SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001277_2.0
Identity
TranscriptSECIS binding protein 2 (SBP2)
SpeciesLoxodonta africana (Elephant)
Transcript IDSPT00001277
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001181_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001277_2.0 # Transcript # SECIS binding protein 2 (SBP2) # Elephant (Loxodonta africana) # Full length # Forward
AAGAATGTCAAACTGTCAGCTGAAGTAGAGCCATTTATTCCCCAGAAGAAGAATCCTGAT
ACAATTATGATCCCTATGACACTCCCAAATGAGAATGGAAGTGTTTCTGGTGTTGAACCA
ACTCCAATTCCCAGCTACCTGATTACTTGTTACCCATTTGTGCAGGAGAACCAGTCGAAT
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TGTTTGCTGGTGTCCTTACTGTTCCTTCACCTTGTTTGCTGGCGCCCTTACTGTTCCTTC
ACCTTGTTTGCTGGCGCCCCTACTGTTCCTTCACCTTGTTTGCTGGTGCCCTTACTGTTC
CTTCACCCTGTTTGCTGGTGCCCTTACTGTTCCTTCACCTTGCTTGCTGGTGCCCTTACT
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TACTGTTCCTTCACCTTGCTTGCTGGTGTCCTTACTCTTCTTCACCTTGCTTGCTGACGT
CCTTATTGTTCCTTCACCTTGCTTGCTGGTGTCCTTACTCTTCCTTCACCTTGCTTGCTG
GCGTCCTTACTCTTCCTTCACCTTGCTTGCCGGTGTCGTTACTGTTCCTTCACCTTGTTT
GCCGGCGTCTTTACTGTTCCTTCACCTTGTTTGCCAGCGTCCTTACTCTTCCTTCACCTT
GTTTGCTGGGGTCCTTCCTCTTCCTTCACCTTGTTTGCTGGTGTCCTTACTGTCCCTTTA
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GAGCAGGATTTGAGGTTTCCTCACTCCCTTAAAGTAGTGGAGCAATTCAGAAATCACAGG
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AAATACACGCTTGTGTATGATCCATGACCAAGAATTAGATGCCTTCAAAGGCACAATTGC
TTTTATCCTTCTGTAGCCTGTATTCAAATGAGGTCAGGGTTGAAATGAATAAGATAGCTT
GTACTTCCCTTCATTTGGGCTGTACCTTCTCTTTTGGCTGTCTTTTTTTTTAGTCAGTGT
CTTAGTCATCTAGTACTGCTATAACAGAAATACCACAAGTGGATGGCTTTAACAAAGAGA
AGTTTATTCTGTCACAGTTGAGTAGGTTACGAGTCCAAATTCAGGGTGTCAGCTCCAGGG
GAAGGTATTCTCTCTCTCTTGGCTCTGGAGGAAGGTCCTTGTCATCAGTCTTCCCTTGGT
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CTTTCTTAGTGGTATGAGGACCCCATGTCTCTCTGCTCGCTTCTCTCTCTTACATCTCAA
AAGAGATTAGCTTAAGACACTAATCAGTATAACAGCCACTAATCCATTTCATTACATCGT
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AATCCATGACAGTCAGTTTTACCCTTTTACAGTTAGTTGCATCTACTAGGAGCAGAGAAA
GAACCTGAGAATCAGTTAAATAATCTCTCCGATAGTACAGTCCTTGTGCTTTGTTAGGAC
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ATCAGTATTTTTATTCTTTAGCTTATTTTCAAATTCTTAAGATTAATTGGTAGCAATCAC
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CTTTGTATATCCAACAGATTGGCAAAAATTACCACGTAGAAGACACTAGCAAGTGTTTGG
TGAACATGTGGGTCAGTGGAAGCACTTGTATGGGAAACCTCTGCTGGGGTGTGAATTTCT
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AAGTCCCAGCAGTATATACCTCAGAGAAACTGTCACGTGTATACCATAGGTATTCATGTC
TACGCACAGAAATGCTCACAGCAGTATTGTTCTTCATGGTAAAGAAAAGAAAAGAGAAGT
CTCCTCAGTGGTACAAATAATGAATACATTATGGTATGTTCATACAAGTGAGGTATTTAT
TGGTGGTTCAATGGTATAATTCTCACTTTCCATATGAGAGAGCTGGGTTTGATTACTGGC
CATTATCCCTCATCACCCGTCTGTCAGTGGAGGCTTGCGTGTTGCTGTGATGCTAAACAG
GTTTTCAGTGGAGCTTTCAGACTAAGATGGACTAGGAAGAAAGGCCTGGTGACCTGCTTC
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AAAATTACATGATATATATTTTAGGAATAAGGAAATTTGGTGACTGTATAAGGAAGAGTT
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AGTTGTGGAGGAGGGCTCAGAGTGGACGTCACAGGATTGACAACACTCTTTCTTAAATGG
GTGACTGGTACGTGGGTATTCGCTTTACTATTTCAGTTATACAGATATTCTATTTTTGTA
ATGAAATACGTTGTAAGCCAACTTGTCAGAAACATATTACCTTTTAATGATCTTTTAAAA
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GCTTAATGATAGTTTAACAAGAATATATAAATTTGGTCATCACACTTCCTTGCCTTGTAG
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CCGCCTTGATTTCTTTATCCATCACCTGTGTCGGTATTATCTTTATGTCTTCTGCTAAAG
CTTAAGTATCTGTTTTCATTAACAATTCTTATAGTAGTAATAGCGTGGTTAAATAAAAGT
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GACTCTTATATGGAAAATAATTTTCTTTTTTGCTTCCTTTTTTTTAGCATGTGGAATCAT
CTATATGTTCAGGTACTTATTTTCTGCATAGTGTTTTTGCTTTACTTATTGCCTTTTTTT
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TTAGGGGGCAATCTTTTAGGTTTTGGCATCTCTTGTAAGTAGATCATATTTTTAAATCTC
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TTAGAATAAATTGTTAGCTATAATAATGGTATAGTGGTTATGAGCGATGATGTCCTTAGT
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TGAAATGGCTTAGCGACGAAGGAAGGAAGGAAACAGCAAAATGTTGAATGTAGGTGGTAG
GTATGTGGGTGTACATTCTACCATTTTTCCCACTTTTCTGTGTATTTAAATATTTCATAA
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TAAATTTTAAGATCATTGTAATGCCTTAAATATTGATTCTTTGAACTTCAGTATTGCGAC
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TCTGACCCAGGTGGCTGCTGCTTTCGCTGATGTGTCCAGACTGGGCAGCTCCCTGGCCTT
TGGGGAGCGTCTTAGTTACCTAAAAAAAATCACAGATGGGTGGTTTTAAAAGACAAGACT
TTATTTTCTCACAGTTCTGGAGGCTACAGAGTCTAAAGTAGGGCCCTCCCTTGCATAGTT
TCCTTCCTTTTTAGACATTTCTTGGATCTTTGGCTTGTAGACAGTCCTCACATGGTATCT
CTCTTCCCTTGAGTGTGTGTCTTGTGTGTTTGTGTGTGTCACTCCATCCGTCAGTCCTTT
TATAATCCACCCTACACTGTTATGACCTCATTAATGTAACAAAGCCCCCTATTTTCCAAA
CAGGTACCAAGCCAAAAACCAAACCCATTGCCTTCTAGTTGATTCTGACTCATAGCGATC
CTATAGGACAGAGTAGAACTGCCCTATAGGGTTTCCAAGGAGCGGCTGGTAGATTTGAAC
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GTACAGGGTTTAGGATTTCAGCACACATCTCGGGGCACAGGATTCGGTACATAACAGAAA
GCAGAGCCCTAGGTGCAGTGCAGGCAGAGAGAGGTGACGTGCAATAACTGTCTTCCTGCC
TTGGTTGTCTGTAAGATCAAGGAGTTCATGTGGTCAGTATTTTTTGAAATTATTGATTTA
TTTTGGTTGGAAATATATATAGCAAAGCATATAAACAATGTCTACATGTACAATTCAGTG
ACACTGGTTACAGTCTCCAAGTTGTGTAGTCATTCTCACTGTCCTTCGCCATATTATTGC
TCCACTTCCAGTACAGACTCACTGCCGCCTTAGCTTGGGGTTGCTGTTGTCAATTTAATG
GTCAGTATTTTCCGTTTTCATTTGTTATGATAGCCTTCCTTAATTCCTGAAATCTAGTTA
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ATGAAAAAAGGCCAAATACTGGCCTATTTCTTTGCTTTCCCAAAATGAAGTAGTTCAGAT
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GTTATTGCAAAAATGAATCATCGTTGTTTGTGGCAGGCTTGTGAGGCAGTCTAGCTTTAT
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ATATTTTTGTTTCATTTTAGACATACAGAATCTTTTTTTTTTTACTCTTAAGTCAAAATG
TTTTCCCCTTTGGCAGTTTATAATTTATTTTAAGGCTTTAAAAATCTGTTAGAAATCAAA
TAAATATCCACCTGTATTTTCTGCTATCTCTTTTATAGTATAGTGTTTCAGAACTTTTTT
TTTTTTTTTGAGGTTTATTTTGCTGAATGGTATAAGGATGTAGATTTTCAAAGTAGTTGA
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GTTGGCTAATTTCTTATGTCCTAGATGCTATTCGTTTTATTCCATTTTTCTGATTTTTGC
GCCTGTACCGTGCTCTTTTAATTACAGTGATTGTTTTTAAAAAACATCTGGAACTGTTTT
AACATTTCATAGAGCAGATCTTTTCTCTATCCTGTTGTAGCTTTAATTCTAAGCTGTGGA
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ATGAAAAAGCTTATTCGACTTCTGGCTCCCCTTGCCCTGACCTCTCCCCTGTACCTGTCC
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TTATAGGAACAGACTGCCACATCTTTCTCCTGTGGAGCGGCTGGTGAGTTTGAACTGCTG
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AGTATATTTTCACCCCCAGATACCCTTGTAACTCAGTACTGAAATCACTCCTGATGTTTA
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CCGGTGTCACAAAACAATATGTATATCAGTTGCTTGATGAGAAACTAATTTGCTTTGTGA
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TCTATTTCTTTTGTCTTTTGTACATTTTTGTCAGTGTGATCAAACTCTTATCAAATTCTT
AAAATTTCTAGGAGCCTTATGTGAGTTGAAAATATTTTGTCAGAATTTAATTTTTATTTT
GACATAGCTTGTTGTTAATTATTGCTGTGCAGTTTATTTTTTAAAATAACATTAAGAAGT
TTATAAGTCAGCTTTGTCAGTTGTGTTGTGTGTTTTGGTGCTTTGGATTCTTAAATCATG
GTTAGAAAAGACTTGCCTCTTCTCTAGGGTGAAAAAGGGGTTTGTCTGTGTTTTCTGGTC
TCTTACTGGTCTCTCTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTAAATCTTTAATACATTTCG
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TTAAATTAACCTGTCAGCTTAGGGAGAATTGACTTTATGATTTTGATTCTTCCTGTTCAA
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TAAAATTAATTTTGTGTTAATCATTTGAAAATCTTTGTATTTGAAACTGTAGCTTCTCTT
TTGTTCTGTATGCCCACTTTCTGTCAATAGCATTCTGAGGAGAACTGACAAAAAGTATTT
CGTCGTCACGAGGTTGTTGGTTCATTCCAGGAGGTAATTGGAATACTTGTGTATTTGCTC
CCGAGGAACTTTGTCGGGGCCTTTAGTGTTTGTAACAATGTTAATGCATATATAGTAACT
CCATTTTTCTTATGAATTCTGTTTTTTTCTTAAATAGCAAACATCATCAGACTTAAAATA
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TGTGAGAAGTTTTGACCTTTTAAAATAAGTTAAACACTTTATGAAAATTCATTGAATTGT
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TTTTTTTTTCTTCTCTGGGGTTTACTTAGGTTGGATTCAGATGTCGAGGGCATAGTACTT
CCTCAGAAAGAAGACAAAATTTGCAAAAGAGACAAGATAATAAACAGCTAAACCCCATTC
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TGTTTTTGAAATTTTATAGCAAATGTTCCTATTAAGAAATTTATGTCCCATTGCAAACAT
TATAAATACTTTTATGACTTTTACACATGACTCCATTATAGATTATAAATTACTCAGAAG
TATTGACTCATTTTTATTTGTCTTGGTTATATATATTTAGTCAAACATTAACTCAGTAAT
GTTTATATAGATTTTTGCCAAGTGTGTTCGTCATTTTGAGGTAACTTGTAGAGGTAGAAC
TTGATTTCCTGTGGACTTCACATAGTATAGAACTTTTTCTCTTAATGTTCATTGTTGTTT
TTGTTGTCTAGTCCATTTGTCCAGTTTTTGAGGCTTGAACATTTCAGTCTAATCAATTAG
TACTGCTGACCAGGAGGGCCCCAGAGAAGGAGAAGACTTGACTCTTTCCAGTAGGCAGTC
AGCTTGTATCCTGATTACAGTATTTCTGTTGTTAGTCATCTAACCAGCTCTTGTTGGAAG
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CATAGTCCTGGGGAGATTGCTGTGTAGTGGAGGAATATAGACATGTACATAGCTAATACT
TGATGGGCTGTGGTTGGAATTGAAAGGAGAGAAAAGTCGCTTTGGGTTTGGGGTGAGGCA
GTGCTAACATTTGGGGCGGATTAGAATTTGGCTGTGTCAGGCTAACATTTGAACACCTCA
TTTTGGTTGAATCATAGGTCTATAAAATGAGTGCATAGATCGTGATTAAACTGGAAAAGC
CTACGTGGGCCAGAGGTTGGAGATGAAGAATATGTTAGATGAGCTTAGCAGTTGGACCGA
TGGACTTGAGAGTGCGTCTCACTTACTCTGTCAAGAATAGCTTCAGTAGATCCAGACATG
TTAATTTTACTGTTTGCACTCAACTGTATGATTGGTTCTATACTTATATTTAGTTGAAGG
TACTAAGTATAACTTTCACTGTAAAGGAGGACATGGGTTAAGAAGTAAATTTCGTAAGAT
GTTTTTATTTAAACTTTTAACCCTGCTGACAGCTGTGTATAGTACTGTGGCACAGGGACC
GTGTTAATAAAATCCATATTAAGGCATGTGTTGAAAATCCTTTCTAAGTTATCTGACATG
TAGTCAAATTTGAAATTCTTTTCAATCATCTCAGGGCAGAATTATTAATAAAAATGGAGT
AGTAGGTGCAGAAATCCAAAGGATTGGCACGTGTGGTTATGCCCTCAGCCTTGAATAATT
ATATTGGCTATGTTTTAGCATATAAGAAATGACATTTCCTTTTTTAAAACTGACTTTAAA
AAATAGTCCATTGTGACTTAATGGTCTGACTGAGACGAGAAGGACCCTGGTGGTCATGGC
CCCCAGACCCTCCATTGGCCCAGGACAGGAACCATTCCTGAAGCCAACTCTTCAGACATG
GATTGGACTGGACAATGGGTTGGAGAGGGATGCTGGTGAGGAGTGAGCTTCTTGGATCTG
GTGGACACTTAAGACTATGTTGGCATCTCATGCCTGGAGGGGAGATGAGAAGGCAGAGGG
GGTTAGAAGCTGGCGAAATGGACACGAAAAGAGAGTGGAGGGAGAGAGCGGGCTGTCTCA
TCAGGGGGAGGGTAATTGGGAGTATGTAGCAAGGTGTATGTAAGTTTTTGTGTGAGAGTG
ACTTGATTTGTAAACTTTCACTTAAAGCACAATAAAAATTATGAAAAAAAAGTCCATTGT
TAAAATAAAAAAAAAATTGTTTCTAATTTTTAATTACTCTAAAGTATTATAAAAAGTAGT
TTTCTTAAAAGTTTATTGTATTCAACTCTGTTTTCACTTAAAATGTAAAACCCAATTTCA
GGATGAAGATGGGTTTCGAGAACTGAGTGAGAATGGAAATTCTAAAGACGAGAATATTCA
ACAGAAACTTTCTTCAAAAGTAGTAAGTGACTTAAAATAAAAGCAAAATGGAACATCTTT
TGAACTATGACTATGTTGCAAAGAAACATTAAAGGTAGGTGGGTACTAAACACACGTGGG
ACAGCATGGCATAGCAGAAACTGTTTAGTACTTACCTCTAATATTTCTTTTTAACATAGC
CAAGAACAAAGAAATTTTCCTGTGAATTCCACAGTTCCAGTAGTGTACCTAAGAAAATAC
CAATAATTAGGTGACATCATCCAGCACATAGTCCACACTGAGATTCCCCCAGTCGTTTTA
AGATTTTCCTTTGGAGCTTTTTTGGTTTTTTCAATCTAGGATCCAGGCAGGTACTACACA
TTATGTTAAGCTGTTGTGTCTCTTTATTATTTCCCAGCCTAGAATGGTCCACTGTCTCAC
TTTGTTCTTTATGACACTGAATCCTTTGTAGAGTCTAGGCCAGTTATCCTGTACTTGGAA
CATCCCACGTTTTGGACTGTCTTTCTTTATGATTGTTGTTGGTTGCTGTCAAGTTGATTC
CGACTCTTGGTGACTCCACATGTGCAAACTAGAATTGTTCCATAGGGTCTTCAAGGCTGT
GACCTTTTGGAAGCAGACTACCAGGCCTGTCTTCTGAGGCGTTTGAACTGCCAACCTTTC
AGCTAGCAGTCGAGTGCTTGACCATTTACACCACCCAGTTTCCAACAAAAATACCACATT
GGCGAATAATATCAGGCCATCTGCTGTTGGCGATGCCAAGTTTGATCGTTGGTCAGGAAG
TATATATTTACTTTAGTTTTTGAGTTATGCCAACAGATTCATGTAGATACACAGTATATA
TTAAAGCCCATCTCTTCTCTATCATGTATTTTTAATGTCTTGGTATTTTTTTGAGACTTA
CGGGATCACTAACAGATGTCTTTATTTGGTTGTCATAGTTGGATGATTTACCTGAAAACT
CACCAATCAGTATAGTTCAGACTCCAATTCCTATTACAACCTCTGTTCCCAAACGTGCAA
AGAGTCAGAAAAAGAAAGCTTTAGCAGCAGCCCTTGCTACAGCTCAAGAATATTCAGAAA
TAAGTATGGAGCAAAAAAAATTACAGGTATGTATGCTTTTGCCATAATGAATGTGATAGG
ATATTTGCCAAGCGTGAGGGGATGGACAAGGAGTGACAGGTGTCATCTTAAATTGCCACA
CCTTCGTACTAGAGTGAAAATAAATGTTTTCATGTTCCCATTGCAGGAAGCTTTATCAAA
GGCAGCTGGAAAAAAGAATAAAACACCTGTGCAGCTAGATTTGGGGGACATGTTGGCTGC
CCTGGAGAAACAACAGCAAGCGATGAAAGCACGGCAGATCACCAACACCAGACCTCTGTC
GTACACAGGTGATAGCGTTAGTCGAAGCAGGTTGCTCTTTTTGCTTCGTTAGTATGCTTC
GGTTTTGTATTGTTACTATAAAATTATTCCAGTTGTACACACACACATACTTAAGTCAAC
TTAGGCACAAGCCTTGCAATTGTGCATGTCCCTTCTCTCTCCTTGGACCCCATGTTAAGC
CTTGCAGCACATTGTGTCTGTTTTACCTTAAAAACATTCAGAATCTAACTACTCATGGGC
TCCTCTCCTGCCACTCGACCAGTCCCCGTCACTTTCCTCCACTGTAGTAGCCTCCTGTCT
ACTACCTGTCTTCCCCTCTCAGCACCCCAAGTCTATTTTAAAAGGAGTAATCTTTTTAAA
ATCCGAGCTGTTTCGTGCAGTCCACTGCTCAGAACTCTCCAGTGGCCCTTCCTCTCACAT
GGAGTAAAGCCGAAGTCCTGACTAAGGGCCTGCCTTACCTGACCCTGTCACCTTCCCACC
CTCATCACCGTCCCATCTCACACGAAGCTCTAGCCGTGTTAGCTCTTTGCTGTCCCTCAG
ACACACCCAGCATGCTGACTCAGTGCCTTTGTGCTTGCTGTTCTTTTCCTGGAATGCCCT
TTCCTCAGATACAGTAGAGTTTGTTCCCTCATGTCCTTCTCGCCTCTGCTTTAAATGTCA
GTTGGTATGCATTTTGAAGCAGTAACCTGGTTTTTTTTTTTTTCCCTTCATCAAAGGTTG
ACATAAAAATTACAAATAACTTGGCTCTCTAAACTATTAAATTATCCATTTTAAAACCAA
ATGGGAAACAGGAGTTTTGATCAAATCGTATGTCTGTGTGTAAGAGAAAATGATCTGGCT
TTTTGCTGTAACAGTAATTTCTATTTTAACAGACTGCATGAAATTCAGAGCTCAGCAGCT
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GGCACCAGTGAAAAGCACTGATGTCAAGAGGAAGAAGTGAATTTTCTGTTTCTTCTCTTC
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GGGGTTCATCTTTCGGCACTATATCAGACAATGTTCGGCTGCTCTTCATAAGGTTTTCAC
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CTTCCGGCATTACAGTAACACCAAGCCCCCACAGTATGACAAACTGACAGATGCGTGGGG
GAACTGAGCCCACAGGAGCTGACAACATAAAGATTATTAATTTAAAGTAATACTCATTAA
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GGGCGGAGTAAGATGGCGAAGTGAGTGGGCGCTCCCATTTTCTCCAAAAACAAAACAGAC
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GGGGAGAGGAGGAGCGGGGACAGCACAGAAGCTGGGAGAACCTACTCACTAACATCTGGA
GCACTCATCACTAGCCATTTTGGGACGGACTGGGCACACCCCGGACAGGATACAGAGTGA
GGGCACTAATCTGAGGAAGCAGTAGCCCAATTTTTGAAGATGGTGCAGATTGGCTGTGAA
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TTGAATCTTGGCTGAGGCCCGAGATGGATGAGCACCAGGACCAGGAGGAATTGATAGGGC
AGCAGGGCGAGGGGAATACTTTGGACTGAAGGACAACACACAGGGAAACAAAGGGAAATG
GCTGGCTCTCTGCCCACAGCAGAACACTGTGGAAGAGTTTGTGCAGGAGTGCCTGTGAGG
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