SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000623_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000623
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000527_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000623_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
ATGAACAGCGAGAACTTCAGGCTGAGTGAGAAGCTCGTGTCCGCCTCATATGTGCGGCAG
GGTCTGGACGCGCGCCGCGGGCACGAGCAGCTCATCCGACGGCTGTTAGACCAGGTAATA
ACACACGTTTGGGGGTAAAGTTGGTTTGTATTTGCACATTCGTTCATTTCTTAACAGTCA
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TTCCCCCACAGTCCAAACACATGTGCTGTTGGTGAATTTGGTAAGCTAAGTTGGCCGTAG
TGTATGGGTGTTTCCCAGTGGTGGGTTGCGGCTGGAAGGGCATCCGCTGCGTAAAACCTA
TTCTGGATAAGTTGGCGGTTCATTCCGCTGTGGCGACCCCTGATTAATAAAGGGACTAGG
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TGGAGTTTGCATGTTCTCCCTGTGTTGGCGTGGGTTTCCTCCGGGTGCTCCGGTTTCCCC
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TCCGCTGCGTAAAATATGCTGGAATAGTTGGCGATTCATTCCGCTGTGGTGACCCCTGAC
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GTGCACCAGTCTTAGGCCACTAGTATTTTCACCCAAGGTCTTGTGTAAAAATACTGTAAA
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GTCTATGGTGACCGCTGGTAAGATTCACTCACCACAGCTTTCAATACAGTTTCATTCCTA
GCCCAGAGTATAGGTAGAACACATAGAAGAGAGATTAGAAATTAGACTATTCATTCATTA
GACTATTCATTTATCTAAGTTTTAGGAACAACAGATAATAAATTGACTTCTAGTTCAACT
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GTTCATTCCACCACTTCCTGTTTCGCACCGCGTGTCCCTGACAGGCAGGTCAAAACCACT
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TAAAATAATACTTTTCTCACTAACGTCTAATGTCAAATTATTTGTAATCTTTTAAGAAAC
TGCCATGGAGACCTTAAGCATAAATATCTGCGATGTAATTTTATTATATTATATTATTTT
TTATTATATTAAATTATATTATATTATATTTTCTATATATTCTATTCTATTCTTTTATAT
TATATATTATATTATATTATATTATTTTTATCATATTATATTATATTTTCTATATATATT
ATATTATATTTATTATATTATATTTATAATATTTTCTATATATTATATTATATTTATTAT
ATATTATATTCATTATATTATATTATATTATATTATTTTTATCATATTATATCATATTAT
ATTATATTTTCTATATATTATATTATATTATATTATATTTATTATATTATATTTCTTATA
TTATATTATTTTTATTATATTATATCATATTATGTTATATTATATTTTCTATATACTATA
TTATATTATATAAATTATATTATATTTATTATATATTACATTGTATTTATTATATGATAT
TATTTTATTATATTATATCATATATTATATTATATTTTCTATATATGTTATTTTTTTATT
TATTATATTATATTTATAATATTTTATTTTCTATATATTATATTATATCTATTATATATA
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GATAAAATATATATTTTTTAATTTTCGTCAATATTTTTTTATTCTAAAAATAAATTTATT
TAGTGATCAGATCCATTTATTAATTGATTTTAAATACTTTTTATTTGTTTTGTTTATTAC
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GCTTATGGAGTGCAGTCGTCCAAATGTATGCACCTTATTCAGCAGGTAACACTTTACCTT
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GGATAAAAACTTCATGGTCCCAGTCGGCGGTGCAATTATCGCTGGGTTTGATGAAAACTT
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TAGTGTGTGAGTGATCTGTTACAAACGAAAGCAGTTGCGTTTATTTTATTTTATTTATTA
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TAGCTTAGCATAATGAATTGAATCGGATTAGACCATTAGCATTTTGCAAAAAAAGAGTTT
TGATCCTTTTCCTGACTGAAATGAAAGACTGATAGAAATTTAAAAATGACTATTGTCTAA
GCCAATATTGCTAGGAACTATGCTCTCATTCTGACGTTATTGACTTGATTTTTGCCGTCA
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ATGGCAGCAGTGTGTGAATATAACCAGCTTCTAATGATAAACAGTAATTAGTTCTATTTT
ATAATAACCACGCTTGATGAAAAACACTTGACATGCTTTGTATGTGTCATCAGAAAGGGA
AAAGCCCCACCTACTAGTGACCATCTCATTAGCATAACCCGCCCTAAGTGAGAAGCAGCC
ATCAGCCATTAAAGTTTTGCATCTTCCACTATGCTAATGCATATGCATTTGTAGCTCCGC
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CAGTTTTCAAAGATTTAATCTGTTTTACCAAGTTTGATTATTATAAAAATAGAATTAATT
AATGTTTACCGTTAGAAGCTGGTTATATTCACACACTGCTGCCACACAACTGAGTTTAAA
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GTCTAGATTGAGTTTTTGAGCCGGTGGTTGTTTCCAATTGGCTCTCCGCACACTCTTTTC
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GCCTGGGTTTGTGTTGTATATCACACTACAGAAACCTTGTAATAAACATCCAGTATATTT
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TAGATGTCCTCATCACACTGCTCACACTGGGAGCAAACGGATACAAGAAACTCCTGGCGG
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CCGCTTATATTTAGCATTTGTTGTCCCGCTGCCCATCCCACCCCGTTTTCTAGCCGAACG
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AATCCAAAAAATATGCATCACTAAAATCTCACAAAACAAATGCCGATCTATATCTGTTAA
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TCCCCTACAGTCCAAGCACATGTGCTATAGGGGATTGATGAACTAAATTGGCCGTAGTGT
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CCCTGATAAATAAAGGACTAAGCTGAAGAAAAATGAACGAATGTAAACAATATTTAAACA
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TTATTTTTTTAAAGGTAAGTGGTTGCAAACTATTAATATGGGCTGATTTTAAACAGTGCA
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TTTAAATGTCACTTTAAGCTGACATTTCCATGAATTCGGTCAAACTACTCGGCTCGCATA
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TTTAAAGAAGAACTGGAACAGGTGTGAGTGTGTGGTGCATGACAGGATTTGTAGTTCCTT
TGGTGACAGGATTGTACTCTGGGTGATAGTGAGTGTTCACTATCAGGGTTAGATCGCTGG
TGATCATGACACTGACCAGGCCTATATATTTTATTATTAAATTATTATTATTGTATTATT
AAATGTAGTAAATTATAATCATTTTGATTGGACAAGTGAAAATCTTTCCCTGCTGGGATA
TTCGAAAAAAATCCTAAGCATTAAACCCTGTACAAGTCTAAAATTTCATCCATAACGGCC
TTAATAAGTCTTAAATTTAACTTGGTGAAACCTGCAGGACCCCCGTACTGTCATCATGAC
AAAGATAAAATAAATCAGTGATTAGAGATGAGTTCCCTACTGAAAAAAACAGCTTAAACC
AGCCCAGGCTGATTGGCTGATTATAGCTGGTTGACCAGGCTGGTTTTAGAGTGGTTTTGG
CCACTTTCAGGCTGGTTTCCAGCCATTTCCAGGCTGGTCTTAGCTGGTCAGGCTAGGAGA
TGACCAGCTAAAACTAGCTTAACCAGCCTAGCCAGGCTGAGAGTCCAGCCAAAACCAGCC
TGACCAGCTAAGACCAGGCTGGAAATGGCTGGAAACCAGCCTGGAAGTGGCCAAGACCCC
GCTAAAACCAGCCAACTAGCCTCGGCTGGTTTAAGCTGTTTTTTTCAGCAGGGTTATTAA
AACTATTATGTTTAGAAATGTGTTGACAAAATCTGCTCTCCGTTAAACAGAAATTAGGGG
AAAATAATTCCATAAGATTAAATCATCCTAATAATTCTCACTTCAGCTGTACCAAATTTA
ATAAATCCAATAATTCAGCGTGGGGGAAAGGTACAGGAGGCTGGAAAGCTGAAGCAGCTG
CTGGGTTTACTGTAGGACAGCAGACGCCAAACCCAAAAAACATGCACCTTTAGCAGAAAG
TGCGACAGAAGCGCTGTGTGTGGAGCTATTTATAACTGTGTTTATAATTTTGTGTGGCCC
GCAGGAGCTGTACGGGCATCTGGCGCAGGAGCTGAGCGCTTTAGCCGCGAGACACGGAGA
GAGACTGCTGAAAACACCACACAACCCCATATCACTGGGTGAGGAGTCATGCATAATGTA
GAGCAAACGGCTGAAGGCTTCTGTACAAACGCTCAGTAAACACGCATTCTGCTGTAGTGA
ATGAAAATAGCTCCAGAAATGTTTTGGGTATGAGGCTCAAGGTTTGGCTGGTTGGCGTAA
ACCCCTGCTGGCAGATCCTGTAAATACACCATCTGGCTCCATCTTTCGCTATTGGCGACT
GCTGAATCAGGCTTGTGGAAAATTAGAACAAAATGAAATAAAAGACCATTTAGACAATTT
AACACTTGTTTATTGTTCAAATTGACTCCCCTTTCATTATGTTGGCGGCTGTTTTTACCC
CATTGACTTCCATTATAACCACATGTTTTGATTGCAAAGCCATGACAGCATAACATATTG
ATTGTTGGTGGTTTTCCCTGTTGGGAAGAGGTCAAATTTATTATTTGTACTGTTGATCAT
TAGTTGGCTGCATTAACCCTTTAGATAGACCTGTGCATTGACGTTTCTGGCTTTTATATG
GAGTTCAGTGGAGTTAAACAGCAGATTATAGTGTGTGTGCAGAAATACACTTACTGTGTT
TAACATGTTCTGAGAGCTGAGCTGCTTATTTTGATTTGTTTCAGACATATCAAGGTAGAC
TACCTGACAAAAGTCTTGTTGCCTATCCAAGTTTTAGGAACAGCAAATAATAACTGAGCT
TCTAGTTGATCGTTTGGTGTCTGAAGTGGCTTATATGAAAGGCAAAGGCTTCTAGATGAC
GCTTATTTGAGCACAATAAAATCTGATAATGTCTTGATGTTGACTGATGTGATTAGGACA
GTAAGGTCTGACTCTGCTTAGACTAAAGTCTCATCACAGAACAGAAATAATGTCCAGTAT
AGAATATAAAGTCCTGCTGCAGTGGAGACAGAATGAATATTGTGTCTGACTCCATCATGA
GCTTGGAGGACTGCATCCATACATCTCTGACATGACTCGCATCACTGATTAATAAAGTCA
TCTGGAATGGCAAAGAAAGCGTTCCTGCAGGACTCCCAGAGCTCATCAAGACTCTTTAGA
TTCATCTTTAACGCCTCCTCCTTCATCTTACCCCAGGCGTGCTCAATAATGTTCATATCT
GGTGACTGGGCTGGCCAATCCTGGAGCAGCCTGACCTTCTTTGGGTTCAGGAGCTTTGAT
GTGGAGGCTGAAGTATGAGGAGGAGCGCTATCCTGCTGGAGAATTCACCCTCTCCTGTAG
TTTGTAATGTAATGGGCAGCACAAATGTCTTGATACCTCAGGCTGTTGATGTTGATCATC
CACTCTGCAGATCTCTCGCACGTTCCCATACTGAATGTAACCCCAATCCATGATTTCTCC
TTCACCAAACTTGACTGGTTTCTGTGAGAATCTCGGCTCCATGTGGGTTCCAGTAGGTCT
TCTGCAGTATTTGTGATGATTGGGATGCAGCTCAACAGAAAAATCTACCTTCTGCCACTT
TTCCAAATGATCAACTTGAAGTCAAGTTATTATTTGTTGCTCATACAACGGGGATCCACA
ACAAGACTTTTATCAGGTAGTGTAAGTGCTCAAAGGTCTTACACAGACTGTAACTAGGGA
TCAACAGTAAAAATTACAAATGTTACCTCCAACATTCTGCATGATTATATGCTGTCATTG
CTTTTCATCGAGTGTTTATATCACAACTCAAATAACTGCATGTGTTCTTGTGTTCTCCAG
CGATGTCCCTGAACCATCTGGAAGCCCACAGTAGCTCTGCAGTCACTCAGCTGGGCTCCA
TGCTCTTCACCAGGCAGGTTTCTGGAGCCAGGTGAGCTTCTGACCTTTTTATATTTATCT
TAGAATTTCACATCAGAGGGGAAATTAAAAGGTTTCCTCAGTTTTCGCATGGCATCAAAC
CTAATATCATATACTCTATGAAGCCAACTAAATACTAACCTTTGGATGAATAGTTGTGAT
GCAGAAATCTGTGTTTGTTGATTGACATTTAAGGTGTGGCTTCAGTCTCCATGGTGAAGC
TTTTGTTTACAACTCGCTTCCTAAGTGCTAGAGATTTGACTGAATGAATATTTCCACATC
CCAAAGCTGCATTTTGTGTGTTTATATTTTCCGCCGGACAGCGGCTGACCTGCTGTAATA
TTGATGAAATCTTCTCTCTGCCGTCCGCTTTCATTATTTAAATGGGAGTCATTCTCGTTC
TCATGGGTTTCGCTTCAGCATTATCCTCTTCACCCCTTTTAGCCTGTCAAAAGCTATACA
CTCTATATCTGCAGTGATGGATGTGCAATGAATAAATATCATGGAAGAGTTTAAGACCGA
ACAAAGAAAGTCTGTTGTGAATTTGGAAAGTGTAAAATGTTATTAATTCATAAAGATATT
TGCCATCTGTTTGGACCGTTTGACTCATCATTTTTTACAGAACTGGTTCAATTAATTACT
ACTGGTAAGATATTGGTCATCGTAGTGATAATATTAGGATGGCACAATTAAGTAGAACAA
GCAACACAGGCTTATTGTGAATACATACCCCTGTATACATGTCTGGAGAACGAAAAATAT
GTAGCTAGATGTACATATGGCTGCATTTCGCTTTTAAAACGAACGCTATGGGGCAGTTTG
ACGCCTCCGATAGCTTCTGGTGAGCGGGTCAATCGGTGCTTTTGAAAACACTGTAGGTTG
GGTTTAGGGACGGGCGGTGGGCGGGTCAATCGGTGCTTTTGAAAACACTGTGGGTTGGGT
TTAGGGAAGGCGGTGGGCAGGCCAATTGGTGCTTCTGAAAACACTGTGGGTTGGGTTCAG
GGACGGGCGGTGGGTGGGTCAATTGGTGCTTCTGAAAACACTGTGGGTTGGGTTTAGGGA
AGGCGGTGGGCGGGTTAATCTGTGCTTTTGACAACACTGTGGGTTGGGTTTAGGAAAGGG
GGTGGGCGAGTCAATCAGTGCTTTTGAAAACACTGTGGGTTGGTATTAGGGAAGGGGGTG
GGTGGGTCAATTGGTGCTTCTGAAAACACTGGGTTGGGCTTAGGGAAGGGGGTGGGCGGG
TCAATTGGTGCTTCTGAAAACACTGTGGGTTGGGTTTAGGGAAGGGGGTGGGCGGGTCAA
TTGGTGCTTTTGAAAACACTGTGGGTTGGGTTTAGGGAAGTGGGTGGGCGGGTCAATCGG
TGCTTTTGAAAACACTGTGGGCTGGGTTTAGGGAAGGGGGTGGGCGGGTCAATTGGTGCT
TCTGAAAACACTGTGGGTTGGGTTTAGGGAAGGGGGTGGGTGGGTCAATCGGTGCTTTTA
AAAACACTGTGGGCTGGATTTAGGGAAGGGGGTGGGCAGGTCAATTGGTGCTTTTGAGAA
CACTGTCGGTTGGGTTTTGAGGAGTGGGTGGGTCAGTTAGTGCTATTGAAAACATTGTCA
GTTGGGTTTAGGGAAGTGGGTGGGCGGGTCGATCGGTGCTTTTGAAAACAGTGTTGTTTG
GGTTTAGGGAAGGCGGTGGGCGGTTTAATCGGTGCTTTTGAAAACACTGTTGGTTGGGTT
TAGGTAAGGCAGTGGGCGGGTCAATTGGCGGAGCTACAAATGCCGATCTGTCAGCATAGT
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GCGGGGCTGTCCCGCCCATGTACAAAGGGAGAATGTCAATCAAAGTGTTCCTGCAAACAT
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