SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000623_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000623
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000527_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000623_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Reverse
CTACACACGCAACTCTGTGGATCTCTGTGGGCTCTCCTCCAGCTCTCCATCTTCCGCCTC
CAGCTCTGCAGGGTCACTTTTCTCTTTCTTCAGGATTTTCAGGCATTTCTCCAGTCTCTT
CATGCACACGGTGACGTCTCCTTTGGTTATTCCTATAGCAGACGCAGCGTTCAGGTATGG
GCAGGGGTAGGCCTCGGAGTGGGACATAAAGCCACTGAAGGTGTGTCCACTCACAGTCTG
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GACCTGCCTGTCAGGGACACGCGGTGCGAAACAGGAAGTGGTGGAATGAACACACAGGAT
GTTTTCAGCCCCGAACTCCTCAATCTTCCTCTCCACTTCCTCCAGATTCGTCCTCAGCTC
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TTTTTACACAAGACCTTGGGTGAAAATACTAGTGGCCTAAGACTGGTGCACACTATTGTA
CATACATGTATTATTCATTCATTGATTTCCCTTCGGCTTAGTCCCTTATTTGTCAGGGGT
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AGCCGCAACCCAGTACTGGGAAACACCCATACACACTCATTCACACACACTCATACACTA
CAGCCAATTTAGTTTATTTAATTAATCTATAGCGCATGTGTTTGGACTGTGGGGGAAACC
GGAGCACCCGGAGGAAACCCACGCCAACACAGGGAGAACATGCAAACTCCACACAGAAAC
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ACCATTGAGCCACCGTGTCACCCCTTATACATTCATTAATTTTTTTTTCAGCCTAGTCCC
TTTATTAATCAGGGGTCGCCACAGCGGAATGAACCGCCAACTTATCCAGAATAGGTTTTA
CGCAGCGGATGCCCTTCCAGCCGCAACCCACCACTGGGAAACACCCATACACTACGGCCA
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TGACCCAGCCGAGGCTCGAACCAGCGACCTTCTTGCTGTGAGGCGACAGTGCTACCCACT
GCGCCAGCCTTATACATTCATTATATTATATATTTATTGCATAAAAATCGGTCCCAGTGC
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TTATTCAGAAGACTCGAACCGGCGGCTTTCGGCTGAACAGCTGCGATGTCACCCGACCGA
CCGATGCCATGGATCAGCCTGAGGAGATATTAGCAGAGAATTTATTTACAGCTTTTCTCA
GTTGCTTTGGTAAATCTCTCAGATCGGAATTGAAATTTGCAAAACAGTAAAAGTGCATTT
CTCAAAACAATAAGTACAAATAGCAAAACACCATGAATTAACTGCAAAAGTTAGCCTCTT
GCTCAAAATCCTTAGTTCATCTCTTAAAACGAAGTTTGTGTGTCAATGAAAGTGTCAGTG
CCGTTAGAATGACAAGAACTGGTGTCGTTGTGTGTGGATAAAACAGTCAGATTATTTAGT
CGTGTTGTCAATATAGCAGTGCACACTGAAGGGGTCTTCTGATGTAAACTGTGGATTTTT
TTTGCTGTTTGTACTGTAATTTCTTTTAAAAAGTCGAATAAAACATCTATTAATGAACTT
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TAAAAAACTCATTTTAGGTCATCAATCACAATTTTGAGATATAATACATGTACAGTTGAA
GTCAGAATGATTCACCTTCCTGTTAATTTTGTTTTCTTTTTCAGATATTTCCCAAATGAT
GTTTAACAGATACTGGAATTTTTCACAGTATTTCCTATAATATTTTCTCTTCTAGAGAAA
GTCTTATTTGTTTTATTTCGGCTAGAATAAAAGCCCTTTTAAAATTTTTAAACACCATTT
TAAGGTCATTATTATTAGCCCTCTTTAGCAATATTTGTTTGGATTGTCTACAGAACAAAC
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TAATGTAGTATCTTGAATTATTTACTGTCGTCTGCGCATTAGCCTAGTGGTTAGCATGCT
GACATATGGTGCTGCAGCACTTCAGGGCGTCCCGAGTTCGAATCCCAGCTCAAGGACTTT
TTCAAATCCCCATGAAGGACAGAAATAAGTTATTAAAACTATCATGATTAGAAATGTGTT
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TGTATATACCCCAGACGAATGAATGGATTCAAATGTATTTTTGATGTTAAATGATGAGAC
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CAGTTCCCTAAGAAGTTGTTGCTGTCCATGACAGCCAGTTCATTCAGGAAGAGCTCAATG
GTGCTTTCGCTCCAGCCCTCCTCTGGACATTTACCCTACAGCAAAACACAAACACACTCA
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TCTGATGTCCCTAGAGTGTGTGTGGAGTTCAGCTCAAAATATCACACAAATAATGTTTTT
TTTAACTCTTACACACTGCCTCTTTTAGGCGTTATCATAACTGTGTGGCGTTTGGTGACT
GTCGCTTTAAATGCAAATGAGATTGTGCTCTTTTCAAAAGAGGGCGGAGCTACAGATGCC
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AGATGGTCACCAGTGGGTGGAGCTTTCCCCCTCTGATGACACGTAAAAAGGGAGAATGTC
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