SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000637_2.0
Identity
TranscriptMethionine-R-sufoxide reductase 1 (SelR1)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000637
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000541_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000637_2.0 # Transcript # Methionine-R-sufoxide reductase 1 (SelR1) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Reverse
CTCATGAGGCTGTTTTACACATCCTCGCTCTGAATGTTCCTCGCTGGGCTTTTCTTCAGA
ACGTTTCATTCGCCATCCACATGGTAGACACATCTGAGCTCCTCCATCCACTCTCTCTCA
CATCCACAGGGCTCTACTGTTGCTCATTCTTCACTGGGAAACAAACACAGAGGGTTACGC
AACATAATATAAACTGACATACTGTAAGTTATTACTGAAACCATAAACCTAAAGCCATAA
AACTAAAACCACTTCAAATACATGTATTGGCCGCAAAAATTGGCCCTTCAACATACTAAC
TATTGTGGTCTAAAACCAGGCGTTTCAGTTTCATTGTTTAACACCTGTATGTATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT
ATATATATAAATAACCTTATATAGAGTGTAGGGGAGGATACTTTGGAAATGTAATCGATT
ACAGATGACAAATTACCATATTTAAAATGTAATAAGAAGTGTACCTTTTCAATTACTTTA
TAAAAGTTGGGTAACTGATTACGTCTGATTACTTTTTGATTAACTTAATGGATATTTTCA
ACTAAATCATTTTCAAGCATTTATACCAAGCAGGTGTGACCTTAAAGTAGCACTCTGTTT
ACTGTTAGAATTTCAAAACATTTCATTGCTTGAATTAAGATTTTATTATTTTCATTTTCA
TTTTAAAGTACAGCCACCACAAAACCAGTCCTGAAACAAAAACATTGTTAACTGTTGTTA
CAGAATCTAAATTTTAGTTGTGCATGGTGACTTTTGTGGCATTTTTGCAAAAAAAAAAAT
ACATCCAAGCTATTTTTGCAATTTTCATTTTTAAATCGAAGCAACTAAAATCCAAGTCAA
TCACATCTTGGTGATCAATAAAACTGTCAATGAAACATATGAGGCATAATTGTTCAGTTC
AACTGTTTACTGCAAATAATATGCTGTACTAAACAGAAACAAATTATAGTAAATAACAGC
ACAAACTAAAAATCCAATAAATTCAGGTGTAACACATTTAAAATACTATAGTAATTTATA
GTAAAGGGAAATATTTAATTTTTTATTGTATGTATATATGTATATACTGTGTGTTTGTGT
GTGTGTGTGTGTATGCATATATATATATATATATATATGCATATATATATATATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAACTGAAGTCAGAATTATTAG
CCCCACTTGAATTTTTTTTCTTTTTAAAATATTTCCTAAATGATGTTTAACAGAGCAAGA
AAATGTTCACAGCATGTCAAATAATATTTTTTCTTCTAGAGAAAATCTGATTTATTTAAT
TTTAGCTAGAATAAAAGTAGTTTAATTTTTTAATATCCATTTTAAGGTCAAAATTATGAG
CCCCTTTAATCTATATATTTTTTGATTCTTTAAGCTGTATAGAAGTGTCTTGAAAGTGTC
ATCATGGCAAAGATAAAATAAATCAGTTATTAGAAAGGAGTTATTAAGATTATTATGTTT
AGAAATGTGTAAGAAATTAGGGAAAAATAAACAGGGTGGCTAATAATTCAGGGGGGCTAA
TAATTCTGAATTCAACTGTATGTAATTATAATAATATGCATATATAGTTTGCAGTAAATG
CACATGTAACCTTTAGGAATGAACTTCAGAGAGCTGCTAAATATTCAGAAGCGTGAGAGG
CCGTGTTTGGGTCCGTCATTCACAAACTCATGGCCAAGACCATTTCCACACTTTCCACAT
CTGACCTGTAAAAGATGACAAATTATTAACTGTTCACTGCCTCCGGATGCTATATTAAGA
AATTCTCTCACAGGCTTTTTATTTTGTCAGCCAGCCCAAACAAAACCGCCATGTTTAAGA
TCTGATTTCTTTAAAAATTAGTGATCTTCACAGCCTGATAGATGTACGATATATAGTGAG
GGCGTACTCTCACTTGGCACAGTGGCCTTGGACTGTGCCGAAGCGCGGTGGTCCCCGTCC
CCCCCCCCCCCCCCTCCCCCCCCTCCCCCTCTCTCCCCGATGGCCCACACTCACACTGCA
TCTATACCTTCTACCTACCTGCATTAAATTCCATTTTGCCGCTGCCTATCTTTAAAACAT
GAAAAATTATTTTACCACAGTATTTTCAATGGAGTTCCTGCACTAGCCTGCTGCTCCAGA
TGGCGTTAGCATTTACATAGTCTTTCATCTCAGTTGAATGACTAAATGAATGCTTAAGTC
TATTTAACTGATTGTATTTTAAATACATTACAACATAGATGCTGAAAACAGAAACCTTAT
GACATTGAAAATAGTCAGATAAACTGTTCATCGCTGGCTGAAAACAGTAGCTGTGCATAT
ATCCCATTGAGCTGACCTTGTAGGCGCCCCATCTTTCCTCCTGTTTAGACACGCTGTCTT
CATGGATGGTTTCAGTGAAGGCTGGCCAGGGGGACGAGTGCTCATATTTGGATCTGCTGG
AGAAGAGCTCGTATCCACACTGAGCACACACATACATGCCTGCAGGAGAACAAATCTCAT
TCGTTATCAATAATTCACTCAAAAGCATTTAGGCTAAGTGGGGTTCAAAATGTTTTTAAA
CAAATAGAGTAAGATGTGTGTGTCAATGAAGACAGGAGTAATAATGACAAACATTCAGCC
ATTCAATCATATTCAGTCATCTCAGACTGGTTTCTTGAACATGTTAATGAGTTTACTGTA
CTCAAAAGGCCTCCACAGTCACTTGATTTTAATCTCAAAAGAGCACCTTTTGGGTGTGGT
GAAACGGGAGATTTGCATCATGGATGTGCAGCCGACAAATCTGCAGCCACTGCATGATGC
GATCATGTCAATATTGATCTGAGGAATATTTCCAGTAATACTGAAGGCAAAAGTGGGTCC
AACCCGGTACTAATAAGTAATAATAATAAAGTGGCCGCTGAGTGTATATTATATAACACA
CACAGAAATATCAAAACAAACTTTTTTTTATTTGTATGTGATTACTCTATGTCCAGCAAC
AATTAAAAAAGGCATTAACTATTGTGTTTTTGTATTTAAATATAGTTTAAAGTTGAACAA
AATTGCAGTTTGACCAATTAAACAGATGACTGTTCAATTTCTTACGGAAAAAAAATACAT
TTTATTAAACATTGACAAAGTATTCAGCGATAGTGTACATCATGAAATAATGTTTATTCA
ATATTAGCATAAAAAACAAGAGGAGTGACAACAAAATATGATATATAAAGAAGGAAAGTA
GTAGAAAGTTAGTGATTGAAATTTCTAATCAAAAGTATGATACAAAAAAGGGGGAAATTG
ATAACAATTACAAAAACATTTACCAAACATTTACCAATAGTTAGACTGCTAAGAATAATA
TATGTAACCATACCTTTATTACAGTATTCATAAATATGTATTTATTATTATAAAAATTAA
TATCAAATTATAAACTTTAAATGTAGAAAATATTATATTATAAAAAATACAATTGTTGAT
CCACCTAAACTCATGTCCAATAAATATTAATATAATATTAATACATATTATCCTGATCAT
ATACAACCTTTAATAATACTGATACACCATGATACGATAATGACTGATATACAAGTCATC
CATAATATATCAGTAAGCAAAGAATATGTGATTACCTATGGTTAATAAAAGTTGATGATA
TTGTTAATCTATAAACAACTAATGTTGACAGATTAAACCTCATCTTAAAGTGTCACTGAA
AGCCCTGCATTTTATTATATGCAAGAAACAATAATGTTCAGCAATAATTATAGTATATCT
TCTCGAATCAACGAGAAACTCGTGTAAAACTTTAAAAACAAAACATTTTCGCAACTTTAA
CGTTCAAACGACACAAGTTTGACACATACCTCCACATTACATAAGTTGTCTTGTTTACAT
GTTACAGCACACAGGGACAACTTACCGCTCTCAAAATGATCTTTATAAATCTCCCCTCCA
GAGAACGAACAGAAAGACAT
Chart Advanced