SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000904_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein K (SelK)
SpeciesErinaceus europaeus (Hedgehog)
Transcript IDSPT00000904
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000808_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000904_2.0 # Transcript # Selenoprotein K (SelK) # Hedgehog (Erinaceus europaeus) # Full length # Reverse
TTACCTTCCTCATCCACCAGCCATTGGAGGAGGACTAGGGCCACGCAGATGATTGATTCG
ACCCATTCTTCTTGGGGGGTTTCCTGGTGGCCTAATGAGAGAAAGTTAATTTCTATAGTT
TAGTAAATATCACTTCAACTGGTTCCTTTTAAGCATCCAAATAGACCTTTCCCTTTGCTT
AAAATAGTTAGATGTCAAAAGCCAAACCCTCAAAGCTAGGGAATTAACTCAAATGGTAAA
GGCTAGGGAGTTGGGGAAATAGCGTAATGTGAATGACTTTCATGTCTAAGGCTCTAGGTT
CAATCCCCAGTACCACCATAAGCCAGAGTTGAGCAGTGCTCTGGTGTGTATCACTTTATC
TCTCTTTCTGTATGTTTCTCTCTGATCTCTCTCATTAAAATAAACACCTCCTGTAAATGT
CCAACCAAAACCCAGCTCTTGCTAATTTTTGCCACATGGAAACACACACCCAACCCAATG
CTGTTTGATCTTTGTCTTTTACTAGCAGGTAGAAATCCAGATTCCAAAGCAAAGTCTCTA
GATTTTAATGTTGGGCATTGATTTTTTTTTTTATTTGACTTTCTTTAATTCACTTTCCCT
CGAGGATATTTTATGTATATTTTAGTTCTACCAGGTTAGCTGTAATTACTGAATCTGAGA
CAACTGATTTATAGTAATGCATTACTTTTATGAAACAGAATTTCACCAAGACTTTGATTG
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNACCCTTTTGTTGCCCCTTGTTGTTGCAGCCTCGTTGTGGTTT
AGTATTTATTGCCATTGTTGATGTCGTCGTTGTTGGATAGGACAGAGAGAAATGGAGAGA
GGAGGGGAAGACAGAGAGGGGGAGAGAAAGACAGACACCTGCAGACCTGCTCCACCGCCT
GTGAAGCGACTCCCCTGCAGGTAGAGGAGCCAGAGAGGCTCCCAACTGAGATCCTTTATG
CTGGTCCCTGCGCTTTGCGCCACATGCGCCTTAATCCCACTGTGCCACTGTACGACCCCC
ACTGGCTAGCTTTAGCCAGGCCTTTCTCATCCTCCACTGTGCTTTTCTATGAAACTGTCA
CCTTAATTTTTACCCTTCTATTTTATACTGCATGTAGCCACCAAGGTCCCAAATTCAAAT
TCCAGCATTGCTATATGCCAGAGTTGAGCACAGATAAAGCTTAAATATTTGACTCTTCTA
TATCAATTCTATAACCCTCTGTTCTAAAAAAAGTTTACTATTGGGAAGTTTTCAGGAAGT
ATAACAACAACAATAATAATAATAGCCTAGAGCAGTGAAGGTGCACATATGTGAGTCCCA
GGCCCTACCAAACAATACAGACATACATATATGTACTATACTGTAAGTACTATACTTACA
ACAAAATCACGAACTCAGCTATTCCCCAGAAGAAATCTGTTATGAACGATAATCTCCATG
GGGATTGATTCCGGCTGTCCAACACTTGTCCTACAGTGACAAAAAACAA
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