SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000639_2.0
Identity
TranscriptMethionine-R-sufoxide reductase 3 (SelR3)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000639
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000543_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000639_2.0 # Transcript # Methionine-R-sufoxide reductase 3 (SelR3) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
ATGTCCGGCTTCAATCTTCTGCATCTGGTCAGCCAAGGCCAACCTGTAAAACTCAAGGCC
TGCGGGCTCCCCTCAGGTCACCTGGATGCTGTGTGTGTGTGTGTAGTGTGCTTTGCTTTC
TTGATGTCTTTTTTTAATGTGCGCACACGCGTGTTTGAGTGTCCGGTAAGGGTGTGTGTT
TGGTTGATGATATGGTCACTTGTGGAGAAACCAACTTTTGGAATTACTCCAAGGCAGCTT
GACATTGAGTCTTCTTCACTTTGACAGTGTTTATGCATAAATGCATTGACTGGTCTACAG
GTGAATATAGATATTATTTTTTTTAAAACATCTTTTTTTGAATATCAATATTAAAAAATC
CGTAATTGTTTCTGTAATTTAATATCCGTTATTTTACTGTAAGTTTCTGCAATTTAATAT
CTGTTATTTTACTGTAAATTTCTGTAATCTAATATCCGTTATTTTACTATAAATTTCTGT
AATTTAAAATCCGTTATTTTACGGTAAATTTCTGTAATTTAATATCCGTTATTTTACGGT
AAATTTCTGTAAATTTCTGTAATCTAATATCCATTATTTTACTGTAAATTTCTGTAATTT
AATATCCGTTATTTTACAATAAGTTTCTGTAATTTAATGTCCATTATTTTATTATAAATT
TCTGTAATTTAATATCTTTTATTTTATTATAAACTTCTGTAATTTAATATCCGTTATTTT
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CCGTTATTTTATTATACATTTCTGTAATTTAATATCCGTTATTTTACGGTAAATTTCTGT
AAATTTTTGTAATCTAATATCCATTATTTTACTGTAAACTTCTGTAATTTAATATCCGTT
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AATATCTGTTATTTTATTATAAACTTATGTAATTTAATATCCGTTATTTTATTATAAATT
TCTGTAATTTAATATCCGTTATTTTATGGTATATTTCTGTAATTCAATATCCGTTATTTT
ACTGTCAATTTCTGTAATTTAATATCTGTTATTTTACGGTAAATTTCTGTAATCTAATAT
CCATTATTTTACTGTAAATTTCTGTAATTTAATATCCGTTATTTTACGATAGGTTTCTGT
AATTTAATGTCCAATATTTTACGGTAAATTTCTGTAATTTAATATCTGTTAATTTATTAT
AAATTTCTGTGATTTAATATCCGTTATTTTATGGTATATTTCTGTAATTTAATATCCGTT
ATTTTACTGTCAATTTCTGTAATTTAATATCTGTTAATTTACTGTAAATTTCTGTAAATT
TCTGTAATTTAATATCCGTTATTTTAATATAAATTTCTGTAATGTAATATCCGTTATTTT
ACTGTAAATTTCTTTAATTTAAAATCCGTTATTATACGATAAGTTTCTGTAATTTAATAT
CTGTAATTTTACTGTAAATGTCTGTAATTTAATATCCGTTATTTTGGGGTAAAATTCTGT
AATTTAATATCAGTTATTTAACGGTAAATTTCAGTAATTTAGTATCCATTATTTTACTGT
AAATTTCTGTAATTTAATATTCGTTATTTTACTGTAAGTTTCTACAATTTAATATCCGTT
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TGGAAGAGTACATTTTGGAACTTGAGGAAGAGCACATTTTAATTTTGGGTTTGAGCTATC
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CCAACGTCGTGGGATGTTATATTTTGATTGAAAATGAAAATCAGGTTGACGTCAGAATCC
AATGTCAGGTCGTTGTCAATGCCTAACATCAGACAGACATTACATTTTGGTTATCTTCCA
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GACGTTACCAATATGACGTCCATCAACGATTTTGGTTGCCATACCTGTTGAATAAACTTC
AGTATTTGACGTCAATATGACATTGGTTTAAGATGTTGGCTCGACTTTGGATTTTGGTCA
CTTTCCAATACAACCTAAAATCAACCAAGTAGCAACGTCATTTCACGTCGTTATTGGACA
TCAAAATAACATCCTTTATTCTCCTTAGTCCTTAGATGCTGGTGAACTAAATGTAAACTA
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TAAAAATATATAGGAGAAAAGTCTGTGGGAAGACCTGATATTTTTAGTGTGAAACAAAAG
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CGGAGGGATGTTGGAACAACGTGCTGATTTGTAGCGTGACCTCTCTGTGCACCAAAACTA
AATCATTTGCAGGGGGTGACACAGACCGAATTCCTGAATTTCTTTAAATGCCTCCTTAGA
GGCTTTTCTAGACAAACCAAGAAATAAAACACTTTCCCCCCCCTCCCTTGATCTCGCAGT
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TCACTAATAGGATCCAGAAGACCCCTCTCACTGAGTGGAGAGGACTACGGGAGAGTCCTG
CAGGGAGGCGACCCCCCCTCCTCTCTCTGCACACTCCTCCCCTCTTACCCATGTTTGTCA
GAAGTAACTTTGTACTCGCTGGACAGAGCAGGGCCCATCAATGGAGCCCATTCACCAGAG
GGACCTTTAAAGACCCCATTATTTCCTCCATTCACATGGCTTCAATCTTGTCGAGAGGAA
TTCTCCATATATTCTAAGTGAAGGGAGAACGCAAAAACCGAGCAATTCAGCAGCAGGACA
GACCCCACAGGAACACGAGTGAAAAAATCGTTATTAGCTAAAAAAGAAGGAGGTAGAAGG
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GTGACTAAATGGTGTACAGATGGACATCTGGGCCCCTTTAAAAACGCAGCTAGTCTTTTG
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TTTATTATCAATGGAGGTTGTATCTTTGTTTGGTCCTTCTGGTGACAATTATTCACTCCT
CAGCTTGACCTCTAGAGGTCAGCATTGGCGTAAAGCTAGACATCAAGTGTAGCGGTCAAG
ATCGAACAGCCAACATGAGTGCTCCTCTAGATTTAGCATAACTCTGTGCGTGTGTTTTAC
ACAATTGCCTCGGTGTAACACTTTGGCTGTAGCACATCACTGACAGAGCGTTTGGACTGT
GTGTGTGTCACTGACATTGTGAATTTTCCAGGCAAGAGTTGAATCATTAAAGTAGACTTC
GCCAGATCAATTGAAACCAAAGTGACCAGACTCTTGCTTGGAAGGAGTCACATTGAAAAC
TAGATTAGTGTGACCGTTTGTTGTTTTTTAGTAATGCTGGTGTTGTCTTTTTTTGGTGAT
TTACAAATGAAACTTGCTTGTATTTCCATTAGGAACGTGCCGAAGTAAGAAGACATGGCC
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AGCTGTTTCACTGGCTATTCTTGTTAGCATGGCCGAACTGCAGGTTGATGTTGATATTTC
AAGTTTCATTGAAGAAGAAGATTGCTTTCTGTTAGACCAGTGGTTCTCAAACTTTTTTCA
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GCAGATTACCTCAGAAATATAGGCTATATGTCATATATAGCATATTATATTCAATTCAAT
TCAATTCAATTCAGCTTTATTTGTATAGCGCTTGTACAATGTAGATTGTGTCAAAGCAGC
TTCACATAAATGGTCATAGTAACTGGAACAGTGTGGTTCAGGTTTTAGTGTTTAAGTTCA
GTTCAGCTCAGTTTAGCTCAGTTCAGTGTAATTTAATCATTACTGAGAGTTCAAACACTG
AAGAGCAAATTCATAGATGCGTAGCTCTACCAATCCTGAAATATATACATTATTTTTGAT
AAATTTTTGAATGTGTGTAGCATGTACATGACATATTTCATTCCTTTGCGTACCCCTAGA
AGGAAGCCCGCGTACCACTAGTGGTACAGGTACCACCGTTTGAGAACCACTGTGTTAGAC
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AAAAAATGTGTGCTACAAGTGTACTAAGGGGTATTTAAATCAATAAAAATAATTGTTTTG
AATGGGACAACTTGTCCTGGAATATGAAACATAAGCAGTCAAAGCAATATTTTCAAATAT
GAATTAGATTTAATGTAATGTTAAGTTTTTAAAGCATTGAAATCAATCAGTTTTTGAAAC
CAACCATTTAAACGTTCATTACTAAATATGTGCATACATTTATTTTTTATTGCATTAATA
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AATTTATTTTATTTTTACCCCTAATATTCAAGTTTTGTCCTAGTTAATGTGTTTTGCTGT
GAAACATCAATAGATAGGACATTATCTGAACACATTTCATTATGCGAGGCTCAAAAAAGC
ATTTGACTTTCTCTCCAAGGCCTTGAGATAGATTGAGTAAATGGAGGATGTAGCATGGAA
GGGAAAACACTGACACTTCCCCTCTTTCTCTCCGTCGCTCTGCAGTAAAACACACACGTG
GGGAAAGTATTTATCGGCCCATTGGCAGTAGGAATGTGAAAAATGCCCTTTAGTGAAGGT
GCATTCTGTGGCCTGCGCCTCTGTTTATCCACAAATCCTCCTCTACTTATCTAGAATAGA
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TGATTTGCAAATTGAAGCGAGCATTTATTGGTAACTATGAACTTTTATTGAGCTCACAAA
GAGCGTTAATCGTTTAAATTTATGACTGTTTGTGCTGTTTTATCTTTCTCAGCGCATTCA
CAGGAAAATATGTCGATAATAAAGAGGAGGGAACTTACCACTGTGTTGTTTGCGGTGCAC
CTCTTTTCATGTAAGTGCTAATAAATTCTCATTTTATAACAATGCACATCTTATTTAATC
TTTATTTAGTTGTTTAGAGTGGCACGTCTTTATTTAAACATCGATATTTTTGTTTTTTGT
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ATAAGAATAATAATCAAAATCTAACAGACACAATAGTATTTTTGCCAAAAAACTTGATTT
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TGCACAATATATTCTTTAAGCTTGATATCGCAATGTGCATATCCGCCATAGTCACGTCGC
AGGATTAGATTATTGATTAAAGATCAAAATATAAAGATATTATTATTTTAAAATAATTTA
TACAATAATGACCTTGTTATTTTATGTTTGATTGTGAATTTCTATATCTGAATACTGTTA
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TGTTTATGCTTGTAATTTATTATAATTTATGCATAGAAAAAGACTCAATCATCACAATCT
ATCTAAATCTTTCATAATAGAGCTATTCAAATCATCTGGAGAAATTAAATTCATATCGCA
ACACATCGCAAGAAAACTTAAATAGTAACTTTGCAGGATTAGATTATTTATTAAAGATTA
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TGTTCCATTTTTTTTTATGTTTGATTGGTCATAAATTGTTAATTTCTGTACCTGAATACT
GTTAGACTCCCCCAAAAAACAGAAACCGCTGTATATTTGACCTTTATCTTTGCTCTGTCG
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AATTATATTCATATCGCAATATATATATATATATATATATATATATATTGCAAAAAACCA
AATGTCTGTACTAAATAATTTCCAATGTCATAAAGCCCTAATTGCTTCTCTAAAAATGAA
TATTATATTCATTGCTAAACATTACTCTCATCTATCTCTTTTAACTCTTTTACTTTCTGC
TGCTAATAAGCTCTAAGTGTGGGGTATGAATTGCAAATAGCCAAAACATTTTTTTAATGA
ACGTTATCTATTCCCTTCAAGATTAATGTTATTGGCTGCAAACATTCCTTCGCTGTCACA
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TGCATGCAAGTTCATCTGATTCTCCTAGGGAGAAGCAAATTTTGGAGGTTTTATTTATTT
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AGAAAAATACAACATAACGAATGACTTATAAATTTAAAGACATTACATTAAGGGCTCTAT
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GGATAGTAAAATAATCTTATTTTTAATTTGAAATGTAGATATTTGGACTAGAAACAAGAT
AAAAAGTGTTTAAATAATTTAATAAAATTAAGCTTTGTTACACCACGAAACATTGTACAT
TTTTGTGCCCAAATGTTCTAAACTCTATTGAAATGCTCAGTTACAGACCTTAAAAACAAT
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AAAAAGTGTTTTTTTGTTTTAAATCACTTTGATTTTAATGCAGATGTGCAAATAAGATCA
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GTATCACAGCAACGGTTTGTTGATCCCGTACAGATCTGAGCTCCAGATCACATACTTCTA
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GAATACAGTTTATTATTACAGTTAATTGTTTATTTTTTGCAGCGATGGCAAAGAAGATAA
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TTAAGAACATTTTGTTCAACAGAAAAGTTCTATAAATCTTAATGGAATAGAGGTGAATAG
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ATGGAAGTTTAATGCAAATATTGTTTTATTAGTAATTGGTCTTATTCAACACAAATAAAT
CATAAAAAGCTTTCATTTTTGAATTCATCTTGTGGAGTGTTTGAACATTAAACACAGTCA
TTATTTTTTGCAAGTCTGGTGTTGCAGAAATTACACACTTCATCTACAGTGTTTTGAAAT
GACTGCATTAAAAATAATCAAATATACAGAATACAAAAACGTGAAATATTACAAATGGAA
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GTCTTATTTAATTAAACACAAAAAAATCATAAAAATCTTAAATTTTTTAATCAAGTTTGT
TGAGTGTTTGAACCTTAAAAGCAGTCATTATTTTTACAAGTCTGGTGTTGCAGAAATTAC
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GCCTTTTACTTCTCATTTGTTCCGCTTAACTTAATGTGTTTCCCCAGTAATCAGGAGGTA
ATTGTTTAACGTTTGTAGGGCTTTTGTCAAAAATCTAAACAAATATGCCAGCACAGGCTG
TGTAGTTGTAAGCTCCCAAGGTTCCTCTCCTCCAGACGTTCCACCTACCCAGAGAGCCAT
GAGCTGGACCACCCATGAGCAGCCATTCTTTCCACTTACACTCCTGTTACTGGGTAGAAA
TTTTCCAGATGAAAGAAACAGGATTGAGAGACAGCCTGTTACTCTGCAGATAACACAGAC
TATTTTCAGGGAGGTTTGTTTCCCTTTTTGACCTCTTGAGATGTCAACCAGCCATGTGCT
AGGACAGTTGGATGATCCTTATAATTCTAGTTTATCCATAAATCAAACATCTAACGATTG
TGTTGGTCATTTTTGCATTACCAAACACCAAATATGCTTTGCCACCTTTGTTTTTAAACA
GAAGGAATAGACTTTCAATAATGGACCCTTTTTACATTTCCGGGTTTCTCCGCAGCAAAT
TAGAGCACAGGGAGAGTTTCATAAATAAATTTGTAGCATTCCTATTTGCTTAAATAAAAC
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GGTGACCCAGGTTCGATTCCACCTCGCGGTCCTATGCTGATCCTTCCCCTCTCTCTGCTC
CCCATGCTTTCCTGTCAATTCTCTCTACTGTCCTATCGAAAATAAAGGTGAAAACCCTGG
AAAAATAATTATAAAAAAAACCCAAAAACAATAAATAAATACTGCACAATAGATATACCA
CGACTTTCGGGAAAAAATGTATGAGACTGATAAAGGTAGCCAGAAGAGTGTCCATGTCAA
ATTTATCTTCCTGCCCATAGACCTTGCACAAGCAATAACTAGCCTAAGCATTAGCTAGCT
AACTATTAACTGATGCAGAGATGATAAAATGCAAAGAATAGTTTCATTAATGTAAAATCT
TTTACTGATATTTAAAAGAAACGTCTTGCACTACATTTGCTGAACTGGAATTGGGCATCT
GTAAGTGAGACATCACAGCTTTGGAATCCCCCCAGGCGATCACTAAATCATGTTGTGAAT
AGGGTCAATTGTAACAAACTGTCAACCACTTCCAGAGATAGTCGAAAATGTATTTGACCA
GATTAGACCCTCTCATCAAGAAATCAGGAAAGTGGTCAAAAAATTGGTAGAAGAGACAGA
TTAAAACTCCTGGTGTAAATGGGAACATTTCCCTCATTTGCTTGTGACCCAATCAACCGA
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AAATCTACATGGAGAGATTGGCAGGAAATGTGAGAGATTTTACCCAGGAAGAACTTCAGT
ACACTAAAACTCTTAAAATTATAGGTTTGTGTCATTAACTCTTAACGCTGTACTGCTTTT
GCAGGATGGCCTTCTTTTTTCGATTTGATCAATAAGGACGCTATAGCTCAAACAGATGAC
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CTTTTTATGCTCAACTTTGAAAGCACTGTTCTTTAAATTTGACCTCTTCTTTAAAGTGTG
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TAAACTCGGCCTCACTCAGTTTCCAGCCCAAAAACAGTGCCACTGAGGAAGTGGAGGCAT
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Chart Advanced