SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000565_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein W (SelW)
SpeciesCiona intestinalis (Sea Squirt)
Transcript IDSPT00000565
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000469_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000565_2.0 # Transcript # Selenoprotein W (SelW) # Sea Squirt (Ciona intestinalis) # Full length # Forward
CAATACAGTGGTAGCTGAGGGTATTATGGGCGCTTCATGGACCTCAAAAACGACTTGGAA
TCTGGATGTCCCAATGCAGTGGTGTCTGGTTTTGTCGGTCGTGAAGGTAATTTGAAATCG
AATGTGCTGTTCGTATTTCAGTTGATGGATGTAATGTTCCACACTAATGTTAGCTTTTGT
AAAATGGAAAGTAAAGTCTGGCCTGCCATTAATTCAGAGGTAATTGGTTCAAAGCCAGTC
GCTTTTACCATTGTGGGCTTTCGTGGTCAAAACACTCAACAGCTATTGCTCCAACCCAGT
GGTCAATAATGGGTTGTCCAAATTATCAGCCACACATAAAAATAACCCCAAAAATAATCA
CCTACAAAGAAACATACTTGGTAACTCAAAATCTGGCACGAGGTGTATGAAACAGTACAC
CTGTGTTATACCAACTGTCGTTTTCCGGCCACGCAAAGATAAAGTAAATTTCATTAACAA
AAAAACTTAAAGGTTTGACAATTTTAGATATTAAACTTTCTAACAACTTAAAGAATGTCA
TTGCTTCGTCATTTTGTTAATCAAACCTCCTTCACAGTATTGTACAAAATATTGTCAAAT
TAACAATCAGTGTTAAATTATTTACCAGGTTCATTTGAAGTGTCCATAAATGGGAAACAA
ATATTTTCAAAACTTGAAACTTTTGGATTCCCGTACCCAAATGATGTAAGTTTTTTATAT
GACAAAGTTTGATTCCCAAATCTACCTTAAAACTTAATTATTATATTTTAAACTTTCTAT
TTGACTTTAGGAATATGAATCCCGTAATAAGATTTAATACAAAAAGACTCGAATCTCACG
GATTCTAAATTCTGTAATGTGCGTCCCTATATATATGACCAACTCTAATGCACAAAGCTA
CTTTAAAACTTAATTATTGTATTTTAAACTTTCTATTGGATTTAAAAAATCTAGTGTTAC
CTATAAATAGGAATGCTATGTAACCTAAAATACATTAAAGTGTAAATTTATCTTATTTTC
AGCTTATTGAAGCTATGAAGACAGCTCAGAATGGGGAAGAAGTCGCTGCTATTAATAACA
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AAATACATGTGCTGCTTTATCTGTATGCCTTGCACATTAATGAAGGTTTGAATTTAAAGT
GGTTAACACCACCGATTCAAACTGGAAACCTGTTGTAAAGGCAGAA
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