SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000475_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesCavia porcellus (Guinea Pig)
Transcript IDSPT00000475
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000378_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000475_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Guinea Pig (Cavia porcellus) # Full length # Reverse
CACGGAGTCCAGGGGCTGCCAGTGACAGTCCATCAATGCATCATACAGCTCTTCACTCTG
TTCCATGAACTCCTTGTTGGCTTCTGTCACATCCAGCTGTGGTGTGGGGTCTGGGAGAAC
AGCAAGGCTGACATTAGGGCAGGCTGAAGGAATAACCATCGAATACAAGGGTACTTGTGT
CCAGCTTTCTAAAATAATGGTGGTGGTTTTTTGCTTCCAGATTTGTTATAAAAGCTGTGT
CTCTATACCTTAATTTTCTGGACTGGTCTTCATTTGAAATTTGGATTTAGAAGCTAGGTG
TGGTGTCACACAACCTGTTAACCCAGCTACTTGGGAAGGGGAACCCGAAAGATCTCAAGT
TTGAGGGTTGAGCAACTGGACAAGACCCTATCAAAAAAGTGAGGGAGAAAGCTGGGTGGT
GTGGTGCCACACAGGAGGATCCTATGAGTTGAGGCCAGTGTAGTTGAGAAAAAAAATAAG
GTGGGGAGGGAGATAGTGTTAGTCCCAACTAGAAAGCAGCATCTGTACAGGCTACAGCAT
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TTTTTTTTTTTGAGATAGCCCAGGCTTGCCTCAGCCTCCCCAAGTGCTATAGGTGTGTGC
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GCTCTGTGTCTGCATATCTGGCTCTCACAAGAATATGAATTCCTTCAGAGCAGTTTACCT
TGCATTCCTCACAAGGCAATCATTTCATAAGAGCTGACCGAGGAATAAAAGTGGAGTCTT
TCTTACCTTCCAATGCATCATCTCCAACTTCTTCATATGTCTGTCAAGAGACCAGAGAGG
TGAGTGATCAGCCCAGTGAAAACCTACCCCATAATTACCATGTTTTATCCGCCCCCCCTT
TTTTTGGGTACCAGAGATGAAACTCAACTACATGCTTGCAAAGCAGGCACTTATGCTACC
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CTGGGTGTAGCCATACTGAGGGTAACTGTAGCTGTAGCTGCCTGTGTTCTGGTCATAGCC
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TTGACTGTATTCCACTGGCTTTACACGGCTCCTTGTATTAAGAGACAAAAATAAATGTAA
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TTCCTTCTCTCCCTACAACCCCTCATCCGCTCCCTATTTACTTAAGTGTCATTTACATTT
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GGGTCTATTCATTTCCAATGCCCATTTTTGGACTGGGTTACCAGTTGTTTTTTACTTTTG
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GAGGACACATTTTCTTTTAGGGGTCTGTGGACCCCCCCGAACCCCCCCAACGCCCCGGTA
CTGGGAATTCAGGAACTTGCACTTACCAGGCAGGCACATATGCCACTGAGCTATATCCCT
GGCCCAAGTACTGCAGATTGAACACAGAGCCTTTATACTAAGTATCCCCAGGGCTTTATT
TTTTGAGACAGTCTCACTAAAGCACAAAATTATCCATGATGGGCTCAAATTTGCAATCCT
CCTGCCTTGGCCTCCTAGATGCTGGGATTATGAATATGCACCCTGCCAAATTTAACTGTA
AGACTAATACTACCCTGAGCTGGATTGAACTATTCCTAATGCCACACTGTGCTCCTAATA
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GTGGCATAGTCACTGCTAACCAAAAACAAAATGTCAAGCCTATAAAGGATCCATTATCTC
CCACATCTTAACAACTGTGTACACAACAGCCTCATAAAACAAGCCTGAGGGCTGATCCCC
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AAGCAGGAGCCAAGTATGATACAAATAAATCCCTGTTACAGAAACTGCAAATACTTCCAG
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TACACTGGGGTAACTGAAGGGATAGTCTAATTTCTCTGGCCTGGCACTGGTTTTGCCCTC
TCTGGGAAACTGCGTATTTCTGCTGTTTGTCACCTCCATTCCCAAAGGCTGAGGGCACCA
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TCCCTGCCTCCTTCTCTCCTATGGGCACAATGCATCTGCCTACATTAACCATAATCCTCC
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CTTCCTGTCCCACTAGCCCGCCCTTGGCCTATAAAAGATGTGATCACAGGGCTGGGGATT
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TCTTTATTTAATCCCTGTTCCCCCTCCAGGTACACCCCACGGATTGATCCGTGGGCCGGA
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CAGAGAGCACTTTCTCTTGTTATAGCCTCATCTTCAAAATCAAGGAAGGGCCTGCACAGC
TGTAGGAACTCAGTAGTTACTGACTGAAAAGCTGGTGACACTCCAGAAACTGTCAAAATG
GTCAACATCAAAGTATCTGCTGGACAGATAACATGCACAAAAGACTTATATAGTTGCTAA
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TCTGGACAACTCTGTAAAACTATTTCAAAAATTTTCAAAAAGAACTGAGGATGTAGCTCA
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TCTCAGCATGCAGGAAGCTAAGGCAGGATTGCAAGTTTGCGGTTAGCCTGGGCTATGTAA
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ACAAAGTCTCACTATACAGTTTAGGCTGGCCTTGAGCTCACTTTATATCCCAGTCTGGCT
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TTTCTACTTAGAAAAGTTTTTTTTTTAAAGCTAGTATAACAGCTGCAATAGTGATATATA
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ATAATGGTTGATACATTATATCAACTTGAGATATTTATAAGTTTAAGCCACTCAAGAAGG
GGCCAGGATCCTTATTTTGTAAACATCCTCAGCCTGTGCAAGAGGAAGGCACAGAGGTGG
TCTCAGTACTATATTTGCCCTGGTGCGGTGGTGGCTTGCTGGTAATATAAGGCAGAAGCA
GCAGCTTACTCACCTACTCACCCTCCTTTTGTTCTTGCTGCTTTTGCTATCTTCTGCCAC
CTTGAAGAATTGGCTCTGTGCCACAACACTCTGCCTTGGAGCCAGCTGATTACAGACAGA
AACCTCCAAAAACCATGAGCTAAGTAAACCTTTCCTTCCTTAATTTGGGGTGTCAGGTAT
TTTGTCTCAGCAACAAGAGAAAAGTAACCAAGACACCTACTAGTGTTACGTGTTTTAAAA
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GGATGTAACTTTTTTTTTCTGCTCAGTTCTTTAATTACTATGAGACAGTGTCTCATTACA
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ACAGGCCACCTCATTAGTATCCTTTATCTAAATTCAATGCCTTACTAATTCTATGGACAA
ATTCCCGATGGTGGCACTTACTGAGAAAAGAGCAGGGACATTAGGAATGTACAGCCAAAC
AGCTTTTCTACTGTTGGTGCCACTAATATTGAAATGGACCTGCCTGCCCTACCACCTAGT
CTCTTAAGTTTTTGGAGTGGCTGCGGCTGGGGATTTAGCTCAGCTGGATAAGCACCTGCC
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AAAAAAACAGTTTTTGGAGTGGTGAGGTTATGTTAGTTCATCTGTAACACATAGAACCTA
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GCACAGGTTTAGACCCCAATCCTACTGCTCCTTGGCACTCTGTCAGGGCTCGCTTCTGTT
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GGTAACATATTGTAATTTAACCACTTCTCTGTTAGTAGGTTGTATCTATTGGCCATACCA
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GCCTCAGCCTCTGAGAGTGCTGGGATTACAAGCATGTGAAGGTGTGCTTTACCATGCCCA
GTTGACGGTGTTTGTAAAATTTCATATAACCAGGCTTGGTGGTGACACAGGCCTGCAATC
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AGAATGGTACTGAACGTGTGATCCTCCTGTCTCCAGAGTAGCTCCAGAGTTTACAGATAT
TCACAACCACGCCTACGCATAGTAGGTAAGTTCTCATGGAATACAAGCTCCATATTGTGA
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TTTGCTATGCAGTTCAGGCTGGCCGTGGGCTCACTTTGTAGCCCAGGCTGGTCTTGAATT
TGCAATGATCTGCCTGCTTTAGTCTCCCAAGTACTGGGATTACAGAAGTGTAATCCCACC
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CTTCCTTCTAGAAGTGACTGGCACACTGTCATTTTCTGCAAGTTGATGCTACCTTGGGAC
TGCTCCGTACTTACCTATTATCTGGTTGTTTCCCATAAGTAGCATAATTCAATTTAAAAC
GTTTTGCCTGGAAATTTAAAAACAAACACACTAAAACAGAGAAAGGTGTTTCAAGAGTCA
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GCCAGCTCCATGTTCTATGAGCCCAGGTGTGCCAGCTGGTGCAGCTGTAAGCTAAGTAAC
TGTGGGAAGAGCAGAATGTAACTCTCTTGAAATGTGTTCTTGCTGCTGCCAGCCTGTTCT
AGTTTCTCGATCAGGCAAAAGAGCTAGCATTTCAAATCTTCCATCACAGGAGGGAGGCAG
TGACACAGAGTGGAAAGGGGACAGGTTTTGGAGGCAACCAATCTTGTCTGAATCTTGGCT
GTCATTTACTATCTTTATTGCCTTGAGCAAGTTATTTTACTTCACTGAACTGTTGCTGGT
CTGTCAAAGATAACAATGCCTACTGCACAGGGTGATTTTAAGATTAAATAAAATACACAG
TAGGGATTCAATAAGTGATAGTAATTAATGACAAAAATGGTGACATCATCATTATCTAAA
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AGCTGTGGCCAAATCTGCAAATTCTACAAAGCAGTAGCCAGCTGGGATCCTGAAAAGCAA
GCACACAGAACAAAATGGTTAATCCAGTTAAGGTTTCACCCAAAAAAAAGGAGAAATAAT
TTTCTAATCACAGCCTATACTACTTTTGTTTGCTGCCACATTCCAGTGGAGATGTAACTT
AGAAAACTGAACATAAGGACTGCCAAGCTAGATACATTCAGTAAAACTTCGTTTACATAC
TATATTACCTGTGAAGTACTCATGCTAATGTTTTTTTTTTTTTTTTGCCAATAATGTTTT
TAATGGAATTAAATCAAGTGTGTAGGTCTAACATCCACTTCAGCGGTAACTAACCTATTG
CACGTGTACCACCGCCAGCTGTTAACTAATGAAAGCTCTAAAAAGGTTCATCATCACTGA
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GAATTCAGAATACAGGACATTACCTAGGACAACTACTCTTGATCTCTACTTAAAGTGAGT
ACTAGAAGCCTGGGGGGTGATGCACACCTATAATAGGAGCACTCCTGAGGCTGAGGCAAG
AGGATCATGGTGAATTTGAGGCCATCCTGAACTACATAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAT
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CTCTGTCTCAACAATTTAAAACATAATGAACGCAGTGTTTATTACCTAGCAGGCTATAAT
CTTGTCACAGAATATATAACACTCACTATTCTAACAGCCTAGTAGGAATTCATTTAATCC
TCACTTACGAGGTAGGTGCTATTTTCCCCATTTTCACAGTAGAGTAACTTACCCAAGGTC
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GTTATATACACTGTGAATTGTTACCCCTTAGACCCTGTAATTCTCAGAGATAGATGCCCC
AGGAGTAGACAGAAGCCCAAAGCCCTTCCTTTTCATATTTACATTCTCTCGAATGTAATG
GATCAGCTGCAGCAAGATCCATTAAGGGAGAAGTGGGAAGATGAAAAAGACACGCACCCT
GTGAGGCGGTTTCGGATAATCTTGACGCTCATCACGGTTTCCCCCATGGTGGCAAAGGCT
CTGGAGATGAAGTTCTCATCCATGTAGGGTTCCAG
Chart Advanced