SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000475_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesCavia porcellus (Guinea Pig)
Transcript IDSPT00000475
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000378_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000475_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Guinea Pig (Cavia porcellus) # Full length # Forward
CTGGAACCCTACATGGATGAGAACTTCATCTCCAGAGCCTTTGCCACCATGGGGGAAACC
GTGATGAGCGTCAAGATTATCCGAAACCGCCTCACAGGGTGCGTGTCTTTTTCATCTTCC
CACTTCTCCCTTAATGGATCTTGCTGCAGCTGATCCATTACATTCGAGAGAATGTAAATA
TGAAAAGGAAGGGCTTTGGGCTTCTGTCTACTCCTGGGGCATCTATCTCTGAGAATTACA
GGGTCTAAGGGGTAACAATTCACAGTGTATATAACACATTGCGTAATGATAGGACTCAGG
AGCCAGACTGGTTTTAGAAATTATTTCTGTTGTGTGACCTTGGGTAAGTTACTCTACTGT
GAAAATGGGGAAAATAGCACCTACCTCGTAAGTGAGGATTAAATGAATTCCTACTAGGCT
GTTAGAATAGTGAGTGTTATATATTCTGTGACAAGATTATAGCCTGCTAGGTAATAAACA
CTGCGTTCATTATGTTTTAAATTGTTGAGACAGAGTCTTGCTATTTGGTCCAGGCTGACC
TCAAACTAAGTAATCTTCCTGCTTCAGCGCCCTTTATTTTTTGAGACAGGGTCTTGCTAT
GTAGTTCAGGATGGCCTCAAATTCACCATGATCCTCTTGCCTCAGCCTCAGGAGTGCTCC
TATTATAGGTGTGCATCACCCCCCAGGCTTCTAGTACTCACTTTAAGTAGAGATCAAGAG
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CTTTCATTAGTTAACAGCTGGCGGTGGTACACGTGCAATAGGTTAGTTACCGCTGAAGTG
GATGTTAGACCTACACACTTGATTTAATTCCATTAAAAACATTATTGGCAAAAAAAAAAA
AAAAACATTAGCATGAGTACTTCACAGGTAATATAGTATGTAAACGAAGTTTTACTGAAT
GTATCTAGCTTGGCAGTCCTTATGTTCAGTTTTCTAAGTTACATCTCCACTGGAATGTGG
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AACCTTAACTGGATTAACCATTTTGTTCTGTGTGCTTGCTTTTCAGGATCCCAGCTGGCT
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GGAAACCCCTTCCAGGAGCCACACCTGTAAGGACGTTTAGATAATGATGATGTCACCATT
TTTGTCATTAATTACTATCACTTATTGAATCCCTACTGTGTATTTTATTTAATCTTAAAA
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CTGGCACACCTGGGCTCATAGAACATGGAGCTGGCAGTGCCCTTAACGGTGATCCGTGCA
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GAGAACTTACCTACTATGCGTAGGCGTGGTTGTGAATATCTGTAAACTCTGGAGCTACTC
TGGAGACAGGAGGATCACACGTTCAGTACCATTCTAGACAGTTTAATGAGACCAGCTCAC
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ACGCTTGGCTAGAATGTACAAGCCACAGACAGGTTCTGTCTCCAGCATTACCAAAAACAA
ACATAACTACCTGTCATAGTATAAATTGGTTAGTATTTCAGTTTGCTATGTGAAATCTTG
GGGGGTTTGTTGTGTTTTATATTGTTTATTTGCAGGACTAGTTATTAAACCTAAGCTACC
TTTTTTTTTTTTTTTTTTAAACTTGCTATGTCCCTAAGTTGCCCTGGCTTGGCACAAACT
AGTGATCCTCCTGCTTCAGCATTGTGGAGTATCGAGATTGCAGGCCTGTGTCACCACCAA
GCCTGGTTATATGAAATTTTACAAACACCGTCAACTGGGCATGGTAAAGCACACCTTCAC
ATGCTTGTAATCCCAGCACTCTCAGAGGCTGAGGCAGAAGGATAACAAATTTGAACCCAG
CACTGACAACCTAAGAGTCTGTCTCAAAATGAAATTTAAAAAATGCAGATTTAGCTTTCT
AGTAAGGCCCTGAGTTTAGTTGTCTTTTAGTTTTTTAATTTGTTTTGCTCTTATGAAACA
GAGTCTCACTGTGTAGTTCAACTCTGTGATCTTCCTGCCTCAACCTCTGAGGTGCTAGAA
TTATAGGCCTGCACCACCATATCTAGCTTTTTTTGGTTTTGTGAGACGGGATCCAACTAT
GTAGCTCTGGCTGCCCTTGATTCACTACAGAGCCCGGCTGGCTCCAACTCTTGGCAATCT
TGTCTCAGACTCCTTACTGCTAGTATTACAGATGTCTGCCACTACGACTGGCATATGAAT
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AAAGTTGAGAGGGGAGCTGTACAACTTAATGACAGATTGGGCGTGTTGGGCCAGGAATTT
TAGCTCAGTGGCTCAAGCACTTTGCTAGTAAGTGTGAGATCATGAGTTCGATCCCCGGTA
CAAAAAAAAAAAAAAAAGATTGGGCCTATTCAGAATGGTATGGCCAATAGATACAACCTA
CTAACAGAGAAGTGGTTAAATTACAATATGTTACCTAATTGGAATACTTAAGTTGTGCTG
TAGAATACTGATTTGTCAAAATACAAGGATATGGTTTTATGGTTTTTTCTTTCTTTCTTT
CTTTTTTTTTTAAACCGGGGATCAAACTCATGACCTCATGCTTGCCAGGCAGGTGCTTGT
GCCACTGAGCTAAACCCCTGGCCCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGAGATGGAGTTTTT
CCAGGCATGGTGGCTCACACACAATCCCTGTACTTTGGAGGCTGAGGCAGAAAGATTGCC
ACAAATTTCACGCTAGCCTGAATTTCATAGTGAAACTCTGTCTCAAAAACTGAGAAACAA
AGGAAAAAAGCTAAAATGACAGATAACATGAATTGTATACAACTTTTGTAAATTCAGAAG
AAAAATTACAGAAAAAAGAAAAGTATATATCCACAGTTATAGTAATTGCTTTTGAATTAT
TGGTAATTTTTTACCAATTTGGTAACAGATTATTGGTAATTTTATTTTCTTTTGCTTTTA
TACTAAATTAAAAATAATAACAAATGTCTGCTTACTTGGTACTAGGCATTGAACACAAGG
CCTTGTACATGCTAAGCACACTTATTCCACTGAGCCACACTCTGCCTCATTAAATCTTTG
CATAGAACTTTTTTTTTTTTGCGGTACTGGGGATTGAACTCACGACCTCGTGCAGGCACT
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TGTAGTCCAGGCTGGTCTTGAACTAACTGTATAGCCCAGGCAGGCCTCTGAACTGAGGTG
ATCCTCTTGCCTCAGCCTCTTGAGTTCTGGGATTTCAGGCATGTGCCACCACATCTGACT
GTGTCACTCTTTTTGGTGGCGGTACTAAGGATTGAACCAGGGTGGTTGTTTTTTTTGTTT
GTTTGTTTTTGTTTTTGTGTGTCTTTTTCCTTTTTATCAGTACCGGGGATCAAACTCATG
ACTGCCTGCTTGCAAGGCAGGCGCTTATGCCGCTGAGCTAAATCCCCAGCCCCTGAACCA
GGGTTTTTACATTGACCTCTTTCTCAGCTCTTTTTATTTTGAGACAAGAGTCTTACTAAG
TTGCCCAGACTGGGTTCAAATTTCCAAGTCCTTCTGCCTCAGCCTCCCAGGGTGCTGGGA
ATACAGATGTGCATACCATTCCTGGCTTTTGTGTCTTAACATACAAAGTAAAAATATGTA
GGTTTAGGGGCCAGGAATATAGCTCAGTGGTGGAGTGCCTGCCTGGCCAAGCGCAGGGTC
CTGAGTTCAGTTCCTGGTCCAAAAAAAAATGCAGGTTTTCCAGGCGTGATGGCTCAATGT
CTGTAATCCCAGCACTTAGGAGGCTAAAGTAGGAGGATTGTCTTGGATTGAAGACCAGCT
TGGGCTACACAGTTAGTTCAGGACCAGCCTAAATTACATAGCAAGATCTTGTCTTTAAAA
AAACAACCAAAAAAGAGTGTCTAGTTTATTTCAAAAAAAATTTTTTTTTATCTTTTGTGC
TCCTCAGGGATGTGCTTCTGACCTACCCCTTCATTTGTATTTCCAAATCCTAAAACCCAG
ACAGACACTGTGCAGGGCAGTGACATGTTTCCATTTCTATTCCTTTTCTGCCAGAATGAT
TGTGAAACAAATTAGAACCAGTTTAAGCATAGTAGGTATGATGCCTTGGACTCTATCCCA
CAGCAAAAAATAAAACACCCAGAATCTGGTTAAATAGACCCTTCAGAAGTGGGGTTCCCT
AAGAAGCTCTGGGAAGATTTACTTAGAGTAGGCCCAAATCATGCTCTGACCAAGGCTTTC
ATTTTTGTTATTGGCTCTTCTCTCAGTCCAGAGTACTCCCTTTTTGTTGGGGACCTGACC
CCGGATGTGGATGACGGCATGCTATATGAGTTCTTCGTCAAAGTCTACCCTTCCTGTCGT
GGAGGCAAGGTGGTTCTGGACCAGACAGGCGTGTCTAAGTAAGGCTTTCTCTGCGCTAAA
GTGTGTTACATAACTTTGAGCATCTTTTCTGTTAGAGGAAGTGTTATTGTTACTGAGCCT
TTCAGTATAGTTAGAAGTTTCTCCCTTCAAAAATGGAAAAATGTGGGGTTGGGGATTTAG
CTCAGCAGCATAAGCGCCTGTCTTGCAAGCCTGTGGTCGTGAGTTCGATCCCTGGTACCG
GTAAAAATACAAAAAACAAAAGGAAAAATTTGAAGGCTTCTTTTCAGTTTTTTTGTGGTA
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TGAGAGATGTGGATTTGAATGCTGCTCCTGTTATGTATGACTTTGGATATGTTATCAAAC
CTCTGAATTTTGGCTGCCTCTTCAGTCAAACGTGGATACCACCTTCATGTAATTATTGGA
CAGTTTTGCTTGTCCTGGTAACACATGCCTATAAAGCCAGTATTATCAGTTGATAAAGTA
TTACAAAGTTGAGCCCAGCCTGGGTAACTAGGCTACTTAGCTAAACCCTGTCTCAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAATGGAAAGAGCTAGAGATGTAGATCTGTGTGAAGGCCTTAAAGT
TCAATCCTTAGTGTGAGGTTTGGACAATTTGACAAAATAACCCTGTGAAAACGTTCAGCA
TGGCACTTGGAAATAAGTGTTCATTAAATGTTAGCTGTCGTTAATTTATTCCCCAGCTAG
AGTATGACCTCAGGAAAATAGGAATCTGTTCTGTCTGACTGTCTTGTGCCATGCCCATTA
TAGTACTGGACATTTGGGGCAGTTTCCAAAAACATTTGCAGAACGGACTTCTTAAGCATT
ACTATTGCTACTATTAAGATAATGATAATAATTTGTTACCTTCTAGTAAATCGGGGAGGG
AAGCTACTATTTGGGAAGAAACCCCATAGGTGAACGTATCAAGAAGAATGGTGAACTGAA
AGTAAGAATTCCTAGATTTCACAATGGCCCAGTGCTTCAATCTCAACACCACTATGTAGC
TGTCTCCACTAATAGGACTTTATCCCTTCCCATAGCTTGATGGAGTCCCTCTCCATTATC
AGTCCCTGTCCTCGCCATATTCCTGCCCACATTCTTGCTCTTTCCCCTTTTCCTGACATG
CATTCTTAGACTTCATCACATCTGTGATCTAAGTGTATTGGATTTTTTTTTTTCCTGCAG
GGGTTATGGTTTTGTGAAATTTACAGATGAATTGGAACAGAAGCGAGCCCTGACAGAGTG
CCAAGGAGCAGTAGGATTGGGGTCTAAACCTGTGCGACTGAGCGTGGCAATCCCTAAAGC
GTGAGTCTCTCAGGGAGGGGAGAGGGCATTAGACTCAGCCTACCTGGGCACTGCCTGTCT
ATGGCTGGGAATCAGGGCATCCACATCCTGAAAGGGAGTCTGTAAGAGAGGCTTAGCTCA
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AATCCCCAGCCGCAGCCACTCCAAAAACTTAAGAGACTAGGTGGTAGGGCAGGCAGGTCC
ATTTCAATATTAGTGGCACCAACAGTAGAAAAGCTGTTTGGCTGTACATTCCTAATGTCC
CTGCTCTTTTCTCAGTAAGTGCCACCATCGGGAATTTGTCCATAGAATTAGTAAGGCATT
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ATTAAAGAACTGAGCAGAAAAAAAAAGTTACATCCAATTTTAGCCTCTATGAAAGTCCTT
TGCTATAGGAATGGTTAAGAATTAATGCAGACATCTTTTAAAACACGTAACACTAGTAGG
TGTCTTGGTTACTTTTCTCTTGTTGCTGAGACAAAATACCTGACACCCCAAATTAAGGAA
GGAAAGGTTTACTTAGCTCATGGTTTTTGGAGGTTTCTGTCTGTAATCAGCTGGCTCCAA
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AGAACAAAAGGAGGGTGAGTAGGTGAGTAAGCTGCTGCTTCTGCCTTATATTACCAGCAA
GCCACCACCGCACCAGGGCAAATATAGTACTGAGACCACCTCTGTGCCTTCCTCTTGCAC
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GTTCCTGGTCCATAGCAACTGACTGCCATCTCTTGTCTTTCCCCAGCCCCCATCTTCAAA
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TCTTTAACACATTGTAGATCAACCTGAGTATTCCCCAGCCAAATGTTACTTGTTGTGTAA
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AAAATTTTTGAAATAGTTTTACAGAGTTGTCCAGACTGCACTAGAACTCATGATCCTCCT
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CCAGCTTTTCAGTCAGTAACTACTGAGTTCCTACAGCTGTGCAGGCCCTTCCTTGATTTT
GAAGATGAGGCTATAACAAGAGAAAGTGCTCTCTGCAGTCTGTAGTATTGTGATCTGTTT
GTATCTATTCTTCATTAAACACCATTTTCAGTTGATCCGGCCCACGGATCAATCCGTGGG
GTGTACCTGGAGGGGGAACAGGGATTAAATAAAGACATGGGGGAGACAGAGAGAGAGACT
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CAGGGATTTATTTGTATCATACTTGGCTCCTGCTTGTGGCTTGGTTTCCTGCCTGTCTTG
ACTCTACAGATTCAGTATACAGATCATAAGGAAACAAGTAGGTTCCACTCTGTGTGACAG
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ACATGCCGAGCCTGTGGTTCCTCTTAGCTTAGACTGGGGATCAGCCCTCAGGCTTGTTTT
ATGAGGCTGTTGTGTACACAGTTGTTAAGATGTGGGAGATAATGGATCCTTTATAGGCTT
GACATTTTGTTTTTGGTTAGCAGTGACTATGCCACTGTATGTTGAGAAGGAAGCTTTATG
CTTACTCTGGGCCTCCATCCTGATTGGTAAGCAAGTGTGGTAAAGACTGGCAAGATGTCT
TGAACTTGTAACAGTAGGTGCTGTATGTAACAGTGTATTAGGAGCACAGTGTGGCATTAG
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GCCTGCCTGGTAAGTGCAAGTTCCTGAATTCCCAGTACCGGGGCGTTGGGGGGGTTCGGG
GGGGTCCACAGACCCCTAAAAGAAAATGTGTCCTCCCATCCTAGGCACGATGGCTTTAGA
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AAATAGATATATTAAAAAAACCTTCAACATCATTAGTCATTCAAGAGATGCAAATTAAAA
GTGCACTGAGATTCTGTCTCCAGAAAAAATGGCTGTTACCAAAAAATGCTGCTATCAAAA
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GCAGTTGTGAGTTCGATCCCCGGTACCGATAAAAAGGAAAAAGACAAAAAAACAAAACAA
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AAAACTGAAACTGGAGGTTCCATTCTACTCAGCTGGTCACCTTCTTGGTATCTTCCCAAA
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GTACTACACTGCCATAAAGAATGATAAGCTTGAGACATTTTTAACTAAATGGATGCACCT
TGAGACCACACTCTTAAATAAATCTGACACATGCAAACTGCATTGTTTCTCTAGTGTGAG
AAACTGAAAGTGAAAATAAAGACCAAAATATATAATAATTGGAGCATGGAAAGAAAATGT
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CATAAAAGATAAAGGATTAGCACAAATCTTAAGTAATCAGGTACATGAGATCCATGTTTG
GGGATGTAGCTCAGTGAAAAAAGTTTTGCTTAGCACATGTAAGGCCTTGGATTTGATCCT
CAGCACCCCCAAGATCATCACTATAGTAATGATGATAAGGCTCCTGTGATGGTGGATCTT
TTTGGGGTAGTGATTAGATATTTCTGTAGTTTGAAGTGCTGTTTGGATGATCCTAAATCA
AGATTCTCTAGATCATGTTATCTGAGCTCTTTCAGCTGGCTGAAAAGTCTCCGAAGATTT
TGAGAAGAAAAAAAGTCAGTCCTGATAAGGTTTGTTGCGAGAAACAGGCCCACTGTAGTA
AGTAGCGCACTCCACACCTGGAATCCCAGCACTGAGACCAAGGCAAGAGGATCACTGTGA
GTTCAAGGCCAGCATAAACTGTATGGCAAAACTCTGTCTCAAAAAGAAGAAAAAAACCCA
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TGGCAAACTCATTGTGTAGGGTTGTTGTAAGAATTAAATATAACTATGTAAAGCAGAACC
GTCCCTTGTCACATAGGAAATGTGTAAATTTCTGCTTACATTTATTTTTGTCTCTTAATA
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ATTACCAGCAGTACCAGAACTACTATGCCCAGTGGGGCTATGACCAGAACACAGGCAGCT
ACAGCTACAGTTACCCTCAGTATGGCTACACCCAGAGCACCATGCAGGTACCTGTGTCTT
GGCAAGTCTAGCCCTCTTGGGTTATGTTTCCTCTCTGGGACAGGTCATTCTCTGAGATGG
GGTTGGGTATAGGGAGCTGGGCTTCAGAAAAGGTGGGGAAATGGTAAAGCGACATCTTAA
AAATAAACCATGGCATCAAAAAAAGTGGGGGGCTGGGTAGCATAAGTGCCTGCTTTGCAA
GCATGTAGTTGAGTTTCATCTCTGGTACCCAAAAAAAGGGGGGGCGGATAAAACATGGTA
ATTATGGGGTAGGTTTTCACTGGGCTGATCACTCACCTCTCTGGTCTCTTGACAGACATA
TGAAGAAGTTGGAGATGATGCATTGGAAGGTAAGAAAGACTCCACTTTTATTCCTCGGTC
AGCTCTTATGAAATGATTGCCTTGTGAGGAATGCAAGGTAAACTGCTCTGAAGGAATTCA
TATTCTTGTGAGAGCCAGATATGCAGACACAGAGCAAGGTGTGACAGGGTATCAGTACGG
TTCCCAAGAAGCCCATCACTCCCTCCCCTGAGTATGGGTCTAACAATACTGTTTCTTGTT
TCGTCAGTTTGACATTGTTTTTGCTAGGCATGGTGGCACACACCTATAGCACTTGGGGAG
GCTGAGGCAAGCCTGGGCTATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTTTTCTGAAGT
TTACAGCACCACACCCAATAATAGCCATTTCTTTTTATCGGTACCAGGGATCAAACCCAG
AATTCCCTGCTTGCAAGGCAGGTGCTTATGCTGCTGAGCTAAATCCCCAGCCCCTGATAA
TAGCCATTTTTAAAAAAAAATTCATGTCCTTTCAAAGTACAACCTTTCTAATCACTGTTA
CCTAGTCCTCTAGCTGCTGGTCACTAGCCATCTATTTTCTGTTTCTCTGACATCCTAGGC
AAGCTCTGTACCACTGACCCATATTCCTAGCCCTATGTGTTATTTTTTAAATTTATTTTT
GCAGAACTATAGAGGAATTTGGAACTTCACACTGAGCCACATCCCTTTGTAAATTTTGAG
CTTCAGTCTCAAATTGTCCAGGCCACCATGCCCAGCCTTTGGTGTTTGAATTGAACTGCT
CCCGTCCCTTAGCAGTTTTCAAGGCACATCCATCCATGCTGTAGCCTGTACAGATGCTGC
TTTCTAGTTGGGACTAACACTATCTCCCTCCCCACCTTATTTTTTTTCTCAACTACACTG
GCCTCAACTCATAGGATCCTCCTGTGTGGCACCACACCACCCAGCTTTCTCCCTCACTTT
TTTGATAGGGTCTTGTCCAGTTGCTCAACCCTCAAACTTGAGATCTTTCGGGTTCCCCTT
CCCAAGTAGCTGGGTTAACAGGTTGTGTGACACCACACCTAGCTTCTAAATCCAAATTTC
AAATGAAGACCAGTCCAGAAAATTAAGGTATAGAGACACAGCTTTTATAACAAATCTGGA
AGCAAAAAACCACCACCATTATTTTAGAAAGCTGGACACAAGTACCCTTGTATTCGATGG
TTATTCCTTCAGCCTGCCCTAATGTCAGCCTTGCTGTTCTCCCAGACCCCACACCACAGC
TGGATGTGACAGAAGCCAACAAGGAGTTCATGGAACAGAGTGAAGAGCTGTATGATGCAT
TGATGGACTGTCACTGGCAGCCCCTGGACTCCGTG
Chart Advanced