SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001058_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesGallus gallus (Chicken)
Transcript IDSPT00001058
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000962_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001058_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Chicken (Gallus gallus) # Full length # Forward
CTGGAGCCATACATGGACGAAAACTTTGTTTCAAGAGCCTTTGCCACCATGGGAGAGCTT
GTACTGAGTGTAAAAATCATTCGAAACAGGTTGACAGGGTAACTGTTTATACTTGTTCTC
AATTAATTCTGCTGCTGCGTGGCTGTGCTTGGATTGAGCTGTGTGCAGCTCACGTGGCAT
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ACAATATGGGCGTATTGATGACAGCAATGGAGAGGACAGTTGCTGACTCTTTGACCTTGC
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TGTAATAGCACAGCTATGTGATGCTAGCAGAGGTGGGAGGCCTAACTGAGAAAGGGCCCT
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GAAATCGTTTTTCTCTCCTGTCCTTTGTGTTCAGAATTCCTGCAGGCTATTGCTTTGTAG
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CTGGTGCTACACCGGTGAGTAAAGCACTTCAGTCAGTAGAAAAGCAAAACTGTGAGAGAG
AAGTGGGGTAGAATGTGTGTTTCGAGTAATGATGACAAATAAATTAAGTAGCAAACGGGA
GGGTTTCTTTTCTTTGGATTTAATGGCCGTAAAGCTGTTAATGTTGCTCAGAAACGCGTT
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GTGGCTTTCTATTTCTGAGCCTTTTGCTATTACCAGCGATGAGAAACCAGAGAAGAACAA
GGAAAAAATAGGCTGAGTGTACATACCACAGTCCTTCTGTCTCCTTGCATTTGCAGTTCC
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TGCTCAATTTTCAGTAACTTTGGTTTGCAGAAGTGACTTTTAAACATTGCATTATTCTTA
GCCCCTAGCAAACAAAAGCTATTCAGACCCATTTAGAATGAAGAAAGAACTGGTCCATTG
TATAACTGTGATACATAACAAATACCTCGAAGCTAGGTGGATGGGAAGAGAAGGAGGAAT
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CTGACAGCTGTTCCTTGTATCCACAGAATTTGGCTGCAGTAGCTAGGATGGCTGCTTCAT
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TTCAGTGCAGTTACTCCTCTGAGTTGGAAACTGTGGAATCTGGGTGGTATTTCTTGAACT
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TTTTACATACTGAATCAGTCAGAGGACTGACAGAGGGCCCTGGTGTTCTTATTGTCTCTT
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TTTTAAGCCCAAAGTATTGCAGTAAAGAACTAGACCCCAAAAAAAGATGAAAGTGCTTCA
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TGAACACCACTGTACAGCAGTGAACACAGGCATGCAAGGAGCATGATTATAGCCCAGAGT
TAAGTCTTTGCTCTATTTCCCTTTAATTATTTATGCTGTTTTTGAGGGAAGAAAATACAT
CATACAAGGCATGGGAACACACCAGGCTCTCCACTGTGTGAAACAAATGTTCTGGTCTCT
AGGTGTTGGACTAATTGTAGGCTTGTGTTCTTTGTCCAAGTCAAAGTCTTTGATGCTATG
CCACTGCGTAGTGCAGAGAGATGTGTGCTTTGGAAGTCTGCTGGGAGACAGAAAGATTGG
TTTGAAGCCATTTATGTCTTCATACTAGCAAGGGAATCCAGCTTAGTTCTTCCACTGTCT
GGGTGAGTTCTGAAACCAGTGTTCTTTTCAAGGAGTTCAACCCCTTGCTGCTTCATCTGT
CAGATCTGTTTTGGAAGGAACTATTTGGGAAGGCAGTAGCAGTCACTGCTGCACTGTGCA
GTGAGCCTGCAGGTCAGTGTGTGCTGAGCATCATGTAAGGGTGCCTGTGGCATTGAGACC
CATGGGATTTTGAGGCAGCAGTTGATCAGCTCCTCAGGTCCTGGTCAGACCTGCATGTGA
GCTGGACACAAGTGGCTGAACTCTGGTAGGATCTGGGTGAGGTGTTCCAATAGCACAGAT
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GGGATTGGTTCCATTTCCCAGTGTGGCAGATTTTGCTTTGTCAGTATTCTGGTATATGAC
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TCATGTAATACTTGCTGTTAGAACCTCAGCGTTCCTGTCTTCCATAAAGATGCACAGTTT
TGGTACTGGGTAAGGTTTGCCCATCTTTCACTAGCTTTGTGAAGTGCTCAATAAAGGCAG
AGCAGACCCCTCGGTGCAGGTCCTCTGCTGCTTCTCATTATTGTAGCTGTACTGAAGTGA
AATCAAAATGTTGTCCTAGATACCTGAACTGAACGGCCTCACAGCTCTGAACATCTGCCA
GTATTAAAAAAAATAGATATATAGAGTAAGCTTATTGCATTTTTCCTAATTGTATGGATT
TACATGGGAGCATTTGAATGCATGGATTCATTTTTGCCTTTTTTCAGGCAAAGCGATTTA
AATTGAATTATGCAACGTATGGAAAACAGCCCGATAACAGGTAAACACCCAATATTCAAA
TGTTAGTTTTGCCTGTTTAATGTCTCTTTATCAATTGCCTTGCAAAGAGTATTCAAAAAA
TGTAAACCCCCGGGTTCATTATTGCTGGACAAGATGTACAGCTGGCAAATTTAGACAGGA
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GCTAAATCCCACAGTTAGAAACGTGGATTGCATTAAACTGTCTGGGAACACAGTGTAAAT
ATTTGTGATGCTGCAGCATGTTAGGACTTTGGCTGAGGATACATCCCATCATAGTGCTAC
ATTGTGCCATGAGTATGTTTGGCACTGAAGATAGGTGCAGTGGTTTCACAGCACCTGGCT
TAACTGGCTGTGGTACCACAGCAGTCAACAAAGGGAGGGAGAGGTGCTGTGAATGCCTTC
AGAAGGAGCCCATCCCTCTCCACGGGCAGTGGAAAGCCCACAGGAGGCACAGCAGCTGTA
TGGAGTTTCTGGAGTTGGGCAGTGTGAATAGCTTTCATAATGCCTGCCCAGAAATGCTTG
CATGGTTGGAGTAATAACAACACAGTGTGTTCAGGTAGGTGTGTACCAGGGTGCAAGAAC
ACAGTCCTGCAATTTATGAGGGCTGTGTTAGTCATATCTCAGCAATTATATTTTTAGTTT
AGGTAATTATTTATGAATATTAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACAACTTCAGATTAGAATCA
AAGCATGAGAGATGGGGCCAAGAATGAGGTTTACGTCTTGTATCATTCTTGCAGTTCTGT
TTGCTCTGGAAATAGTCACATACTGCAGATGGATAACGCAGCCTTTCTGACTCCAACAGC
TTGCCCAGGAGTCTAACAGAGGGAGGATAACTTAGACCACCTGTCAGTTTCATGCTTTAC
CTTCTGTGTGGCACAGCAGGTTTGTCAGGAGTGTCTTTTTAAATATTTAACTTTTTAGCA
TCCAAGTATCTAATTCATGTGTTATAATTTAAGATCAGTATTCAGGGAATAGCAAACCTA
TAAATGAGATGGTGATGCTTTCTTGACACGTTAGAAATTCATATGTAGTGCCCAGTTCAG
AATGTCTGAGAACCAAAAAATGAAATTATCTTTAAATACAGAGCAGTATAATGCAGACTC
ATTGTGCTGCTGAACTAATTGAGAAAAGCATTGCTGATGAAAATGGTCCTTTCATATCAG
TTTTCTCTGAAGTCACATTTCTGGGCTCATCACACTTTGTGTGTGCATGTGTGTATTTGT
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GACTGCTGACGTGGATGATGGGATGTTGTATGAGTTTTTTGTTAAAGTTTATCCATCATG
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ATTCTTTTCCTTAACTTCCCATTCTAGCATAGGAAATACGCAACAAGGAAAGAAGAATAG
TTTAGATTTCAGTAGAACACACACCTGCTAACATTGCAATGTTCCTGCATGTCTGCAGCG
TTGGGGTCAATGTTGTGCTCTGTGTGTTGGCAGTACAGTATTACACTTCTGAAACTGCTG
GAAAATGATCTGGAAAAACTGGATCCTGGACTTTTGGTAGAACTGTGCTTTTACAGTCTC
TGGGCTATTGAGTACATACTCCTGTGGAAGCTTTGCAGGTTTTTGTTTCCAATAGGGCAG
GGCAAACAAAGCTATGATTCATTAGCAAGGAGTTGGGAGCCACCTTGTTCATCTTTACTG
GGAATGTCTCATCAAAAACAGATGTCAAAAATGTTCTTAATGTTAATAAAACATTTTCTA
AATTGGAGAACATGAATTCTTTTTTATTTTCTTAGGAGAGAGACCAGTTGGCTAGCATCC
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GAATGTGGTGACAAGACGTAGAATGTGGCTGTAGATCTCCCTCTCTCTCACGTAAGGGTT
TCTCACTGTAAGATATGTTGGTTTGAAGGAATATCTGGAGGTTTCATGTCCAACTTCCCA
CTCTGAGCAGAGCTGCTGCCAACATGAGCTCAGGTCAGCGATGAATTGTGTAGCCTGGAA
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CCAACCTGAACCTCTTGCAGAGCTGCTCAGTCCCTCTCAGGCTGTTAAGTACGTGTGCTG
TTACTGCCACCAGTCCTGAGACCAGCTGTGCTCTGGGGCCTCCCCCAGTCCCTATTCTGC
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CTCAGTGCAGACCTCAGGGAAAGGTACCCTGTATTCCCTTGGGATGTGGGGAAGGGGCAG
TGAGTCCGTCTGGCTGCTGGGAGAGCTCAGCAGTCTCACCCAGCAGTGCTGGGGTGTTGC
TTCCAGCTTCCTTATGTCTTGTGCACTTACTCAAAGCTGAGGCAACTGCAAGTGTTAGGG
TGGTACAAGAATGTATGTTGGTGTTTGTGGATGTGCCCAGTGAAACTCTGAGCCTGCAAG
GGTTTTCCCAACACCTGCTGTCTAAGCAAGAGAGGAGCTTGGAGTCCGATGCTGTCGTGC
TGTGCCTGCTTCCTTGCTTTCTGCCATGGGTGCAGGCTGAGTGTCTTCTTTTAACTGTTG
GGGCAGGGCAGAATGTCTGCCAGGGAGATTCTGACTTCAACAAAATGATTTTGGGGGGGA
TTTTTTGTGTGCTTGGGCTTTTGGGTTGTTTTCTTTTTTTGCCTTAGGGTTTTTAGTTGT
TCTGTTTGGAGGGTTTTTTTGGTGTTTTGTTGTGGATACGGTTCTTCCTCTTTTCATTTA
TTTCTTTTGCCTGTATTAAAATCTGGCTTAACCACTGATACAAAAAAGCTGAGCTGGAAA
TGTTGGAAGAATGGCCTTCTCTGCCTTGCTGCAGCCAGCTGTCCACACCCACACCCTCCA
CCTACTTTGTCCACCTCTCATTCAGAGCTGGCAACGTTCCTGCTTTCGTTTACACACTTC
TGTTCCCATCTGAAGGCTGCTGCAGCCTCTGTAGCTGCTCAGAAACTTACACACTGCTGT
GTGTGAACAGCCCTAGCTGACTTAGGTGTTGACTTACACTGGTTTGATCTGCTGCTGTGC
TTTCACAGAGGGTAAGTTGAATTAGGGTCACCAATTTGAAACAGAACACGTACCCATGTA
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TGTTACTTTGCATTTAATTGTTCCCACAGAATAGATAATAATGCTGTAAATTGACACCCT
CGCTCAGGGCTCGTTCTTTTCCTGGGTAACCAAGCACCTCCCTCGCTCCTTCAGTCACCC
AGGTGGATTCCTCTTCCCCTCCCAGCCCAAGTCTTTGATCTTTGTGCTGCGTGAGGCGGC
CCATCCCATGCTGGGATCCTGGCACTGCCCTCTGGGGTGCTGTTGCATTGCTTCTGACTC
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GAATGCTGCTGGTGCTCAAGCTGTGCTATCAGAGCAAGTTGTAGCAACCTGGTGTTAAGA
GCTCATTCTCATTCACTGTTGACAATGCTGATGGGATGGGTGGTTGTTAGGAGTGACAGA
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TCCCAGCATAGATGTGAGGCTTTGCTGCTGTCTGTTTGTGCACTTTGACATGTCTTCACG
TCTCGTGTCAGCTCTCTTTTTGTTCCCTGGGATCTGCTGGTGGAAGGCTTGGCTTCTCTG
CAGCCCTTGGAAGTGCTGCTGAAGCTGAGATGTGAGCCTTGAAGCTCTCTGCAAAGAAAG
CAAAGCAACTGGAAGAGGGAATCGTGTAACCTCTGCTGAGAGCCCCAGTGCAAGCGTTTC
ATTTACTGTGCTTTGCAAAGCCAGCTTAGATTTCACCGTCAAAACTCCAAAAAACACAAC
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GAAAGCGTGAGTATGAGAGCACCCAGCTGGCTGTGGGAGAGCAGCCCTTGTGAAGTCACA
CGTGTCTTTGGGTGTTCGATAGTGCTGTGGGTGCATATCCTGGGTGTCTCCATCACGCAG
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TTTTTTTTCTGTGTTTGTTCAGAACCTGATACAGTGAGATCCTGCTCTGACTTGGGGCTC
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CTTTAGAATCAGTGTACAATACACCTTTGCCTTTGATTCAATCTGAGCCTGATAACATTT
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TCATCAGGGCTGTAACTAATTGACTTTACTAGCACTGAGACCATTTGTGGTTTAGTGTCC
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TTTTGGTTTGTTTGGTAGGCGTTCTGTTTTTTCCATGGAGTCTTGTTATTTGGAGTCCAG
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TATTAGTTTTAGCAGGCGTTGGCTGAAATGGGTCACTAAACAATACTGGGGCTTTAGATA
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TGTCTTGAATGGAACGTGCACTGTGTGATGTGTTTTCTTATCCTCTTAAAAATAAGAATT
AAAACAGCCCACGATGAAAGCAGGAAGCAGCTGGGTGCTGTGCAGAACCCATGGGTGTGA
GGAGTGGTGTCAAGGAGAAAGCCCATGCTGGCTCCTAAAGCATTACATGAGAGCTTTCCT
ATCTTCGACATGCAGAAAGTGGAACTCCTGTGCTATAATTAGAATATCTCTGGGGTATCT
TTTTCTTGTTGATTAAATTTCTTGTGAAGCGATACGCTGTGAGGTGGTTGGGCTGTTAGG
GATGATTGGCACCAGTGTTGCAAGCTGTTCACCATACATTGGTAGCAGCAGAATGGATCC
CACTGGGTTGCTGTGCAGCCCCCGAATGCTCTGCAAACACTTCATCCAGCTGTAAAACAG
GACACGTACTCGTGCTTAACGCTGTCGCCGGCACTTCTTTGGTTACTAACTGTGCAATGC
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CTGCCGTCCCCATCCGTAGCGGAGGGAGCAGAATGGAACGTGTGCCTGCGCCTCTGCGGC
TCCGCCTGGCACACCTTCTTTGGCAGCTTAAGTGGCCACACGGGGCTGCGAGGTGCAGGT
ATGCGTTCTCTCTGTTGACTCTGCTGTTGGGGCAGTGGCACTGGAAGGAGGGGCATGGCT
GCTGTTAGATTTATCCCGTCGCTGAAGGATCTGCTAGGGCTGCACTAGTCGGGTCGTGAT
TGGGCAAGCGATGGGGCTGATCTGGGACGTCCTCCGTGTTAGTGTGATGTGTCTGTGGGG
TGGGGGGTTTTCCTAACCCATTTGACACACAACCTGTTTGTTTGCCATTCCTTCTTTAGA
TCCAGCACCTCATTTGGACGTCCATGAAGCAAATAAACAGTTTATGGAGCAGAGTGAAGA
GCTCTATGATGCCTTGATGGACTGTCACTGGCAGCCTTTGGACACTGTC
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