SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001109_2.0
Identity
TranscriptThioredoxin reductase 2 (TR2)
SpeciesGasterosteus aculeatus (Stickleback)
Transcript IDSPT00001109
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001013_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001109_2.0 # Transcript # Thioredoxin reductase 2 (TR2) # Stickleback (Gasterosteus aculeatus) # Full length # Forward
GCTCGTGCAGGGATCTACGACTACGACCTGGTTGTTATTGGTGGCGGTTCAGGAGGCCTA
GCTTGTTCAAAAGAAGGTGAGTTTTTGAGTATCTATGCTTTGCACGCAGATGTGTAATAT
TAATCAATTGAAAATATATATTTTCAACAACATACTAACAATATATCTGTATGTACAGCA
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TTTTTCTTAAACTGCTGTCCCAGATAATTACACACATGACAGTTGTTTGATTTAAAGACC
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GTGGTACGTGTGTGAATGTTGGCTGCATTCCCAAGAAGCTCATGCACCAGGCTGCTCTCC
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GGCCGAGGCCATTCAAAACCACGTCAGGTCTCTGAACTGGGGTCACAGAGTTCAGCTGCA
GGACAAGTAAGTGACACCAGCTCTGCTCGCTCACTCATTCTCCAGGATAAACCAATTTAT
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GTTAACCTCTGTGTTTAGCCCACAATGTTTTCATTCCAGTGAGACAATTAGCTTCAACTC
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GCTCTTCAAGTGTATGATGCTGAATTATATATCAATACACGGCATCCCCTGTTCTCATTT
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GCCGGGCCGCTTCTCTAGGCAACAAAGTAATGTTTTTGTTCTCCTGAGTTAACTGCCTTT
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GTTTGTAATTCTCATTTTGTTCACAAGAGGCTGCAGTAACCACCACTTGCTAACTTTTAT
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GTTTTGTTTATAGTGGGTGGATGGTTTGATACTCCTGCTCACACCTTTTTAACTCTTCTT
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ACACGACACGTCCCACGGTCACGCACTGCAATCATTCGTTGGTGACATGCAGCTTGTTTT
TCCTCCCTTCCTGTCAGCCTGTCCTCGCCTCGTGATTCCGATTAGCGGCGTGCATCCTGA
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GATATGTAAGATTCAGATGTATCCAGGCAGCCGGCTCCCAGGGCAGTTTTTAATTGTTTT
GTTTCTATATGCCAATTTTGACTGCTTTGGCTTATGATCCATCATTTGTTTTGGGAATTG
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CTGTTCAGCTCTCTGCCCACTTGGTGGCAACGCAAAATCATTTATAGAAAACCAACTAAC
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AACGCCGCTGTGCATGAAGCAGAATTACCCACTTGAGCTCAGGAAGTCCTTTTGATGTAG
CGGTGTGGTGGTTAGTGAAGTCCTCCGCCTCCCCGCTCTGAGCGCAAACCGCACATTGGG
GCTGGAGGTGCTGTTGTGCCGCCGAGCCGCCAGCTGTGCAGGTGGGGGCGAAAAGGCCTT
CTCTGCCGGCAGGGCCGGTTGTTGGAGGGCGTCCAGCGGAGTGATGGGTGTCTAATGGGT
CTTGGAACACAAACACACCTGAATGACAGATCTGGCCCCGGGGTCCGAAGCCCAGAGCTG
GCTGCCTTCATCATGCGCGTACCAGAAGGACTGTGATGCTGTGCTAGGGAGAAGAGATGA
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AACTTAGAAGAAGTGAAAAGAAGTGAAGTGACGTTTGTAAATAGAAAAGAGGATGTTCCA
ATTTTTTTATGACTTAAGTCTTTAAGACTAAAAACCACAGCAGCAACCGTGTGGGACTGT
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TGACACACAGGAGAAGCTCCTGAATGCAGTGTTATCCGTGATGGGGCTTCAGACTTCCCA
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CCAGCTGGGAGGCTTCCTTTTGATCTTGCGTGTCAGTTTAAATGAAAACTGACAAGATAT
TTAAGCAAGGAACCAAAAATGGACATTTTTGTGCAGCCAATATGATGAGAATGTTACAGC
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TGGACAAAACAGATACTCACCAAAAAACATTCACGAAACAAAAAAACACAAGGTAACAAG
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CTTAAGTGCAGCTGTGCATTACACCGACACGGAGAACAAGGCCAAAAGGCTTTTAGTGCT
TTGTGTTAGCGTGGACGAGGGCAGGATGTGCCTCGGGCCGTGCTGTCACAAGGAGGAGGG
CCAGGTTGGAGAGGTGAAAACAGGGTTGAGAAGGGCCTCGTCGACGTGAGTGACGGGCAT
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GTGTTTTGCAGGCTTGTGGTTGGAGCCAGCTGTATCCTTTTGTCATTGCTGGATATAGAA
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TTCATGCCTGTTAACTTGCACTTTCTTTTGTTGATGAAGAGTGTGCTGACATACATCAAG
TGCTACTGTGCATGTGAATCAAGAGAAATGGTGTTGTCCTCAACCCGTCGTGGCTCAGAT
GTGGCTCTGGAGTGTGCAGGCTTCCTCACCGGCATCGGCTTGGACACCACCGTGATGGTC
CGCAGCATCGCCCTCCGGGGCTTTGATCAGGTATTGCTCCCTGAACAACAGTATGAATAT
TCTGCACAATTGATATATAAAATCTTTTTTGTCACATCTGAAAGTGGGTGTTCTCTTTGG
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TTTATGGAAGAGTGTCCCAAAGAGTGTGGACAAACTTTCCTCAGGAGCCCTCCAGGTGAC
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AGCAGAGGACAAGCTTGAGACTTGATATTTTGACAAACATTAGACATGGAACCTTACAAA
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GACTGTGACAGGCATATCTTCCATGAAGTCACTAAGTTAAATATTTCACTTATTTCAAAA
GCAAAGGTTTGACTTCACTCAATTGACTTGAGGCTTGAATTGGACCAAATAAATCTAGCT
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ATACACCCGTCGTATTCTTCCCCGTGTCTGAACGAAAACATCGGCATGAGGATCCTCCCT
GCTACCAAACAATTGGATTGCCGTCCCCCGATAGAGAGCCGTGTCAGCAGGTAGCCCAGG
AATCAGGGCAGCAAACAAAGTAATAAAGCCTGAGTGATGGCAACGGGGGGGGGGCGTTAA
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GCGTTCCCCTCTTTGTTCTCCCACTCTGGGCCTTCCTGCCCGTGCCAGCCTCTGCGGAAA
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GCTTTTCATAAAAGGTTTTCCAGTGTTGCTTTGTGAGAGGGTCCCCTCATGCGTGTGACA
GCGGCGAGGATGTGCGTGACCCTGCTGCTGAGATGACGTTTGTTCTTCCCTCCCGGGGGG
CTGCATTCCCACATCATCCCAGTGTTAGTTACTCACTGCTGGTGAGTGATGTATGTACAG
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TGAGCGATAAACGTGCTGCATTAAGTCCATGTCATTTGTTGGTCATCGGCACAACATTAA
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GTGGAACCCGGCTACGTCCACGGCAGCTTGTGTTCCCATACAGTTCACTGAGAACCAGCG
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CCCTTTACGGTGACCTTACACTAGGGGCCGGGCAGGGTTGCGGGTCTCGGCGGAGTTATT
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CATTACTCCCCCCTCTCTGTGGGCGCTACAGTACTGAAGGATGTCATTCGAAAACATTTC
CTAGTTCCTTTTTGAAGGACTTTTGACTTTGCCTCAGTTTTATGGGTTACTGATGACATC
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TATTTGTGCACGATGACAAACACGTTGCATGTTGCATACAAGCCTAAAGGATGTTGTTGC
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GTAACTGTACATGTGGTTTAATTTAATACTAATCTTCAAATAAGCAACAATCATTTAGGT
TTTTTTTATGGAGATTGATTCATTAATTTGTTGTGAGGTCTGCAGGCAAAAAGCTTATAA
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GGTCTTGTTCGCTTCAAGGACCCTGAAGTGAGCTAAAAAGATCGTGGCCGACCCCTCCCA
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CCGGTCCCCCACAGACTGACTCTGACATTCCACCCGTCACTTTCTTTCACACTGCACACG
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TTAATTTTTAATATTTAAATATTTTTAACTAACTTTTATTCCTTTATTTTAAACTAACCC
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CTGACATATTATGGCAATAAATGTTCTGATTCCTGAACAAAAACAAACACTCGGTAGTTG
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CATTTCAACCTGTGGTGGGTTGTTGTGGCTAATTAGCCTAGCCGTCTAGAGGCTTCCTCC
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GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGCCTGCTTCAACCAAGTCCCTTATCAGCTGGC
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CCTGCGTTGTTTCCTTCTATCGGACTTAAGGCAGAGCCCCTGAAACCAAAGCGCTGGGCC
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CCTGCAGTGTTGTTTTTCACCACGACCAGCTGTGTGCTTCCTTCCTGCCTCCCAGGCTTC
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GGAATTGTTTTGGACAACAGGATGTGCACTGGTAATTTCACACGTTTAAGTCATGCCTTT
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CACTATTTCTCTACAGTGTAGTCAGAACTGTTGGAAATAGTAAAGGATATGTACGTTTTT
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GCAAACGTCTTTGAAGTCCACATATTTTAAAGTCATTTAAATTGTGTCTTGTTTTAGGGT
CGTCCTGAATTGACCCCAACGGCCGTTAAAGCGGGAAAGCTTCTCGCCCGTCGATTGGCC
GGGCTCAGCGCTGAACTCATGAACTACGACAACGTAAGACGCACGCACACACACTCGGAT
CCTGGTCATTTCCAACCATTTAATGGGCTCTGCTTAGAGACTCATCTCGCACACCCACAC
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ATGTCATCATTCTTCATCCTGCCATGTTTACTCATATTTATCTCTTCTGCCAGTTTTATT
GCAGTTGTTCATTTTGTTATAGATTAACTGTGTATGCACATTGTCAAGAGTGGATTTCTA
AGTGACACTAAATATGTATTTACTAAAATATAAATTCATGTGACACATTCAAAGCCTCCT
GCGCCGTATTAAAATACAAAGAAAATGTAATCGGTACGCTATAATGCATGAAGTATTTCA
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TGTTCACCCCCCTTGAGTACGCCTGTGTGGGTCTGTCTGAGGAGGACGCTGAGGAGCGGC
ACGGGAAAGACGGCATAGAGGTATTCACTGTAGGCCGAGTGTAAGCATTTAGTACTTGAA
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TCTATGGTGTATTAACTACACACCAGGAAAGCCAGACTACATTAGAGGATATATATATTA
TTCAGGTAATAGAATAAAGTAAGCAGCAGGGGATCAAATTAAACGTTACATCATATTTTT
TGTGTACACGGGTACTTTGCAGGTGGTCTGAAAATGAACTGAACGTATAACATCTCTCTC
TGTATTTTTTAATATATATAAATAAATATATAGGGCCGGTTTCGGAGACAAGGCTCAAGC
CTAGTCCCAGACTAAAATGCTGTTTGAGCTGGCTTAACTGGCTTGCACAGACGTAGCTTA
AAATACTCGTGGATTAAGCCTGTTCTGGATTAAACAAAGCCGATTGCAAAATTGAGCATT
AGAGCTACTCCAGGACTAAATTGGACTGAATTGAAGCTTAAACTAATCTGCCAAGGAGGC
AGGTTTAACTCCCGCTTAGTAGGCTAGGCTACTGTTTGTGAAACTGAGCTTGGATTGTTT
GGGAGCATGGACTATTTGGAATATCTAAATGAGGACCAACATGCACGACAAAGGCCAGCC
AGACGAATACTGCTGGATAGGAGTGATCCATTGAATCAGTTTGATGAAATAACTTTTCGA
GACCGCTTTCGTATGCACAAGGAAAATGCATTGGAGATAATTACTTTGCTTGAGCCTAGA
CTTTCCTCTCTGTCTCAAAGAGGAAGGCCTGTGTCCAATCAACTGCAAGTTCTGATCACT
TTGAGGTTCTTGGCATGTGGAATCTTTCATCGTGAAACTGGTGATTTGTGTGGTGTCAGT
GAACCAACTGTATGTAGAATAGTTCACAAAGTCTGCAGTGCCATTTGTGAACTGAGGAGT
CTTTACATCAAGTTCCCTGATGCTGCTGGGCAAGCCAACTATAAAGTGCAATTCTATGAA
TATGGGCACTTTCCAGGAGTGATTGGCTGTATAGACGGATGTCATGTTCCCATCAAGTGT
CCATCAACTCCTGATGCAGAGGAATACAGGAATCGTAAGAACTGTTTTTCAATCAATGTT
CAGGGTGTATGCACTCCTAATTTGGAGTTTTCAAACATTGTTGCCCGTTGGAAAGGTGCA
ACCCATGATTCAAGGATTTTTCTCAACTCTTCATTGTGTGCACAATTTGAGAGTGGACAA
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CATCTAAATCCCACAACAGCTGAGCAGCAAAGGTACAACAGAGCTCATATCCGTACTAGA
GGGATGATCGAGCGTATGTTTGGAGTATGGAAAACTCGATTCCAGTGCTTACGAAATACG
ATTCGTTTCAAGCCAAGAAGATGCTGCAAAGTGATCATTGCTACAGCTGTGCTGCACAAC
TACCTGAAGCAGCATGGCTGTCCTGACCTGCCAATGGAAGATCAGGATGATGCAGATGTG
CCCATGGTGGCAGAGGCAGCCAATGACCAGCGAGGACTTGCACACAGAGCTGCTTTCACA
GTGCAGCACTTCAGCATTTAAATATGGAATGTATCCATTATGGTATGGTGGTGCTTGCAT
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AAAATGTAGTTTGTGATGATTAATACTCACTCACACGCCAAATGACAATACATTTATTTT
TATTTTTCACAATTCCTCATATTCACCATGGCTACTAGTATGCAGAATTCTTTTTTGGAG
CATAGCCCTCTCTCCCAATTTCATATCCAGTTCAACCTCTAGAATTCTAATTTTCATTTC
ATGTTCTTCTTTTAAATATTCAATTTTACGCTCATGAAATTCTCTGGCTAACTTTTCATG
CATAGTTATCTTTTTTGGTCTCTGTTGGATGGTAGCAGCTTCATCTCCCAGGGGTGCCAT
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AAAAGACCACTGTTCCAAACTCAAATCAACTAATATGGTCCTGTAACCAATTTACTTCCT
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GGTATACCATCCAGAGGTTGCTGGTGCTCTATTATACCAGACAGCAAGTCACCCAATTCA
TCACATGTGTCCTTTATTGGTGGTCCACCACCTGTAATAAATCGCTCTCTTCTGCTTGCT
GCATTCTCTTTTTTTAATCCCAGTTTAATGTTCTTCCATAGAACCTATGAAGGCAGATAT
CATTCATTAGTTTTCTTTTTTGATGTCACAAAAATAGTAATATGGGAAATCTGAAATACT
GGTACTGATAAGGCATAATAAAAATAAGTTTGTCTCCTGATAATTTAGGTCATGGTGGAG
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GGCCATAAATAAGCAGGGTATAGGCAACAGGAAACAAACACATATTTTTGTGCCTAATAA
TGAAGATTAACTCACCTGCAGTTGTTGTACTGTTCTTGTGGTGACATCTTCATTTGCATT
GAATTCTTTGCCAATTGCAGTCCAAGCACTTCTTTTCTTATGTTCAATAGCAGCAGTATG
GATTTTGCTTTCAATGACTGGATGGTTCGATACAATTAGTTTTAGTAGTGCTTTTTCATG
CTCACTATAATTTTTGGAGCGAATTCTCTTTGCCTCTGACATTGTGTTGTCTCAAAATTC
ACTGCAACAATGGTGTTTCATACTCCATTTCAGGTTTTCATGAGCACAATTGGACCAACA
GCCTGTGCTTCCACTTAGTCTAATGAGGCTTGAACCAGGTGTTCTCATTAAGCTTACTCC
AGGACTCCATAGTCTCAGACTAACTAAGCCAAATTTATGCCATGTTCATGCAAGCCACTT
AAATAGCCAGGATTAACTAGTCTGATTTAGGCCTACTTCAGTCTTGATTTAAGCCCTGTC
TCCGAAACCGGCCCATAGTGTATTAACTACACACCAGGAAAGCCAAAATACATTAGATGT
ATTATATATATATAATATACATATAATACATACATCTATGTATTTTGGCTTTCCTGGTGT
GTAGTTAATACACTATGTTCATACTCTCACATAATAGGGAATTGTGTCATCAGAAATAGT
ACTCTTTCAAATATAACAGTACAACTATACCTGTAACTGGTATTGCGCTCCAGTCGTGAC
CGTGACTTTGTTGTAATATGTGCTTAGTTTATTTACCCAGAAATGACATGCCTCGCGTGC
ACAAAGCCGGTCACAAAGCCAGTGTTTATGGCTTTGGTGCTGCCGTCGAACGACAAAAAA
AAGAAGTACCGCTGAACAAACATTGACACGCACGTACAGTGCAAACAGCAAGCAGCTCTG
TATTTCTTCGCGCTGGCGGACGTGAGCGCCGTGCCAGATGCCGGCCAACACCTGCACAAG
GCCGCCGATGAACACTTTGAGCGACGAGCTGGGACTCCTTGCTGTGACTGACAGGCGAGC
AGGAGGTCTGATTGAGGCGTGTACGAGGTGATGACAGGCCCGCTGAGATCTGAGGAGGAG
CCGGAGCTGAAGCACCCGGCAGCTGCGCGGCCCTCGCAACTTGTGTCGGCACGTTGGCCG
CAGAACACGAAACACCGCGCGGCCTTTAGTGAGGAGTTGGACATCAATCCCCATCAGGAG
CGGCGCAGGCATCGCTGCTTTTATCGAGATTCCATGTTGCGTGTTTTGAGTTGTGGCTCA
TAACTCGGTAAATGGAAGAACGCTTGAGCCGTGACCGGATGGCAGCTCAAGTACATTTTT
CTTAGGCTCCTGTAGAGTGAGATTAAAAAACGAAAATGAAAGACACATTGAGGTTACCAT
TTTATTACACTATTTGCAATAGTGGATTAAAGTTAAATCCGCCCCAGATTTTAGATGAGG
CCTCCGTTCAGAAAGCTCGGAATGCAAAAAGAAAATGATCACATTGTAAGTAGTCAGCAG
GGGAAGTCTACAACAGCTTGTTTTGTCATCCCTGTGAATACTGCAGAATGCAAAATCAAC
TGCTTGGACTTGAGGGCCAGAATTATATATAGTTTGTCCAGTGAAAGTGATTTTATTTCT
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