SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001183_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesIctidomys tridecemlineatus (Squirrel)
Transcript IDSPT00001183
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001087_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001183_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Squirrel (Ictidomys tridecemlineatus) # Full length # Forward
AAGAATGTCAAGCTTTCAGCTGAAGTAGAACCATTTATTCCCCAGAAGAAGAATCCTGAT
ACATTTATGATCCCTATGGCTCTCCCAAATGATAATGGAAGTGTTTCTGGTGTAGAACCA
ACTCCAATTCCCAGCTACTTGATTACATGTTATCCATTTGTTCAGGAAAATCAGTCCAAT
AGGTAACTTATTTATTTTCTGTATTGTTTTCTGTGTGGGTTGGGGTCTAGAACTTGGCAA
AACATACTCAGTTTTCTTTTGTAACTTTTAGACATTAATCCTTTGTTTATTTTTAAGAGG
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TCTAGACTGTGATTTTGGTTTAAACTTAGTGTTTGTTCTGTAGTCACAGGATGGTTTAGC
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AAGAATTCTTGCTGGTTCTTTATAACAACTGCTCTACAAGAAGCTCTAATTTTGAGGATA
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AGTTGGAAGCCCTAAATGGACATGAAGAATGAGAGGTGGAGAAAATCATCCTATGTAATG
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GCTTGGACAGGTCTTCCCATTATCCAGTCATCGAAGCAGAAACAGTAACAGAGGGCCAGT
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ATAATTGTTTTTTAGACTTATAGTTATCTTCATGTTCCCTCAGAGTTTTATGTAAACATA
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TTCAGTGAAGTCTTTGCTGCTTCCTGCCATAATTTTTACAAATTAAAAAACAAACAATCA
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AATCCTTTTGGAACCTCTGAGAATGAAAAGAAATAAGTATTGAAAACAAGATAATAGTAT
ATAATTTCCAGATGTTGAAAGAGTACGATTTCTCAGAATGTATTCCCAGTAGTTCAGCTT
GGGTAGTTAAAGAAGTTAAATTCAGAATTCTATTGTGTAAATTGCTATTAAACAATAAAT
GCTCAAACTTTAAAAAGTGAAAAAAGGGATTAGCTTTTTAATGTTTTCTTTTTGAACTCC
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ATACCCTTATTATTTATTGTTGATTGGGGAAATGAAAAATTCAAGTAACAGTTACATATG
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TAGATGTGTTTTATAATGGATGTGTATTCTATAATGTTTAGTAAATTGAATAGGTTTCTT
TTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGACTTAAATCAGCAACAGCTTTTACAACAGCACATAAA
AAGCAAAAGGCCGCTGGTGAAAAATGTAGCTACTCAGAAAGAAACAAATGCAGCAGGTCC
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GGTTCTACACATCATTGAGTTTTCTGCTTTCATGCATGGACTTTTTAATTGTGGACTATA
CTTTCTTCAGGGTTCTAGACTTTCATCTTTCCATTTGTCCTACGACTTTGTGAGAGTCTG
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ATTTTTGAACAGGGCTTAAGTTTCCCTTTCCCCTCCCTTGTCTTGTAGTAGAGGAACAGT
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AAATTGTATATGTTTTTATAACTGAGATTAAAGCTCTTCATAAAACATCCTAACTTCCTG
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GCATGACACTTGTATTTTATCAAAAAGTAAATATTCTAGTCAAATTTTAAACTAATTAGT
TGAAAAAATTTTAAAGTACTGTATAAGCATTAAATAAAAATGCTTTATCCTAATAATAGA
TAAGAATTAATATCCTTCCCACCCCACAATACTAGGAATTCAATCTGGGGTGCTGTACCA
CTGAGCTACATTTACATCCCCAGTCCTTTTTAATTTTGAGACAGGGTCTTATTAAGTTGG
TGAGACTGGCCTTGAACTTAGGATCCTTCTGCCTCAGCCTCTCAAATTTGTTGGGATTAC
ATATGTGCCACTGAATCCAACTCAGAATTAGTATCTTGTAATGTTCTATTTTCCAGTTTA
TATCATGAAATTCTAGTTTGTGTCTCTGAGCTTAGCTTATTGTCTATAGAGTAGATATGT
ATCTCTTTTTTACCCATTGTCATTGACACTGGTAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAATAG
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TTTTTTTTTTGCTTTTTCTTTCTTTCTTTTTCTTTCTTTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT
TCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTGTGTGTTTGTGTAAGAACACTGGGGATTGTGGATGGG
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TCTCTTTGTAGTCTCTGTTCAATAGATTGAAATGAATAAAATGGCTTACTTTTTTTTTTC
ATTTGGGTTATGCATTTTTTTAAAATTAGTTATCTGTTCATAATATCCTTTTAAAATTAC
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TTATAGTATAGTTGAAGGGTTTGTAGGGCTTAAAGCTTTGAGATTGATTAACAGACTCCA
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TAAAAAAACAATTGTTATTGCTTCTTTAGTTTGCTCACTTAGTCACCATAATGGCAACCT
TTTGAAGCTTAAAAATTTGAAAATGAGAAGATAAAGGCATCTGTTAACATTTTTATTCTT
TAGTTTTTAATTTCTGAGCATTAATTGGTATCAGTAAGATAATTAAATATTATAATTTGA
TGGGAAAATGTCATTATAGTTATAACAAATATACACTTTTGAACACATGCTTGTATTATC
TGGGAAAAGTTTAATAAGATGGATAAATATATACAAAAGTTAAATGCATTTCAATATGCC
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CTGGGAATAAATCTTCAGAGATGCATGAGACATGTATGCAGAAACTATAAGGCTTTATTA
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GAAAGATATACCTGGAAAACAACTTTTCTCTAGATATAAAAGACTTAAAATATCATTTTA
ATTTCTGTAGATATGTATTATCAGTGTAGTGTACAAGAATTTACAAAAAAAAAAAAAGAG
AGCCCAGAAATGAACCCCAAGTATATGTGGAAATACGTATGTGGAAAACAACAGAGATCG
CTTTGCAGATCTCTAATTTATATCCCTCCCAGATCTCTTCCAGGTAGATTAACGATTTAA
GTGAGAAAACTAATGGTAGAAGAAAATAAGGGCAGATCTTTATGACTGTAGGAAGAGAAC
TATTACTAAAATGAAGAATTTTTAATTTTTTTAAATTGAGCGAAAGAGCCAGGTGCAGTG
ACACATGTCTGTAGTCCCAGCTTCTCAGGAGATCACAAGATCTCAAGAGGATCACAAGTT
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TTATTCAGTCATCACAAAGAGTTGTCCCACTTTCCTTGCCTTGTAGATTTTCCATCAGAT
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AGGAGAAGAGCTTCCCACCCCACTGCTGAATCCTCTAGTGAACAGGGGGCTAGTGAAGCC
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GGGGCTTTGAGAAATCCCGATTCTGGGACCATAAATGTACGTAACATTGCCTTGATTTAT
CAATCATCGATGTCACTATTATTTTGTGTCCTTTAGTAAAGCTTAAGTATCTGTTTTCAT
TAACAATTTCTATAGGAGTGAGATGTTAAAAATGTATTTGTATATTTTATTAGTAATAAA
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TTGCTATATTTTCTTCTTTGTCCCTGTCAAAGTTTTCAAACATGAAGATTCTTGATGCCA
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CTGGAATACCACTTAAAGTTTATAGAAAAATTTTCAGTGTTACATTTATATTGCCTGGAT
TTCAGTGTGTGAAGTTAGGGGGCAATTTAGATTTTGGTTTCTTTTATAAGCAAATCATAT
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AAAAAACCCTGGATGGAAAAAAATCAGACATTTTCCAGAGGTGGAAGGCAGACGGAACAA
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TTCCATTTGTTTTAATAATGGTGTAGTGATTATGAAGGACAGTATACTTAATTTTTGAAG
ATGCATAGTAAGTTATTTAGAAGTAAACTATTATAATATCTATAACTTTAAAGTGGCTTA
GCCAATAAGACTTACTTAAATAATAAAACAAAACAATAAAATGTTGAATGAATGTAGTGA
GTATATGAGTATATATTGTACCATTTTTCTGCTTTTCTGTATTGTTGAATATTTCATAAT
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GTGTATGTTTGACTATTAATACCCTTCTGTATATGGCATTGCCATAGTGATTGCTGCATT
GTGCCATAAGGGAGAAGCTACAGATTGGGTTGCTTCCTGAAGGTCTGGAAGAGCAAGATT
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TTGGCTATGAAATTAGGAAGTTGTTTATTGGTTGCTGTTTTTCCTTTTTGTTTTTAGACA
GCTTTCCTGGATTCCCTAAGTTAAGGATTAAAACCATCATATAAGTAGATGTGCAGATGG
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CATCCCTGAAATGAAGTACTTCAGATATACCTTAACACTAATTAGGCTGTCAGGAAAACA
GGCAGAATAATGTCCTCTTCTCTGTGGTTATTGCAAAAATGCCTTGCTCATTGCAGGTTT
GTGAGGCTCTTTAGCTTTATTTGATTAAAAACAGAAGAACTACAGAGTGCTTGCACAAGG
CCCTGGGTTCAATCCTTAGTACCACACAAAACAAAACAAAAACAAAAAAGCTAAAACATT
TGTTTATATAGATTAGATAAAATCTACAAAATGTTAGTTTATGTGAGGAAATTTTTTGTT
GAAGCTGCAGACTGCTAATCTTGCCAAATTTGTAGCACTGTTATTTTTGGTATCAGTAGC
TCATTGGAGTAGAAATAATCCCGAAATGAAAAAACATTTTATCTCTGTCTCAACTGTTGA
GAAATGGTAAAAGAACAAAAAAAGGAAATTAAGCAAATACACATGGTATTGTTAACTTTG
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TTTTTACTTGCTGTTTTGTTATGTGCTTTTCCTAGGTTTATATTGTTTGATTTTTTGAGA
TGTAGAATCTTTTCTAAGTCAAAATATTTTCCCCTTTTGCAATTTCTGATTGTGTGTAGG
CTTTCACAGTCTTTTAGAAGTCAAATAAATATCTGTACTTTCTGTTTCAAGACTTTTTTT
TTTTTTTTTTTAGAGAGAGGAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGGAGAGAGAATTTATTTATTTATTTTA
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TGCTGTTTAATTATAATTTTAAATATCTTTCATTTGTGTACTTAGTGTAGATTCAATTTT
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TGATTTCTGTAGTTTTGTCCATAGGCACTTGAGTTGTTTTTTAACTATTGCTCTTATAAA
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TGCTGGTTAAAAGGTAAATTCATCTGTTGTTTTGGTAAATATCACCTGATTGTACCAGTT
TGCTTTCTTAACAACCTTGAAGAGGGCCTGTTTCCATATAGTTTTAGAAACAATGTTTTT
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GACAGACTATTTTATAGAGAAAAGAAGCTTATTTAGTTCATAATTTTGGAGGCTGAAAGT
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TTTTATAACAACTTTCTATGGTGAGAACTCACTTTAAGGAGACCAGTATTCATAAGAGTA
GCTTCCTCATTGACCTATGGACCTTCCTCTAGGCCTCCCAGTATTGTCACTCTGAGAACT
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TTTTTTTCAAATTATTAAAGTTTCTAAGAGCCTTTAATCTGTAATTAAAGGTTTTTAATT
AGGTTTAAATCTTTATCTTTTACTTTGCTCATTATTACTGCCATGCACAAGTTTATATTT
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CCAAGGATACTCTGCCACTGAGCTACATTCCCAATTCTTTTTATTTTAAGAAAAAGTCTT
ACAAAGTTACTGAGGCTGGGCTCAAACTTGCCATTCTCCTGCCTTAGCCTCCCAAGTGTC
TGGGATTTCAGTGTGTACCACCATGCCTGGCTGGCTCCTGAGTTTTAAATGAACTGAAAA
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AACCACCTTGTGATGTAGCATCTTTCTATACAAAAACAGTATGTCTTCCTGTTTTTTGAG
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TTAATATTTATTTTTCAGTTATAGGTGGACAAATATCTTTTTTTTAAAAAATTTTTTAAT
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CGGGCCTCACGAGGCATGCCAGGCGAGCGCACTACTGCTTGAGCCACATCCCCGACAAAT
ATCTTTATTTTATTTTTATGTGGCGCTGAGGATCGAACCCAGTTCCTCATGCATGCTAGG
CGAGCGCTCTAACTTTGAGCCACAACCCCAGCCCCTGGGGTTTTTAATTTTAATTTTGGC
ACTTTTGTCCCTAAGAATCAAGTTGTATTTGTTTTTAAAGAAAATTGTTACGTTTGTAAT
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GCATGTATATGTTTGATTTCAGAATCAAAGGCTTATGTTCTAACACCTACTCTCAGTCTG
CTTCAAATTCTATTTATTGTTAGATTTTTGGGGTAACTGTAATGAAGATCATACTTTTGC
ATCTTTTTTAAGGGGTGATACTGGGGATTGAACTCAGGGGCACTTAACCACTGAGACTTA
TCTCCAGTCCTGTTTTGTATTTTCTTTAGAGACAGGGTCTCACTAAGTTGCTTAGCACCT
TGCTTTTGCTGTGGCTGGCTTTGAACTTTCAATCCTCCTGCTCAGCCTCCTGAGCTACTG
GGATTACAGGCGTGTACCACTGCACCCAGCTTCTTTAGCATCTTTTAATTCTTCAGGTTT
AGAGAGTCATTTATTGTCAGGTACAATGGGTATTTGAGAGAAGGTGCTTTAATTGTCTTT
TAAGATTCTTAGAACGGTTACTATGATTTATTTTGTGATATTGGGGATTGAACCCAGGGA
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TCTGAGTTGCAAGGCTGGTCTCCAATTTGTAATCCTCCTTCCTCAGCCTCCCTAGTTGCT
GGGATTACAGTCACCATGCCTAGCTTAATTTTTTTCCCCTAAACCTTATGACAGTTAAAC
ACTTTGAAAAATCGTTAGTATCAAAATGTATTGTGTACATAGTGGCTAATAAAGAGAAAT
TTATCGCTCATGATCCTGGAGGCTAGGAAGTCCAAGATCAAGGCACTGGTAGAAGTCAGT
GTCTGGTGAAGGCCTGCTTCCTAGTTCATTAGTGGCTGTGTTCTATGTCCTGACATGGTG
GAAGGGGTGAGGGAGCTCTCTGGAATCAATTTATATATTTGTTAATTTTTCCAGTCCTGG
AGGTTGAGCCTGTGGCCTTTTGCATGCTAGGCAAGTTCTTTACCACTGAGTTACACCCCT
ACCCACCGGGACCCCATTTGGTCCCTTTTATAAGATCACTAATTCTTTTCATAATGGCTC
TGCTCTCATGACTTAGTCATCTACCAAAATTCCCACCTCTAAATAATATCACATTGGGAG
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ACTGTGTTCGATCCTCAGCACCACATAAAAATAAATAAAGAAAATTATTTTAAAAAGTCA
CCTTTAAAAAAAGAAAAGAAGGGTTTGGGTTATGGCTCAGTGCCAGAGTGCTTGCCTCAC
ACATGTGAGGCATTGGATTTGATCCTCAGCACCACATAAAAATAAACAAAATAAAGATAT
TGTGTCCATGTATAACTAAAAAACATATTAAGAAAAGGAAAGGCTGGGTGTGGTGGAGCA
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CTCAGCAACGACAAGGAATTAACCAACTCAGTGAGACACTGTCTCTAAATAAAAAATACA
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CCACTCCCCCCCAAAAAAGGAAAAAAAGTAATGTGCAGTCTCCTGAAGTGGTAATAACAT
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GAAGTGATCCATCACAGGATCTCACTTTCTGTTATTTTGTTTTAAGAATGTTTTATGGCT
GGGCATGGTGGTGCATGTCTATAATCCCAGCAGTTTGGAGGCAAAGTGGAAGAATTACAA
GTTCAAGGCCAGCCTAAGCAACTTAGTGAAACCCTGTCTCAAGATAAAAAATAAGAAGGG
TTGGGGGAATGTAGTTCAGTGGTTAAGCACCTCTGGGTTTAAAGGAGTGTTTTGTGATAG
TACTTGTATAATCCTTTGGGGTTGGCTTTTTTCACTCATCTGGTTTTCTGGAGATCCATC
ATGTTGGGCTTATCAGTAGTTCATACTCTTATGGCTGACTACTGACCAACTGTACTTTAG
TGTGGATATACCATAGTTAGATTAACTGTTCACTCACTAAAGAACATCTGGTTTATTCTC
AGTTATTGGCTCTTGTAAATAAAGCTGATATAAATAAATATTCATGTACAGGAAAAGGAA
AGGTAATGATCGTTAATTGTCACATTTTTATATTTTCCTTTTAATTACCTTATTTGTCAG
AAATTTTCAACTTTTTAAAATAAATTATGCACTTTGAACATTTATTGCATTGTACACTTT
TGTATATTTTTCTGTAAGATGTTATATTTCAATAAAATATTTACTTAAAAATAATATTTT
CTCTTCCCCTCCGGGGTTTATTTAAGGTTGGATTCAGATGCCGAGGCCACAGTACTTCCT
CAGAAAGAAGACAGAATTTGCAAAAGAGACAAGATAATAAGCATTTAAACTCTAGTCAGT
CCCATAGAAGTGACCCAAATTCTGAGTCTTTATATTTTGAGGTATTTTTTTCCAAAATCT
ATACATAAACTGTTATAGAAAATTTCTCATTAAGAAATTAATTTGTTGTACTGTAAATAT
TTCTTAGCATGTGACTCTACTATTAGATAGTAAATAATCCAGAAATATTGACTCATTTTT
ATTTGCCTTGATTAGATATATTTAGTCTACATTAACTTCATTAATGATTATTTTATAAAT
TTTTGTCATGTGTGTTCATTTTGAGATGGTATATTAAAGTAGAACTTGATTTCATGTGGA
TTTCATCCAGTATGAAACTTTTTCTCAAAATTTTTTGTTGTTGTTGTTCAGTCCATTTGT
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TTAGAGAAGGAAGAAAAATATACTCTGTAGTACTACTAGTACATGGCAACCTTCCTATGG
AGAGTGTCCATCCACCTAGTAGAATGCAGAAATATAAACACCTAATACTTGGTTGAGTGT
GGTTGGAGTTGAAAGTAGCCACAAGTCACTTTGGGTTTTAGGCAGGATAGGAATAACATT
TGAAATGGATTTTAAGGAATCAGTATAATTTGCTTAAGTCATACATCCCTGATAATCCAT
TTATATAACTCATTTTGGTTGGATCATAGATTCTATAAAATAGGCTAATAGATGGAGATT
AAACTGGAATTCTTGAGGTTAAAGGATAAAAATGAAAAATATGATATATAAGCTTAAGTA
ATTTCCCCAAAGTACTTGAGAGTACATCTCAATTATTCTATGAAAAATAATTTTAGTGTC
TACAAATATGGCAATTTTAAAATATGCACTTAACTATGATTGGTTGCATTCTTATATTTA
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AAAAGATGATATTGGTTAAGAATTAATTTGAGTAGAAAAATTTAAAAATTTTAAGCTTTT
AATCTTGTAGTTGTGTATGTGGGATAGAGAATATATTAATAAAATGCATCTTTTCCAAAT
GATCTGAATGTGATAAAATCCAATTTAATATTTTTTCAATTACCTACCTGTTTGGGATAC
CTATAATTACTAATTTATAATTAGTAATCAAAATGGAAAATAAGTGCAGAAATCCAAGGA
TGAACATAATGTGGCTATGCTCCCATGCTTTAATAATTCATTTGGGTGGGATTTAGCATG
TACAAAATGAGATTTCCTTTTTAAGGCTGATTTTAATTAGTTCAATAGTACAATACAGAA
AATTATTTCCCCATTTTTCATTACTCTTAGCCATTATAAAAAGTTTTTTTTTTAAGAGTT
TGCCCTCAATTGTTTTTATTAAAAATGTGAAATTATTTTAGGATGAAGATGGATTTCAAG
AACTACATGAAAATGGAAATGCAAAGGATGAGAATATTCAACAGAAACTTTCTTCAAAAG
TGGTAAGCGATTCTTTTTAGAAACATAAGCAAATAGACTATCTTTTAAACCATGGCTATG
TGAAAAGAATAATATATTAAAGGTAGATATAAGGAGAAATGGGCAGAGTAGTATACAGAA
AACAGTATGTTTAGTATTTAACTTGAATGTTTCTTTTTGTATTTTGTTTTGTTTTTGGTA
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