SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000620_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000620
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000524_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000620_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
CAGGATGTAAAGCTCTCTGCTGAAGTGGAACCGTTTATTCCTCAGAAGAAAGGCGTGGAT
TCTTCATTATTACCCATGAGTCTGTGCGGTGAGGGCGGAGCTGAGCCCACGCAAATCCCC
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ATTAATTTATTAATTTATCTATTTAATTATTTATCTATTTATTTGTTTATCTGTTTATCT
ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATCTATTTATTTATCTATTTCTTTTATTTCTTTATC
TATTTGTTTATTCATTTAATTATTAATCAATTTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC
TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC
TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC
TATTTATTTATTTATTACATAATTTAAATTAATTTAATAAACAGTATACACTAAGATATA
CTGACAAAGCAAAACAGAATGAGAACAAATAAAGGTGTGTGTTTGTGTGTTTTAAAGTGT
GTATGTACTTGCATGGTGGGAGATGGGTAAAGAGATCTATTGGCTTTAGTTCTGCTGGCG
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Chart Advanced