SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000983_2.0
Identity
TranscriptSelenophosphate synthetase 1 (SPS1)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Transcript IDSPT00000983
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000887_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00000983_2.0 # Transcript # Selenophosphate synthetase 1 (SPS1) # Cod (Gadus morhua) # Full length # Forward
ATGTCTGTGCGAGAGTCCTTTAACCCAGAGAGCTACGAGCTTGACAAGAACTTCCGACTC
ACACGTTTTGCTGAGCTGAAGGGTAGCGGCTGTAAGGTAAGCTTCTAAATGACCCGTTGT
ATCCATTTATTATCGCTGTGTGTTTCTTAGGTGACTTTAGCAAAGCCACTGTGAATGTTG
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GGAGGATGAACAGTTTCTTGGAGCTGTTATGCCCCGACTGGGTATGTCTATTCAGAAACA
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ATTAGGCCATACGATTCCTCCCACACAACCCCATACTACCCTACGCTTTTTACCCTCTTT
ATTTCTTCAGCAATTACGTAATAGTAGCACTAGCAGTAGCCTTATGCTTTCTGACTGATT
TTTTTTCTTTAATCACCCATTTAACTGGCTCTGGGCTTCAATTCTATTATACATAGCTTA
GTAACATATTGGTAACATTTCTGTCTATGGTTATCAAATAGGCCTGTTTTGTTATTACCT
TATACCTATGTTCGCACATTACGTCCCATGCGCTGCTAACATAGAAATCAAACGTGTCAC
CTTTGGAGTGTGTGTCTATCTGTGTATTATCTGTGCAGGCATAGGGATGGACACCTGTGT
CATCCCACTCAGACACGGGGGCCTTTCACTGGTCCAGACCACAGACTACATCTACCCCAT
CGTGGACGACCCCTACATGATGGTGAGGAAAAGGGACACCATTTCTATCCCATTCCATAC
AATGGGACATAACGTGCATAACGTGCACATCGCCGCTGCAGAGTTCATTGAAATTGTATC
TGTGTGTTTCTGTTGTCAGGGGCGGTTAGCTTGTGCCAACGCTTTAAGTGACCTGTATGC
CATGGGCGTGACGGAGTGTGACAACATGCTCATGCTCTTAGGAGTGAGTAACAAGATGTC
AGAAAAGGTGAGAAAAACCTGAGCACTCAGGCCTGAAAATGTACCTCCTACATCTTTTGT
TCCTGGTCGATTCAGAATAATGATCCAGAACAAAAAAGTACATTTTTATCATATAATTTA
ATAATAATGAATTGAACTTTTATTAATTAATAACCCTATTATTTCATATTGGATGTTTAT
TTGTATTTGTATCAAGCCTTTGTAGACACTCACTCACACTCAGGCCACCTTAGCAAAGGT
ATAGCGAGGTGGAGATTGTCTCGGAGGTTCATCCCGTCTCTCCCCTTGTTCGGGTCGCAG
GAGCGGGACAAGGTGATGCCGTTGATCATTCAGGGCTTCAAGGACGCGTCAGAAGAAGCG
GGCACGTCGGTAACAGGGGGCCAGACGGTGCTCAACCCCTGGGTGGTGATTGGCGGAGTG
GCTACCACGGTCTGCCAGCCCAATGAGTTCATCATGTGAGTGTCCTTTTTAAGGGCATAA
TATTCGTATGAATCATTCTGTGTTGTATTGAGCATGTATTTATGGTATGGTGTCTACGGT
TTCTATACCTTGTATACCGTTTATGTTATGGCTGGTCGGATTGTTGTATTGCATTCCATT
GAATGTGATTGCGTTGGCTTGTGTCATGGACGTCCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTCCAGGC
CTGATAACGCGGTACCCGGGGACGTGCTGGTGCTGACCAAGCCCCTTGGCACGCAGGTCG
GGGTGGCCGTTCACCAGTGGCTTGATATCGTAAGTCTTTGTCTTCTTAAATGCTCACAAT
TCAGTAAACATTGAGACCTTGTGTGGGACCTTAGCGGCGGCAAATGATCCCAGTATACGT
TGAGCCCTGGGGCAACCACGTTAAAGAAACGCACAAATAAGAGCTCTTGCCTTAACAGGT
TCATCCTAGAAATTTGCACTGGTTGTTGAGAATCTGGTGAAAACAACTCGTCAACAAAGT
CTTGATTATATAATCAATTTAACTAAATGCATTCTGAGTTTGTTAATCAATTCTATTATT
CTCAAAATCATTGTTTTTTTGTGAATGATATCGTACAGGGTGTGTCCCCAGCAGCGTGAT
CTGTCAGCACTGTAGTCTGATGCTCTTCCCCGCTCTTCCTCTTCCTCCAGCCAGAGAAGT
GGAATAAGATCAAGCTGGTTGTAACCCAGGAAGATGTGGAGCTAGCCTATCACGAAGCTA
TGATGAACATGGCTCGACTCAACAGGACAGGTAGGATGCTTACAAACATAGCGTACAAGG
TTTATGAACAAGAAGAAGCTGCCATTCACTTTCTGTGTTTTTTTGTCTCGCTTGCTAGCC
TCTGAACCAAATAACATCAATACATGCAAATGACCTCTGATGGATCAATACTCAATCACT
CCATCCCCCCATCCCCGCTAACCTCATTCCAGATGTTCATCTCGCAACAGACTGCCCTGA
AAAGGGTTCTGCTGCACATGTGATTATGGGCGAGACAGGGAGTTTTGGAGGGAAATCTGT
ATTGGTTAAGTGGGTTAGATAGGCCAAAGGCAGGGACTTCCGATGGACATCGATACATTT
CTGTCCAACGCGACAGGTATTGCTGCATCAATAAACACCTCCTCTTTGTTGTTCTCCTTC
TTTTCATGTTCTTATTCCGGGAATAAGAAGAATAAGTAGACTAGGTAGACTAGGGATGGG
CCGATAGTCAATTCTATCGACGATAGATGGATTCCATCGTTTATTTTACAATTCAATAGT
TAAATAAAGAAGTTTATAATATAAATTAATCTCAACACATTGGCCTGGCCTCAAGGAAAG
AGACGTTTTTATGTTGACTGCTACCAATGTTGTGTTGGTCACACTCAAGAATGATTTTTT
TTTTGTGAATAATACACATAAACATAAGGAACTTAATAAATTATAAAAATCACACGTTAA
ATCGCAATCACAATATTGGTCGAAATAATCGCAATTACCGGTAGATTATTTCCTCCAATG
GTTGAGCCCTGGTCTGCTCGGTCCTGAACGCCGCTCCTACCTTCCAGCGGCGAGCCTGAT
GCACACCTTCAACGCCCACGCCGCCACCGACATCACGGGGTTCGGAATCCTGGGGCACGC
TCAGACGTTGGCGCGGCAACAGCGGAGCGAGGTGTCGTTTGTCATCCACAACCTGCCGGT
CCTCGCCAAGATGGCCGCCGTGTCCAAGGCCTGCGGCAACATGTTTGGGCTCATGCACGG
AACTTGCCCGGAAACATCAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCGTGTCGT
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ATCTGCCTCCCCCCGGGAACAGGCGGCCCGCTTCTGCGCGGAGATCAAGTCCCCGAAGTA
CGGCGAGGGCCACCAGGCCTGGATCATCGGCATCGTGGAGAAGGGGAACCGCACCGCCCG
CATCATCGACAAGCCGCGGATCATCGAGGTGGCGCCGCAGGCCGCCACCCAGAACGTCAA
CCCCACCCCG
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