SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000640_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein S (SelS)
SpeciesDanio rerio (Zebrafish)
Transcript IDSPT00000640
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000544_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000640_2.0 # Transcript # Selenoprotein S (SelS) # Zebrafish (Danio rerio) # Full length # Forward
ATGGAGGCGGAGGACGGAGCGCGTGTCCGGAATGAAGATGTTCCTCCGCAGAACCAGGAT
CTAAGTTTCCTTCAACCGTCTGGTATGTAAACATGAGCCCAGGCTTCACTTTACTGAGCT
AATACTTACCTGTGAACGGTATTTAGATGTATAATGTCAAATGTTTTGCTTTATTAATAT
CTAATAAGCACATGTGTGTTCGAAAAGGACTCGTCGGTAACAATGAATCGACGTTTTGTA
GCGAAGTGATACGGAAATGATGAGAACACAGAAAAAGCTTGTGTATTTAGCCAGTTACTG
CTTATTAGTTACAGTAGAACCTGTACTGAATTAGATGCACGAGTTATTTTTAATATTGTA
TGTATTAAACAGTTAACAATTCAATAATACAACAACCATATATGACAGTTCCCAATTGTT
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ATTGTCCTACCCACTGTGCCACCGTGATGCCAAAAAGAATTTTGTATTTATTTGTATATA
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TGTGGCGACCCCAGATTAATAAAGGGACTAAGCTGAAAAGGAATGAATGAGTAATGAGTA
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ATTGATTTTATTTTATTTGACATTTTTGCATTCATGAAGAAAAAGGGTCGTTATGGATGA
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TTTTATGTTTTTTGTTTGTTTAAAATCCACCAAAATTCCTAATTTTATAAGCTGGCTTAT
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AATTGACAAACAGTCGCAGCCAAATTAAACTTTAGTGACAAAGCAGCACTGGCCCCTATC
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GGCAGTCCTTATTGTTGAGCCCTGTCTTCTGATGGCTACTTCCAGCAGGATAACGCACCA
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GTTGAATCTTTACACTATCGAGGCAGCGAAATTCAATCATCCAATAAATAAATACAATAA
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TTTGCTGCAGTCACTGCGTTCATGTCGGAGTATGGCTGGTATCTGCTGTTCGGATGTGTT
GGAGTGTATCTGCTCATCCAGCATCTCCGCAAGAGCAGATCCTCCACACAAACACGCAGC
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GGAATGAACCACCAACTATTCCAAGTAGTATCTGGATGCAAGCTGAGATTGCATCACTCA
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CACCACCAGTGTGCAGCATCCACCTGGATGACGCGACGGCAGCCATTTTGCGCCAGACTG
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TAGCTGCCGGCAATGGAGTGAGTGACGTCACTGTGACGGGTGGGGTTAAGTGAGCGCATT
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CAGTCGCGGGTATAATTCGCCCTTAAAGCGGCCGCACGGTCACGAGACAGACCAGGAGAA
ATCAAAAGCTGAATTGAAACTTTTGAAAAACCTGAATTAATATTGGAGTTACTTTAGCAT
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AGCCACTGAAATCTCCCGGTGAAAGATTGATGTGATTATTTTCAGTTTCATAAGGTTCTT
TGACAGCATCTATAATGTAGATTTAAATTTAGTTTAACAACAAAACACCAGTAAATAGCG
CTATTCCGCCTAACCTGCTTTATTGAGCTGAAGTTGCTTTTATATTCACATTGGTTCATT
TTTGAACAATGACAGCTATACTGTTTACCATGCTACTCTGAATATTTACTCTGAAATACC
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AGTCCCATTCACTATACTGGGGCTTAAGAACCCACTCAGACCGCAGGTTAGGCGCCCCCT
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GCAGATTCCGTCTGGGCCTATCCATGTGTAATAGTCTCTGCTGCTACTTTCCCCGCGATC
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CAATCATGCATACTGTTACTTTTAGTCACACTTTACAATAAGGTTTCATAACTGAAGTAT
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TAATGCATTATTCAAATCCTAAATCATCATCGTTAACACTATGAGCTAGCATTAAATGGC
TTTATTTTCATGAACTAACATTAACAGAGCTAAATACTGTAATATATTGTTTATGTAAGT
AAATATTAACTAATATGTCCTATTGTAAACCATATTAACCTATTTATTTATATTACTCAA
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ATGCATAATAATCACATTTGCGATCAAAATGACGTCAATATCCACATTTGTTTTTCTTTT
CTGCCTTGTAAATGATTTTTAAACAAGTGTTTTTCACTTTCTTTATGATTATTATGATGG
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TACTCCCGAGGCGGCTGATGAGTTTCAGTAATGA
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