCCAT
GTTTCTATTGTCTATTGTTTGAGATAAAATAACTCAGCAGCATGCATAGAAAATCAGGTC
CTACATGCATATTTGAAACTGAAAAAGAGGCAGTGTGTTGCAAAACCCTGACAATTTATC
TTAAAGTCAACCATTTGCTTCTGACTTTTAAAATGAAGTCAATCATTTGTCACATAATAC
TTGCTAAGTATTGACAGCAAACTATGGATAGTAAAGAATATCTGCCTCAATTTGATTATC
GAGTTACTGCCAGTGCTTCAATGATAAAAATAATTATCTTCAGCGATTATATAGAATAAA
AACACTTTTATTCTCATTGAACCGTTCTTTACATTCTATGACAAGACACTTTTGTACTGA
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TTTTCTTTTTCCATCATTAGGTGAAACTGGGCGAAGATGCCCCCAATTCCAGTGTGGTGC
GTGTGTCCAGTCCTGAAGGAGGCCACAGTGGTGGAAACAGGGTCCAGGAGAAGACTGCTG
AAGGAGTCCAGTGCCACCTGCTTGACTTTGCCAGTGCCGAGCGCCCACTGGTGGTCAATT
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AAGAGTTCTCATCAGTGGCTGACTTCCTGTTGGTCTACATTGACGAGGCTCATCCCTCAG
ATGGTTGGGCGATACCTGGGGGGTCCTCTTTGTCTTTTGAGGTGAAGAAGCACCGGAACC
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GCCAAGTTGTGGCTGATCGCATGGACAACAATGCCAATGTAGCTTATGGGGTAGCCTTTG
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ACTATTCAAGTAGCACTGGGCTAGATAGTAGTACTGCTGCTCTCTTTTTAGTGAAAAAAA
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GTTTGGGCTTTGGAGTTCATTGTGTTTGAGTAGTTATAGCTGTGCATTTCTCTGTACCAA
TCTACACAGTCCTTCTGAATACACAGAATTGACAGGTGTATTTGTAGATACCAAGAATGA
TCCCTCCACCTGAAGGTTAGAATATCTATCTGGTGGGTTGCTTTCTGGGCAGATGAGAAA
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TTCAGAGTTTCACCTTGAAAACTATAGAAGGAAACTAATTTGCTCACCACAGAAACGTAG
GAACATATACAAAACTATAGAAAGAAAATGCTTAACTAAAACAAGCACAGAGAAAACAAA
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TGCAGTGGTGGGAGACAGGTACCTTAGCCATTCAGCGACTGCTTTTCTTCCTACACCCAG
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GTCTTTCTTTAGTCTCATTAGCTAAAGTTTAATAATCCAAGACCCCAATATTAGGTGATT
ATAATTATATACAAAAATATATATGTATGTGTGTGTATACACATACATATCATGTTTCTC
TTTAAAATAAAAACAATATAGTTTTACTAATAAGTAATACCTGAAGATCATAACCCTCAA
AAAAATAGGCTAGTCATCAAATATAACTATTTTTAAAAATTTAAGAATACTGTCAAATTA
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AAGTGAATCATAAAACTAATCATAAAAAGATAATCTCAAGGTGAGAGTATATTTGTTGGC
TCCAAGGGAAAAAATAATGAGAACTGGGTGTGTAAGAATCAAAATTTTTTATGGAGCTAC
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ATTTTATAGCAGTGCCTAAGCTTTCCAATGTTTTAAATTCTATTTAGAAAAAAATTCCCT
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TGACAATGGGACAGGATGTCAGAGCAGCTGGATGGGGGATGAGATTTGGGTTAATGCATT
GCTAGTTGTCTGGGGAAAAGTGTGATGGAAACATGACCCAGTTGTGCTACATTTTTAAAG
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ATAAGTCTGTAATTATGTAACCTATTTGTCTCACTACAAACTTTTATGGTTTCCTGTGAT
GTACCTTTTATAAAATTAACAAGAACTCATTATTTGAGGTAGAAGAAAATCAATGCTTAG
CTGATATGCTCAGAGAAATTATTATATTTTCAATACCCGCAACTCTCGTGTCTTTTATAA
GGTACGTTCCCTTGAAGAATTACAGTTTTAATTCTCACAAGGGAAAAAACACATAAAACT
CTGAGTTCCTTTTCTTAGCACCTAAATATTTCCTGCTGTAGGCTGTGTTTATATGAAACT
ATCACTTTAGCCTTTTACGCTGAATTTGCTTGTGTAGAATTGAATTAGTTCCCAAGAAAT
TTTCGATATTATTATAATATCTGGATTTACTCAAACATTTAGTGTTTGAAGGATGTCATG
GAACTATTGGAAATTTATTTTATTTCTTATAGAAAGTATTAGTGGGATTTACAATGACTT
TCCTGAATGGGCATGAATGAAACGCATGAAAAGTAATGTAGAAATGTTTCATCAGCTATT
AAAAAGTAACAGACCTCCAGAGAGGCAAACTAGTCACTTGTCTTGTATAGCGAAAGTGGC
AGTTATTTCCTATTACTTTCTTTATTCAAATTTTAAATCTCTGGGCCTGTGTCTTCACCT
CATTTATAAAATCATTTACTGATTTTTGGTAATAACAACTGCTGAGTGGTGGCTTGATTT
CTTTACAATCTTCCCTCATTAACCAAGTCTCTGATCAAGAAGGGAAGAAAATTCTATGCA
GTGTTTTTCATTTTGTTAGAATATACTTTTGGGTTCTTGAATAAAAGTTATAAAACATGC
TGAGATCATAAATAGAGGCTGCCTTGCTGGATAAAATACCAGAAGGACTCATAAAGATAA
TATTTATGACTTTGGGAAAACTCTTATATGGGTACAAGGTGGCTTTGGCATGGCTGGTAA
GCTGTGTCCACAGCAAGAGAAATTTACTAACTTTTGACAGCTTCCCATTATATGAATCAT
GAGAGGACGAACTTGGAAATTTATTCCACTTGACTTCTGATTGATGGTTTGGAAAATGAG
TTTAATTAGCATCCTTTGGCCATTGCAAAGAGTAAAATGTGGACACTAACTTGTCTATTG
AAGGATTAATGAAAACCTTTACTAGCGTTTAGAACTTTTCGGGACATCCCCAATGTCATG
TCTCTGGGCAGCAAAGATTGATGATGAATCTTAATTTCAAGAGCCTTTAAAATATGATAT
TACCAAAAGTTAGAATTAAAATATACTTATAGTCTAACATTACTTCTTTTGCCTTAAAAA
TAAAAGAGAAACCCACTTTCATACATATTTCCAAAAGGAAATGGAGGTATCAATTGCTGC
TTGGCTATGGAGCCCTCTTGGTCTTATTTGAGGCCTTTTATGAATGGAAAGGAATGGGGC
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GCATGTCTTGGGCAGCAGCACCAGAGCTCCAGGGAGTTTATTTAATATTTACTGAAACTT
TGGAGATCCAGCAGATGTTTAATGAAGTCATTATTTTGGCTCAAACTATCCTCCCTCTCA
CTACCTTGAAAAAAAATAAAAAAATAAAGCAAACAGGTAAACACATAAATGAAAGAAGCA
CACAGAAAGGGAATGGGAAAAAAATTCTCTTAAGACTTCTCTAGACTATGTCCCTCACTG
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ATCCAATACTTCATAACCAAAGCAATTAAAAGATATTGGATAGGGAATGTTGGCCAGTTT
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ATCGACTCAGTTAGTGGTTGGATGTAGTCACATTAGTT
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