SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000858_2.0
Identity
TranscriptSelenocysteine synthase (SecS)
SpeciesEquus caballus (Horse)
Transcript IDSPT00000858
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000762_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000858_2.0 # Transcript # Selenocysteine synthase (SecS) # Horse (Equus caballus) # Full length # Forward
ATGAACCGCGAGAGCTTCGCGGCTGGCGAGCGGCTGGTGTCGCCGGCTTACGTGCGGCAG
GGCCACGAGGCCCGCCGCTCGCATGAGCACCTCATACGGCTGCTTCTGGAGAAGGTACCG
AGCTGTCGGGTCCCTCCCAGCCGCCGCGCCCCCGGGCTCCGGCCCCGCCCCGCTACCCGG
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GTGTCTATGAATTTGACTACTCTAGGTTTTTCATATAAGTGGAATCATGGAGTATTTGTC
TTTTTGTGACTGGCTTATTTTGCTTAGCATGATGTCTTTAAGGTTCATTCATGTTATAGC
TTGTGTCAGAATTACTTTCATTTTTTAAGACTGACTAATAACTCATTGTATATATATCCC
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TTTGGCTGTTGTGAATAACGCTCCTGTGAAGAGGAGTGTACAAATACCTGTTTGAGTTCC
TGCTGTGAATTCTTTTGGGTATATTCTCAGAAGTGGAATTACTGGATTGTATGTCCTTAT
TCTTTAAAATGGGCATATGGTTGCCTGCCTCATGATATTGTTTTGAGGATTAAATGGGAT
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GGCATCATTAAGTATAGATGAGACAAAAACTTTAAATTGATGTTTTAATATTTGGCTTGC
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ATTCATAATAAGGACATATAGCAGAAACTGATGGACTTTTAAAAAACATACTGACTTATT
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GTAGAGAATTTGAGAAATAATAGAAAATTAGCTGTCCTTAGGAAGCTACCTACTTAAGTA
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ACTTTTACTGTGAGTACTTACTAGTATTGCAAAGTACTTAGTTATGTAAGTGCTTTGTCC
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TGTCCATCTCTGAAATAAAGTGAACTTGAAAATAAACTTACATGTTGCCAGAGAATGAGT
TGGTTTACTTTTCTAGTTGTCCTTCACATTATTTTGACCTGCATTTGACTCATACCAGTG
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AACATTTTGATTTCTGGTTGGCTTGGTTAGGTTTTGAGCCTGTGGTGATAGAGAACGTTT
TAGAAGGTGACGAGCTGCGCACAGACCTGAAAGCAGTGGAGGCTAAAGTCCAGGAACTTG
GGCCTGATTACGTTCTGTGTGTTCATTCGACTACATCCTGTTTTGCTCCAAGGGTGCCTG
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CAGATATACTAATTCTCAAATATGCCTAAATAACATTTGACAGTAAATAGGTGCATGGAC
TTTTGTAAGAGAATGGATTGACCTTGTGGAGAAGCAGCATAATGGCTTAGGAAAATAAAA
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TAGATGCGGAACGTCTCTGTTTTCTTGCTTTTTTTTTCTGTTTCTGATGTCTTCGCATCT
TTTTCCTCATTATTTAGTAGAAGTTTCTAAGCTAAATGTTGGATTTACATGTTTCCATTC
CTATCTCCACTTCTTTGATCTTACAGTTAGTTTTCATGTATAGGCACTATCAGTATTAAC
AGATGTTAAATAGAAAATTTCAGGATTATTTACTGTCCTTTGAATTTTCTTTTTAATTGG
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GTTTTTGTCAATCAGCAAAATTCTCATTTGCCACTTTTTAGTGGTGTTATGTAATGAATG
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TTCACATGGAGAATATTTTTTCTGCCTCTCCTTGCCTTTCATTGAATACCTTTATACGTA
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TTTTTCCTTTTTACAATAGTACTTTATGTTATTATGGTGCTTTACTTTCAAGGAAGTTTG
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ATAAAAATACTTTGCTTCCAAACTATATTATAGAAAGAAAAAAAATTTTTTTTTTTTGAG
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GCTGAAGCGGAACGTGCGCACTTAACCGCTGCACCACCAGGCTGGCTCCTAGAAAGAAAA
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GCTGGGCTGGCAGCCCACATACTAAAAAAAGAGAGGAGGATTAGCACAGGTGTTAGCTCA
GGGTGAATCTTCCTCAGGCAAAAAACAATTATTAAATCACAGAATTTAGTTTTAGCTTCA
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AACCAAAAGCATTTAAAAATGAGCACACCACCTTGTAAGGGGTCATTATAAATAATTTGC
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ATGATTTTATTTTATTTTTATAAGCATCAAATAGATCTGGTCATCTGTTTTAAATTCTTA
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CTCACCTGCTCTCTCCTGGCACACTTGTCTGTTTTCTTTTCCTCCGTGGTGCCACACATG
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TGCATGGCTTCTTACCTCACTTTAGGTCAGTGAGACTTTGTCAGACACCCTATCTAAATA
ACACCTCCCTCTTCCTTGCCAGCATTTTTTTATCCCTCTTTTCCTGTTTTATCATATTCA
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ATCATTGGTGTTGTATAACACTAGTTTGGCAGTGTTTTTTTTTTAACCTAGTGGTGTGTA
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CCTCTTGATAGGTTATTTGTTTATTGTCTAGTTATTGACAGTAGTTAAAATTAAGGTTCT
TTTAGGGCAAGGACCTTGTTTTGTTTGCTGTGTCCTCAATACTTAGGACAGGGGTTGGCC
CCATGGCCGAGTGGTTAAGTTCTCGTGCTCTGCTTTGGAGGCCCAGGGTTCGCTGGTTCA
GATCTTGGGCACGGACCTAAACACTGCTCATCAAGCCATGCTGTGGCGGCATCCCACATA
GAAGAATTAGAATGACTTACAACTAGGATATACCACTATGTCCTGGGGCTTTGGGGGAAA
AGAAAAAAAAGAGGAAGATTGGCGACAGATGTTGGCTTAGGCTCAATCTTCCTCTCACAC
ACAAACACACAAGATACTTAGGACAGTACCTAGTACATAATTGACTCTCAACAACTAGTT
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TATTATATTAGGATATGGATATATATCCACATATGATGTGAGTTATACAATTTGTGTGCA
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ATCTAATTTGAGTGGTGGCAGAGGAAGGTTGTACAATTCTCTAGGCTGGAAATCTTGGAA
AACGTTTTATTTCAGTGCTCCGTGTTTATTCCTTCTCCTTCTTTTCTGTCTTTCCTTCTC
CTCTGTAATTTTCCACAGCCTCAATTCATTTAAAAGTCATCAGCATTACTAAAAGTTTGG
AAAAATGAGGAAGGAGTAGAAGATCATTCATAAGCCTGTTACCCTAACAAATTAATAATT
TCCGTGTCCACTGTTTTCTCTTTTTATATTTATTGCTTTTTTACGTAGTTACAGTCATTG
TGTACATATAGCGTTAACTTCTTTAAACTTAGTGAAAAAACTACATTTAATTTTTAAACT
TAAATATAAACTTAGATTATATTTCTTTGCCCTCCGCATGCCTACAGAGTTTTCATAATG
ATCATTTAAATAGTTCTTTAACATTTACTCATATATTCTATACTTACCCCAGAAGTGCTC
AGTGTTTTGGTGCTCACAACGTATCTTTGAATACTAGAAATTTGGTGGTGTACTTGAAGA
GATTAAGGCTAAAAGAAGATGAGTTCCAGGGTACAGTATGAAAAGTGCTCTTGGAGTTGT
ACATCACAAATACCCTGCTCTGTCATCACCTCTCTTCGTTCATGAGGTGGTTTTACTAAA
TTTTTAACCAGAAAATAACACTATAAGATGGATGAATGAATTTTTTAAATGTAGCTATTG
TATTGTTGCAGATACTGTTACTTTCTAAAATTGACATTTCTTGAAAGAAAAAAAAGCAGT
ACATAAACATTCCAACTTTCCTAAATTGGCCCTCACAAAAAGAGGTGGTGGCACTGTTGC
TTTAAACCAAATAAATCCTTGGGTCTCACTGAGTGCTCGTTGCTGTTTCATGACGTTCTA
AAAAATTAAAGTTAGCTTTAATTCACCTCAGTGGTTCTTATTAGTAATATATACCACTTA
CTGAGTACCCACCATGTGTCAGGGATGCTTCTAGACTTTTAGAGTTTATTAACTTAATCC
TGACACTTTAAGGTATACTTCCATTCTACAAATAAGCAAACTCAGTAGGATTAAGTGACT
TGCCCAAGGTCCCAAGCTACAAAATGGCCCATCTAGTTTAGTGTGACTCCAGAGCCCCAT
ATTTTTCTCTAAAAAACAAAGTACTAAAACTGCAAATATTTTTTTTTTCTCTAAAGATTG
GCACCTGCACTATCTTCTGTTGCCAGTCTTCTTTTTTTTTTTTCTTCTCCCCAAAGCCCC
CTAGTACCTAGTTGTATATTCTAGTTATAAGTCCTCTGGCTCTGCTATGTGGGAGGCTGC
CTCAGCATGGCTTGATGAGCGGTGCCAGGTCCACGCCCAGGATCTGAACCGGTGAAACCC
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ATACTTTCTTGAGAAGATAGTATTGTAATAACCAAGCAATTGGTGAAGATGAGCTGTAAC
TAAAATATTACAGAATTCTTCTTTTTTAAGGGCGATGACCCAGAATGAGTTAATGCTCAG
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ACTTCTGTTTATATACTAAACTTATTTAGGAGACTCATGGAATATGGATGTTATGACAGA
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TAGGTGTTAATACTACTTATTCACAGACTTAATTGTCAATTTGTTCAATAAATATTTACA
GGGTTCCCATTGGTGTGCCAGGCACCAGTGTAGGTGCTGGGAGTGCAGTAGTGAATATAA
CAAAATGCTGTCATGGAGCAGCAGCAGACAGTAAACAATACGTATGACTGGCCTTGATTA
ACAATCTTCTGTTTTGAGGGGAGGGGTGTCAGGCTAGCTGGAGTGATCCAGGAAGGCCTC
TCCAAGAAGGAACATTTGAGCAGAGCCCCTAGTGATGTGCAGGAGTGAGCCATGCAGCTC
TCTAGAGTGATTCCAGGCAGAAGGTACAGCAAGTGCCAAGGCTCTGGGGCAGGAGTGTGC
TTGGGATGTGTGAGGAACAGCAAGGAGGCCAGTGTGGCTAGACCAGGGCAAATGAGGGCA
GCAGTGGTAGTAAAGAGATTTGAGGTGTGTTAAGGATTTGGCATTTTATTCTTGGTGTGA
TTGTCAGCCATTGGAGGGTTTTGAACAGGAGAATGACAAGTGATTTACATCTTTAAACCA
TCATTTTGGCTGCTCTGTGGGGAATAGACGTAGGAAGGCAAGAGTGGAATGCTGTTACAG
CAGCCCATCTGAAATATGTTGTAGTTTGGGCCAGAATGGTAGCTGTGAAGGTGGTAAGAA
TTGGTGAAATTCAGATATATTTTGAGAGTGGAATTTACGGGATATGCTGATACGTCAGAT
GTGGGGTAAGAGGAAATGAGAATTCAGGGACTCCTAGGCTTTTGGCCTAAGTAACTGGAA
GAACAGAAATGCGATAGGAAGGGTGTTTTATCTTTTAAACATGAGCTCTTCATTCAGATT
ACCTAGGTTTTAGTCCCTGCTGTCATTGACTGCCTGAGTGACCTTCTATAAGGGGCTTTA
ATTGCCTGGATTTGAATCCCAACTGTGCTGTTAACTACATTTCTGACCTTGGGCAGGTCA
CTTTAATTTCATTGTGCCTTAATTTTCTCATCTGTAAAGTGGCTGTTATACTAGTATCTA
CCTCATATGGTTATTGTGAGGGTTAAATGAGTTAAGAAAAAAGTAAAGTGCTTAGAACAG
TGCCTGATGCATAGTAAGTTCTCAGTAAATTCTGGCTGTAATCATTTCATGAACAATTAT
CTGTTTTATTCACTGCTACTATCCCAGAACCTAGATCAGTGTTTGGCATGTGATAAGTGC
TCAGATATTTGTTCTGTGAATAAATGAGTAAATTAATGAACTGATAAATGGCAACCCTTT
ACTTCATAGAATATGCTCCTCTGTTTCCTCTTCTCTTAAGCCCTTCCATCCTTATGGTGT
TTTTATCCTCTTCATCGATAGCCTCTGACTTCAGTGTGGGGAATGAGGTCTATATTCCAT
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CTTTCTGTGTTTTAGGCTGAAGGGTTCTAGCAAAGTCTGGTCTACTGATGTTCTCTTAGT
ACTCCTCCTCCCAATTTAGATTCAGGTCTCTCTCAGGAAGCCTTGGACAGCACTTAGATG
TTAGTAAAGGGGCAACTCTAACTCTTCTGCCTTATTTTTACGTGCTGCTACTTGGCTTGT
TTTTCAGTTATTTATTCTATTAGTCTTTTTTTCTTTTGAGGAAGATTAGCCCTGAGCTAA
CATCTGCCGCCAATCCTCCTCTCTTTGCTGAGGAAGACTGGCCCTGAGCTAACATCTGCC
CATCTTCCTCTCCTTTATATGTGGGACGCCTACCACAGCATGGCTTGCCAAGCGGTGCAG
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AGGTTAAGATTTAAACAACCATGTGATAGCCCAGAGTGCTTGGCTCCACTTCTGTGCTTT
TGCTGCTTCTACCTGTTTCCTAGTCTGGTCTCTTAGATTAGGCCAGCTATCTGCTCTTTC
TGTTCTCCCTGAGATACTGATGTGGAGAGAAAGTGTGAAGATGAAGGTCAAATGTGCTTA
TAATATTAATAGGAATGTAGATTGTGAATACAGATTGAAAATCTGTGGCTACAGATAAAG
AAAAAACTACCCTAGTTGAAATTTAGATAGTATCTATTTTTAAGAGGAGAAAATTGAAGC
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TGTTATCTGAATGGTGATAGGAGCAGAGCTTATTGCCTAAAGTGGTCGTGCAGGTGTAGT
AGATTATCCAAACATCAAAGAGTACCACTTACCAGTATAACTAATTGATTGGCAGCATGA
GTGACTAAAGTCCATTAGATTATGGTGGCCACTCTTGAACTCACAGAGGGTGTTTAAGAT
TACTTAGTAGTTGTAGGACCCACTGTTGACATTTATTGTCAAATAGAAGATATCACAGAT
GAGAGGCATAGGAGAAATCCACTCTTACCCAATTTTAAGGTGAAATGCTCTGTTTCGGTA
TAGTTCCCACTTGAACTGATCCTGAAACCCTGCCTTCCTCAAAGGGTTGTTTTGAGGATT
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TTGCTGAATATTACTGATTGCTGATGACCACCCCACTGTGAGGAGTTACATAATTTCTGG
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