SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001205_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U1 (SelU1)
SpeciesIctidomys tridecemlineatus (Squirrel)
Transcript IDSPT00001205
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001109_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001205_2.0 # Transcript # Selenoprotein U1 (SelU1) # Squirrel (Ictidomys tridecemlineatus) # Full length # Forward
GAGATGTCTTTCCTCCAGGACCCAAGTGTCTTCACCATGGGAATGTGGTCCATTGGTGCA
GGAGCCCTGGGGGCTGCTGCTTTGGCACTGTTCCTGGCCAACACAGACATGTTTCTGTCC
AAGCCCAAGAAAGCAGCACTGGAGTATCTGGAAGATATAGACCTGAAAACACTGGAGAAG
GGTAAGTAGTCACCCTGCTGTTCTCAGTACTTTTCCAAGGTACTGGCATGCAGGCTTGCT
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GGAGGTGGACAGTAGCCAAAGCCCACTTGGGTTCCCCCATCACACAGGTGGACCTTAATA
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TCTAGGCTGGTCCTTGCCCAGGGGCATGACATTAAAATTTATAGCAAGTGTTGTTTTCTT
TCTGTAGAAAGACAGGGTTAGTCTACATGGTTGGATCTTATCATCAATATTGATAATTGC
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TGGCATACCTGCCGGCCTTTTCTTGCCTAGTGATGACTCACCTGATGCTCACAGGCTGGC
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CAGTTTTTTGCCACCATGGCTGGCAATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGTCTGAGT
TCTTAGGTGTAATGGGTTAAATAACTTAAGCTCAGTAACATACCTCTATAATCTCAGATA
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GGATTTTACAAGGCCTTGGATTCAATCACTAATGCCCTCTGTCCTCCCAAAAAACTTTTT
TTTTTTTAACCACTTCTTTAGGATTACTTTGGGATATCCTGGTCTTAGTGCATTTTGTTT
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TGCTGAAGACCTGCTGAAGTCTGCTGTCTGAGTTCCACTCTGTCGGGTTTTTCTTTTATC
TTCATTCAGTTCTCTTCAGCTGCTATGTTCTTTTGCCGCCTCTCTGTCTATGAACACCTG
AGTTACCCTCTCTGCTTTATCCCTTTATCATAATTAGCAGCTCCTGGCTTCATGATCCCA
AAGTGTTCCTTGCATACTCCAAATCATGTGATGTGGCCTTTCTGAGTCACCTTCCCCCAA
AGTCTGAATTCCTCCAGGGCAGATGCCAGGCCTTATTGGGATCCATGTTCCTTGAGCACA
AGGCTTGGTGTACAGCTGGTGCTCCACGTCTGTCTCATGAATGAATGACTTAGAATGAGG
ATTGATATTCCCTCTCATTTCCTTTTTAGGGCATTCTTCTTGAGCACCGAGAAAAAGAAT
TTGGAGACAAAGTAAACCCACTTTCTGTTCTGGAAGCTGCTAAGAAAATCAAATCACAGG
TTCCAGCCTCAGAGAAAAAA
Chart Advanced