SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000628_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein J (SelJ)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000628
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000532_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000628_2.0 # Transcript # Selenoprotein J (SelJ) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
ATGGCTCTTGCCCTTTCTAACAGGGCTATCGGAGCGATTATTGGATCAGCTGTTGCCGAT
GCTGCAGGTTTGCATTACTCACGCATACTACAAAAATACTTGCTAAATGTGTTTATAGTC
ATTATCTATTGTTGCAGTACAGACAACTGTGTATTTACTTAACCCCTGAGTATAGACCTT
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ATTTCTGTGGTAACAGCCACACTTTTCTTCAATTCACCCTTTAATAAAGACATATAATAA
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GCTTCAAATACTTTTTACAGTTAGGAACTAGTTTCATATTATTAAGATTCCTACTTTGAG
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ATAACTTGGGCTGGCCAATATGGCCTAAAATCAAAATCTCGATTAATTGAACATTTAAGA
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GTTATTGAACAACTTTAGTTATAACACACATTGCCTAAAATAAATAGTCACTTTTATTTT
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TATTAGATAATATGCTGTCACAAGGAATCTCTGGCACAGCTTCCAATTATCGTCAATGTA
GTCGTCAATCTAATGTCCTACTTGACCAGAGATCAGATGTGGCTGCAGAAGAATAAATGA
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TTTCCATGATTTGTTTAAATTATTTATGACTTGTTTTTTCTCCAGCTCCCAGGCCTCAGT
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AATTTCTCAAAGCATTTTATGTGAATTATGGTTTTATTGTGGTACCTTTTAGGTTGTGAA
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TGACGTGTACTTACAGTAAAACAGACTTTTAAAAATGTTTTTAATTTCCAATGTTAAGGC
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CCTTCACCCGCTTGTGACACAGAAGAAGAGGAAGAGAGGAAGTTCACACACTTGTTAAAG
TTAGGCTGCGTCCAAAACCGCATACTTGAATACTATATAGTACGCTAAAATCAGTATGTG
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AATTTTCCCATTGACTCCCTTACGATTCGTTTAGCGATTCATTTTTTCCACTGCATGGAA
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GACTTTGAGTGTAGTTTTTAACAGCAGATGGCACTGTACAGGCCTATAGCCAGCCTGGTG
AATAGGGTGGTTCTTTTTTCTCAAAAAGTGGACTTTTTTGCAGTTATTTTCCATTTAATT
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AAAGATGACTTCTCTTATGTCAGATTGTATATTCGCTTGCACTGCTGGATGTTGAAAAAT
ATTTGTTAGCATTGGCAAAAACTGATTAGCTGAAGTCACACCGAAACGACAGCCAACAGA
GGATTCTGCTTGGTCTTTTCAATGGGTTACTCTCACTCTTTATGATGGCATAGCAGTCAA
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GAAGGAATCCCAGCTTCCTGGAAAAGCAAGACATTGAGATGCAACACTTTATTAGATCTT
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