SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00000984_2.0
Identity
TranscriptSelenophosphate synthetase 2 (SPS2)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Transcript IDSPT00000984
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000888_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00000984_2.0 # Transcript # Selenophosphate synthetase 2 (SPS2) # Cod (Gadus morhua) # Full length # Forward
ATGTCCGGCTCCACTCCCCCCACTCCCCCGGCCGAGGCCGTGGGAGTCGAGGGCTGTTTA
CTACCCGGATACAAGCCTTTCAAACCCGAGGATCATGGGCTGGATCGTGGGTTCCGTCTC
ACAGCCTTCTCCGACCTGAAGGGGTGAGGCTGTAAGGTCCCCCAGGAGGCTCTGCTCAGA
CTCCTGGCGGGACTGGAGCCCGACCCGGCTGCCGGCGCAGGGGAGGCCGGAGACCAGGCC
TCGGAGTTCGGTCAGCAGCCCCCCGGCCCTCGCCTCGGTATGTCCCGCAGAGCCGCCGTC
ATCGTCGGGGCGCTGAGACGCACGCTTAGCCCATTTAGTTTGAGATCCTAATACATCAGA
ACGCTGTTTGTTTCGCTCATCTATCTTAACTTAAGATCCTCAATGCATAAGAAGGCTGTT
GGTTTACTTTAAGATCCTCCACTACATCAGAAGGCTGTTTGGTTCTTCGTTGCTTGCTCG
CCATGCTGAAGCCATTGACAGGTGCCCTGGCATATACCCTAGTTCCGGTTGGAATAAAAC
GAAACTTGTAAAGGGTAAATCATAAAAAAATATATTGTCCTGTGACAATGGTAAGCCTGT
TAAAATGTAATATAACTTTTAATTGCATGTGAATACAGATAGACCTTGACTCTATTAAGT
TAAAGATATAAAGGTGTGCGTGTGTGTGTCTAGGCATAGGGATGGACTCGTGCGTGATTC
CTCTGAGACACGGAGGTCTCTCACTCGTCCAGACCACGGACTTCTTCTATCCTCTGGTGG
AGGATCCCTACATGATGGTAAGCTACTGTGCTCTAAAATTATAAAGACAACACCCATATT
AAGCAAACACTTGGCCAACCTCAGACAGGAAGCTATTGCATATGATTGTGACTCAAACAA
AATTCACCTTTTATGGAGTTTTCTTTGCTCAACCATCATTGTCATGTATTATGTGAACCA
GAGCTGAGAGATCTCCAGTCAAAATCAACTACCAAAGAAACAAAGTTTAGGAATACCAAG
CTTTGTTTCTTGGGTAGTTGATTTTGAGTGGAGATCTCTCAGCGCTTGTGTATACTGTAA
TAGTTGTTTTTTCAATAATTATTTTAGACTGGAATAATTGACAGTGTTGGAGTAGCAGGT
ATTAATGTGAAGTCGACATGAGAAGGTATAGAGCCTCTCAGGGTGGTGGCAGGCTTAGCT
GCTGGCGATCTGAACATCCATTTCTTGACATTGCATCATATTGGAGTTTCTGGATGAGGT
TGTTAGATGAATCCCTCACTCAACCATTTAAAACTCATACGTGGATCAANNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACACC
GTAGGCGTGGGGGCTACAGACTGGACCATTTTATGATGAACTGTTGCATATAATAACTTA
CTTTGAACATGAACGTATTTAGCAATCATGTCAATGTTAAAACGAAGGCCAAGTATACCA
AAAATCTCTACCAGCTAATGGTTTCCGGTTGGTAATTGGAATAAACATAAATAGAATCGG
TAGGGAGGTTTTTCCTTCTCTGCGGCTGTGTGTTCCTCTTGAACCGCACTATGCCTGCTG
CGCAACTCCACCACAGCTTGGCACAGTGTTGAAACAAGCCTATTGGTACTCCCCCACTAT
GGAGAACATGTCCTACAGGCTCCAAGCCCTAACCTCTACCAACCTGGAGGCTATCCTGAA
CGAGGGACCCCAGGCGGCCCATATTTTGTAGTATAGTTCAATTGCAACATTTCCACTGGA
ATCACTTTTGGAGACTCTTTAACAATGTGAATTTGTTTCTCAAGCAGCCCAGAATACTTG
CATGCTAAATTGAGAGCAGCTGTGCGTCCTATGTGTCCCCTGCACTGCTGCGAGGGAACC
TCCCCATCCTCACCCTGTCCCCGCTGTCTCTCAGGGCCGGATCGCCTGCGCCAACGTCCT
CAGTGACCTCTACGCCATGGGCATCACAGAGTGTGACAACATGCTGATGCTGCTCAGCGT
CAGCCAGAAGATGAACGAGAAGGTGGGGTGTCAAGACATGCCGGCCAAAGAACGTGTTTC
GGGGACGTTGCATGGCGCGGGCGCGTGTGAACGAGAGATGTGCGGTCTTGTGTTCAGGAG
CGCGAGCGAGCCATGCCGCTGCTGATGCGAGGGTTCCGGGACGCGGCGGAGGAGGGGGGC
ACCTCGGTGACCGGGGGGCAGACGGTGGTCAACCCGTGGATCATCGTTGGAGGCGTGGCC
TCAGTCGTGTGTCAGCCCAGCGAGTTCATCATGTAAGGACGCCTTTCAGCAGTTACACGC
TGCACAACTGTGAACTGAAAGGGCTTTGTTTTGCATGCTGGCTTGCAGATATGGTCTCAT
GTGTACCTCTTGAATATTGGATGTCACATCCTGCTTCAGTAATCTGATATAGATTTATCT
GGATCTAAAAAAAAAAATATTCTCTGATATGCATTGTGTTAACATTTGGAAATACCTATA
ATGGAGTCTAGGACCATTCAAACGTATGTTTGAACACGGTGCTACTGAGCCTCCATGTGA
CCTTTAGGCCCGATGGAGCCGTACCGGGAGACGTCCTGGTGCTCACCAAGCCCCTCGGAA
CCCAGGTGGCAGTCAACGCCCATCAGTGGCTGGATCAGGTCAGCCCTCCCCTCGGCTCAC
AGTCTTTGTATCGTCAACATGGCACATAGGACGTGTCCACTGTGTCCTTCCTACTTCTTC
ACACGTCTCTCCTCCCCAGCCTGAAAGATGGAACAAGATCAAGCTTGTTGTCAGCAAGGA
GGAAGTGAAAGAGGCCTATCAGGAAGCCATGTTCTCCATGGCAACACTCAATCGCACAGG
TAAATCCAGTCTTTTGTCCTACAGTGCAGCCAGAAGGAACATGGTGTTCTGTTGTTGTCC
TCGTCATGCTCATTATTGAAAGTGTCTCATTTAAGCTGTGAGGCGTCCACCTACATTGTA
GTACTTTGCGTGACAGAGTTCAGTGTTTCCCGTAGTACTTCAATGAAACGTATGTTTGAT
GCGAGTGAAAAAGCAACACTACCTTTCCAGCGGCTGGCCTTATGCACAAGTTCCAGGCCC
ACGCAGGGACGGACGTGACGGGCTTCGGGCTGCTGGGCCACGCCAACAACCTGGCGGCGC
AGCAGCGCAGCGAGGTCTCCTTCGTCATCCACAACCTGCCCATCATCGCTAAGATGGCCG
CCATCAGCAAGGCGTGCGGAAACCTGTTCAACCTGATCCAGGGCACGTCCGCGGAAACCT
CTGGTAGGACGGCTCCTAGAATACAATGAGTTGGTAACCAGCCAGTGTTGGTGGGGAATG
GAATGCAGCAGAATTATATTAAATATATTAATTATCATTGTCTGATTATACGTCGTGTTT
GGGCTGTTAAACAGCTGTCCCACATCCCTGTCCTTCAGAATCATTATCGGTTACTTTTAT
TTCATCTTATTATACAAGTACACAAAGAGTACATTCCTCAGGCGTGGTTCCTCAACAGCC
AAATAAACAGATAAAATAAACAACGATAAGTAGAAAAAAAGATTGTAAAAATAAACAGCA
GAAATGGAAGTGGTACCAGCCACGGTTGATTCTGGCGCCAAAATGACTGTGGGTGCTCTT
CTTCCTGTGCCCTCCTCTCTCCAGGCGGGCTGCTGGTCTGCCTCCCCAGGGAGCAGGCGG
CCAAGTTCTGTTCGGAGATGAAGAGCCAGGGCTCTGGGTTCGGGGGCCAGGGGGCCGCCG
GCGGGGCCTGGATCATCGGCATCGTAGAGAAAGGCGACCGCCGCGCCCGCATCATCGACA
AGCCCCGCATCATCGAGGTCCCGCCTCGAGGGAGCCCGGCAGCCAATCAGGACAACAGCA
CGACTAGCCCCGCCCCCAGCCCCAATGTGTCATAAGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCATCCCCTCATC
AAGAAGTTTACGAGCATATGATATAATCGGCTGGCTACTAGTCTTTGGTCACCTCTGTCC
TGAGGACGAGATTATGACGGTCTGCTTCATCTTTTTCTAAATCTCGTCCAAGGAGCTCGT
TCTACCACTTTTTTTGTAAAGAAGAAAAACATTCCAAATAAGATTTGAACAAATTTCAAC
GACGCTATAAAATGTATGCCGGAAATAATGTGGCGGGGGTTTTGTTTTTTTGTTTTAAAT
GATTTTCTTCAGTGACTCCAGTGTTGGTGAATGAATCCCTAGCGGATGTGTGTGGCCTCT
GTCACCACCTCGCGGTTTCAGAGGGAGTTGAGCAGCTTTCTCTGGCGCCGCTCGGTGGTC
GGAGCGCCTTCTGTCAGCTCACTGGCCGCCCAGCACCAAGCCCGGTCCTCTCATTCTGTA
TGATGCTCTGCCCTGTAAAGCCCACGGGCCAGGGGGGAGTGGATGTGTGCTTCTGAATGG
AGG
Chart Advanced