SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001017_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase 3 (TR3)
SpeciesGadus morhua (Cod)
Transcript IDSPT00001017
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000921_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001017_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase 3 (TR3) # Cod (Gadus morhua) # Full length # Forward
ATGCCTCCCGTCGAGAAGGACGCGGGGAAGACCGGACTCAAAACCCGAATACAGGAGCTC
ATCGAGTCCAACCAGGTGGTGGTGTTCAGCAAGAGCTACTGTCCGTTCTGCGTGAAGGTA
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GGTACTTTACAGCCCCACTGACATAGAGATAATATAGTAGACCTGAGTCAGTGTTCAGCT
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GGAAGACCCTGCTGATAGGGGCGTCCTACGTGGCGCTGGAGTGCGCAGGCTTCCTGGCGG
GGCTGGGCCTTGACGTCACGGTCATGGTGCGCTCCATCCTGCTGCGTGGCTTCGACCAGG
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TGCAACCGTATGGCAACTGCACACCTAAAGGCTAATATTACAGATTTGAATAAAGCCAAC
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GGTTTGTATGCAGTCTGTCAAGTTTTGACCGACACCATGGCATTTTGTTGGCATGTTAGC
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TCATGTCAACACAAAGCCTCTACACGCATTACTGAATGTGAGGAACTCATCCGAGGAACT
TCCTTGATCCCAGGTTCTGATCGCCGTAGGACGAGATGCCTGCACTGACAAGATCGGGCT
GGCCCAGGCCGGGGTCAAAGTCAACCCAAAGTGAGTGCCCCTGCCTTTGGTTTCTAAGCT
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CCATCACTATGATTCAGCACTTTCTCCTCCCGGGGCCCCCAGCGGGGGGTGTGTTTGTCA
TTAGCCTGAAGGGTTTATCGCCTTCAACGGCGGTGTTTGTTTTTTGTTGTGTGCGGGGAA
GTTGGTATTAAGAAATTATTTGAAGTCAGCCACTTAATTATAATGAACAATGGTTGATGT
ATTGTCATCATCCAATGGATTTACCACTTTATAAAACATTCAGTCTCCAGTTGTCAAGGA
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TAGTTCAGTATGGGCTCGGTGCTGCCTGAAGCCCAGTATAGACTGGTCTTTGAGTCATGT
GCTCCGGTCTCATGACTATAGCAGTGTTTCCAGGGTGATGAAGGTCAGCCTACCATCACC
AGCGGTGCCATGTAAACCCTTGACCTCAAAGTTTTATATGTGCCTTTGACCCACAAAGCA
ACATTCGTCTTACCCACTGTTGGCTATGGGGTTTGAATGAAAACCTTGGTGGTCCTACTG
ATCAGTGTGTTCATGGAGAGACCAGTTCTCTCTTCTGACCCAGGCCTTCAGCACAGCCTG
TAGGTTTAAAAGTATTGTGCGTGGACCTGCCTTTCTCCAGCTCTCCTGAAGTTCATTCAG
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ATGGGATACTTTCATTTTTGATTGTAGGCACACATGACTATAATGTTTTGTACCTTTCAG
AGACCCGCAGCAATAAAATGCGTGCATGAATATTGGTTATTAGGTAACTTGCTCTGTCCA
TGTAAATAAAGGCTTGGATGATGCCGGCTAACGACAAGAGGCTAACGCAATTAGGTAGTT
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TGCTTGTATGCTTGGGCGTTTGTTTGCTTGCGCACAGACCGACTGTACCGACACTCGAGT
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AGAGGAGAACCTGGAGGTGAGCATCTCAGCGAGGAACACCCGGCCACGCTGAATAATGCA
GGCCGCTGGCGTCGGGTTCACGCTGCCTTCAATGGAGCGGCCTTCAGTGACTTGGTAATG
AGCATGGAGGATATCCTTGCTCAGCATGACTGGCGATCCGATAGAGCTAAGAATGACTTG
CACATTTACCTGAATCAAATGCACGGCCTGAGCCTCTTTCCTCTCCCTGTTGAATAAAAC
ATGGGTTTGATGGAGGTGCTGCTGTTTAATTATATTGCAATTAAATGTTATTTGTATAGC
CCACCGGTACAGTCTCATAGGGAAGAAAAAGAAAAAATACTTGGAATGCAGAGGGGTCTC
CCTCCTCACAGGGACGGGCAGGAGGGCAATGGGTGCAGTAATTGACGGACAGACTCGGTG
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AAATACAGCAGTATGCGCACAGGCACATTTCAGTATCGTATATGACACATCCTGCGGAGG
CTTTGAACGCGTTGAGCTACATTTTTCAGTCACGGGTAATCCAAAGGGAGGAAAAAAAAA
AGAGGCTATTGGAACAAACTGGTGCTTGCAGCCTATCCAGATTGTGTATCAAAGATATTC
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GTTGATGTTTACTCCATTATTAACTGTATAATATAGATGGGATGCATCTTGAATGCAGTT
GATTTCTCTGGCAGACAGTGGCAATCTGTATCATTCTGACATGGACAATACGTTTCCTAG
TGGTTCAGTGGTCAGTAAGGATTGTGATATTCGAAACAAGCAACGCGTGTATGTGTGACC
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GCATTCTACAAACAAAATAGTTCTTTCTTGCCCATAGGCACAAAAGGAAAGTAAAAAAAA
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CTAGTCACCATAGACTATAAAAGTTGTAAGATGTGGTGGAGCTAACAACCTATTAACGTT
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TATTGATCATTCTCTCGATGGTGCTACAAGTGAATGTTTAATGGAACTGTCACGCCAAAT
TTGTACCGGGTGCCAAATTTGGCGTGACAGAACCTCAGTACCTGAATGTCGGTGGTTTTG
ATGTCATGAAGTCGTGCAGTTGTATGGCAGCAGCTTTGTTTTGGATACCATCTTTCCATG
AAAAGTGTGACTATTTTAGCTAGAACAGAGAAACTAAAGAATTGTATTTCCACATGTGTG
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AAAAAATACATTTATATAGTCATTTCAGCAGTCGAATATCCATTATTTGACTATTGGCTT
TCTATTGTATTGCTGAGATGCGTTCCCACGGCCATAGTGACTGTTAACTCTGTGCCTAGG
AGCGGGTGATCGGGTTCCACTACCTGGGTCCGAACGCCGGGGAGGTGACGCAGGGCTACG
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CCACCTGTGCTGAAGTGAGACTTAGAACCGGCGGTCATCGCTAGACAATGCGACCAGTCA
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CGGTGTGTCTGTCTCTGTGCTTCTTTCTGTTTGAAGATGTTCACCACGTTGGACGTGACC
AAGAGTTCCGGGGGCGACATCGCCCAGGCCGGTTGCTGAGGTTAAACCCTGCTAGTTCAG
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TGAACAGCGGGGTTACTCTGCTTCCTGTTGGGTCCTCCCATGTCTCCTCCCAGAAGAGCA
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GCGAGGACCGATGTCCTTCTGAGGGGAAC
Chart Advanced