SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001076_2.0
Identity
TranscriptMethionine sulfoxide reductase A (MsrA)
SpeciesGasterosteus aculeatus (Stickleback)
Transcript IDSPT00001076
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00000980_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001076_2.0 # Transcript # Methionine sulfoxide reductase A (MsrA) # Stickleback (Gasterosteus aculeatus) # Full length # Forward
ATGGTCTCCGCCTCCAGGCTCCGTCTGATTTGGCGTCATTTTGTCAACAGTGGGATGGGA
GAGATGGGCTCCAAAGCCCAAATGCCGACTCAAGCGACAGCGCTTCCCGGCCGGACCGAA
GCCATCAAAGTATCCGGTAAGCTAGCTTTTGAACGTTAGCCTCTTTAGCAAGAATGCTAT
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TCTATAAAATGTACCCCTCTTTAGGCTGAAACTTTCTAATTGTTGTAATTTTTTTGAGCA
GTGTAGGTGAAGGAGTGACTTGTGTTTCTGTGTAATTGTGACATTTCTCAATATTTTTGT
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GACCTGGATGAGGGCGGATCTGTGTCGGACGGAAGTATTACGATCCTTTACTGATCCTTT
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TTTCCCCAGGATTGCAAACACACGTTTAAAACCACAAATCTATTTGGTCTCAGTATTTCT
TTTGAAAAAACAGATCTGTTTCTTTCCATGGAAACGATTCATTCTAATTGGGCCATTTCT
GAAATCAAATGCTTTTTACAGTTATTGAGGCTGTTTTTGTAGTTACTAAAAGCTTCACAA
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GTTGCTCAAGGAAAAGAGATCACCATGTATTTTAACGTCGGTCGTATGCTTCTGCTGAAC
GTCTTCCTGGTTGAAGCTTTGCCCCCGTCAATCCATATCCAGTACGGGCCGTCGTCTTTG
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AAAAACACCCGAGGCTCGTCTTCCTGGAGGCCGTCTGCGGCGGAGCGATGACGATAACGC
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TGTGTGTGTGTGTGTGTCTCCAATATCCACGAGGCAGACATTAGCTGCAGTGTTTCATTC
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GAGGGGCGGTGTGAGGCCCAGTATTTCTCTATATTGTCAGTAAATTGTGTAGATATATTA
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CGATTGGAAAACAATTGATGATTGCTGGAGGTTCGGGCTTCATAACCTCTTGTTAGGGTT
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GGATGTGCTCCCCCCCATGGACGCTGCAGCGCGCCGCTCTCACAATTCGGCCGCAATCGA
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CGCTTCTCCACCGTCGCCGTGTTGAGCGCCGACGGAGAGGCAGTAAATATGCCCCCTTAA
GGTGCACTTCACATTGTTAAAACATTCATGAGGACCACCCTTTCCACTGATGTAAACGTA
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GCCTGCCTCCAAACGCATGTAGGCCGGAGCTGAAATAGAGCAGCACTAATGAAGTGCGCA
CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCGCAGATGTCACCATGC
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ATGACTTCTGTTGCTTGTGATTTTTTTTAATTTGCTTCTTTGCGAGTTTTTTTTTTTTTT
TTGACAGTAAGGGGGCGGACCCAGTCACCATGGTATCTTTACATCTAACTGGTTCCAAAC
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TTTGCGTGCGCGGCTGGAGCTCATTTGTGCGACTAAATCTGGGCTGACCCTTTTTAACGT
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GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTCCAAGTTAAAATCTATACCGCAAATGACAAAATAAAA
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ATGTTTTATTTGTAACACTTTGAAAGGATCCATTCTGCTTAGTGAGAACTTTTTATAGCT
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TCTATCTGTATCTGAGTAAAATAGCGAGTAAATCCATCTGAAATGCTGGAGGGCAGCGGT
TGAGTGCATGACTTCTCTGTCATTTTTAGCAGGAGCAGTTCAATGAAATGTATCTGTAAA
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TGTTATTGTACATTTTAAAATATGTATATTTAGTTTAGTTTTCTTGATTTAAACCTGTTC
TGTGTTTTGGTAATTGGCACAGTATCTTGGCAAAGCAGTGACAGTCCACACGTGGCGAAT
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TCAAAGTCCTTGTCTTTGCATTAAGATACGCCCCAGATGGTTAATGATCAGACACACATT
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AGTCTATTCCGAAATGGATGTATTCCTGCGAGATTGACCCGGTGAGGCATTAATTTAATA
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TTAAAAAAGTAATAAGAGACAGAGAGGGATGGGAGTGGAGGCAGAATGAGAGACGGGAGG
AAAATGAGGTGCGGCGTAATGGGTCACAGTGCATTGCCAACACCAGCTGACGTCTGTCTG
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CTTTTATTTGTAGATTTGACCAAAAAAACATGTATTTCAAGAATTGTTCCAGAGTTTTTC
AGATATTTTTTCAGCTCGTATTCAGTTGCCAGGTAACTGGAGGCTTTTAAAGTTTTTCTG
AGAATCCTAGACAGATTATTCTTATCTGTTTGAAACAGATGTTGACAGTCTCGTCTCAAG
GTCCACTTACTTGCTTTTCCTGGAGCTTTTCGACCAAAAAATACAAGGAATGGTTAAAAA
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TACTCCTCCACAACTTCTTCTTTATATGCAAAAGGCAAATTGAACGCATGAGACCTTTAG
TTTAAGAATTATGGCATAAAAACATCCTGCAAATAAGACATTTGCAAACACAAAAGAGGT
CTAGATGTCTGTTTGACTTCAGTGCAGTGTTTCCCCTAACCCATTATATCAAAACCGTTT
GCCCGACTACCGCCCCCATCTGTCGCCTGCTCCGCCCCCCTAAAGTTGTAAACCATGGGG
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CGCCGAGGTAGTGAGAGTCGTCTTCCATCCGGAGCAGATCAGCTTTGCCGGCCTGCTCAA
GGTGTTCTGGGAAAGCCACAACCCGACTCAAGGTACGGACACTCCCATCACTGAACCTCG
AAGGAAAATAAAGCCCTTGTTCATGGGTCTAAAAGAATGTGTCGATACCTGCGAGGCAAC
TGCAGTTCTCTCGCTCAATACTGAATACTGAATACTTTTTCCTCCTCATTAGTCGCTTAG
GCACAAAAGCATAGAAATAGGGTCCAGATCCAGATGTGCTACATCAGGGGAGACCCTGAG
ATTGACCTGCTTTAGTAATCTTTGATGTCACATGCTAGTGTCACAACTTGTTGGCATGCT
AATGGAAAGCAGAGGTAAGGCGAATCCCTGTCGGGAGTCAGGAACTGGAATGTAAAATCC
TGACCCCTGAGAAGCCGAAGATCCCAAATTTAGGAGGGTACGAAAGTCATTAGGACTCGT
ACGTTTGAGTCACAAAAATGTTTCACTTTAGACCAAAGACGCACGCTGTCATCACACCAG
CTGCACCACTCGAGCGGCTGAAACCGGTGAAAGGAGTACGTGATGAAATGATCCAAAAAT
GAAATGATTTAAAAAAAAATGTAGCTTTCAGTTCGGCCAAGACGAGCAAGTTATATTTTT
GGAAAGTCCTGTCAGCCGTTGTGTTCGGACAATGCTGCCTGAGCCAGGAACGGAGGAGGA
CTGAAACCCACATCAGCTGAAATCCTAAAGTGTTGTTATTCCTTTCTGTGTGTGTGTTCA
GGGATGCGTCAGGGGAACGATATGGGGACGGCATACCGCTCCGTCATCTACGCCGACACA
AAGCAGCAACTGGAGGAAGCTCTGGCCTCCAAAGGTCAATACCAGAAGGTACACACACCT
ATCCACAGATCTGCCTAGAATGCCTCTATCATCCTCAATTCTCTGTTTTCCTTTGTCCTC
ATCTTCTTCCTTCTTCCTCGTCACTCTATTTCCCAGCATCCCCCGCTGCGGCCCATCCCT
CTTTATTTCACATTATCTCAGGAACACTTGCACAGATTATTTTGCCGTCTGACGCTGAAC
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CACACATATACACACACACAAAAGATGTGAAACACACTCCCTCCGTTGAACTCTCTCCTG
CTGAGACTCCTGCACCACTACCCCACCAACAGGGCTTGTTGCCATGGAAACTGACGAAGA
TGTTGTTGCTCTAGTCTATTCTTTTCTAATCTAGTGTAGTCTGGTCTTTTATGAGCTTCT
CCCTTTTCTCTGTCCTATTCTTCCTGCTGCTCACAGCCATTTCTTCTGTCTGAAGCCTTG
TGTCGTTCATCATGATTTGTCTCTCTTACGGTCTTTTGTTTTAGTCCCCTCCAAGGCTGT
GATTTGATGTTATGCACAAAAAAAAAAAAGGTTCCTGGGTTCAATGTCAATGTCAATTTT
TATTTATATAGCACTTTTAAAGGCCAGTGGCCAGCCAAAGTGCTTTACAGGATAAAAACA
ATCAGCAACAATCCAAGCAAACCTAAAACAAACAAACAAATAAAAGATCCAATGCAGGTG
ACTTAACTCAGCCAAAGGCCAATGTGAACAAGTGAGTCTTAAGGATAGTTTTTAAGAAAA
CGACAAAGCATTCCACAGTCTGGGAGCCGCTACTGCGAAGGGTTGATCTCCTTTCGTTTT
TAGGAACGACCGAGGAACGGTCAGAACCAGCTGGTCAGCTGACCTCAGGGCTCTGGACGG
TTTATGTATATTAATAAGGCTGGATAAATATTCTGGGACCATTCCATGCAGAGACTTAAA
AACAAATAAAAGATTCTTAAAAATCAATTCTGAACCTCACCGGAAGCCAGTGGAGAGAGG
AAAGCACTGGCGTTATGTGACCATGCTTCTTTGTCCCGGTCAGGAGACGGGCTGCTGCAT
TCTGCACAAGCTGTAGACGGTTGAGTTCTGACTGGCCGATACCGACATACGGTTGCAACA
GTCCAAGCGCGAAGATATAAAAGCATGAATGACTTTTTCGAGGTCAGCCCTTTTTAGATA
GGGTTTGACTTTGGCTAGCAGCCGAAGCTGGAAGAAACTAGCCTTAACCACAGAGCTGAC
CTGCTTGTCCAATTTAAATGCCCCATCAATAATCACACCAAGGTTTCTGGCCTGGGAACC
TGTGTAAAGTGCTAGTGGGCCAAGGGAGCTGGCAAGGACCTGGACCAAGTCAGGGCGACC
ACATAGCACCATCTCTGTTTTGTTTTCATTTAGTTTTAAGAAGTTTAGGTCCATCCATGT
TTTAATGTCCATCATACAATTAAACACAGCATGAAGGGATTCCTTGGATTGGGCCTTTAG
TGGCAAGTACACCTGCACATCATCAGCGAAGCAATGGAAAGGGATTCCAGGTTCAACCGT
AACTTACAATACTACATCGTAGCAAGTACTGTTACTGAAACCCTTCTCACACACGGAATA
CCACATTTTGCTCAGTTGATCTATTAAAAGGACACAACTGTATTTTACGTTAACGTTCAT
TCCAGAGTAATTCAGACCCGACTGATGTTTCCTGTACCGGACCAGGATTACGGCAAAGTC
TAATTCTACACTCTCTAGAACTCTATTCTTCAATATCTTGACAGTAAATGTTGGAAAAAC
CAAAGAGTTGGTTATTGATTTTAGCAGGTAGAGGGAGGTGGTCTCCTCAGTGATAGTTGA
GGATATCTTGGGGTCTATTTGTGTTACGACTGTATACATGACCCAGCACACAGAGATTCC
ACACAGACAGTTAAAGCAATTTAATCTTTTATACCAGCAGCAGTAGTCTGGTTTTTGAAT
GGACACCTTTCTGATGTTGATCATGTTTCATATCGCATCTTCTGGTTTTGTTTGTTCCTT
GTAACGTGTTTCTTGTCTGTTGTGCTCTGTGCATTGTGTCTATTGTTGTCTGTCTGAGTC
TGAATTCATGTTTTGGTAGCAAATGAGTTTCCCCACTGGGGATTAATACAGTTTTCTAAT
CGAATCTGCCAAGACCAGAACCAACCAAATTAAAAAAAATACTAATAATTGAATTCCTAT
GCCAGAGGTCACTAACTAGCGGTCCGGATCCGGACCCAGAAGCCGTCCCATCCGGACCGG
GACCTGAAGCTAAAACAGACTGTTGTGATTTAAAACCGGACGGTGTGGAGATGAACTTCA
TTTCAAGTAAAGTCACCATAGTGCTTTTTCACACATCAGGCCAACATAACTGCCTCATAA
TTATGTAAATATTTGTATATCTGAAAGGGGCTTGAACTCTCAAACAATCGCTGAAGCCCG
GTTGTAAAGTTTAACAGCCTTTCTACCAAAGTATCTTTAGACTTATTTCCCAAGGCTTCA
AAGAGCAGCAGCTTGTTCCCCAGAAGTATACAGATGTTAATATCATGCAGCTTGTTAAAT
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