SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000799_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesEchinops telfairi (Lesser hedgehog)
Transcript IDSPT00000799
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000703_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000799_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Lesser hedgehog (Echinops telfairi) # Full length # Forward
GCCGCGCTCAGGGCCTCGCTCGTCGCCGCTCGTGCCCGCTCGCTGCCCCTCGGCCCCCGC
TTCCGCGCGCCGTGCTCGGCCTCGGCCGCCGCCATGGAGACGGCGCCGCACTGGCTGGCG
GGGCTGCGCTTCGACAACCGGGCCCTGCGCGCGCTGCCCGTGGAGGCGCCGGCGGGCCCC
GAGGGCGCGGCCCAGCACCCCGCGCCGCGCGCCGTGCCCGGAGCCTGCTTCACCCGGGCG
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GCTGCACCGGACACAGCTTGTTTGGGGGCCAGGGTGGAACCCGACAGAAGGGACAGCGCC
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CTGAGCTCCTTCCCCAGCCCCCTGCTGTCCCTTCCTGAGCAGAAGCACCCTTCCCAGGGA
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AGAGCAGCTTGCCTTCAAAAGCAGACTTGAGACCATGGGCTGGTGACTCCTCTCCTCTCC
TCTGGCCCACTACGCAAAGACCCTGTGGCACCTCACCTGTGACATCACTGGCCCTCTGGA
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GCTGACAGCCACTCCTGTCGTCTCAGGCCTCCATGGCAGGGACAGCTCTCAGATCCTTGT
TGCTTCCACGGCCACCTCCCTTCTGGGAGGCGAGTCTGTCTGTCCTTGGGGGCAAGCATA
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GGTCCCCCCAGCAGGTTTGGATCTTTTGAGATCTTTAAGCCTGCGGACGCACTCACGGGG
CGCGAGGGCCCCAGTGTCGGGAGGAACGATATCCGTGTGCAGATGCTCGACTACGTGATC
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GCCTTCTTCCGGGAGGTGAGCAGGTCCAACCCCACCTACTGCCTGACAGCTACCACATCG
TCCCTGCCCCGGGGACCTCAGGCTAATGTCCTCAGGTCTGCACCATAGGACGCTAGCCAG
CCCAGCAGGCTGGGAGAGCTGCTGGCAGCTCACGTGGGTCAGAAGTACCCCTGCTGTCAA
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AGCATCGTGGGGCTCACCATTGACTATGGGCCCTTCGGCTTCCTGGACAGGTCAGTGCTC
CTGCCCATGGTGGGGGTGCTTGTGCCCTGGACTCGGCAGTGGACCCGTGGTGGGGTGGTG
GGGATGCCGGTTTCTCGGCTGCCCCGTGGAGAGCAGGTGAAGGGACAGGGGGCCGAAAGA
GCAGCACAGGGAAGGTCTGGCTGCAGTTCCTCACCTGCCACAGGTATGACCCTGACCACG
TGTGTAACACCTCGGACACCGGGGGTCGATATGCATTCAGCAAGCAGCCTGAGGTGTGCA
AGTGGAACCTGCAGAAGCTGGCCGAGGCGCTGGTGCCCGAGCTGCCCCTGGCGGTGGGGA
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GAAGTGTTTATTTCGGGGGCTCTACAGCAAGATGTCCACCCTCAGCCCCCCAGCCGGTGA
CCCACATCCACCCTCTGCCTGCCTGCAGGCAGCTCTCAATGATGCTGACGCTGGCACAGT
CCAACCCGCAGCTGCTGGCCCTGGTGGGCGGCAGGGCCGGCCTGACTCGGGAGCTGGAGC
GCAGGGAGCAGCATGCACGGCTGGAGCAGCTGGACCCAGCCAAGCTTCAGGACGAGAACC
GTGCCCACTGGACTGCGTGGCTGCAGGAGTACAGGTGAGGCCGCCCCTGCCAGGGCTGGG
GTGTGGGGCCTGGCAGCACGCTGACGGCCCACTTATGCAGCACGCGCCTGGAGAAGGACG
TAGGAGGCGCCAGTGACCCCGAGGCGTGGCAGACAGAGCATGTGCGGGTCATGCACTCCA
ACAACCCCAAGTACGTGCTGCGCAACTACATCGCCCAGAACGCCATCTCGGCAGCCGAGG
AGGGAGACTTCTCAGAGGTAAGTGGGGCCCTGTGCAGGCATGCAGGCTGGACCTCGGCGG
CCCTCGCTCACTACCTCCTGCCCTGCAGGTCCGCCGTGTGCTGAAACTGCTGGAGGCCCC
ATACGCCCTGGAG
Chart Advanced