SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000560_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein S (SelS)
SpeciesCiona intestinalis (Sea Squirt)
Transcript IDSPT00000560
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000464_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000560_2.0 # Transcript # Selenoprotein S (SelS) # Sea Squirt (Ciona intestinalis) # Full length # Forward
ATGGACGAGGACATTTTAGAAGCTCCCGGAGATCCGAATACTGCTGGAAGTGCAGGGAAC
CAAGGACCTTTAATAAATGAAAACCCGTACGTCATGATGTCGGTTTTTAACCAAGGTGAA
CATGTTTTTTATTTGTAGTTGAGTATTTTTAATGTTGTGTGCAATTTTTGTTTCAAAACA
GTAGAAATTTATTGTTATCATTTGCTGTTATCATCAAAACAGTAGAAAATCTAACTGTTA
TCATTTGCTTTCTATTGAACCTGAATGTATTTTTCCCTGTATAAAAATACAAGATTCGTG
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GTCAAGAATTTGTTTGGTCGCAGGAAGACATATTATGATGACACAGAAAACATGAGTAAG
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TAAAACAATGTTGTCTCTGTTTCCATGCAGTAATAACATATTAACATAATAAACTTTTCT
TTACTGTAATCTCATGTATGTATATTTCATAAGTGTTATAACTTATAACTTTCAAACATT
CATTTTATTTATATATATACTCTTAATTTTGGCCGACTTGCCAACTGTTATCTGAATTTA
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ATGATGCTCTTAAAGCTGGGAAAACTCAATCAAAGACTTCTAAGAAGTTAGATCAGGTAA
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GTGCTGTCTTAATGTCGGCACTGAACGACTTTTAATGTCTGCTCATTATTCTTTTCCTGC
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ACAGTCACATATTAAGAGAAATAAAGAATCCAAGCCTTTAAGATCAAGTGGTAAGTTGTG
TTTGGATTTGGTGAAACATAACAGTGATTGCTTCAACCCAGTGGCCCCTTATGCGTTGTC
AAAATTGTCAGCCATACATTAAAAAAAATCTCCTAAAATAATTGCAGTTACATATGTGGT
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TTAGGCGGTGGGCCTTCTAATTCTGCGCGATGGCGACCAGGCAACAGTCGTCCTTCTGCT
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AAACCCACGCTGCCTTTGCATGGCGTGGGTTTGGTATGACGTAAACGACGTAAAGAGCAT
CAACGCTTCGTCGTTTATTGATGTTACATCACTATATCGTG
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