SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000884_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesEquus caballus (Horse)
Transcript IDSPT00000884
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000788_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000884_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Horse (Equus caballus) # Full length # Reverse
CTACATCATGGCGGGGATCTCTGAAGACACTGTGTCCAGGGGCTGCCAATGACAGTCCAT
CAGTGCATCGTATAGCTCCTCGCTCTGCTCCATGAACTCCTTGTTGGCCTCAGTCACATC
CAGCTGCGGCATGGGGTCTGGAAGAGAAGCAAGGATGCGTTTAGGGAGCGCCAAGGGGAG
AAGCACTCAGCAACCCCAAGAGACTTGGGTTCAGTTCTCTACTCCCAGGACTTCCTGTTC
CCTGGGGCAAGTTCCCTCGTTCCTTACAGGGGCTGATACCACTGCCTAGCAGGGTTCCTG
TGAGGACGGAAATAGGATAATATGTACTTAGAGAATGAAACGTAGTTACTATTCAAGTAA
TGGCAGTTGTTACTCCACATTTATTAAAAGCTACACCTGTACCTCTACCATCACATGCCC
TGGATCTTCTAGTGTGGTCCTTATTTCAATTTTGGGTTTGGAAAACCTGATCAAAATTAC
TAAGTCCAAAGCACTATTCCTAGAATATTACACAGCATTGAAAATGAACCTCAGCTGCAC
ACAACTTGGATGGATCTCACAAATAGCATGCTGTGTGTTAAATGAAAGAAGCAAGACAGT
ACCTACAGTATGACTGCATTTATAAAGTTCAAAAATAAACCTAGAGTTTAGGGATTCATA
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GAAGAGCCCGGCCCTGTGGCTGAGTGGTTGGGTTCGCGTGCTCCACTTCGGCAGCCCAGG
GTTTCGCCGTTTCGGATCCTGGGTGCAGACATGGCACCGCTCATCAGGCCATGCTGAGGC
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GGGGGGGCTTTGGGGAAAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAAGAAGGTTGGCAGCAGATGTTAG
CTCAGGTGCCAATCTTAAAAAAAACAAAACACACAACTAACTGGAAAATTAAAGAAGACC
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TGAGAAAGAGTAACAACTGCTGGTGAGGATGTGGGGAAAATGGAACCTTCATATACTGTT
GGTGGGAATGGAAAATGATGCAGCCCTTTTGGAAAAGTCTGGCAGTTTCTCAAGTTGTTA
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ATGAAAACTTTTCTATGCCCACACAAAAACTTAGACGAATGTTCACAGCAGCATTATTCA
TAATACCAAAAGCATAGACAACCCAAATGTCCATCAACAAAATGGATACTCATACAATGG
AATATTATTTGGCCATAAAAAGGAATGAAGTAATGATACCTGCTACAACATGGATGAACC
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CGGTGACAGATATTAACTAGACTTACTGTGGTGATCATTTTGTAATATATACAAATATCG
AATCATTATGCTGTACATCTGAAACTAATGTATGCCAGTTACACCTCAAAAAAATGACTA
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GGATAAAATATTTCAAGTAAAATTACTGATTCAAACATAAACATTGTAAGAACTTTTTAC
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ATAGTGCGATGATTAAATTTTATGTGTCAACTTGGCTAGGCTACGATGCCCAGTTGTTGG
GTCAAGCACCAGTCTAGATGTAGCTGTGAAGGTATTCTGTAGATGTGGTTAACATCTGCA
ATCAGCTGACTTTAAATAAAGATTATCCTCAGTAACACAGGTGGGCTTATCCAATCAATT
GAAGGCCTTAAGGTCTAAAACTGAAGTTTCCGGAAGAAGGAATTCTGCCTCAAGACTATA
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GGTTTCACCGGTTCAGATCCTGGGCGTGGACATGGCACCACTTACCAGGCCATGCTGAGG
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CCAGCATGCTGGCCTGCCTTACAGATTTATATATACAGATATCCTGTTGGCTCTGTTTCT
CTGAAGAACCTTGACCGATATAAGCAGCATGCTTAAACTTTTTTTTCTTGTGGTTTATAG
GCCATTTGTTTCTTTCATAAATTATTTCCAGCTTTCTCACCTACTCTTAAGAGTCTGTTT
CCATTTCCAAACCAGTCAGTGCTCAATCTTTCCACATAAGTACAATGCCTGTTCCTGCAA
CCAGAGGGATCTTTCTTTTCTTGAATTTTTAAATTGTAAGGGTTGATGCTTTGAGCATTT
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GTCACAACTTGCAACTATGTTGACCTTGAACAAGTAATTTAACTTTCCTCTCAGTTTTTT
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TTTTTTTTTTTCCTTTTTCTCCCCAAAGCCCCCGGTACATAGTTATATATTCTTTGTTGT
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TTTAAAACTTAACATGAGTTCAGAAACATGTTGAAAAAAATTTTTTTTCATAACTTTTTT
AAACCTTAGAAAGTTTTTAAGTATTAATATCTCAGTTAAAAAAATGTGTTTGGGGCCAGC
CCGGTGGTGCAGCGTTTAAGTGTGCACATTCCGCTTTGGCAGCCCGGGGTTCACCAGCTC
GGATCCCGGGTGTGGACATGGCACCGCTTGGCAAGCCATGCTGTGGTAGGCGTCCCACAT
ATAAAGTAGAGGAAGATGGGCACGGATGTTAGCTCAGGGCCAGCCTTCCTTAGCAAAAAG
AGGAGGATTAGCAGCAGATGTTAGCTCAGGGCTAATCTTCCTCGAAAAAAAAAAAATTGT
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GGATTAGGGGTGATTTTCAGTTACTTCATAATACTTTACTGTATTTTCCAAATTTTCAAT
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CCAGTTGCTTCCCCCCGGCTCTCTGGGACCTGCACTCACACTCACTTCTTACCGTAACTG
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CCTTCAGCATCTAGCTGAAGGCACGGTGCTGGCCATAAAGCAGTCACTCCGTAAGGGCTG
ACAGAGGAATGAGCGAATGGACTTTCTTACCTTCCAATGCATCATCTCCGACTTCTTCAT
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AGAGTGGCTTATCTTTATCAAAAAGGACTAGGCTGCTTCATCTTGCCCCATGTTTTCCCG
AAGCCCAAGCTCCTGTCCTTACCAATCCCATCCTGGAGAACCACCTCTGCCTCTAGAGGA
TGCCGTAAGCGAAGAGGCCTGTACTTGCCAAATCACAGTTACCTGCATGGTGCTCTGGGT
ATAGCCATACTGGGGATAACTGTAGCTGTAGCTGCCTGTGTTCTGGTCATAGCCCCACTG
GGCATAGTAGTTCTGGTACTGCTGGTAATACTGGTTGTAGCTGTAACTGTACATCTGACT
ATATTCCACTGGCTTCACACGACTCCTTAAAAGAAGAAAGAACCAAAAATAAACAAAAGG
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GTCAGTGGAAAGCTTTCTTATCCTGAATGCACAGCTGCCCCAGCTGCTGTTAACCAAAGA
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TGGGGCATAAGGAGAGTCGTAACTGCCACATAGCGTGGAACACACTATGTCTTCATAATT
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CCCAGCAGCAGTGTCTGCCTCCACGACTCCCCTTCCACGTTTCTAAGACGGCTGCCACCC
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TGTGCAGCACTGCTATCAGTAATGTCTGACTGTACCCGCCTCCCCCAAACACAGCTCTCT
CCTCCACCGTAAGCTTCTGGAGGGACAGGGTATGCTCATTCCTCTCCAACACTTAGCACA
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CCATCCAGCATGTGGATGCCCTGATTATCGACAAACAGAGGACGAGTGTCCAGGCGGGAG
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CGCTCAGCCGCACTGGTTTAGACCCCAGTCCTACTGCTCCCTGGCACTCTGTCAGGGCTC
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ACAGAGCAATGCGAGATTTAAGGCCGGGAGGCTCCTGAGATCTGTAGGAATCTCTGCTTT
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GGGTTATTTCATCAAACAGTCCAACAATTTGGGGCCGGCCCAGTGGCGCAGCAGTTAAGT
TCACACGTTCCGATTCTCAGCGGCCGGGGGTTCGCTGGTTTGGATCCTGGGTGCGGACAT
GGCACCACTTGGCAAAAAGCCATGCTGTGGCAGGCGTCCCACATATAAAGTAGAGGAAGA
TGGGCATGGATGTGAGCTCAGGGCCAGTCTTCCTCAGCAAAAAGAGGAGGATTGGCAGTA
GTTAGCTCAGGGCTGATCTTCCTCAAAAAAAAAAAAACCCACAAAAACAGTCCAACAATT
TGATGAAGGTAGTATCCACATTTTACTGAAGAGGAAACCAAAGTTCAGAGAGTTTAACAA
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TGAGCTTATAACTACTACTCTGATCAAGAGTGAGCCCTTCCCATGTCTGAAGTAGCAATA
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AACAGGGTAGGCATCAATAACAGGTAAGGCCTTACTTAGACACGCCTGTCTGGTCCAAAA
CCACCTTGCCTCCCCGACAGGAGGGGTAGACTTTGACGAAGAATTCATAGAGCATGCCAT
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ACAAGATTCAGAGACAAAGACCAAATCCTTTGTTCTGACAGGCTCTTCTGGCCCATTCTA
GGTAAACCTTTCCTGGGCTTCCTTAGGAAACAACACATCTGCTGGGTCTTTAGCCAGGTC
CTAACTTGTTTCATTTGGCAGTCGTGGCAGAAGAGTCACGGAGGTAGTCCCCTGCCCCAA
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AATGGGGTCAGAGGTGCTCAAAAGATAAAACCAGACATTCTGTATTCATTGCATATTTTT
AATTCAAATGGTGAAAGACAAAGAGAGAATGAGAACTGGACCTTCTCTCTTAAAGACCTA
AAGCTTAGCTAAAATAAAATCCCCCAACTTTTAGAACAGGGGTTAGGAAACTTGTTCTGT
GAAGGACCAGATAGTAAATACTTTAGGCTTTGTGGGGCACCTATGGCGTCTATTGCTTTT
TCTTTGTGTGTTTTCACAATCCTTTAAAAATGTAAAAACCATTTTTAGCTTGTGGGTGAT
ACAAATCAGCCATAGTTTGCCAACTCCTATTCCAGAACAATTCTTAAAAAAAAAAAAACT
CATTATTTTCTTATTTCAAGTATGATACATATCCCTTGTATAAATCAGAATACACAAAAG
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TAATTTTGTCTTTCTTCTTTGGCTTCTTCTTTTGAATTAAAAAAAATTGGGTATGATTCA
TTTGCTTTGTTTCTAGCATTTTTTCACTTTTAACGTATTGCCAATATCTTGACATGTCAG
TATTCTGCTACAACATGACTTGTTAATACGTAGCGTTCCAATTAACAAACCTATTGCAAT
TTAAACCACTTCCCTATTATTATTTGTTTTCTCTCCAACTTTGCCCATTATACATAATAT
TTCACTGAACACTTTTGACGTTAATCTTTGCTCACATCCTTCGATAAATTTTGAAAAGTA
GAATTACGGGGTCAGCGGGCACAAATCTTTATACAGCTTTTGATACATTGTTTTAAAGCT
TTCATACAGCAACTTGAAATGCTTAATCAATTTTTGTGGCTACAACAGCTCAATTCTTAC
TGAATAAAACCTCACCACTGTGGGGAGTAACAGGGTGGAAGGCTAGGGGAGGGATCCAAT
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ATTTTAGAGGCACCCAATCTTTAGTTTGCATCCTGGCTCTGCCACTTACTACTTGTGTTG
CCTTGGGCAAGTTATTCCAATTTCCTGAGCTTCAGTTTCCTGGTCTGTCAAAGATAACAA
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Chart Advanced