SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000632_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000632
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000536_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000632_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
ATGGCTTCTGTTGGATCTCGTTTAACCCGGTTTTACATCTCACGCCCCGGTGTTATTGCG
CGTAGATTTCTGGCACATGCGGGAATGGACGACATGGGCGTAAGCCTGAGCCGCTCTTCC
CTTGAACGACTCGAGTTTGACAATGTTGCTCTTAAAAAACTTCCTCTGGACCCGTCCACC
GAACCAGGTGTCCGGCAGGTCCGAGGTTCCTGCTTCTCCAGAGTCCAGCCGACCCCTCTG
AAGAACCCGGAGTTTGTGGCGGTCTCTGCTCCAGCTCTTGCGCTTCTGGGTCTGGATGCC
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CTCGGAGATGGAGCTGCGTGTTATCTAGGAGAAGTGAAAGCACCGGCGGGTCAGAGCCCG
GAGTTACTGCGGGAGAACCCGACTGGACGCTGGGAGATCCAGGTGAAGGGTGCTGGACTG
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AATGTACAAAATACAGCAATACCAATGTCTCCACTTTGATTGACATTTGTATTACTGTAT
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ATGTTGTGATACTTTTAAGTGTTCACACTCGTTTAGCTGCAATGCTGAGATTACATGTTT
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CATACAGAAAGGGTTAAATCATGTTCTCTTCTCGGGTCCTCCCTCCCACAAACACATAAG
GCCAGTGTGATTGGCTGGGCCTATTTATGCTGTAATGACAGCTTTTTTTTTTAGCATTTC
TCCTTCACTGTAAGTGTTGTGGACATTAGTAGCTACTTTTCAAAGATTCATGTTTTTAAA
GTCAAGTTCACTTGGAGTCCACCATAATAATAATAAACAAATCTGTGCAATTATTCAAAG
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ATCATGTAAATTGACATATGCAGCATGGAATGTGCTTCATTAATTGTTATTCGCTTTATT
AAGTGTTTAAAGCCTTTATTTATTTATTTATTTATTAAAAGCACGTGTCCACACCAATGT
CAAGAGCCACTCTACATCCTTGGTTATTTATGAATGAATGAATGCAAAATCTTTTATTAA
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GAGATTGCATTTTGCCATATCGCCCAGCCCTAGAGCAAACTGTTGCCCACGTCTCTCAAA
TATTTCCACTGATGCTATTTTCAAAACAGCCCAATGTGCAGGAAGGTCACAAGCCCCGGC
AACACTACTGATAATTATTTATATTATTTATATATATGGATAATATTTCTGTTCTTTTTA
TTTTTTTGTTTTAGACAGGCCGATGGGCGTAAGGTCTTGCGCTCCAGCATTCGTGAGTTC
CTGTGCAGTGAGGCGGTCTTTGCTTTAGGAGTGCCAACCACGAGAGCTGGATCAGTCGTG
ACGTCAGATTCTCGAGTCATGAGGGATATATTCTACGATGGCAACCCACGCATGGAAAGA
TGCTCTGTGGTCCTGCGCATTGCTCCCAGCTTCATTAGGTGACCTTTATACTCTGTGCTT
TTTTTAACCATTTAAGTATTTAGCATTTATTTTCTCATATATGTGTTTTGTTTGAAATTT
TATGTTAATTTTACTTGATATAAAATGTTTAATGTGCGTGCGTCACGGTGGCGCAGTGGG
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ATTTCTGTGTGGAGTTTGCATGTTCTCCTCATGTTCGTGTGTGCTCTAGTTTCCCCTACA
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GTGTTTATGGATGTTTTCCAGTAATGGGTTGCTGCTGGAAGGTCACCCACTGCATAAAAC
ATATGCTGGATAGGTTGGCGGTTGATTCTGCTGTGGCGACACCTGATTAATAAAGAGACT
AAGCTGAAAAGAAAATGACTGACTGATGACTGTTTAATGTAAACTTGGTAATTTTTTATC
AAATTTTTCTGTGTACCTTTATTTTTAGTTTAGTTCTTCAACTATTATTATTATTTAATA
TTTTAAAATAAGGCAAAATTTCAGATTTTTTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTATTATTA
TCATTATAATGTATTATTAATATTTAAAAATAAGGCAAACTTCAGATTTATTATTTTATC
ATATAATATTCATTTTTTTACTTTATTTGCAGGTTTCCTATGCTTTATCAAAACTGCCAT
TAAATAATTGTATGTTTTTTTTATGGACAAAAATAAAGTAAACAAAAACACTTATTTCCC
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TGTTTGCATTGCAAACGACTTAGAAATGAGTTGAGTAGATGTGATCACAGAATTAAAAAT
ACAACAAATTTATTTATTTACATACTTACTTGCATACAACCATTATAAAGAATTAATTAA
CAGACACATATAAAAAGAAGAGCTTAAAATATTGACCATTCTACATTAAGTACTGGTTCA
AAAAAACATAAAACCTCATTTTAAATTATCCTAAGTATTCTACCTGAGGGCAACGAAAAA
ATGTGTTTATTTTTTATTTTTTAAATTTTTCATGCTTTTATTTGCTGCAAATGTTAGACA
TTCATGTCATCAATAGGAGACAGATCACAGCTTCTAAATAGTCTACATTATATCACAAAT
TTGCCCTATTAATAAAAAAGTGTAAGAAAATGTAAACTTAATCTACTCTGTACTTTCATT
ACATTTACATTTACATTTACATTTAGTCATTTGGCACACACTTTTGTCCAAAGCTACTTA
AAATTGAGGAGGCATTCAGCGATTCAACAAGAAGAGGAAACACATGCTAAAAATGCTAAT
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GTTATTTTTTAAAGAGAAGAATGTTTCTGAGGTGATTTGTCAAGTCCACTTACCTGTGTG
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GTTCTACAGGTGGTTTGTCAAGCCCACTCACCTGCATGAGGCACAGTTGGAATTGCTTAA
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TCTCAGTTGATAAGAAGTTAAATCTGACAATCATAGCCAGTTTTAGGTAGCACTTTATAT
TCATCAATCAAAGAGTGTCACTCATGAAGGTCTTTTAGTTCTTGCATTAATTGTTCAGGA
TGTTAATATTTTTTTTATGATTTAGGTTTGGATCGTTCGAGATCTTCAAGCGAGCGGATG
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AGTACGTCATTGAGAACTTCTACCCTGAGATCCATCGCAATTATCCAGACCTCACTGAGA
GAAACACTGCTTTCTTCAAAGAGGTAGACTTACAGCACTTTCTTGTATTTTATCAAACCA
GGGCTAGATATTTTTTCCTCAATGTTTGGTTCCTGCTGTCGTTCATTGGTCTTCAGTTAT
CGTATTATCCTCCATGACCTTATTTACCTGAATGACTTAGGCAGGATACCATCATCAGAT
TTAGCTTCTTATCCACGGAGAGTATATTAGAGCATGTTAGTATAGAACAGTGAGTAAATT
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AAATCTGTAAAACTTCTATAATTTTATTTGTTTAATTGCAGTTTTGACATTATATTATTT
GAACATATTTGTGAACTTGTTATGACTGCCTTGTTGATTTTAAATATATGGATTTTTTTT
TTGTTTTGTTGGTTTTTAATTTTCCTGTAGATTCTCCTGTTTTTTATTCTTCATTGTACT
GCAAGTTTAATTTATTGTACTAACCAAAGGGTCTGATCAGTTTAAATAATTTTTTACATT
TTACTGTTATATTTAAACCATTTTACAACTTATTAAACAGTTTTTTAAATAATTTTTATT
GTTATTTATTATTATTAATATTATTATTGTATTTATTATGTAGTTATTATATTTATGAAG
GAAGTACTTTCCATTGCGTACTGCATAATAGTTGTAGGCAACTTCAAATAATAAAAAAAA
AGTATTGTATGTATTTTGACAAGATGCTATTCAGATAGTAAGAGTTTTTATGTTCTTAAG
ATATTTATTTATTTCATTTTATTTTTGTTCATATATTCATTTTCACATAGTACACATGTG
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TATCACTAAAGTGTTTTGACTTTTTAAAACACGTTTAATACATAGAACCACTAAACATTG
TTCTTATGCTGGTTTTATACAGGAGGAAATGCAAATTACTTCCAAATGCTTTAAATATAG
TCTGTGTTAGTAAATGCAAGGCTATTTAAGAAATCCAGGCATAACTCTGTATGACAATGT
TTCAGATGACTGTTCTGTAGCCCACAGCTAATCAATCTGTCAGATTTTGGAGTGCATTAC
AGGTCAAAAATATATAAATGGTAAGTTATCTTAAATAAAACAAATACACTTAAAGATATG
ATATATAGTAATTGTACGCACCTGGGAATGGTTTGTGAGCATAATTAAGTACACCCAGCA
TGCCAAATCATCTGATAATTGTAAGAAATAATTTTGAAAGGCAATTGACTGTGTAAAGCC
ACAGAAAACAAAACAAAAATATGATGTACAGTTGAAGTCAGAACTATTAGCCAATTATTT
CCCTAATTTCTGTTTCTGTTTTTCAACACATTTCTAAACATAATAGTTTTAATAACTCAT
CTCTAATAACTGATTTATTTTATCTTTGTCATGATGACAGTAAATAATATTTTGCTAGAT
ATTTTTCAAGACACTCCTATACAGCTTAAAATGACAAGTTAATATATAACGATGGTTTGT
TCTGTAGACTATCGGGGAAAAAATTTGTTTAAAGGGGCTAATAATTTTGTCCTTAAAATG
GTGTTTAAAAAAATAAAATAGCTTTTATTCTTGCTGAAATAAAACAAATAAGACTTTTTC
TAGAAGAAAAAATATTTTCTGACATACTATGAAAATGGTTGTTTATACTGTTTTCTTGCT
CTGTTAAACATAATTTAGGAAATTCTTAAAAAAGAAAAAAAACAAAACAAAGTGGGGCTT
TTAATTCTGACTTCAACTGTATATGCCCAGATCAGCCGCTAATCAGCCGGAGTCAGCTGA
GGTGAAGTGACGGCGACCAGTGAGACCTAGCTGTCACTCAAGTGGCAAATCAAGTGGACT
TAATAATACAGACTTAATATAACTTAATATAAACAAAACTGATGAGTTATGTAACTTATG
AGTTTAAAAAAAAAGACTTTACGATGGAGAGTGGGAGGTTGCCGCTTGGTCATAAAAGCA
GTGCCCTTCATTTGCTTAAATGCAAAACATGCAGACCTCATATTTAAGTATTCTTTACCT
GCACAACCCAATTATTCAGTAAATTAAAAAATATATATATATAATATTTTGTAATACTTT
TTTATAAGCCTGCCTACATTCTCAGCATTGCAGAAATTATAGTGCCCTATTCTATAAAAC
ATTCAACAGCATAAAAAACAGTTTGCGTGCTATTGTAATTTCACTTATTTACTATTATTA
TTAGGTGACTGTTCGAACAGCGAGGCTGGTGGCTCAGTGGCAGTGTGTGGGTTTCTGTCA
TGGAGTCCTCAATACTGATAACATGAGCATCCTGGGCCTGACTTTAGACTACGGGCCTTT
TGGCTTCATGGACCGGTGAAGTTTCACTTAAATAAACATTTTGTTTAGAATGTTTGTCAA
ATATTGCTTTAGTGAACAAATAAACATGATTTTCCTGTTGTTGTTTTTTTGTCCTTCTAG
TTTTGATCCTGATTTCATCTGCAATGCCAGTGATAACTCAGGCCGCTATTCTTACCAGGC
GCAGCCGGCCATCTGCCGCTGGAATTTAGCCCGTCTGGCTGAAGCACTGGAGCCTGATTT
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TCTGAGTAACATGAGGAAGAAACTGGGTTTATTGAGGAAGGAGGAACCAGAAGACGAGAT
GCTAATCACAGAGCTCATGCAGACCATGCACAACACGGGTAGGAGGATAATCTCTGGCAA
ATAAATATGCAGTAGAGGTAATGAAACGAACAAGAGGCCAAAATATGAGATTTCTTAGTT
AGTTTAATGTGGTATACTGTATACTAGTACTCTGTCCATGCACCAATTTTATTCATCATC
AAAATTATTCAAACCCTTGGCAAATTCTAACTTAAAGTTACTTTTATTCACACTTCAAGT
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GCATTTTTGATCCATTTGTCAGTGAATATAGCCAATATGTTTTGGTGCATTTAAACAGTT
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GTTTTTATACAAAAGTTTGAATACAGGATAACACTTTATTTAAGGTGTCTTTGTTACATG
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TATATCCCTAAACAACATAGTAAGAACATGTAATTAGTTATTATAACTCAGTAGTTAAAC
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GTGCTGAAGGTCCAGAGCAGATTTTTATAGATGGAACAGAAAATATAGTGTATGTGTTAG
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AATGTCACCTCACATCAAGAAGATCGCTGGTTCTAGTCCCGGCAGGGTCACTTGGCATTT
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GTTGAATTAAATAAACTAAATTGGCTGTAGTGTATGGATGTTTCCCAGTACTTGGTTACA
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AATGTTGTAAACTGCTAGTCATTGGCTTTCAAGCTACTTTTGCCTACTGTGGATATCAGT
ATTGGTTACCATCAAATTATCTTCTTTTTTGTTCTGCAGAAAAAATACATTCATTTTGGA
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AACCAACTTGATGCATTCTTGTTGATTAAATGCATTATTATATATTTAGAAAGTCACACA
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GTTTTCATTATGACAGTTTACTCTGTACATTTTTTCCAATGCAAAAAAGTCATATTGCTC
AAGAAAGCACTATAATATTTGCACAGCCGTTTGAAAACTGCAGTAAAGTGAGACATTAAT
GCATTTAGTGAGGAATCTGTGTACAAGACACTGAATATGTATGCTTCACATTTTTAACTG
CAGATGTTTTTGCAATTCTAATTTATTCACAGCATTGTGCAAAAAAATAAATACACCCTT
ATTTACAACAAAAATAAACTTCCTTTGGGTAAATCTGGGCACAACTGTAAATAATATTGC
AGTACATATTGGAACTGAACCTACAACATACACAGGTCTGTAAATCCTTTATGAAATTGT
TCAATTTAGAAGACATTTTCAGGAAAAAAAATTAAAATCTTTTTATAAAATTTGCTCAAC
AGATTTTGACAACTCGTTCAACATTTTAGTATGTAATGACTCAAGTAATGAATTGAGGAC
TATCAGTTTTATGTGAAATGACTATTCAGCATTCACAAGTTTAGTTAATTTTGACTGACA
TGACATAGGCAAATAATAATGTTCTAAAACAGTAGAGAGTTGTGTGAAAGCAATCGATGC
ATGTCTAAAAGCATCTGCAATTTGTTGGAAGGAATGAGAAACTGCTACTATGATGTGCAC
AAATAACTAATTGTTGTGAGAAATGTATTAACTGTTGTGCAAATGTAAATAGTGTTGTGA
GAAATGCACCAAAGCCACTGAGAAAATCTTTAAAATAAGTAAATATTTATATAGATATTG
CTGAGTGATGTGTTTTTTTTCTTCGATGTAGTGAGCTTGCAATGCTGGTGTCCATGGCTC
AGAGTAACCCTGCCCTGTTCCAGATGATTTCGGACAGGGGGACAGTCTCCCGGCAGCTGG
AAAGACTCTCCAGACTGAAGGAGCTGATGGACACCACTGAAGAACAGCTGAGGGTCAAGC
ACACTGAACACTGGTCCGACTGGATCCAAAAATACAGGTACAGACGTGGCTGTCTTGATC
TGATAATCTGTTGGGAGATTTATTATGTATTTGGATTTTTAACAGAGGTGTTTTTCATAC
AGGTGTATTATTATATACATTTTATTCTAAAAGACTTTCTGGTAGTTTGTATTTTTCTGT
CTGTTTGCAGTATTTTTAAAATTATGAAGTAATAAAAAACACTCTAATATGGCCAAAAAA
CCCTATTTGGAACAAGACTTTAACAAATGTTCAGAATTTTGTGCAAAAAAACGTATGCTA
ATTAGCACATATTTAATGAGTTGAGGCCTCATTTACATTTTTAAACTTAAGATTTCATAA
AACTTAAAAAAAAAAGTTTGGAAATCTTTATCTAATCAATTAACTGAGGAGTTATGGAGA
TTACAATTAATCCTGTTTTTACTCTGTTCACTTGCAGTTTCTTACTGCAAAAAACATTTA
TCAGTGTAAATATATTGGCTACTATTTTTTAATATATCTGTTCAATTTCAAGGCAGCGAC
TTGCTCGTGAGTGTGAATCTGGGGTCGATGTGAAAGATGTACAGACGGAGAGAGTGCGTG
TGATGAACAACAACAACCCGCACGTGGTGCTTAGAAACTACATCGCCCAGAATGCAATAG
CAGCAGCTGAAAATGGAGACTTCTCAGAGGTGAGGCTTCATTAGCTTGTTATTCATAGCT
TCTAAATTGTAATTTTAGTTTAACAGGGAGACGGTTATCACTAAATGTTTTACTTTTTCT
CAATGTTGATATTATGTTAAAAAAATTTTCTTTATCACCAAAGATCCATATTAAAAAGAT
TTCTGAAGATGTCACCACAATTACAATTTTTTAATACTTGTGTTAAATCATAATATTTTA
CTGTTTTTGATTAGGTTACTCTAACTTTTTTTTTATTATTATTCTTTTGAAAATACTTGA
TCGATCACAATTACTCTGTCAGTAGGTTTTGTTAAGACTGTTAGTGTGGGTGCGTATTCC
ACACACTATGGGGACCAAATATTTACTCACATCTTGCAATACCAGTACTTTTGTACTTCA
TGGAGACATCTTTTTGGTCACCATGAGGAAAATGGCTCATAAATCACACTGTATGACTTA
TTTTAAAAATATAAAAACAAATGTTGTTGTCTATGAGGTTTGGGTTTAAGGGTAGATGTA
TAGGATATACAGTGTTCTATAGGTGTGCGTGTGAGATGGATGGATGGATAGAATGATAGA
TACAGTGCATCCAAAAAGTATTCATAGCACTTCACTTTTTTCATGTTACAGCCTTATTCC
AAAATGGATTAAATTTATTTATTTCCTCAAAATTCTACACACAACATCCCATTATGACTA
TGTAAAAAAAGATTTTTGGAAATTGTTGCAAATTTAATAAAAATAAAAAACCTGAAATAT
CGCATGTACATAAGTATTCACAGCCTTTGCTGCGAAGATCTAAATTTTGTTCATGTACAT
TATGTTACTACTGATAATGCTTTAGATGTTTCAGCAGCTTAATTGGAGTTGACTTGTGGT
AAATTCAGTTGATTTAACATGATTTGAAAAGGCATACACCTGTCTATAAGGTCCCAGGGT
TAACAGTGCATGTCAAAGCACAAACCAAGTATGAAGACAAAGAAATTGTCTGTAGACCTC
AGAGACAGGATTGTCTTGAGGCACAAGGCTGGGGAAGGTTACAGAAAAATGTTTTGAAGA
TGTTTGGCACCACCAGGACTCTTTTTAGAGCTGGCCGGCCATCTAAGCTGTGTAATCGGG
GAAGAAGGGCATTAGTCAGGGAGGTGATCAATAACCCGATGGTCACTCTGTCTGAGCTCC
AGCGTTCTTCTGTGGAGAGAGGAAAACCTTACAGAAGGACAACCATCTGTGCAGCAATCC
ACCAATCAGGCCTGTATGGTAAAGTGGCCAAACAGAAGGCAACTAAAGGACTCTCAGACC
ATAACAAACAAAATTCTCTGGTCTGATGAGACTAAAATTGAACTCTTTGGAGTGAATGCC
AGGTGTTATATTTGGAGAAAACCAGGCACCTCTCATCGCCAGGCTAATACCATACTTACA
GTGAAGCATGGTGGTGGCAGAATCATGCTGTGAGGATGTTTTCAGCAGCAGGAACTCGAA
GACAAGTCAGGATAGAGGGAAAGATGTACAGAGACATCCTGAATGAAAACTTGCTTCAGA
GTGCTCTTGACCCCAGACTGGAGTGAAGGTTTGTTTTTCAGCAAAACAATGACCCAAAGC
ATACAGCCAAAAATCAATGGAGTGGCTTTACAACAACTCGGTGAATGTCCTTGAGTGGCC
AAGCCAGAGCCCAGACCTTTATCCTAAGGAATATCTCTGGAGAGATCTGAAAATGGCTGT
ACACCGTCACTTACCATTCAACCTGATAGAGCTTGAGAGGTACTGCAAAGAGGAATGGAC
AAAAATTCCCAAAAGACAGGTGTGCCAAGCTTGTGGCATCATATTCAAAAAGACTTGAGG
CCATAATTGCTGCCATAGGTGCATCAACAAAGTATTGAGCAAAGGCTGTGAATACTTATT
TAATGCAACAATTAAAATAATCTTTTTATACATTGTTATTATGGCGTATTGTGTGTAGAA
TTTTGAGGAAATAAATGAATTTAATCCATTTTGGAATAAGGCTGTAACATAAAAAAATGT
GGAAAAAGAGAAGTGCTATGAATACTTTCTGCATGCAATGTAGACGGATGGATGGATAGA
TGCATAGATCTCATAATGCTTCAAAATTTGTATTCAAAACTTTGTCTCAAATCACTTTAG
GTCCAAAGAGTCCTGAAAGTGCTGGAAAAGCCTTTCTCAGTGCAGGAAGGTCTTGAACAG
CCAGGTTGGATGGGAAGAGGAGGAGCAGCTATTCCTGGAGAAAGAGACGAGACTGAAGAA
GAAGGGAGTAATAGTTCAGGAGCAGGGGCTCGAGGGCTTGTCCCTTATGACAGCAAACCC
CCTGTCTGGGCCAATGAGATCTGTGTCACCTGATCATCATAAAACCTTCGTGACAACTAA
CCTGCTCATTAAAGCAGAATAATCCTGCAGAAGCTGGTTAGGCGTCAGCGGAGGTATTAA
ATGAGGTATTAAACTCCTGTCTACCAGTTCAAAAATGGGTAAGGTGTAAGTGAAATGTGA
CTGGTTTTTAATGATGACTTTGACCAGCAGTCTTTGCATGACAGGTCTCAGTCGGAAAGA
CAGAAGTTAAGC
Chart Advanced