SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000912_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U (SelU)
SpeciesErinaceus europaeus (Hedgehog)
Transcript IDSPT00000912
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000816_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000912_2.0 # Transcript # Selenoprotein U (SelU) # Hedgehog (Erinaceus europaeus) # Full length # Forward
GGGAAAAGCCCCCATATAAAATCAAATATACTGTCAGGAAGCATTCGGAGCCTGTGGCGG
GCAGTGACTGGCCCTCTCTTTGACTTTCAAGGAGATCCAGCTCAGCAAGGCGGAACCCTC
ATTTTAGGTCCAGGTAAGCATGAAAGCTCTAATTCAATAGTTACTCCATAAGGGTATCTT
TTATTTTCATATACTTAAAACACTTTGAAATTTGCTTATTGGATGTAATGACTCCATTCA
TTGCCTGACTCTAGGTATTTGGGATAGAGAAAGTTAGTTGTGGTTTGGTGAATAGAAGAA
TATGGCAATAGTACTCAAGAAGAAACTTAATAGAGATGAATGTTTCCAAAATAGAGAATC
ATCAAACTTTTTTTTTTTTTGACAGTAGAAGATTCAGCCTACTTAGGGAGCTGGGCGGTA
GCACAGCGGTTAAGCGCACGTGGTGCAAAGCACAAGGACTGGCATAAGGATCCTGGTTCG
AGCCCCCGCTCCCCACCTGCAGGGGGATCGCTTCACAGGCGGTGAAGCAGGTCTGCAGGT
GTCTCTCTTTCTCTCCCCCTCTGTCTTCCCCTCCTCTCTCCATTTCTCTCTGTCCTATCC
AACAACAATAACATCAATAATAACTACAAGGGCAACAAAAGGGAATAAATAAATAAGAAA
ATTATTTAAAAATCATCGTTTAAAAAAAAAGTAAGATTCAGCCTACTTATTTATATGTAG
CACAACTATGTAAGTTCTGTCAAAAGGCACATCAACCCACGGAGCAACTCCTAGTGTAAA
GTCATGTACTTTTAGTACCCTCGTTCATCAGGTTGAACTATCAGAAATTCCTGTACTGTC
ACTCTGTTGAACGGCTGTGTGTTGGAATTCTGCATGTTCAAGTACAGTTGGGGACAAACA
CCCAAATGTGACAATGCCAAACAGCCTTAGTCACTGTTGTACAGTGATATTTCTTGGTTA
TCTTTTCTCTTTAAAATTGTACATGCTTGTCACTACAGTCTGGGTGTTACAAAATTGACA
TTTATTTAATTTCATATGTCTAAAAAGTTCTGGACATAGGATGTGGTAGGAATCAAACTC
AAGACTACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC
ACGTGTTTCAGTTACTCCCTAAGTTACCTTCTTGCCTCTTGTAAGAAATTCTTTAAAAGG
AGGATTTGGAGAGTCAGGCGGTAGCGCAGCTGGTTAAGTGCACGTGGTGCGAAGTGCACG
GATGGTGTAAGGATCCCGGTTTGAGCCCCCGGCTCCCCACCTGCAGGGGAGTCACTTCAC
AGGCAGTGAAGCAGGTCTGCAGGTGTCTATCTTTCTCTCCCCCTCTCTGTCTTCCCCTCC
TCTCTCCATTTCTCTCTGTCCTATTCAACAACAATGACAACAAGAATAACTACAATAATA
AAACAAGGGCAACAAAAGGGAATAAATATTTAAAAAAAAATTTTTAAAGGAGGATTTTGA
CCAAGTATTGGGATTTTTTTTTTCTGGTTGGAATAGTATATCTCATTAAAAATTCATCAT
TGCTATTTAGTTTCCCTCTCCTCATGAGTTTATATTTTAAATTATCTTTTAACAAACAGT
TTTGAGGGTGAGGGGGTAGATAGAATAATGGTTATGCAAAGAGACTCATGCCTGAGGCAC
CTGAAGTCCAGAAATCCATCCCCGCGCCCCACCATAAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTGCTTTTAATAAAATAAACAGAAAACTGTAAATTTAAGAATCATTCCCCCTTGGATCTC
ATAAAGCTTTAAAAGTATCACTCTTAGTTAACTATTATCCCTTGTCATGCTTTGTTAGAT
TAATTAAAATTTATTGTGGCATTATATAGAGAATCTAATGTATTCCAGGTAATTAACTTT
TCCTTTTGGCCTAATTAAAAGTTGAAAAACCTCCTTTATTCTAGTGAGTAACATACTGAT
TAATACTATATGCCCACTGCTGTTTTTCATTCTTATTCTTTTAGGTAACAACATCCATTT
TATACACCGTGATAGGAATAGGTTGGATCACAAACCCATCAACTCCGTTTTACAGCTTGT
AGGAATACAGCATATAGACTTTACTAACAGATCTTCAGTTATCCACGTGTGA
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