SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000982_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Transcript IDSPT00000982
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000886_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000982_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Cod (Gadus morhua) # Full length # Forward
CTCTCCATGCAGGATGTAAAACTATCGGCAGAAGTGGAACCGTTCATCCCACAGAGGAAA
GGTGTGGAAGGGCACTTGGTCAGAATGAGTCTCCCTGGAGAGTCTGGGGGCAACAACAAC
AACAACATCAGCAGCAGCAACAACAACAACGGCGGTGGTGGTGGAGGCGGAGGCGGAGGA
GGAGGAGGAGTCGAGACAACCCCCATCCCCAGCTACCTCATCACCTGTTACCCCTTCGTC
CAGGAGAACCAGCCCAACAGGTACTGTTGGTGTTCCGCTTCATCTCTACGGCGAGACCGC
ATATTTTAACCAAATTGGTGAAACCTCAACAAAAGTCTGGGGCTTGTAGATCGGGGGTGG
GTGTACTTTCTCTCGCGTTCTACAATTTGCAACCTAAAGTGGGGCTTTAAATCGCTTGGC
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AATCATTCCAATATCGTCCCCATAAAACGCCTCCTACCATTCACTGTATTTTCTGTTGCC
TCTCATAATGAGCAGGGAGGCTCTGACTCCGCCCCTTAGCGATATAGATCAGCGACGCTC
ACGCCACCTCCATATTGCTGTCCAGCCATTGGCTCCCCAGGTCACTTATACTCTGAACGG
ACACGGCCTGTTCCACAGTTCACACGCAGCCGCTATCTGCCTCTCGGCAGCGAGTCTCTC
TTTGTCTGAGGAGATCTGTTGTATCCTGTGCACATCCGGCCCCTTTGTTTCCTTCCTCTA
CCTTATTGAATACAAGGAAGTGGCCACTTATAGAACGCTGGCTGGCAGTACGCCGTTTTG
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TCATTTCTACTGTCCCCAAACCATTTCCATCCCCATCCAAATGTATGTAAATCACTTTGA
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TTTATTTACGATTGTAATGGAATGTAATCAAAAGCGCCAAGGTATTTTGTTATTGCTCTG
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CCCCCTGTCAGCAAATTAGACTCCAGTGCATGATCACAACACGAATAACAGAATGCTACA
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TAACCCAAGAGAATAACATGGACTTACACCACATCCTGCCTTGGTTTTCCCCCTCACAGG
CAGCACACGGCGATGTACAACGGAGGAGAGCTGCGCTGGCAGCAGCCCAACCCCAGCCCC
GGTGGGCCGTACCTGGCCTACCCCATCATGCCCTCCCCTCAGCCGCCGGTCTCCAACGAC
TACGCCTACTACCAGATCATGCCCGCACCGTGTCCGCCCGTCATGGGCTTCTATCAGTCC
TTCCCCGGACCCTACCCCGGGTCCGTGCAGGCCGGGGTGGTGAACCCCGTCTCCGCGGCT
GACGTCGGCGAGAGACCACATTTCGGACAAGCCTTTGGACTGACCAATCAGAGAGGACGG
GCTCTGATCCGGCCCCCTCTGCTGCCCAAGGTAACCCCGACTGTAGTCGTTCTTAAGGGC
TGACTACGGTAAAAAAAGGTTAACCTTGCGTCGAGCAGCAGAAGGCTGTGATTGGTCCTC
TCGCTAAAACCCAACGAGGGACCACTGCAGCTTCCCGACTGTTTCCGCGGGCCAGAACCA
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CCTCTCCTGTCGACGTGTCTTTTTAAACCCTTTCTCTTTGCACTTGTTTCCAGCAGCAGC
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GTAATTACTCCACTTCTTAATACCTCGCATGATGTCACTGTTAACGAGGGACCTCCCTGA
CGGCTAACTGAGCGTTTAGTGTCAGCGACTAGTCTATTAAAAAAAGAGAAGGCTTAGAAA
TGGTTTCAAACTGGTACTGATTTCCTTGGCAGAAGTATCATGCCAACGTATGGTTTCAAC
CCACCGTAGCTCCCCTCATGACGCGTCTAATATGGCCCCACTGTATCTGCCGGCATCCTG
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CAAGAGCAACTCTCCTTCGATTGAAACCCCTGACCAGCCAACTGCTTGGTGAAAGTTTCT
CTTCAGCAGTCTCCTGATCAGTGTTATGTAAAGTAACACTTTACATTATGTAAAGTAACA
CTTTACATAACCACTCATTAACACAGTAATACACATTACTAAAAAGCATTAGCAAAGAGG
TTAGTGGTTTTGGGTTAACCCTGATAAATATTGTATAAATTAATACAGCAAAGGATTACA
GAACAAATAGTTAACTTTTCAAGTTGTTAGTTATTGCTTATTACTGCATTTACTCATGTT
GAATAGGGCTTATATAATTTTCCCCTATTGTAAAATTTCCAATGACGCAAAGGGAATGTG
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TGACAGCCATGCTACATCACCTGTGGAAACCACAGGAAGAATGCCGGTCTACCAGTTGGA
GAAGTGTGTTCCTTGACTCAGGCTGGCACCGCATGTTAAGAAGATGTTAGCTGAACAGTT
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ACGTTATTCAGTTTGTTTACTTATTTCGTTAATAAGCAAATGTAAAACATAATGTTTTAG
GTCAAGTTGAAAATGATATATAACAAAATCCTAAATGTATATTAATTTGCATTTTGCTTT
ACGACTATATGGAAAAAGTCAATAATCCATAATCTTCCAGTTAGTTCTGACTTGTTAGAT
AGAAGAAGCTAATTCCAGCCTTTATTAAAGACGGTAAAACAGCCATCAGCGTGACGTCTT
GCACTGGAGACGGCGCGTCCTTCAGGCTTGTTTTCTTTCTTTCTTCTTTCTGGTGTCACC
ACTGTCCTTCTGTAGGGCTGATCGATTGATCGTATTCAAACCGACATCGCGATGTTGTAG
AAAAGGCTGATAGTTAATAAAAAATAACTTTATTTATTTCTTTTTATTTGTAGGATTTGT
TGTTGTAACTGACTGGAGATCAGTAAGATTCCTATTCATTTTCTTGTACAATTCAATAGT
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GTGGCCATGCGAGCGGGCGCGGAGCACGGCAGCCCCCTGTTGTGGAAGAGCCGGCCCAAG
AGGAGGCAGGGGTCCAACGGGGGGGCGGAGGGCTACAGCGAGCAGGGGGGCGGCGGGGGA
GAGGTGGACGTCGACAGCGACAGCGGCTACTGCAGCCCCAAGCACAACCAGACGGCCGCC
CAGCACGCCGCCATGGGCACGCCAGCGTCCACGGTACCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
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CCGTGCGGACCCTCCTGACGTGCGCCTCCAAAAAATGCTAACCTCGCGTCGAGGTGACGC
AGCAGCAAGGGTCGTGATTGGTTCGCTCACTAAAACCGACGCAGAGACAAAACAGGTTGC
GTCGAAGCGTCTGCGTGGTCGTTGCACTGCGTCGACGAGGAAGCTTGTGTGTTGTAAGAA
ATAAACGCCCTTCTCAAAGGAGGATATGTTTTTTTGCTTTAACTCCGAGCGGATTGCGCC
AGAGCAGAGCCGAGCCACAGCGTGACTCTGGTTATTTAATCTGATTGGCCGTCTGCCATC
CTCTCGTCAGGATTTCCATGTCGGAGGCTACGCTGGCCGCCTGCAGCACAACCTGAACGC
CAACCCCGCAGACAAGAGGCTGTTGCCCGGAGGGGCCCCCGGGTCCCAGGCCACTCCCGA
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GGGTTGGCCCAGCGCAACGCCAAGGCGGATTCCAACACGGGGCCAACGCAGACACAAGCC
AAGATCCACAAGAACCTGGTGAGAAGGGTTCTCCTATTCGATGAAAGACTAGAACCTGAA
GGGCCATCGGAGTAGGCTTCACCACTGGACACGGATCAGTCTTCTACAAAAACAACAGAA
AGCAAGAAAAACTTTAATAAATGAAAAAGGAGTCATAGCTTTCACACTTCCACTTCAAGC
TGGACATTCTCCTGATATCACCCAAGGGGGATGTATGTGTGAACGCAAAAGTCTGAATCC
CCCCCCCCCTCCTCCCCCACCGCCCCGGCAGGGCCCCCAGTGTATAAAGTCTGGGGATCA
GAGAGCTTCAGAAGTCCCAACAAGCCAGTGGGCGTGTTGCTGGCGTGTGGGGGACGTTTC
ATTGCTGACGGAGTGTAGCTGCTTCGTACTTTTCTGTCCTCGCCTGTATTTTGCGTTCCA
ACTCCTTCCTGCTTTCCACTCCTCTGTTTCCACTCTTCTGTTGTTATGCGGATACGGTCT
AAATAAATTCAGTATAGATATCAACGGAAAAAGTGTCAGCATTACGCAGTTGGAAGCCTC
ACCCGCGACCTTCGGTGTGTTATAAACAAACCACTGTGGCTTGTGCTGCAAACGTGTTGC
GTCACGTCCTGGCTCCAACACGCTCTACCCAGGCGCCACTAAAATATCTCATGTGTGTGG
GATGTGTGTGTTGAATGTGTGAAACGTCAACTCCGGATCATCTCTGGACCCGCTTATCTG
GAGAAGATCGTGTGTGAAAGGCCTGTGTCTATTTTTGCTAAAGCCTTTTATGCATTTTTT
TTAATTGCCCTGTAACAAGGAATTTAACCGCTCAGAGTGACCATGTGTACTTTGCATGTG
ACATTTACATTTAGGGCATTTAGCAGACGCTTTTATCCAAAGTGACTTGTAAGTACATTT
GTCATAAGAAAGTGAACAAATATCTTTGTTGCGTGCACAACAAAGATACCTAGGATAAGA
TGCTACACTAACTAAGTACTATAACTAAACACAACATGTGTCTACCAACCCATGTGGGCT
TTGACAGTGTGTCCGAGACCTCCGTGACACCGTCTGCCTCGTCTGACCCACAGCTGGACA
ACCTGCCGGAGAACTCCCCCATGAACATCGTGCAGACGCCCATCCCCATCACCACCTCGG
TGCCCAAGCGGGCCAAGAGCCAGAGGAAGAAGGCGCTGGCGGCCGCCCTGGCCACGGCCC
AGGAGTACTCCGAGATTAGCATGGAGCAGCGCAAACTACAGGTCAGGGTCAAAGGTCAAA
GGTTATTATTTGTCACGTACTCATACAGCATGTGCGGTGAAATGTTTGTGTGACATGCTC
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ACTAAGAATATTATAAATAGATATAAAATGAAAACTGGATAAACAGGGAGATGTACAAAT
TGCATTGTGCAACATGGCCACGGTTAAAGCAGGCATTGTGGTCACCCGGGCAGTGCAGAG
GTTTAACCCCAGGGTGTCGTTCCCTTGCGGGCCTGCAGGAGGCGCTGACCAAGGCGGCGG
GCAAGAAGAGCAAGACCCCGGTGCAGCTGGACCTGGGAGACATGCTGGCGGCGCTGGAGA
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GTTTTCCTACTTCATTATTAGTGAAAGTTAGTTCACCAGAGTCGGCTCCACTAGCTTAAC
CTCTCCCTCTGTCTTAATGATGAGATCATGATACAAACACAGCCATGTGAACCGTACTCT
GAGGTTTGACGAGACTGCTCTCCTCCCCCTACAGTGGGGACGACGGCCCCCTTCCACAGC
TCGGGCCCCAGTGGTGTGCCGTCCAAGGGCCACCACCACCAGCAGCAGGCCGGGCCCCCC
TCCCACAACGCCCTGGACTCCACCGCCCCCCGCGTCCGCAGGGGCAAGGAGCGAGAGATG
CCCAAGGTCAAGCGTCCCACGGCGCTCAAGAAGGTACGCACTAACGTTACAATGAATTAA
CATTAGTTAATACAGTGATATGAAATATTGTATTATATTGAGTTAGGGTTAACCCTATTG
AATTGTATATTTTAATGAATTAGGTTAGGGTTAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
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AATTGTGTGTGTGTGTCACCACAGAAGCAGGTCTTTAAACGTGTATCTGTGTAAATAATT
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TGTGTGTGCCAGTGATACACACACACACACACACACACATGTATTGGTAAACATGCACTC
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GGTCATTGTCATATGCACAGCAATTACAGCAGCAGGCGCTGGCAATGAACTTCTTGAGTC
TCAGGCTCCTTCAACAATGCAACATAAAAAGTGTAAGAGAATAAAATCTAATAATAATAG
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GAGTGAGGGGTTTGATTGACGGGGATGGTGTTCTGCTCCCGTCCAGATCATCCTGAAGGA
GCGCGAGGGGAAGAAGGGGAAGCCCAGCGTGGAGCCAGGGACCTCGGGCCCCGAGGAGCA
GAACCCGGACGAGGAGCTCCACTTCACTGACGACCTCACGCAGGAGCCCGCCTCCCAAGA
GGGTGAGCCTGGGTGCTGGTTGGGGGGGGGTCAGACAACCACGTCCACCTCCAATCGGCT
TGGTCCGTTCACAACCCCATCTTCTTTAGAATTTAGAATTTTCGCTTTACACTATATAAT
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TTACTTTAGCATTTACCTTAGTGTTTAGCGTGTCTATTTTTATTGTATTGTATTTGTGTC
CTGTGTTTTCCCACTGCTGTTGCAACAAACAAATTTCTCTATCTAATCTAATCGATCTGA
TCTTGTACCTAACAACATTCTCTGTCCCAACAACGCGCTTCACTGTCTCATCTTTGTGTG
TCTGTCTTTCCGTCAGAGAACGGACTGAGCATGCCCAGTGACGCCTCCCTGTCACCGGCG
AGTCAGAACTCTCCGTACAGCATCACGCCCGTGTCCCAGGGCTCCCCCGCCAGCTCTGGC
ATCGGCAGCCCTATGGCGTCCAACGCCATCACCAAGATCCACAGCCGGCGCTTCAGAGAG
TGAGCACGCACACGCGCACGCACGCATTAAAACCAACAAACGCAGTCACATACACACACA
CGCATATGCACACACACGCGTTCACACAAATGAACACAGTCACACACACACACCAACGTA
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ACACATGCACGCACACATGCCCACAGTCACACATGCACAATCTCACATACATGCACACAT
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GACTTGTGGCTCTTTGAGTATGGCACAGACGCCTCTCACGTATCCCCATGCTCAGCAAAT
CCTCAGCTCGGTGTCACAGGGAGGTCTTTGTCCCACGGCTGTGGGCTCCATTGTCCTCCG
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GCCAGGCTCCGCCCCCGTCCTCGCTCTGCTCCCCAGAGGGACGTGGTCGGCTCAGGCCAC
ACTGCGTCGATAGCGCGTCACCGGGCGGCCGTGGAGCACCATGGCCGCTGCGAGATGTTC
TGACTGCTCACTGCAGCTCTGCTGGGGCAGCATAGGAGGGCTGAGCGATTGAACGAGTTC
GAACCGGCATCGTGATGTAACGGAAAGAGATGTGCAAATCGTAAAAGGCTGCGTTTTTTG
TTATCTTTTGTGATTTGTTGCTGTAGCTGACTGGAGATCAGCTGGATTTGTATTTCTTTT
TCATTTTACAATTCAATAGTTAAATAAAGACAAAGGCCTGACCTAAAGGAAAGGGCCGTT
TATATGTTGACTGCTTCCAGTGTACGTAAGGAACTTTAACAAGAAAAATCGCATACTAAC
TAACAATCACACAATATTGGTCAAAATAATCGCAATTAGAATATTTCCCCAAACGGTTCA
GCCCTACAGCATAGTTTCCTGATCGATGTGGATCAGTTAGATGTAATACCTGGGGGGTTG
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CCAACCCTAACCCTAGTTGGGTTTGATTATTCTGTGGTTAATGCAAATGAGCGACGTACC
TATATAGTATCTATCCAAAAACTGAGAAGGAAACCAGAAAGTGGAAGTGGCAGGGTAAAA
CATTTATTTATTTGAAAGTAATTTTGTATAGGCCTACTTAATCTATGCAATATATAACAT
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GTAGTCTTTTTAGGCATGGTGTGGGGCAGATCCCTCCAGGATCGGATGTTTTGGCTTGTC
CTTCCCCCCGCTCAAAGTTTAGTGTTCACTTCTAGCCAATCACGTGCTAACTGACCCCCG
ACTCCAGCACCACGATTGGTCGAAAATAAATATGAAGTGAAAGTGGGTGTCGCCCATATC
TTAGACGGTCTGCCAACAGATGTCAGACTTTCTTTGATTCCAAAGTGTGAGTGGTGAGCC
TGTGACTCAGTGGTGACCCCTTGTGGCCGTGCTCCGCCCCTGCAGGTACTGCAACCAGGT
GCTGAATAAGGAGATAGACGAGAGCGTGACCATGCTGCTGCAGGAGCTGGTGCGCTTCCA
GGAGCGCGTGTACCAGAAGGACCCCACCAAGGCCAAGTCAAAGCGGCGGCTGGTCATGGG
CCTGCGGGAGGTCACCAAGCACATGAAGCTCAGCAAGATCAAGTGCGTCATCATCTCCCC
CAACTGTGAGAAGATCCAGGCCAAAGGTGAGTGCAGCGGGCGAAGGGGAGCCCCACTTTG
TTTGTGGGAACACTCGCTGGTAAAAACAAGGAAAACACACATTAGTTTCTATGGGCAGGC
TTTTAGTTTTCCTCTTTACTGGTAAAGTGTTAACTTTTCTGAATATTGTTGATACATGTA
TGTCATTGTTAATGTGTGTCAGACAATGCAGAGGCCAGCAGAGGGGGATAGCGTGTTTCT
TAAAGACAAAGGGGGCAGAGATGACACTTGAACTTTTATGAAATGTTTTTCCACTGTGTT
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TGAGTGTTATTATCTAGGTGGGCGTGTCCACCTAGATGTATGACAGATAGATAAGCAACG
TTTTTTACAGTCCATTGGGTAGGCTGGTAGACTGATCTATCCAGCACACATCTAGGTGGA
CACGCCCACTAGTGATGTCAGAAGAGGCAGATTTCCGAAACAGCTTGTAACGGCCGACCC
CACTCACACCTGGTGGTATAATATGTCACCTGTAATGCGTTCACTCCACAGTGCAGGTTG
AACACAGCTCTACTGTGTGTGGGTTTCAGGTGGGCTGGATGAAGCTCTGTACAACGTGAT
CGCCATGGCCAGGGAGCAGGAGATCCCCTTCGTGTTCGCCCTGGGCCGGAAGGCTCTGGG
GCGCTGCGTCAACAAGCTGGTGCCCGTCAGCGTGGTGGGCATCTTCAACTTCTCGGGGGC
CGAGGTGAGTCGCTGCTACCCGGTCACACATATTCAGTTTGGTATATTTAAACATACAAA
GTGACTCGGCGAGGGGGGTGCATAAAAGAAAATAAGCAGCATGATGTAAGCAATCTATTT
ACAAAATATTGAAAAATAAGAATTAAAACCAGATGGCAAGATAAAATGTTAAGTTATTGC
CAACCTACTATTAATCATGTAGGCTGTCAAAGGCTAATAGAGGCTTTGAAATGGGAATGG
TGCGTGTACACTATAATTAGAACAAAAACAAATAAATACTGATTTAGGTACTATGTATAC
ATTTGTATAACTTTCTATAATATTTGTATAGTAAATTTTGTTATTCTTAATTTTGATTTT
AAAAACATTGAATTAGAATTAGAATGGCAGGATGCTTCTATCCAAGTGTTTTAGGTCTCT
CTTTACCGCTCTCATTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGCTGCCAGGCCTTGTTCAAC
CAGCTGGTGTCCCTCACCGAGGAGGCCCGCAAGGCCTACAAGGACATGGTGTCGGCCCTG
GAGCAGGAGCAGGCTGAGGAGGCCCTGAAGAACGTCAAGAAGGTCCCCCACCACATGGGC
CACTCCCGCAACCCCTCCGCCGCCTCCGCCATCTCCTTCTGCTCCGTCATCTCCGAGCCC
ATCTCTGAGGTCAACGAGAAGGAGTACGGTAAGACCCCCCCCACACACACACACACACAC
ACACAGGCTCCTCCCCCGTTCTCCTGGTCACCGTGGTTACAATGCGGTCGCGAGCTCTCC
ATGTCTGACTGAGCCGACCCAGTCACGAGGGTCGAATCATTAGATTAAGATCCATGGGAC
AAAGATTTGTGATTTTCAAGCTGAGTAATTGAGTTTAAACGAGAAGACGTGAGCGTCCCT
CAGATTAACCCACGGCCCTTGTTTTAACGTGCGCTACAGTGGCATCACAAATGTGTGTCT
GCACCCCTGTCTCCCAGAAAACCAGGCTGTAACGACCCCCTTTCAAGTACCACACAAAGC
AGTAGGGCTGCTCCGTGATGAGTTTGAAAACATAATGCACTTATTCTGCATTTCTCTNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGGAG
GAGGGCCGCGTTGACGACCGGCTGGAGCTGGCCTCTCAGCAGAGCACGGAGACGGGCTCC
CTGGACGGCAGCTGCCGGGAGCAGCTGCACTCGTCCATCACCTCCACCACCTCCACCCTG
GTGCCGGGCATGCTGGAGGAGGAGGACGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACTACACGCCG
GAGCCCATCTCGGTGGAGGTGCCGCCGCTGAGCAGCCGCATCGAGTCCTGGGTCTCCAAG
ACCCTGGAGAACCTGCAGCTGGGAAAGGACCAGGACAGCACGGACGACGAGGACGAGGAC
GAGGAGGAGACGGCGGGACAGAGCGAGGAGGAGATCGAGTCGGCCGACCTCCCGGATGAG
CGGGCTGAAGGC
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