SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001007_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein T (SelT)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Transcript IDSPT00001007
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000911_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationReverse
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001007_2.0 # Transcript # Selenoprotein T (SelT) # Cod (Gadus morhua) # Full length # Reverse
TTAATGGCAGGGGACATCCGGCCGGGCCACACAGAGGACTGCTTTAAGGCCCGGCCTTCA
TTAATGCCAGTAGACATACATTCCGCCAGAACCAGGAACCGACTGCACAGCAGAGCTAGA
GACAGAGACAGATAAAATTAAGGATTTTCAAAGAAAGACTCAGGATTTTTCTTTTTTTAA
CGCTTGCTGCTCCCAATTCTGAAGCAAGGGCATAACGGAGAATAATAGCCATTGCTTTTC
ATATGAAGCAGGACGAAAGAGAAAGGTACAAATTGTATAATGACATAGCAGTCTGCCATC
ATAGTTAGGATCAGGGTCATTAATCCACAAGCAGTTTTGAACCAGATTATCAATACATTA
CATATTTACATACTTTTTATTCATTTTGACCTTTATTTGAAGAGCTTCAACACATCTAGC
AACGCTCTTTGACCGTCCCCGTATCTATTCATACTGCCTTTGACTAAAAGGACACTGTAT
TTCCACCAGGTGTGGTGTTGATTAGCCATTTCAGAATCTACCCTATCAGCCCACCTGTTT
GTATAGTCAACTGGGTAAGATGATGGGTTGAACCTTCGTCAAATACCTGTGTGGACACTA
CCACGTAGGATTTCCCGATAGGGTAGTTTTAAATGGCTTGTTATTGCCAACCTACATCGC
AGCTGGTTGTAGTAACAAAGGTGGCCCTTTGATTTATTTCATTCATCCCTCAAGGGAACC
ATTGGTAGCAGTTGGCTTGGTGTTCACCTTGCGGTTGAGGCTTTATTTCCAGCACTACGG
GGACGAGAAGTTCATCTGATCCACCTGATTCATCTTAATGTGGTTGTCTAGAATCTGGAA
GACCTCCTGGACGTTGGGCACATATCCAGACTGCAGCTTGGACCAGATGGGAACATCTGC
ACACATACATGGCAACAAATACATCTAGTAAAAAAAAAAATCAAATTTTTTATGTACTAC
AGTGTGCATTGAGGAATAAGGGGAAGATATGGCGACGTGCAATACATTTCTTACATAAAT
TCTTCTGCCGTTTAGCTCCTTCTAAGAAAGTAACAAGTTACATTACGAGTCATGAAAGAC
AACTAGCAAATGCATTTCCTGCAGAAAATGCGGTGAGTGCTGTAGTGCAAAGTGAGGCTG
AAAATATGTTTTAATAAAGATAGTTTAAGACGTCAAGAGATGTTAAATGGCAAGTGAAGG
GATTTGAAATTTGAATTCGAGTCTAAATGGAGTAAACAATGTAAACATGCACACCATTTA
AGAAAATGTAAATGGTTAGAAACAAATAAAGTGACCGCTGAATGAAAAGCGCAAAGCATT
CAGCGTTGCTGTATCCGAAACGTCAAATGTATTGCCCTGCACTGCTCGCGCGCGTGTGCG
TGATAATATAATATAATATAATTGTATATATATCACGGCCAAAAGCTCTGCGCCTCCGGA
CGGCCGTATCACGGCGGGCTCTTTAGGGATTGTGCTTTGTGGGGTTTGTTTACCGGCGTT
GCTGCTATGGTTACCTAAATTATTATAAGCAACTGAAAACTGCCGGTTTGAAACTAAAAC
TGATTCTGAAAAAAGTATAAATTCTATCGAAATTCCGTTTCGATATTATGGAAGATACAA
GTGTGAAGATTTTTTAAATGGTTTGAACGAAGATAAACACTTGAAAATGTATTTAGTTAC
GTTACTTCTACAGTTGAAGTACCAGAGGACGGCTCTACCGTCCTCCCATTGACTCCCATG
TTAAAAAAAAGATAATATTTTAAAAGTACAATATCTTAGAGTATAAAATATTTAAAATAT
CTGAAAAGAAGCGGACGATTCCAAGCTATTCTGGATATTTTAAAATTTGAATGGAGTCTC
TAGGTGAAAATTTGAGAAAGGAGATAGGTCCCAAAGTTTGTAGAAAGAAAGAAAGAAAGA
AAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAATAA
AACTTATGAAGAACAATAGTTGAGCGCTGCATGCAGCACTCATCTAATTAGGTGTTTCAT
GTTGAGGTGATTTCCAGAAACTCAAGAGAAGTAAGGTTATACGTACCATTGAGCATGATC
TCAAATGCCCCAGTGGAGAGGAAGTGGGTCTCCAACATGTTGCTAAGAAAGAAGGCCATC
AGGCACGAGAAGATCTGAAACACACAAACATCATGCCGAAACGATGAGCATAATGCCAAT
GGGCAATACTCACCTAGCGGTTATCTTAACTGATGTTCTCCCACCTGCTAGAGTTAAGAA
TCAAGTTGGAATACACTGTTACACACGAAAAAATGCTGAGCAATTTTCCCAAGTGTTTTC
CTCAAGAAGTCGTTTTTGCACTATTTTGAGTTTGATGAATAAAATGTGGAGTCTGAGTGG
GAGCAGAATTATAGAGTGGTTGTATACAGAGTGATCACTGATCAATAGGCGGAGCTTATT
GTTTTGTCCGCCAAGTTTCGTTTGTCCGCCATTACTCCTCCCGAGTCCCCGACACCTGAC
CGCAGCTGAAGTCACAGTAGAAGTGCAATGGAAGTCAACGATTGTTACTGATTGTTAAAG
TAAGTAATATTTCAATTTTGTTGTAAATATGCATATCTGTTGAATTTGTATTTTCTTAAC
GGATTTTCCAACTTGTATTTTCGTAATATATTTTCCAACTCTGATTTGATATACCCGACA
AGATAGCCTAATTATGTGCTGGTTATGAAGTATCGGCATTAAACTACCGTTTTGCAAGTA
ATGTGGCAGTTATTAATTCTAAATTATTAGAATACCGTTCCTTAAGAACACGTTGCCATC
CGTTATGAGCTATTCGTCAGGGTTTCAGACCAACAGGCATAGCAAACGTAGCAGCTAGCA
AGCTAACTAAGTAACTAAAGTTCGTTAGCTAAGTTTTGTGCAACATTCATGTATGAGTTG
CCTGTCGATGAGGCATGTATGGACAATAGGGATGTGTCGGTCGCGACTGATTCGTTGCAA
CGAACAAATCCCGAACGTGAACGACAAGAACTGGTTCCCTAAAACAAGAAGAACTGGTTG
TTTGATTCTTTTTTTTAACATAAACCAAACGTATGGTCACGTAAATAAAATATACAAACG
AACAGAGCTCCGTCTCCCCGCGACTTATATTGAATGAGTCTACAACTTTCTCAAAGATTC
AGCCAATGAGAGGTAGCAATGGTGTTGGAATGGCACCTGGGTAAACCAATGACAAGGCGG
TACCGTCGAATATGCGCGCTTTCTCTGTCTGACGTATCCTGGGTCATACCAATCGACGTG
GGGCCACTCATATATCCCCCTACATTTTTTCGAAAATAGACTTGACCTCCATCTGTTTAA
TGGATAAACGCATTTCCCAATCCCAGGAGTCTTTGATCCATTCTACGTCAATTTAAGAAC
AAACAAAGAAATTAAACTGCAGTTCGTATTTTTTATTTATGACCATGCAAGCTCTGTAAT
GCCTGAACAATGAAGAATTAAATGTAAAGTAAAATAAAATTATAAATGTAAAACCAAGAA
TGAAATATAGAGAGTAAGCAAGTGGTATAAATATTGGTGGGACGTTCGTTATGCTATGTA
GCCGGCATCTCCAAACGGCGGACTGCGGTCTTGACTGTCCTATCCGGACCCATGACCAAT
TAAAAAAAAATATATATATTATAAAAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GTTCTCATCATGCCGGAGTCCCATATATATTTGAGTCAAGGTTATAATGTGATAAACCTG
TCCATATCCAGGCTGCCAACGACGTTAGGTTACGTTGCTGTTAAACGATTGAGGTTTCTC
TCTCTCTCAGACTGGTACCAGCATTCAGGGACACCTGGACGTCATTGCATGAAGTCTCCA
ACCATATCTGCTAGCAGTTGGGCCAAAGAAAAGTAGGATCCAGTCTTACTTCATAGTCAT
TGACCAACAAGCTTTGCCCTGTAAAGCCTCACATTCCCTGGCTGCTGTTGATGAGCTTTT
TAAAGCTCACTAAGTTTTTGGCACTACATACTGTCAGGAGTTGACAAACCTGTACACTTT
CCTGCAAACAACTGTGTTTGGCATAGATGCTGAAACCACAAAAATAAATCCAAGAGTGGG
CCAGAATGATATGCTTTATGTGTAAAAGGTGGCATGCCAATGCACTTATTACACTTTAAA
TTAGTTCATGGTCTTTGCTCGGGAAAGGGTCTCAAGTTAAAATGTGCTCATAGAGGTTGT
TCTCACGTTTATCAAAGTTTTTCTGGATTACGAAAGCATCTAATCAAGTGTTGTGCAAAT
GACAATTTATGTTTTGATGACAGTGAATGTTCCACAACCAACAATTCCATTTCATTAGGG
GATACAGATGTTTTGCCCTCTCAGAGTTTGCCATGTGACACTGCTCTGCAAGAAAGAAAC
ATAGTAAACAGTTGTGCAACAATTTTGGGTTGCCATGGCGGCGGCGCACATAGTTGCAGC
GGCCTGGAGCTCCCCAAACTGGCATGTTTTTTTGTAATTTTTGGTAGCACTTAATATTAT
TTCACACAGCTTTTCACACTGCTTTCAAACCCAACAATGAAGTACAGCCGGAATTAACAT
TTGGAGCTCAACGGCGCACCATTTCGCCAACTCCCAGCGGACTTCACCAGACGCTGTGCG
CGGCTGCAGATCCGACTGGAACTGGCTTCACAAAAACACATCGAGAACTGCTGCAGCTTA
ATCTTTGCGGAAACCTGGCTGGAGAACAAGACCCCGGACTCGGCTATTGAGCTAGATGGC
CGCACTGCCTATCGAGCATACAGAACAGCTGACATGGCTTTGTTGCCATGGCGGCGGCGC
ACATAGTTGCAACGGCCCAGAGCTCCCAAAATCTGCGGACTTCACCATCCCAGCCGAGAT
CACCAGATCACCATCCAGCACTCCTGAGGCTGAGAAGCGGAGGAGGAGACGCTGTGCGCG
GCTGCAGAAGAGGGAAAAACGCAGAGGACCGCAGCCCCCCCCCCTCTCACTCATCACAAC
TATGGACTGGATTTGCTGCATTCTCATTCATGTTATTATTGTTATTTATTTATTTATATA
CTATGCCAGTGGTGATGCTCTAAACTTAATTTTGTTGATTAACTCTGTTGAACAAGGACA
ATAAAGAAATCTAATCTAACAATGCTCACAGAACTTAAAGTTGCTGGGGTTGCAGAGGCA
ACTATTAACTATGTTGTTAGTGCTGTACAAGAAGTGCTCAGAGACATACATAGTCACGCT
CACGCTCTAAAAAAAGTCTTGCTTTAGAGGAGCCCATCAAAAGTGTGGTCGAGTCTCAAA
TTAATGAGTGTTTTGAGAAGGTGATTAATCCTTTTGTTGCATTTAACAGTGAGAGCAGGA
GAACTTGTTCTTGGAACAAGATTTGCTACACGAATTAACAGAACAACTTTTCTACAAACC
ACTGTCAAAGACAAATGTATAATACATACCAATTCTTGAAACGCTGAAGTCCATTTACAA
TCACCCAAATATCAAAGATATGTTGATTAGAGATCCTAAACAGAGTCAACATTTACTATA
TGACATAGAGGATGGAGAATTCTTTAAGGATCATGCGCTCTTCTCAAAACAAGAGCATGC
TATTCAGATCCAGCTTTTTTTTTTTACGAATGAGTGTTGTAACCCCCTTGGATCAAAAAG
AGGAATCCATAAGTTAAGAGCCATCTATTTTACCCTCAGAAATGTTTGACCTAAATACAA
TTCACGTTTGCTAAATATCCATTTGGCTGCTTTGTTTCATGCACAAGATATCAAAACATA
TAGGTTTGAGAAAATACTAGCGCCACTCGTCCAAGATGTCTCTGCTCTTGAAACTAATGG
AATTCAGATTCCTCTATTTGATCATACCGTTTATGGAACCATTATACAAGTTACTGGAGA
CAACCTTGGTATTCATTCTTTATTTGGTTTTGTGGAATCCTTTAGTGCTAGATACTGTTG
CCGCTTTTGCCTATTAGAGAAGGAAGACTATCAGACTGAATTCACTGAAGAAAGTTCAAA
GATGTCATTACGAAGTAAAGAGCTTCATGTTGCACACTGCCAGATAATGCAGAGCAATCC
AACTTTACCTTATGTGATGAGAGTAAAAAAATCTTGCCCTTTGAATTCATTGCAAGATTT
TCACAAAACAGCAAACTTCTCAGTTGATATAATGCACAATATTTTGAAGGGTGTTGCACA
GTATGAAATGAAATTACTCATTCAGCACCTGATTAGAAATTACACTACATCAGCAGAAGT
GCATGGGAGAATTCAGAGTTTCAACTATGGCTTCACGGAACAAAACAAACCACCTGGTGT
AAAATTAGTGGAGGGTTCGAATGACTTGGGCTTAAATGCCATTCAGAGCTGGTGTTTACT
ACGTCATCTACCCATTATGTTTGGAGATCTTGTGCATCCTAATGATCAGCACTGGTATTT
GTTCATTTTATTGCTGCAGATGGTCAGCATAGTGTTTTCGTCAGTTGTCTCCTCAGGTAT
CACCATCTACCAGAAAATTTTAATCAAAGATGAGCAGGTTCTTTTTATTACAACTGCTTT
AGAAACCATATGCTTAAATGAACATGTCCATGCGTACAAGGTATTGCGTACATCAGAGGC
ACCCTTTGTCTTGGACATAAAAGGTATTTTTTACCACAGAATATTTGATATACTGATGTC
TTATGGTGGTGATACAGATTTTATTTATTGTGCCTTACTGTTTCATGTAATTTCTCCCTC
TTCTATTTCTTCTCTTCACTACTCTAACAGACCTCTGAAGAATAAGTCCCGCCTCCGAGG
CTCCCGGTTCCCTCGGTCAAATGTCTATGGCTGTGTCCCAATTCAGGGGACGCATCCTTC
GAAGGGTGCATTCGAAGGGCGATTGCGTCACTGCGACGCGTCAAGGGCTGTCCCATTTCG
AAGGCTCCTTCAAATGCGGCCGACAAATGCAGCCTTCTTTTCCCGGATTTGAAGGATACA
CCAGATGTATCCTTCTCGGCCCAACGTATCCCAAGATTCATTGCGAGTTGGATTTTTTTC
AGTCAGAGAGACGAAGCGGCAGTTGCAGCAAATTACATTATTCAATGACAAAACTATGTA
AAAAAAAATGTTAGTATTAAAATAAAGTTGGGACTATTTTAAAGTTGTAACTTTATTGTC
AAAGTTCAATTTCATTAAAACGAGCCATATAACGTTAAACTAATTAACGTTATATTTTAA
ATAATTATTATATAACCGAATCAGAATCAGAAAACTTCATTGATCCCCGGGGTGAAATTG
TTTAGTTCAAGGTGCTCCGTACAAATATAAATTACAAGCATAGAAGATAAGATTATAAAA
AATAGAAAATTATGAATACAATAGAATAAAAGTAAGAATAAAGTAAGAAGTGGACATCTA
AGTGAAAGTGGACATCTCTGAATGGGTTATATAAAACGGCTCCATATTTCTCCTCCGCCG
TCCGGTTTGAACCGCAGCTGTCAGGGTTGCTAGGTGACAGGAGTGGCGCGTCATCACGCA
AGGTAAAGGGTGTTAACGGCTTGTTACGCAAACTTGAAATGCTCCGTAGGGCAGACCGTC
TCAATTAAAAACGTTTGTTCGGCCTTCGGTCCGGCCTTCACGGTCTACGAAGACCTTCAT
AGACTGCGTCCTTCGAAGGATGCGTCCCCTGAATTTGGACACAGCCTATGTCTACTCTGT
AGGTGGCAAAGAAGTAAAAGCTCACGTTTTGAAGTGCACACTTTTTCCATCTAGTTTCCT
TCTTCAGCGTTTACTTCTTCGCCACCTACAGAGTTTGTTATGTACGATTATTCAAAAACA
CCAGGTTATTTCCCATAGATATTTGACCTAGGGAACCGGGAGCCTCGGAGGTGGAACTTA
TTCTTCAGAGGTCTATTCATCTCTTCTCTCGGTCTTCATCTTCTCATCTCTGTCTTACTC
TATTTTTTATTTACCCTCTTGTATTTTTATTGTTTTCATTGTATTATTTATTGTTTCTGT
ATTATTTATTGTTTTTGTAAGCACAAGTGAATTCACCAGTAAACCAGAAGAAATGCATAA
TTATAAAAAACAACTCTGAAAAGAGTTGATAAATTACTCTTATATGAGGATAAACAACTC
TGAAAGCTGAGGAAAATGGGTTACAGGCATTTTAGAGTTTCTCACAATAGAGTTAATGTA
GCTCTGAACGGAGTAGAATAGTGTTAGAGTTCATTTTAAAACCCACTGAAAAGGGTCAAT
TACCACCACAAAGTCAAATATTACCTCTGGGAAAACAGCTCCACCAAAAGAGTCAATTTT
ACTCTTTTTAGAGAGGGACCAAATGTTATCTGCGGCAGAGTAAAATTTTCTTCAATTTGA
GTAAATTTTACTCAGGCAAATTTACTGTGTATCTATTCGGTGAATAAGGCCTAGCTATTA
CGCTGGATGATATACTTAAAGTTCCTTTGTGCATGATTGAGGCCCTTCTCAGTTAGTAAG
CGATCAATCAGAAATAAAAAAATCTATAACTATTCGGTCCACTTGAACTGGCTGTGCAAC
TGTGGGACACGAACCAGCATTGTTAGGCTAGCAGCTGAATGGGAGGACTCATTGTTTCTT
TAACTATAGTTGCTGATCATAGATGGAACACTGTATTTTCGAATCGTTGTTGGATGGATG
CATTTATAAGAATACATCTATTATCTCTTAGCACCCCCCCCCCCACCACACACACAATTT
TCTCATAGGATCTACATAAATTACATATTTTGTATTCAAAATGGCTATCCATTCCTGACC
CTATAACTCACCTTGTTCTCCTGACTCCAGACCCAGGCCCGCGGGGTGGCCAGGCCCAGG
ATGGGGAAGGGGTTCTGGCCACTTACTACCAGAGTGATGGCCAGCAGCTTGAAGTAGGCG
AAGAAGTTACCTAGATACCTGATGTGGTGAACCAGGGGATATGGTTGATAGATGATAATG
ATGAGAATTGGGTGGATTAGAAAGGCAATAAACATGAAGCACCTCTAATCCCAACATGCA
TTATTTTCTAACCGAGCCCATCCCTTTATATGAAGATTTTTATTAATACTAAATTTAAAA
AAAAAAGGATTAAAAAGGAATGGAAACTACGGTGTGTTTTGTTTAGAGAGTTGTGACCAT
CCCTTACCTGTTGGTGGGTGTTGGAGGGTAGTTCTCTCCCTCGATACGGATGTCCGGGTA
CAACTGGCTGATGGCCCGAGAGTACTCCTGGTACACCTTGCTGTACCCTCAGGAAATACT
GAAAACACCAAAGATAATAGACAATATACAGAATAAGAAGATGCCAATTCACTTTATGAT
GTATTCTATATGACGTATTGTATGAATGTACTTTACTGATACAATGAAAAGTCAGTGGAT
AATGGATATATATATTCGTCTGTGTTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGGGGGGGGTGTCAGGTTGTTGAGGTTATCGTTGTAAATGGCTCATTTTGATTAG
CAACACAGCTAGATGGTTCAAGCTAATCCGCTGGTAAGTTTGTAGCCACCTAGCTCTCCT
AGCCATGCATACATCATATGCATTTGTGGCTTAGTGAAATGAATAGATAATGTTATGTAT
TGATCAACTCACCAGTATTGAAATTTCAACACAGGCCCAGTGTACAGTGAGGGCTTCCCA
GGCTTCACGGTGCCGGCGTCCGGCAGGCTGTCAGAGGCCATGCCGAGGCTTTCGGAGGCC
TGCGGACCCTGCTGCTGGGTCTGGCTTCTCCCGACGTAGATGTCTCGTAAAGTGATGGCC
GAAAAGAACAGTACAGCCGTCAATATACCCTTCTGCGTATACTCGGCCAT
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