SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001240_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein L (SelL)
SpeciesLatimeria chalumnae (Coelacanth)
Transcript IDSPT00001240
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001144_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001240_2.0 # Transcript # Selenoprotein L (SelL) # Coelacanth (Latimeria chalumnae) # Full length # Forward
TCTGATGTCCGCGATTGTGTTGATGACTTGCTGCAGTTTGAGGTAAATTGATTTTTGGCT
TTGAGTTGTCTATGTGGTGTCTGTCTGCATTCTGTTGTCAGATCTTCTTACTATCACCTG
CAAGGCTGCATCCTTTTCTTGCCCCACAGAATCCTGAGGCCCTGATGTGTGCTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTCTTTCCCCTACCAGTATTGATTACTATAGCTCTGGTTACTGGACT
CTCTAATATCTCCAAACTGCAAAGGATTAAGAACTTAGGTACCAGAATTTTGACCTGAAT
CAAATCTACTCAACATATCACTGTTATCTTTGCAACACTTTGTTGGTATCAGTAAAGTGC
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TGCAGGTCCCTTCTGGGAAACAGCTATCCAAGGCCTGGGCAGCAAGAGGTCTGGGGCTTT
ACCCTCACACTTCTATGAAGGCCCGTCCCTGGCCCCCCCTCTGTGTGGTGGCTCTTCTCC
AGCACCAGCCATATGTTGGGGAGCAACCTGGCAGGGCTTCGCCACTCTGCCTGTGCTGCT
CCTCAATCCAACAGCAGGTCACGTCAAGATCAAACTCCGATCTCCCACATAGGCAGCGCA
TTGTGCTGCCTGCCGTGCCACTGTGCAGGAATGATTTTAAAAGTACTTTCTTTTTTTCAT
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CTATATGATATCTTTGTTTTTATTAAGTGCCCTGTATTTTAACCTTTTTCTCTTCCCTTT
TTCTTTTGCTCTGTTTTCCTTTTTATTTTTTATTTATATGGATATGATTTTCCTGATCCA
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GGGGGAAATGGGAAAGGGGAAAAAAACAAACAAACTTATAAATGTTTTATGTGGTTTGGC
TACAGCGTAACTTGTTGAGTGGATTTCTCCATACTGTCTTGGACATGTGCTTCATTCTGC
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TTATTTATTTATTTTTGGCTCACATATGCTGTAGATCTGAAACCTCTCTTTGACCTTGCT
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CTCAGTCAGAAATAAAGAAACTATACAGAGATAGCATGCCAAAAGAACAACAAAATTCCT
ATCATAAAAAGGCTAATTGCTTCTTAAGTTATCCTAAATTTTTGAGAAAATTCTAACAGT
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ATCTTCAATTTACTGTGATCCTCCCAGATGGCGAACAGTTCCATGGAGACAAGTTGTCTT
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CCTAACGTGCTCACGGGTGGGAGCTGCTGTGTAACAGCCTGATGTGAGAACCCTGCTTGA
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GGGCTACTGGGCCAGCTGTCCATTGAATATTTTTTATAGAATTTCATTATGGATGCCTTA
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TGTTTTTTTAAACCTTTGTTCAGTGTGCTTCAATGGTGTACTGTACATTTCATGTCATTA
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GTTTCCAGTGCAAACCCTGGTCAGCAGCCTGAGGACATTAAACGGGAAAAATCCTGTTTT
TGTTTTTTTTTCTCTTGAAGCTTCCCCTTGCCACATATAGTAGGTAGAGGTTCACCTCAC
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ATGGTAGCAGTTATGAGAAAAATGTGTCAAAATTACTTAGAAGTTAAGATTTATTTGTGG
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AACCTTTATGAAAACATGAATGATAATGTACCATATGTGCAGTTCTCTCACAGTTGCTGA
AAACAACTACTTCAGCAGCTGGGAGTGAGGGAAGACACATGCAATTATTTGGCATGCAAA
GCTATGTTTGTTTTTTTGCTTAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGGGACCAATAC
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GGGTGGCAGTAGGTGTCTGGATCTGCATCAGATCTAACCTGCCCATTTCTGTTCATTGTC
TTCCTGATCTGTTTACATCCTTTCAACATGAATGATTTTTGTTCATTGAGAGGTCTGTGC
TGGGTTTAATCCTTGAACCCCACAAGTAAATTACAAGTAATAAACCCATGACTGTGCCAT
CACTTAGTCCCCAAAAATGGTGATGTACAGTTTCCATAAATTGTGAGATAAGTGCATCGT
GCCTTTTTTTCTTTTCCTTTTTCACAAGAAATATAAAAAATTCTTTTGAAACAAGATTAT
GGGTAATTTTTTTTCCTGGTCTTTAATGTTTCATTTAGATCATATCAACATATTTGTTTA
AGTCAACAAATGAAAATATGGTAAACTGAATTTTATGCAAAATTGTTGCTTTAGCAGCAG
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TTGTATTGTTTTCTACTTCTGTTTTATTTTTTATATAATATATATAGTTATCAGTCAGGG
CGCAGGCCTCCCCATGACAATGCTATTGGGGGTCTTGGCCATACTCACCACACTGGCCAG
GCAGAATGGTGAGGGACTGCACCTGGGCTTCCTCAGTGGTCTCCCATCCAAGTACTGACC
AGGCCCGACTCTGCTTAGCTTCCGAGATCAGACACACCCAGGGCGGCGAGAAAGTCTCTC
TCTCTAAATAAAAATACAGTGTGTGTGTGTGTGTATAATATAAAATATTATGCATACACA
CATACAGTATTTATGGTTTCTTTCTTCAAATCAAGTCTTTATTTGTAGAGTGCTAAACAG
TGTAGCTTTCTGTTTCACCAGATCTATAAAGTTTGCAGATTACCTTGGAAAAGGCAAAAA
GCTGCTGCTTGTGTTGTTGAGACATTTTGCCTGACTGCCATGAAGAGATCATGTGGCACA
GCTTCAAGAAAATCAGGTATAGCCTGTTGAGCAGTATTCTTAATGTAGAAAAATATATAT
GTCTTTTAAGTGCTTTTTTGATGGGCTTTTTTCCTACCTCTTCAGAAACTCACTTTGTCA
CCTAACTACTTGCGGTGGTATAAAATTAGAGATGGGCCGACAGTAAATGCTTTGTCCATC
TGAAGTACTCATGGTTAGCTTAAATGTGTGCATTAAGCATGACTGTCTGATCTGCCTATT
CCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAACATTCTGGAGCTGGTATTAAAATTACCTTACTAAAGCA
GTGTTTATATTAACCTGACAAAGGATGATGTCAAGAAGCTCCAGCTGGATTGAACAGCCC
ATCTTTTAAATCCTTTTTGGTACCAAAATGGCTGATCAAAGGTTTGTTTGGGGTTTTTTA
TCACAGCAACAGTCAGAAACCACCAAAGCAAACTAAGAGATGATTAATAATGTTCTGCAC
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GTATGTTAACTATTAGATGAATTCTTTACTATCTCTAAAGTATAAAACCATTGCTAATTC
TGCAGTGCTGGTAATAATTTTAATAGATTTTCTAGACTCTTCTAGATGCTGTGCCTATAC
ATGTTGTAGTGGTATCATTTGGTTGTCAAGCAGGAGCTCTGCAGTGGCTTGAAGAAACCA
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GCCAGATTGGCCCACGGTGCCCTCAGGGTTAGGGAGGGAAAATCAGCCAGGATTCCTGCT
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CTTGAGCTCGATCCTGCTGTCCCCCAGGATCACGAGGATCATCAACACTGATGAGGCGTT
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CTTGTTTGTTATACCTGAGACACTTAGATTTTTCTTCCTTATTTCTGTGGACCTATTTAG
GGGGGAAAAAGGAAATTTGTTTTGAAAATTTTAGTTATGAATTTTCTAACTCCTTGAACT
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GGATGTATACTGTCAGGGGTTGTCCACCTGTCAACTTTGTAGGCTTTGTGGATGCACCTT
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TCAGAGCCTGCCAGTCCCAATTCAAACAGGAAACAAAAGGCTGTTTCCTTTTTCCTTTCT
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TTAGGAGTGGGCACATGATGGAGAGAGACCCTGATTAGGCCTGATTCAGCTGTGCACATG
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TTAAAACTACAAAACCCCCCAAATAAGGGAGCACGATGATTGGAAATGGTAAGTATTTAC
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CTTTAAACAGGCCAATCAGAATACCTGCATTTACTTTCACAGAACCAATCACAAAGCCTT
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TCTTGAGGGACTTTTAGTTTCTAAAACAACTTTCAGATTTTGATATTTTCTTTCTTTAAA
AATATCAACATATGTTTGGCTTATATGGGACATGTTCTGTGTCGTACTAGAACATTGCAA
AAAGGCAGCAGTAAACACCAATCAGATTGTGTGTATTGATTACTTGACCAGTAAACACAG
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ATGCAGTCAGATGAAGAAAAGATTGATCCATACTCAGAACTTTTATCAGGGCAGTACATC
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TAGTTCCTAGAGGACAGGCATCCACGTCACAATCAACACCCAGCAGCATAACCAGCACTA
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TGAGTATTAACAGTTTCGTTTTATATACTGTGCACTGTGACCTTGTTAAACGCATGGTCA
TGGTAACTTTATTAACAGGTTTATTCTTTTATTAGTTATTCATTTAAATGAATTTTATTG
CTTTGGTGTCTATGAAAAAAGCTGGAAGTAGATACAATGGAACCTTCTTACATGACTATG
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GCCTTCTGAGCCCCAAAATGCTTCCGCAAATTGTTTTTGTATGCGGAATCTTTCTTTTTC
TTTCTCCCCTCACTATTACAGTTGCCACAATTTGTTTCCCTTTCTACATAGATTTTACCC
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GCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCCTATGTAAATGGGTATTTAAGGC
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GGCAACTAACGCTGCCATTTCATTTTTTTAACACTAGAGCCCCATGACAGAGACAGTAAC
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GTGGGGCTGAGGAGGCATTTAATTTAATTTATGTATTACGGTGTACGTTTGAATAAGTTC
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CCCCTGGACACTGTCCTTTTTGCTAGGCAGTGGATAACAGTAAAGTGTTTTTTTTGTTGT
TGTTTTTTTAAAGAAGAGAAATGGACCATAAATTTGCAAACATGGTACAAAACCTCTAAT
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TACCTTACTGCTGTGCACTGCCCTAGTGCCAGTTCCTGTCACTCTTATGCTTTTTCCAAA
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TAGTGCAATGTCATAACCTACAAAACTTATCTCAGTATCAGCTTTCACCCTATTGCACCC
ATCTGAAAATTGGAAGTTTTTTTTTTTCCATAAGAAAAATATGGTCATGTGACACTATTT
TTTTTTTTCTTGGTGAGAGTCAAAACTGTTTTTAGTTTTAGAACCTTGAGAACTACTCCT
TTAACTTCAACACTTTTTTCCTTGGTTTTCATTTGTAAACATTTTCATACGTGCAAATGT
CGATGTAATTGTAGTTTTGCTCAGAATTTTCTTATGCAATGGAACTTCAACAATACACTC
AGTGTACTGCAGTACAAAAATGCCTGCAATATCCAGCCCTCATAACTAGTTATAAATGTT
TGCCTTCCTTGTTATATTTTTTTTTTTTTTTTGTCTTTTTAAGCTTGGTGGTGACTTTGG
TATTGATGACCATGGAAGAGTGATTTTTCTTCACCCAAGTAGTAGCCCCACTGACAGACC
GGAAGTGCCTGACATAGTAAAGGCCTTACAGCAGCAGTTTTCATAATACTGATGTTCTCA
TTTGTAAGTTAGAATTGTTATGCCTGTGATGTGATATGGTTACAAAGAAATCATTTCCCT
GGTGTGTAGCTTGAATAATGAAAGCAGCACATGAAATCAGTCTTTCTGAAAAGTGCTGCT
CGATAAACATTTAAAGCTCCGAG
Chart Advanced