SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000444_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesCavia porcellus (Guinea Pig)
Transcript IDSPT00000444
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000347_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000444_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Guinea Pig (Cavia porcellus) # Full length # Forward
ATGAACCGCGACGCCTTCGCGGCGGGCGAGCGACTGGTGTCGCCGGCTTATGTGCGGCAG
GGCTGTGAGGCCCGCCGCTCGCACGAGCACCTCGTACGGCAGCTTCTGGAGAAGGTACCG
AGGTGTCGGTCCCCTCCCCAGCCGCCGCGCCCGAGGCTCCGCCCAGCGCCCGGTTTAGCT
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GGGGTTGGGGTTTAGAGCCACCTTTCTCCATCTTTGGATTGCAGAAGGGCAAAGAAAGTC
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TGCAGGCTCTAGCCTTTTGAACAAAATTACCAATTCTTTGGTTCTGGACATCTTAAAGTT
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GTAGCTTAGTGGGAGAATATTTGGTGTAGAAGGAGAAATCACTGCCGGGCAGGCGGAGGT
CGCATTACAGCTGGAGAGAGGCAGTCTGTTTCCTTGCTCCTACTCTCTTTCCTGTTTCTG
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AAGAATTTGTAAGAACTGTATTAGCTTTATATGTTCCTTATATCAATTATGCTTTGATTT
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GCAGTCATGAGTTCAATCCCCGGTACCGATAAAAAAGAAAAAGACAAAAAAAAAAAATTT
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GGTTTTTGTAGTCAGTAGAATTCTCATTTTCACTTTCTAGAAGTGCTAGATATTGAATGC
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GTTATAGGGGAAATCTACTTAAATGGAAAGGGGTTGGTCATTTTTTCCTAAATGATACAC
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TGAGAAACCCAAAGGGTAAGTAAGGAGCAAAATGGAGGTGAGATGTCAGGAAGCAGAAAG
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GTTTTTCATTTATTGGTAACCTTAATTTATAAGCTTTTTGGGTTTTCCTTCAGTGCTTAT
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GATTTGTGCTAATTATGGCATTCCACATGTAGTCAACAATGCTTACGGAGTACAGTCTTC
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TCTAGGTTCTAATTTTGAAAACTTGCCCGTGTTTTCTGTTCCTGTGAGAATGAGTCAGAG
CCATGGCCTTCTGGGCATGGCGTGTGGCACTCTCGGCTGCTTCTCTGGGTTCCTTTTCTG
CCGTGTGATCTGCTTCTTGCCAGCCTCCCCGGCTGCCTTTCTTGCCTCCATCACCGCGGC
TGTGCCAAGGGCGGGCCTTGGCACCTGGCCCTGGTGCCGTTGCTTGTTGTTCTCGCTGGT
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CCGTGTGCACGGGGTCACTAACATTTTAACTGCAAAAAGAAAACCATTAGATGGTGAATG
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TGGAACTAAGTGACTTGCTCAAGTTTCTGTAGCCACACGGTAGCCCTTCTAGCTCAGTGT
GACTGAGTCCCATGTTTTCTTTAAAAACAAGTATTAAAACTGCAAGGTTTTTGTTGAGAA
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GTTTATTAGTCAGAATGGATGGTAAAGCTCCAAAAGTACTTATTGAGAATTTGAGAAAAG
TTAGTGTTAATAGTACTTATTTGTATTCCTAATTGTCATTCAGCGAATATTGCTGGATTC
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TGTAGGGATCTGGGAGCGACAGAGTGACCTGCAGTCTGTGGGGAGTAGTATGTGGATGGC
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GCTGCACAGGTGCTAAATATGATTCAATTCAGATACATTTTTAAAGAGTGGATTTCAGTG
TATGCTGGTAAATTACAGGTAGGGTATGAGAAAAAGGAGAATTGAGACACTCTAAAGCTT
TTAGCTCGAGCACCTAGAAGAGATGAAATGCCATAGGCATACTTTATCTTTTAAACATGG
CCACTTTATCTAGATGCTGATCCCTTCTGTGTCACTGATTGCTTGGGTAATTTTCAGCAA
GGTACTTTAACTGCCTGGGTTTGAATTCTGTCTGATCTTGAGTAGGTGACATTAATTTCA
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TATTGTGAAGATTAAATGTGTTTTGGATATAAAATGCTTAAAACAGTGCCTAGTACATGA
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CTTGTTTGCAAACTCTGCATCAGGTCACAAACACGACTATAGCCATCTTTCCTACACAAC
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CTGTATTTTATTCACTGCCGCTGGCTCCACAGCCTACAACAGTATCTGGCATGTGACAGA
TTCTCGTCTGTTTGCTCTGTGAATAAAAGATTAAATGAGGGAACCAATAAAAGACATTCC
CTTACTTTTAGACCATGCTCTTGTGCTTCCTATTTCAGTTCTTCCATCCTGATGGTTTTT
CCCTCATTGTAGATATTAATATGAGGGATGAGTTCCTTGTACTATTCTTGAGATGGATGT
GGCCTGCTAATTCATCATATTCATGTTCATATTCTCCCCAGGCCTTTTTGCTGAGTTACA
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TTGCAGTCCTCCCGCGTCAACTGCCCAAGTGCTGAGATTACAGGTGCCAGTGGGTGTGCC
ACCTCTTGAGTACTTGCATATTTTAGTGATGAAAGGGTTCCAGCCAAGTTTGGTGTACTG
ATTCCTCTCTTACTACTCCGGCTCCCTGTTTAGGCTTGTGTTTCAGCTAGGAAGCCTTAG
ACAGAACTTAAAAGGCAGCTCTGACCACTGTACCACTTTAGTTTTACATGTGCCATGATT
TCTGGTTATTTATTTGTCTTAGGTGGTTTTTTCTGTTTTCTTTTGGAGGGATTTTCTAAT
CATAGTTCACTAGGAAATAAGGAGAGTAACAGGGAAGGTTAGGATTTAGATAGTCACATG
ATAGCTTCGGACTAGTCTGGGCCCCTTCCCTGCTTTTGCTGGCACTACCTGTGGCCTGTA
TCTGGTCTCTCAGATTAGACTGGCTATCTGTGCCTTCCATTCTCCCAGAGATCTGGAGGT
AGAAAAAAAGTGTGAAGATGAAGGTCAAATGTGGTTATAATATTAATAGGAATGTAGGTT
GTGAATACAGATTGAAAATCTGTGACTGCAGATAAAGAAAAAAGCTATCTTAGTTGAAAT
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GACTTTGTTGGATGGGAACCAGAATTTAGTTATACATTTCCAGTAGGCAGAAGTATTCAG
TTTTTCACTAGAGTATTAGATTTTCATTTGAAGTTCATTTGTAATAGAATGAGATCATCT
AAGATTATAATATTAGAGAACATGAGGTATGTAGAAACATTGCTTTTGGAATTGCAAAGA
ATATACAAATAAAATTTTCATTAGTTGATGTTGAAAATAAAATTTTGGTTTTCCCTTTTG
TTATCTGAGCAGTAGTTGGAACAGAGCTAGTTGCTTAAAGTGGTCATAAAATAGTAGATT
GTGTAAACATCAGAGAGAGAGAGACACTTAAATATCTACATAGCTGTTTGGCAGCTTGGG
TGGACGTATTCCATTAGGTCACATTGGCCATGCCGAGCTCACAGAGGGGGTAGAAGGTTG
CAGATACGCGGCACGAGACGATTCGTTTGCTTTATGCAGTTTTAGGGTGTAAAGCTCTGT
TCCTGTGCAGTTTCCACTGGGGTGGATAAAAAGCCCTGCCTGCCCCACACGGCTGTTGTG
AGGACTGATTCATGTGTAAGAGCAGTCGCGAGCTGCGCAGTGCTCTTCTGCTTATGAGGA
ACACCACTTAAAACTTGGTTTAATGCTTGGAAACATTTTACTGGCACTATTACAATGACA
GTAAAAATGGGAGGACTGCTTTTTATTTAATCTGTGCAATGTGTCTATAGTTACTCATTT
TTAAAATTATGGTTGTATTTACGTTGTACAATATGATGTTTTGAAACATGAATGTGTTGT
GAAATGGTTAAATCACACTAATGTAGCCATCACCCCAAATACTTACTGTTTTTAATTGGT
GCTTATTTGTTAATAGCAGTTATTGGCTGTCCTTCTGGCAACTAATATGTAACATTATGT
GTTATTTGATTCTAGGGGGCTCGAGTTGGTAGAATAGATGCTTTTGTTCAGAGTTTGGAC
AAAAATTTTATGGTTCCAGTAGGTGGCGCTATAATCGCTGGCTTTAATGATGCTTTCATT
CAGGAAATCAGCAAAATGTATCCAGGTAAGTAAATTGGTTTTTTTGTTTGTTTGCTTCTT
TTTTTTCCTCCCAGAAAAAGTACCAAAGACCCATTTGTACGCAGGCAGGTAAATTGCAAA
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ATCAGCCTCCCCTTCCTTAGATGTCCTTATTACCTTGTTAACACTTGGATCAAATGGCTA
TAAGAAACTGTTAAAAGAAAGGAAGGTAAGCATTCTGTTTCTTTTATAATAATATTGTAG
ACTAGAATAGTGCTCCAAAAGACTGTGTTTTGTGCCTATTAGTTTATCACATCGGGAATT
AAACTCAGGAACTTCATGTTGAGCTACATTCCTGGGTCTTCTTATTTTTTGTTTTGAGGT
AGGGTCTTACTAAGTTGCCAAGTTGACTATATAGGCTCAAACTTGTGACCCTTCTGCCTT
AGTTCCTAAGTACTGGGATTAACAAGTATGTGTTACTATACCTGACTTCGGTAGGTGATT
TTTGACTAGTTGTTATTTTTGGAGCTCCTGAAAGACAAATATTGTGTGTCTTCTTTTTAG
GTTTTGGAAGCCCAAAAGTAAGTTGTGTGGGTATGAGAGGTCAGTCACAGGGAGAAGAAT
CAGACCAGAAGCTAGTCACCTTCTCAGGCTCACATAATAAATTTCTACTTTGCCGTCATT
AGAATTTAAACTCATCAGTTATGTTGGCTATGAAAAGAGTTATGTTTATGTTTAAAAATT
AGGCTTTGTCTATACCACTGAAAGCTAACAAGTCATGACAATTCCAAAATTATGACAGAT
AGTATTGTTAGGTCAGAGTAATATGTTTTATTTACTGCTTGTCTGAGAAAGTTAGAAAAT
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AAGGAATGCAAAATGGTTCAGCAACTTTGGAACACGCTTGGCTTATTAAGTTAAGCATAC
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CTGTCTGATGAAAATCTATACATGAATGTTTATAGTGATCCTGTGCATAATTGCTTAAAC
CTGGAACCACCCCAGATGTCTTTCATTTGATGAACAGATAGACAAGCTGTGGTATATCTA
TAGTCAGCAATAAAAAGAAATGCACTATTGACATATGCAACAAAGTAATGGCTCTCAAAT
ACCTTATGATGAGAGAGAAGCCAGACTCAAAAGACTGTGCATTACAGTTTCATTTATTTG
CTATCCCAGAGAAGGCAAAAAATAGAGGCCAGAAGATAGATCAGTGTTTCCAAAAACCAG
GGATATGGAAGGGAACTTTAGGGACTGATGAAATATATATTACATCTTAACAGTTGAAGT
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