SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001206_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U2 (SelU2)
SpeciesIctidomys tridecemlineatus (Squirrel)
Transcript IDSPT00001206
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001110_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001206_2.0 # Transcript # Selenoprotein U2 (SelU2) # Squirrel (Ictidomys tridecemlineatus) # Full length # Forward
TTGCTGTGTTGGTTTCAGCATTTCCTGTGTTACACCTGCAAAGAATACGTGGAGGACCTG
GCCAAAGTCCCCGAGCGACTCCTACAAGTAAGTTTCCCGACAGTGGGGGCACAGTGTCCT
GCCTCAGGACGAGTGAGTGGCGCCTGTCGTTCATAACCGGCGGCGTGAAGTGTGGAGGGT
GCATGACCTGCATCCCCAAATCTTCCATTTCCTCCCATTTCTCCAACCCCTCAAAAAAGG
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ACAGATGCCAATTTGTATTTGTTAATAGACTGCAAGTTTCACTACTCTGTTTTTAAGCTT
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GGCCCTGAGCAACTCAGCAAATTTTTAGACTAGTATTCTTAAGTTTCCTAGGCTGTCCTC
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TTATTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTTTTTCCCAAGAGCTGGGGATCCAACCCAGGCCTCACCCATGCTAGTCAGTACTCTGC
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GTTTATTGTTTCTCCCAAACTGTAGGCTTTCTCTTCACTCTAATTATTTCCTTTGCTGTG
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AGGAGGCAGGAGGATCATAAGTTCAAAGCCAGCCTCTGCAATTTAATGAGGCTCTGAGCA
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GTTAAGCACTCCTGGGTTTAGTCCCCAGTACCAAATAAAATAAAGTTTCAGGTGTAAAAA
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TTTCTCATTTGTTCTTATAAAAACTCCAACTATTCTCTCTTCAGCCTTTTTGCAAACTGA
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GTCAGGCTGCTGCTTATGATTCTGGTAAATGATCCAGCTATCCCACACTGAAAGACTTGT
TCTCTGAACGTAATGATGTTTTAGCATTCTGTTGCTATGACAAAATTCCTGAGATAATCA
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GTTGGCTACATTGCTTTTGGACCTGTGTTGAGGTGGCACATCATGGCAGGGAGCATGCAC
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TGCGCTGAGGAGCCAGGTGGCACTGTGCAGCTAGTTGAAGATTGTCATAGCTCCACATTC
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TGTGTGCTTTGGATAGGAATAACTCAGTTTCTGAAATGCAGAATAAGGCAACTCAGACTC
ATGAGCCACAAATACTATATTTTGAGCTCTTGTCTCTGACACCCGCTGTGGTAGATGCTC
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TGTGGTAGAGAAGTGTGTGCTGGGGGCCCGCCTCAGCATCACGAGAGCAAAGGGATCTGG
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GGCGAGCAGGTGCTCAGGACACAGATACATGTGCAGGTACACAGAGGCAGGACTGGAGAA
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TTTTCTTAATTTTATTTATGTATTTGTTTGTTTGTTTGTTTATTTATTTATTTAGTAAGT
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TTTTATTACAGACAGAGTCTCACTGAGTTGCTTAGGACCTCACTAAGTTGCTGAGGCTCA
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ACTGGGGACTAGCCCAGGGGCACTCTATCACTGAGCTATGTCCCTAGCCCTTTTCTGTAT
TTTATTTTGAGACAGGCTGGCCTTGAATTTTTGATCCTTCTACCTCAGCCTCCCCAGCAG
CTGGAATTACAGGTGTGCACCACCATACCCAGCTCACTAGTGATTTTAAAGAAAGCAGCC
TAAGCTGGACGTGGCAGTGCACACCTGTGGTCCCAGTCGCTGAGGAAGCTGAGGCAGGAG
GGTCAAAGTTTGAGACTAGGGCTGGGGATGTGGCTCAAGCGGTAGTGCGCTCGCCTGGCA
TGCGTGCGGCCGGGGTTCGATCCTCAGCACCACATACAAACAAAGATGTTATGTCCGACG
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GAACCCCTGGGTTCAATCTCCAGTGCTGCAAAAAGAAGAGGAGGACAGAAGTAAGAAGGG
AAAAAACAGACTTTATTAAAACTGAGGATGAGCTAGCTTAAGCTTGCGCTTGATCTGACC
TTCCCCTGCCTCTACCTCCCTCCCTCTGTCCTGCCCCCACCCCCAGCCCTGCAGTGGAGG
AGATGGCAGCAGATCTGCCGGAAAGGGCAGACTGTGGCCCTTTCCTCCTGGCACACTATT
TTCACGTGCTGTGACGGAGTCTCAGCATGTGTAAGGTCTGCTTATCATTTAGCACTTTAG
ATATAAACTGTGAGTTTCACTTTAGTAGCACCTCATCCATTGCCACAATAAAGGTATGGA
GTTGCAAAGAAAATAGATGAATTCTAAACCAAATGCATGCTTCTAATTATGAGAAGGTAT
GTTCAAATCTTTTAATGTGCTTTAACTTAAATATACTTTATATAATATGTATAGTTATAA
AGCTTACACTGTAAATATTATATAAACCACTATATTATAGATTTTATGAAATTATATAAT
ATGCATGTGGGGGGTACTAGGGATCAATTCTAAGGGTGCCCTACCACTGATCTACAGTCT
TTTTGGGGGGGAGCTGGGTCTTGCTAAATTAGTTGCCCACACTGGCCTTGAATTTGGCCA
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TTTTTAAAAGCTTGAACCTGTATAAAGTATAAAGCATAAATATCAGAATTGTCCTCAGAG
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TAAATTGTTTTAATGTCAAAAAACAAGAGTTTTACACACAAGAACTAAATTCAAACTAGC
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ATTGAATTTCTATCGACATGAGATCATCTGGACTTCTGAACATTTATTTTAGATATAGAA
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TCGTGGTAAGATGATGTCACAGTGTAAACATGGAAGAAATCAAACAGCTGGAAGAAGCTG
GGAAATAATATGAATCTGGAACTATCAGGAAGCAGTGGGTCCAGAGCTGCATGATCAACG
TGATATTATTCTCCTATATTTTGGTTTTCATCCACAGTTCCTGGCTCATAGCTGCCTTAA
GGCAGGTCATACGAACCAAAAATATACTCTAACCTCCCCAACCGTGCTGTGTTGGAGCTG
GCCATAAAGAAGTTCTCTTTTCTACCTGACCTGATAGTAGATCATGAGACCCCATTTGGG
AAGGGGTCCTGCCCAGAAGGAAGGCTGCACAGAGTCTGGGAAGAATCTGGACAGGCCGTG
CTGGCTCCCCTCCCCTGCCTGTCAGCACCAGATCCAGCCCTCTGCAGAGTTGCCCGTACT
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ACACGTGCAGGTTTCTAGAGGGTAGGGTGTGCAGAGGCCCAGGAGGCTCTGTGTACCCTC
CCCTGTACCCGCCCTGGCCATCTCTTCATCTGTGTCCCCTGTGGCATCTTTTATGACAAA
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TGAGGAGGGCCCAGGGGAACCTTGGTTTGTAGCCAGGCAGTCACAGCTCAGGGCGAACGG
TCGGGGACAGACTGGCATCTGAATTGGCCCCTGTCTCGGGAACTGCACCCTCGGCCTGGG
GACCTGATGCTGTCTCCCTCAGAGAGTGTCAGGGTTGCATTGCATTGGAGGACCCCCCCC
CCCCGTGGTTGGTGCAGGCTGGCTCCCCTGGAGTGTGGGAGAAGCTCTGCCAGTGGGCAG
CAGAAGTGGACTGAGCTGTGAGAGGCCAGAGAGAGCCGAGGTCAAGTCTGAGTTCGTTTT
TCCTACTCAGTTGTCAGTGAAAAGCTAAAGGCGAGACAGAAAAGAGACCCCAGGAAAGTC
CGTTGTGGGAGTAGCACAGGCTCTGTGGGGAGGGGACGTCAGTGGACGGCGGAGGAGGAG
CGGAGGGCAGCTGCCTCTCGGCCTCTCCAGGCCTGGCGCTGCAGGCTGTCCCCCTTTGAA
CTCTGAGGCGGGGCATTCCCTTCCAGGCCTACTCTGAGGAGAGCAGCCCTGGGGCCAGCC
CCTCCCAGCTCCTGCTCTGTCCTTGCCCCCAAGCCTCACCCCAGGGAGGGGACAAGGAAG
CCGCCTTTGGGCTTCTCAAGAGCTGGGGTCCCAGGCGAGCTTCTCACCCACTGGTTAGAA
CAGAGTCTAACCAGCTGTGAGGACGCTGGGCTACAGCCCAGAGAGAGGAACGGCTCTGTG
ACCGACATTTAACCACCGGCCAGTGTGCCCAGAACAGGGCCGGAGCAGCCACTAGTGGGT
GAGACTGAAGAGCAGAGTGGGAGTCGGGTGGCAGCTCTGCCCGCTGCAAACGCCTCCGTG
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GAAAGTGACCTGGGTGTCTGTCATCACCTTTTGAGAGCAGCCGTTCTCACCAAGGACATT
ATCCCCCTGCTAAGGGGGCATTTGGCATTTTCTGGAGACACAGTCGGTTGTTGCAGCTTG
GCAAGCAGTGCCAAGAGCGCGCTGGGTGTCGACCCAGGGTGCTGCTGAGACCCGACCCCA
CGCAGACAAAGGATCATCTGGGCCAGAATGTCCATACGGAAGCCGTTTTTTGAAGAAAAG
GAAAAAGGGCAAATGAGATACGAAGTGAGATGTGACATAAGAAAGCGAATGTCTTGTAGA
AATGCCAGCATCGTCTCCTTAACATTTAACGGTGTGTGTAATGACCCCATCTAAAGACAC
TCTTAACGTTCCAGGACAGAGCCCCCACGTCAAGTCAAATCTGCTCTCAGGAAGCCTTCG
GAGCCTGTGGCGGGCAGTGACTGGCCCTCTTTTTGACTTCCAAGGAGACCCAGCCCAGCA
AGGCGGGACCCTCATTGTAGGTCCAGGTGAGCTTGAAAGCCCAGATCAGCTGTGTGCACT
TCCTGTGCCTCTTACATGTCCCAAGGCCACCTGTTCTCTCTGTAAAGCAGACAGCATATA
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AGAGGCTTCTATTCTTTGGCATCTGTGTGTTTGATGAGTGTGCCTGTCATTCCACGCCCC
AGGGACTGCAGGGCTCGGGACAGGGGAAGCAGCTGTGAGATGCTGATTTGTTTATGGCTA
TTTCACACTTTAAAAAGCTCAGCAGAGGCCAGGAGTGTAGCTCAGTGAGAGCATGTGCTT
AGCGTGTGTTCAGCACCCACCACAAAAGAAAAGAAATAGCTCATTGGAGGTGAATGTTTC
TGAACAGGAGGAAATCCTTAACACTTTCTGTCAGTGAAAAACTCTGTCTAGTCATTTATA
GCTAACGAAACTGCAGGACTTGCAGTGTTCGAAAGCAGGTCTGTGCAGGGCAGCTCATTT
AGTTAGAGCTACTGTAAGCCGGGCACGGTGGCACCTGGTGTGCGCGCCTAATAATCCCAG
CGGCCTGGGAGGCTGAGCAGGAGAATCACAAGTTCAAAGTCAGCCTTAGCAACTTAGGAA
GGCCCTAAGCAACTTAGTGAGACCCTGTCTCAAAATAAACGGGGCTGGGGATGTGGCTCA
GTGGTTAATTGCCCCTGGGTTCAATCCCTAGTACCATAAATAGATAAATAACGTAGCCTT
CATAAGTCACAGACTTTTAATGACTTTATTTTTTTAAATACTTTTTAGTTGTCAATGGAC
CTTTATTTTATTTATTCATATGCGGTGCTGAGTTTTGAGTCCAAGAATCAAAGTGAACAG
AACCTAGACTATAACTTGCAGCTTACTTGAGCAGATAATAAGGATTGTGGACCTCTGAGT
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AGGAGCACTTTACCACTGAGCCACATCCTTAGCCCCTTTATTTTTTATTCTGAGACAGGG
TCTTGTTAAGTTGCTTAGGACCTCCTTAAGTTGCTGAACTGGCTTTGAACTTAAGATCCT
CCTGCCTTAGCCTCCCGAGTTGATGGGATGTCAGGCGACTACCAATGCACCCAGCTTGTA
ACAGATGGCCTTATGCCTTATTTTTAAACCTGTTTTGGGCCTTGTTTATAAAACAGATAG
CCTATTAATCATTATTTGGGCATGGATTTTTAGAAGTGATTTGTTTCATTATTACATATA
TTCAAGAAACAGATGTGATTTCCAGCTTGGTATCTATGTTCAGTATTCTGCCTGTGTGAC
AGGACATTTTATTTAATTATATTCAATAAAACCTAATAGGTTATAATTAAAGAATCTTTC
TCCTTGGATCTCATAAAACCACTCTTATTTAACCATAATTCTTGTCCTGCTTTATTGCTA
TAATTAAAAAGTATTATGGCATTGTACAGAGAATATAATGTACTCTAGGTGATTAATTTT
CCCCTTTGGACTAATTAAAAGTTGAAGCCCTTTCTTGATTCTAGTAAGAAATAAAATAAA
TAATAGTTAACATTCAAACCTCAGCTTTTGTTCTTATTTTCTTCTAGGTAACAACATCCA
TTTTATGCACCGTGATAGGAATAGGTTGGATCACAAACCCATAAACTCTGTCTTACAGCT
TGTAGGAGTTCCGCATGTGAACTTCACAAGCAGACCTTCCGTCATCCACGTGTGA
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