SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001007_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein T (SelT)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Transcript IDSPT00001007
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000911_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001007_2.0 # Transcript # Selenoprotein T (SelT) # Cod (Gadus morhua) # Full length # Forward
ATGGCCGAGTATACGCAGAAGGGTATATTGACGGCTGTACTGTTCTTTTCGGCCATCACT
TTACGAGACATCTACGTCGGGAGAAGCCAGACCCAGCAGCAGGGTCCGCAGGCCTCCGAA
AGCCTCGGCATGGCCTCTGACAGCCTGCCGGACGCCGGCACCGTGAAGCCTGGGAAGCCC
TCACTGTACACTGGGCCTGTGTTGAAATTTCAATACTGGTGAGTTGATCAATACATAACA
TTATCTATTCATTTCACTAAGCCACAAATGCATATGATGTATGCATGGCTAGGAGAGCTA
GGTGGCTACAAACTTACCAGCGGATTAGCTTGAACCATCTAGCTGTGTTGCTAATCAAAA
TGAGCCATTTACAACGATAACCTCAACAACCTGACACCCCCCCCACACACACACACACAC
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TATCAACCATATCCCCTGGTTCACCACATCAGGTATCTAGGTAACTTCTTCGCCTACTTC
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GCCACCCCGCGGGCCTGGGTCTGGAGTCAGGAGAACAAGGTGAGTTATAGGGTCAGGAAT
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CAGTTCAAGTGGACCGAATAGTTATAGATTTTTTTATTTCTGATTGATCGCTTACTAACT
GAGAAGGGCCTCAATCATGCACAAAGGAACTTTAAGTATATCATCCAGCGTAATAGCTAG
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TTCAGTGGGTTTTAAAATGAACTCTAACACTATTCTACTCCGTTCAGAGCTACATTAACT
CTATTGTGAGAAACTCTAAAATGCCTGTAACCCATTTTCCTCAGCTTTCAGAGTTGTTTA
TCCTCATATAAGAGTAATTTATCAACTCTTTTCAGAGTTGTTTTTTATAATTATGCATTT
CTTCTGGTTTACTGGTGAATTCACTTGTGCTTACAAAAACAATAAATAATACAGAAACAA
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GAGATGAGAAGATGAAGACCGAGAGAAGAGATGAATAGACCTCTGAAGAATAAGTTCCAC
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TCGTAGACCGTGAAGGCCGGACCGAAGGCCGAACAAACGTTTTTAATTGAGACGGTCTGC
CCTACGGAGCATTTCAAGTTTGCGTAACAAGCCGTTAACACCCTTTACCTTGCGTGATGA
CGCGCCACTCCTGTCACCTAGCAACCCTGACAGCTGCGGTTCAAACCGGACGGCGGAGGA
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TTATCTTCTATGCTTGTAATTTATATTTGTACGGAGCACCTTGAACTAAACAATTTCACC
CCGGGGATCAATGAAGTTTTCTGATTCTGATTCGGTTATATAATAATTATTTAAAATATA
ACGTTAATTAGTTTAACGTTATATGGCTCGTTTTAATGAAATTGAACTTTGACAATAAAG
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TGTCATTGAATAATGTAATTTGCTGCAACTGCCGCTTCGTCTCTCTGACTGAAAAAAATC
CAACTCGCAATGAATCTTGGGATACGTTGGGCCGAGAAGGATACATCTGGTGTATCCTTC
AAATCCGGGAAAAGAAGGCTGCATTTGTCGGCCGCATTTGAAGGAGCCTTCGAAATGGGA
CAGCCCTTGACGCGTCGCAGTGACGCAATCGCCCTTCGAATGCACCCTTCGAAGGATGCG
TCCCCTGAATTGGGACACAGCCATAGACATTTGACCGAGGGAACCGGGAGCCTCGGAGGC
GGGACTTATTCTTCAGAGGTCTGTTAGAGTAGTGAAGAGAAGAAATAGAAGAGGGAGAAA
TTACATGAAACAGTAAGGCACAATAAATAAAATCTGTATCACCACCATAAGACATCAGTA
TATCAAATATTCTGTGGTAAAAAATACCTTTTATGTCCAAGACAAAGGGTGCCTCTGATG
TACGCAATACCTTGTACGCATGGACATGTTCATTTAAGCATATGGTTTCTAAAGCAGTTG
TAATAAAAAGAACCTGCTCATCTTTGATTAAAATTTTCTGGTAGATGGTGATACCTGAGG
AGACAACTGACGAAAACACTATGCTGACCATCTGCAGCAATAAAATGAACAAATACCAGT
GCTGATCATTAGGATGCACAAGATCTCCAAACATAATGGGTAGATGACGTAGTAAACACC
AGCTCTGAATGGCATTTAAGCCCAAGTCATTCGAACCCTCCACTAATTTTACACCAGGTG
GTTTGTTTTGTTCCGTGAAGCCATAGTTGAAACTCTGAATTCTCCCATGCACTTCTGCTG
ATGTAGTGTAATTTCTAATCAGGTGCTGAATGAGTAATTTCATTTCATACTGTGCAACAC
CCTTCAAAATATTGTGCATTATATCAACTGAGAAGTTTGCTGTTTTGTGAAAATCTTGCA
ATGAATTCAAAGGGCAAGATTTTTTTACTCTCATCACATAAGGTAAAGTTGGATTGCTCT
GCATTATCTGGCAGTGTGCAACATGAAGCTCTTTACTTCGTAATGACATCTTTGAACTTT
CTTCAGTGAATTCAGTCTGATAGTCTTCCTTCTCTAATAGGCAAAAGCGGCAACAGTATC
TAGCACTAAAGGATTCCACAAAACCAAATAAAGAATGAATACCAAGGTTGTCTCCAGTAA
CTTGTATAATGGTTCCATAAACGGTATGATCAAATAGAGGAATCTGAATTCCATTAGTTT
CAAGAGCAGAGACATCTTGGACGAGTGGCGCTAGTATTTTCTCAAACCTATATGTTTTGA
TATCTTGTGCATGAAACAAAGCAGCCAAATGGATATTTAGCAAACGTGAATTGTATTTAG
GTCAAACATTTCTGAGGGTAAAATAGATGGCTCTTAACTTATGGATTCCTCTTTTTGATC
CAAGGGGGTTACAACACTCATTCGTAAAAAAAAAAAGCTGGATCTGAATAGCATGCTCTT
GTTTTGAGAAGAGCGCATGATCCTTAAAGAATTCTCCATCCTCTATGTCATATAGTAAAT
GTTGACTCTGTTTAGGATCTCTAATCAACATATCTTTGATATTTGGGTGATTGTAAATGG
ACTTCAGCGTTTCAAGAATTGGTATGTATTATACATTTGTCTTTGACAGTGGTTTGTAGA
AAAGTTGTTCTGTTAATTCGTGTAGCAAATCTTGTTCCAAGAACAAGTTCTCCTGCTCTC
ACTGTTAAATGCAACAAAAGGATTAATCACCTTCTCAAAACACTCATTAATTTGAGACTC
GACCACACTTTTGATGGGCTCCTCTAAAGCAAGACTTTTTTTAGAGCGTGAGCGTGACTA
TGTATGTCTCTGAGCACTTCTTGTACAGCACTAACAACATAGTTAATAGTTGCCTCTGCA
ACCCCAGCAACTTTAAGTTCTGTGAGCATTGTTAGATTAGATTTCTTTATTGTCCTTGTT
CAACAGAGTTAATCAACAAAATTAAGTTTAGAGCATCACCACTGGCATAGTATATAAATA
AATAAATAACAATAATAACATGAATGAGAATGCAGCAAATCCAGTCCATAGTTGTGATGA
GTGAGAGGGGGGGGGGCTGCGGTCCTCTGCGTTTTTCCCTCTTCTGCAGCCGCGCACAGC
GTCTCCTCCTCCGCTTCTCAGCCTCAGGAGTGCTGGATGGTGATCTGGTGATCTCGGCTG
GGATGGTGAAGTCCGCAGATTTTGGGAGCTCTGGGCCGTTGCAACTATGTGCGCCGCCGC
CATGGCAACAAAGCCATGTCAGCTGTTCTGTATGCTCGATAGGCAGTGCGGCCATCTAGC
TCAATAGCCGAGTCCGGGGTCTTGTTCTCCAGCCAGGTTTCCGCAAAGATTAAGCTGCAG
CAGTTCTCGATGTGTTTTTGTGAAGCCAGTTCCAGTCGGATCTGCAGCCGCGCACAGCGT
CTGGTGAAGTCCGCTGGGAGTTGGCGAAATGGTGCGCCGTTGAGCTCCAAATGTTAATTC
CGGCTGTACTTCATTGTTGGGTTTGAAAGCAGTGTGAAAAGCTGTGTGAAATAATATTAA
GTGCTACCAAAAATTACAAAAAAACATGCCAGTTTGGGGAGCTCCAGGCCGCTGCAACTA
TGTGCGCCGCCGCCATGGCAACCCAAAATTGTTGCACAACTGTTTACTATGTTTCTTTCT
TGCAGAGCAGTGTCACATGGCAAACTCTGAGAGGGCAAAACATCTGTATCCCCTAATGAA
ATGGAATTGTTGGTTGTGGAACATTCACTGTCATCAAAACATAAATTGTCATTTGCACAA
CACTTGATTAGATGCTTTCGTAATCCAGAAAAACTTTGATAAACGTGAGAACAACCTCTA
TGAGCACATTTTAACTTGAGACCCTTTCCCGAGCAAAGACCATGAACTAATTTAAAGTGT
AATAAGTGCATTGGCATGCCACCTTTTACACATAAAGCATATCATTCTGGCCCACTCTTG
GATTTATTTTTGTGGTTTCAGCATCTATGCCAAACACAGTTGTTTGCAGGAAAGTGTACA
GGTTTGTCAACTCCTGACAGTATGTAGTGCCAAAAACTTAGTGAGCTTTAAAAAGCTCAT
CAACAGCAGCCAGGGAATGTGAGGCTTTACAGGGCAAAGCTTGTTGGTCAATGACTATGA
AGTAAGACTGGATCCTACTTTTCTTTGGCCCAACTGCTAGCAGATATGGTTGGAGACTTC
ATGCAATGACGTCCAGGTGTCCCTGAATGCTGGTACCAGTCTGAGAGAGAGAGAAACCTC
AATCGTTTAACAGCAACGTAACCTAACGTCGTTGGCAGCCTGGATATGGACAGGTTTATC
ACATTATAACCTTGACTCAAATATATATGGGACTCCGGCATGATGAGAACAACAAGCAGT
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GGTATGACCCAGGATACGTCAGACAGAGAAAGCGCGCATATTCGACGGTACCGCCTTGTC
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TTTTATTTACGTGACCATACGTTTGGTTTATGTTAAAAAAAAGAATCAAACAACCAGTTC
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TCAGTCGCGACCGACACATCCCTATTGTCCATACATGCCTCATCGACAGGCAACTCATAC
ATGAATGTTGCACAAAACTTAGCTAACGAACTTTAGTTACTTAGTTAGCTTGCTAGCTGC
TACGTTTGCTATGCCTGTTGGTCTGAAACCCTGACGAATAGCTCATAACGGATGGCAACG
TGTTCTTAAGGAACGGTATTCTAATAATTTAGAATTAATAACTGCCACATTACTTGCAAA
ACGGTAGTTTAATGCCGATACTTCATAACCAGCACATAATTAGGCTATCTTGTCGGGTAT
ATCAAATCAGAGTTGGAAAATATATTACGAAAATACAAGTTGGAAAATCCGTTAAGAAAA
TACAAATTCAACAGATATGCATATTTACAACAAAATTGAAATATTACTTACTTTAACAAT
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GGGGACTCGGGAGGAGTAATGGCGGACAAACGAAACTTGGCGGACAAAACAATAAGCTCC
GCCTATTGATCAGTGATCACTCTGTATACAACCACTCTATAATTCTGCTCCCACTCAGAC
TCCACATTTTATTCATCAAACTCAAAATAGTGCAAAAACGACTTCTTGAGGAAAACACTT
GGGAAAATTGCTCAGCATTTTTTCGTGTGTAACAGTGTATTCCAACTTGATTCTTAACTC
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TGCTCATCGTTTCGGCATGATGTTTGTGTGTTTCAGATCTTCTCGTGCCTGATGGCCTTC
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AATGGTACGTATAACCTTACTTCTCTTGAGTTTCTGGAAATCACCTCAACATGAAACACC
TAATTAGATGAGTGCTGCATGCAGCGCTCAACTATTGTTCTTCATAAGTTTTATTCTTTC
TTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC
TTTCTTTCTACAAACTTTGGGACCTATCTCCTTTCTCAAATTTTCACCTAGAGACTCCAT
TCAAATTTTAAAATATCCAGAATAGCTTGGAATCGTCCGCTTCTTTTCAGATATTTTAAA
TATTTTATACTCTAAGATATTGTACTTTTAAAATATTATCTTTTTTTTAACATGGGAGTC
AATGGGAGGACGGTAGAGCCGTCCTCTGGTACTTCAACTGTAGAAGTAACGTAACTAAAT
ACATTTTCAAGTGTTTATCTTCGTTCAAACCATTTAAAAAATCTTCACACTTGTATCTTC
CATAATATCGAAACGGAATTTCGATAGAATTTATACTTTTTTCAGAATCAGTTTTAGTTT
CAAACCGGCAGTTTTCAGTTGCTTATAATAATTTAGGTAACCATAGCAGCAACGCCGGTA
AACAAACCCCACAAAGCACAATCCCTAAAGAGCCCGCCGTGATACGGCCGTCCGGAGGCG
CAGAGCTTTTGGCCGTGATATATATACAATTATATTATATTATATTATCACGCACACGCG
CGCGAGCAGTGCAGGGCAATACATTTGACGTTTCGGATACAGCAACGCTGAATGCTTTGC
GCTTTTCATTCAGCGGTCACTTTATTTGTTTCTAACCATTTACATTTTCTTAAATGGTGT
GCATGTTTACATTGTTTACTCCATTTAGACTCGAATTCAAATTTCAAATCCCTTCACTTG
CCATTTAACATCTCTTGACGTCTTAAACTATCTTTATTAAAACATATTTTCAGCCTCACT
TTGCACTACAGCACTCACCGCATTTTCTGCAGGAAATGCATTTGCTAGTTGTCTTTCATG
ACTCGTAATGTAACTTGTTACTTTCTTAGAAGGAGCTAAACGGCAGAAGAATTTATGTAA
GAAATGTATTGCACGTCGCCATATCTTCCCCTTATTCCTCAATGCACACTGTAGTACATA
AAAAATTTGATTTTTTTTTTTACTAGATGTATTTGTTGCCATGTATGTGTGCAGATGTTC
CCATCTGGTCCAAGCTGCAGTCTGGATATGTGCCCAACGTCCAGGAGGTCTTCCAGATTC
TAGACAACCACATTAAGATGAATCAGGTGGATCAGATGAACTTCTCGTCCCCGTAGTGCT
GGAAATAAAGCCTCAACCGCAAGGTGAACACCAAGCCAACTGCTACCAATGGTTCCCTTG
AGGGATGAATGAAATAAATCAAAGGGCCACCTTTGTTACTACAACCAGCTGCGATGTAGG
TTGGCAATAACAAGCCATTTAAAACTACCCTATCGGGAAATCCTACGTGGTAGTGTCCAC
ACAGGTATTTGACGAAGGTTCAACCCATCATCTTACCCAGTTGACTATACAAACAGGTGG
GCTGATAGGGTAGATTCTGAAATGGCTAATCAACACCACACCTGGTGGAAATACAGTGTC
CTTTTAGTCAAAGGCAGTATGAATAGATACGGGGACGGTCAAAGAGCGTTGCTAGATGTG
TTGAAGCTCTTCAAATAAAGGTCAAAATGAATAAAAAGTATGTAAATATGTAATGTATTG
ATAATCTGGTTCAAAACTGCTTGTGGATTAATGACCCTGATCCTAACTATGATGGCAGAC
TGCTATGTCATTATACAATTTGTACCTTTCTCTTTCGTCCTGCTTCATATGAAAAGCAAT
GGCTATTATTCTCCGTTATGCCCTTGCTTCAGAATTGGGAGCAGCAAGCGTTAAAAAAAG
AAAAATCCTGAGTCTTTCTTTGAAAATCCTTAATTTTATCTGTCTCTGTCTCTAGCTCTG
CTGTGCAGTCGGTTCCTGGTTCTGGCGGAATGTATGTCTACTGGCATTAATGAAGGCCGG
GCCTTAAAGCAGTCCTCTGTGTGGCCCGGCCGGATGTCCCCTGCCATTAA
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