SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001198_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein O (SelO)
SpeciesIctidomys tridecemlineatus (Squirrel)
Transcript IDSPT00001198
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001102_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001198_2.0 # Transcript # Selenoprotein O (SelO) # Squirrel (Ictidomys tridecemlineatus) # Full length # Forward
TTTGGGATGTGGGCAGATCAGCTTGGAGATGGAAGAGCTCACCTTATTGGAACTTATACG
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TTTTTAATGTTACCAGTTAAATTCAGTTGTAATCTAATTTTGTTTCATCTCTGGAAAACA
TGGCATTCCTGTAACCTTTTATATTCTGGGTAATTTGATAGAGTTAAAATAAAAAGGTTA
TTATTTTAATATTGTTTTTTTCAGAATTTTCTGTTGTTGTTTTAGGTGTTTGTAATACTG
ATAACTTCAGTTTGTTATCCATTACAATTGACTATGGTCCATTTGGTTTTATGGAGGCCT
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Chart Advanced