SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001294_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein S (SelS)
SpeciesLoxodonta africana (Elephant)
Transcript IDSPT00001294
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001198_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001294_2.0 # Transcript # Selenoprotein S (SelS) # Elephant (Loxodonta africana) # Full length # Forward
TCAGTGGGCTCCCTGCTGGCCACGTATGGCTGGTACCTCGTCCTCAGTGGTGTCCTTCTC
TTCGTGGTCATTCAGAAGCTTTCCGCCCGCCTGAGGGCCTTGAGGCAGAGGCACCTGGAC
CGAGCTGCGGCTGCTGTGGGTTAGTGCCTGGGAGCAGAAGGGAAGGCAGTGTTCTCGACA
CCTAATTCTCTTAATATTTAAAAGTTAGTCTGTTGTTAAGAATGAGAAGCACATCATTTT
ATGCTTCTGAAATTGATTTTTATTTTTTAATTTCAGAGATTTTGAGATAAAAAACCTGTC
TGATGGTGTGTAGAGCACTCACTGCATATCTTGAGTGTTTTTTTTTTTTTTATAAACCAA
AACCCTTGCTGTCAAGTCGGTGTCAACTCAGCAATGCTGTAGGACAGGGTAGAACTGCCC
CGTGAGGTTTCCAAGGAGCACCTGGTGGATTCACACTGTCGACATCTTGATTAGCAGCTG
TAGCTCTTAACCACTGTACACCAGGGCTCCTTTTCATTTACAGGAGGGATTAAAATGAAA
ACGTCACACTTTCTGTGCTGTGGTTCTGCCTAACTTGAGTTCTCTCTAGAACCAGTGTGA
GTCACAGGACACTCAGCCTTAGTTCTCTGTATCTTTCTCGTTTTCATTTTTGCTTACTCA
TCAGACCTGATTTCTAAATTATGTTTGGCTGTTTCAGAAAAACTCATTCTCTCTGAAAGG
GTGGCCTTTTCACTAAACAGAAGCTGCAGAAGGAAGTTAAATAGAAGTCTTCATTCATCT
TAGTCCCTGTGGCTGTTGAGGTTGGGTAGGAAAGCAAACGTCATAACACAAACATAGTCG
TTAATGGAAAGACTTAGAAAATCTGTTCACTCAGATATGCCCGTCTCCTCTCCCATGAGA
CCCGTGGTCTCTCCTGTCTGTGAGTCTTCGTTGGCTGTACATCCATCCAACAACGGACTG
CAGAGTACAGTTGTCTGTCTTGCACAGAATGCAGGGTTTTATGAAGCAGGTGACAGTGGG
GTTGGAGAACTGCTACAACCATCTCTCCAGATGAAGTTCTGGCAGAATAAGCTAACCTAC
CAACTGGAGAGGAACTTTGCAGTGATGATGATAGAGTGGGTGCTTCAAAAGAGAACTACT
GATTCAGAGAGGTTTTCAAAATCGATGAAGCCTTTGACTATTGCAAAAAATATACGTAGG
AAGCGCTGCAAAAAGTAAATTGTACTTTTGTTCAATTTTGTTCAAAAAATTAGGTTAAGA
AAAATCTATACTTGGTTGATTTTATTCTGAGAATGACCCAGTAGTTACACATGTTAACAA
AATTTTCATTTGTGTGATTTTCTTTTGTTTTTAAAGATAAAATTCCAGTCATCTCTACCA
CCACACACATACATGCATGTGCTACTTCGGTTGTGATATTTTGGCCCCTGTTTTATGTGG
ATGCAGTTAAGTGGCCTTTTTCCAGTACTAGTTGGTCTGCAAATAGTGACGATCTACTGA
TGTGATTATACAAGTTCTAGTTTGTTTTTTTGTTTAAAAAATTAGTCACAGTATAGTTGC
CCTTCCGAAACCAAACCCACTGCTGTTGAGTTGATTCTGACTCAGAGTCACCCTATAGGA
CAGGGTAGAACTGCCCCATAGGGTTTTCAAGACTGTAAATCTTTACAGAAGCAGACTGCC
ACATCTTTCTCCCATGGAGGGGGCTGGTGGGTTTGAACCACGGACCTTTCGGTTAGCAGC
CAAGTGCTTTAACCACTGTGCAGCCAGGGCTCCTCGGTTGCCCCTCAGTGGTCCTTAATA
AGGCAGTCAGAATGATGAACAGCTGGAGAGCTTTACAGGGATTTATAGTAATTCTGCTTG
GTTTTACAAACTAGATAAAAGAATAGGTGAATCTGGGGCACTCATTTTTATTCTTAGTCC
CAGCTAGAAAGATTTTTCTTCCTTCTCTATAGAAAAATGGATAAAATACCTAAGAGTCCT
TACCTTTTTCTGACATAGGTGTGGGCTGACTGAGTGATGGACAACTATCCAGAAAACTTT
CAATTGTTCTAAGTTGTTTTCTGGAGTTCTGGTCAGCCTAGAGTCTGTGGGTGTTAATGA
GGTATCTGGGCTGTGGGATGGAATCTCGGTGTGACCTTTAGGCTACTTACATTTCAGTCA
CGGGAGCCTTATCGCAGATTTTCTGTTGGACTCGCTTGGGAGGGACCCAGAAACCTGCAT
TTCTAAGGTGTTTCTGGTGACGCAGATGCTTAGCTAGGGCTAAGAACAATGGCCGTGGGA
TAGTCCTTTGCCCCTTTAAGTAGTGAAACATCCGCAGGAGGGTAGAAATGTTCGAGCAGA
ATCATCTATTTATCTTCATCATGCTTCTAATAAAAAGGACTCTCAACAATTTTTATTATT
ATACAAGGTGCTTTATCGGAATTTTTTCTGACATTTTAGAGCCTGATGTTATTGTTAAAC
AACAAGAAGCTTTAGCAGCTGCTCGTTTGAAAATGCAAGAAGAATTAAATGCACAAGCTG
AAAAGTATAAAGAAAAACTAAGACAGGTATGCACTGGTTTTAGTTTGGAGAAGTGGTCTT
AAGAAATAAAAGCTTAGTGGGTCAGAATATGTGTGTGTGTGCACCCCTGGTTAATTATAA
GATACTTGGACAAGGTCCTATCCCATAGATTCAACAAGTGTTTCAGTACCTACTGTGTAA
AATATTGGTGATACAAAGAAAAATATGCTGTCTTTAGGGAAGGATAGATGTATGAGTATA
ACACAATGAAAGGTGCAGAGCTGTATTTCACTCAGCAGGATTTTGCGTCTAGGTCTCCTG
CTACTAGACACCCAGAAGACACATTTGGCTTCTTGCTCCTTTGTCCATTTTAAGCTCTGT
GTCTCACCAAGACCTGGGCTATGAATTGGAAGAGAGAGTGGAGGGCGGTGATGGGTATAC
TATAAAAATAGAAATGGAAAGTAGCAGGTGGAGTTTGGAAAGTTTTCTTAAAAGGCGTGT
GGCTTGGCTGGGCAGGGGGATAGAGGAGGGGAGGAAGAGCCAAGGCTGCCTTTCAGGTGG
ACCTGAGAGATGTGCCTCCCTTCACTGGGGCCAGCTCACTCACCCACTGTGACCTGATCT
ATGTCACCCACAACCGCCAAGTGTAGACTCTGCTTTCAGGTTTCAATCTACGTGTGTCTG
CCCTCTCCTTTTTATTTTATTTTATTTTTTTTTTTGTGCTTTACGTGGAAGTTTACAGTT
CAAGTTAGTTTCTCATACAAGAGTTTATATGCATACTGTTACATAACCCTAGTTGCTATC
CCTTTAATGTGACAGGACACTCCCCCTTTCCACCCCGGATTTCCTGTGTCCATTCAGCCA
GCTCCTGTCCCTTCCTGCCTTCTCATCTCACCGCCAGACAGGAGCTGCCCATTTAGTCTC
CTGTATCTGCTTGAACTGAGAAGCACACTCTTCACAAGTATTGTTTTATGTTTTATAGTC
CAGTCTAATCTTTGTCTGAAGAGTTGGCTTGGGAATGGTTTTAGTTTTGGTTTAGCAGTC
TGGGGGCCATGTCTTCTGGGGTTCCTCAAGTCTCAGACCATTAAGTCTGGTCTTTCTATG
TGGATTTGAGTTCTGCGCCCACTCTCTGGCCCCTCTTCGTCACCCCTGAGGACGTCCTCT
GCCCCCTCTGAGGCAGCAGGAGGAGCTGGTCTACCTTTGTCTCGCGTGAGCCTCTGGGGC
TCCCTGGGCAACGCAGTGTCTCTCTGCCAGTCGCTTTGGTGGTTTCTGTGTCATCATCCT
CCCAGGCCGTTCCGCCCAGCTTGACCAGAGCCCACAGGAAACAGGGCACGGTGAGACCAC
ACTGACTCTCCTTGGTCACCCTGTTCCAACAGCCTTCCTCAGCTTTTGTGAATATTGGTT
TCCCATTGTCTTAGTTTTCTAGAGTCACTGTAGCACAAATACCACAGTGGATGGCTTTAA
AGCACAGAAATTTATTTCCTCACAGTTGAGGAGGCTCGAAGTCTGAATTCAGGGCACCAG
CTCTAGGGGAAGGATCTCTCTGTCAGCTCTGCGGGAAGGTCCTTATCTCTTTCTGCTTCT
GTAGCCCAGGCTTCCTCATTTCCTTGGTGATCTTCACGTGGCATTGATTCCTGCCCCCCC
ACCCCCACCCCATCCTGTCTCTGCTGCCCTTAGGACTCTGAAACTCTGAAGCGAGTAGGT
TTAGGGCACACCTTCCAGTGATAGGTGCCATTAACATAAGGAAGAACTGTATTCCCAGAG
GGAACAGGTATTGGGGTGCGTAGAATTGAAACACATATTTTGGGGAGACGGGGAGGGACC
AGTTCAATCCATAACACCCATCTTTCCCTGAAATGAAACCACTGACCCAAAATCTGAGGA
TAGTGGTGGTTCAGTGGTAGAAGTCTCGCTTTGCATGCAGGAGACCCTGGTTCGATTCCT
GGACAGCGTACCTCGTGTACAGCCACCGCCCATCTGGTTCAATTCCTGGACGGCGTACCT
CGTGTACAGCCGCCGCCCAGCTGGCGTGGGGCTTGCTGTCATGGCAGTGATGCTGAACGG
GTTTCAGCAGAGCTTCCAGACTAAGATGGACCCGGAGGAAAAGCCTGGTGACCTGCTTCT
GAAAACCAGCCAATGACAACCACATGGCTCACAGGGGTCTGATCTGCAGCTGGTCATGGC
TCAGAACCGGTATCATTTCCTTCCCTTGTGGCTGAGTCGGGGCTGACTCACTGTTAGCTA
ACAATAACATTAATTTAAAATCTGCTAGCACATTCCTATTGTTTATTTAACTTTTTAATA
ATGGACATGACAGAAAAAAACTTGGTATAAAACTCTGTACCATGAAAATTATCTGTGTCC
ACCTCCTCCCCACCCCCACTCCAAGCATCCCATATTAAGTTTCTTAGGTATTTTTTCCAT
ATGTATTTTATCCATAGATAAACATGCTTATACCCTTTTTGTACAAATGGCATCGTAATA
TACATATCATATGCCATTTCTGAGCCGTTCTGTTGTTGTTTTTCTCTTTGCTGATTTCCA
ATGCCTAATTATTGTTTTATTTCTAAAGTCATAGTAAGTTAAGTTTCTTTCATGTGTCAG
AGTTGAGTGACTTCAGGGTCTGAGTTTTTTTTGTATTAGTAAAATAGTGTAATCATTAAT
CAGCTTGCTTATTATGTAGCTGAAAACATCTTTTAAACAATCACTTTTTTTCCCAAATTT
TATTCATTTTGTTGTTGAGAATATACACAGCAAAACACACATCAGTTCAACAGTTTCTAC
ACGTACAATTTAGTGGCACTGATTACATTCTTCTAGTTGTGCAACTGTTCTCACCTTCCT
TTTCTGAGTTGTTCCTCCCTCGTTAGCATAAACTCACTGCCCTCCAAGTTTTCTATCTAG
TCTTTTCAGTTGCTATTGTCAATTTAACCCCATATAGATAGTTCTTAAAAGAGCAGTGCT
CAAGGCAGAACGTTTTTAATAGTTAAACTATTGTTCGGTTTTAAAATGACCTTGGAATAT
TTTTGGTTTAAGATTTAAAGACTGTCTCAGAGCAGTAGTGTCAGGGGTTTTTCCAGCCTC
CATGGCCCCAGAAAATCCAGAGTCCGTGAGAATTTGGAATTCTGTTCTACATTTTCCTTC
TTTTGATCAGGATTCTTCTATGGAAGCTTTGATCAAAATGATCAGTAATGGTAGCTGGGC
ACCACCCACTTGTGGTCTCATGGCAGAGGGGGCAGTTGTTCATGGAGGCAACTAGCCACA
CACCCATTTCCTCCTTCTATTTCTGACTCTCCTTTTTCCGCTGTTGCTCCAGGCGGATAG
AGGCCAACTCTTGTGCCTTGGAGGCCACTTAACTATGCAGCCAGCTAGGAGGTAGAACAG
AAGCATTGAACACGTGATTCGGCCAGTTAGATGGGATGTCCCATGAAACCACGACCCTAA
ACCTCCAAACCAAGGAACCAAATCCCATGAGGTGTTTGGTTGCACGTAAGCAGCCTCAGC
AGCTCCTCTCTTTTTTTGGCCATTGTTGTAAATACGTCTATCACACAGCTTCAGCCAGTT
CAGCTTTTTACAGGTGTACCGTTTATTGACATCAATTTAAGCCGTCACTTTTTAAGATTA
TGTGAGCCTCCTAAAATCGGGAGAGGGACGAAAAGCCTTTGTTCAGATTAGAAATGGTCC
AGCGCGTGTGGTTCTGTCTCATGTACTTATAAAAATAGTAATAATAAACGGATTAACTGG
AGTCTCCCTCACTCACGGTGAAATCAGGTCTCGTGTCTATGGTCTCAGAACTTGGCAGCT
GTGGTCTGTTCTGATGGTCTTCATGGTTAGCTAGAGTGTAGGACAGTCTTCATGTCCAGA
TGGTTCATCCTGGATCTCACTTGCTGGAAGACAGTGGAGGCATGAGGTGACAGGTATTTG
GGTTTGGCAGCGATGGACCCTGAAAGCCATTGAGGGATTTTCTAGATGTGTGCTCTTTAA
AGCATCTTCTCGCATATCCTTGTGACACCGTGGTTTAACTGGACCCAGAATGAACTGCAT
TTGGGGTTTGAATTCCATTGGAGACAGAAACGTAAGTGAACTGTGATTGGTGTTTGGTTG
CAGGGAGGAGCAGAAGCAAAGGACAGTGAACAGTGTTTCCTTCTTCTTGGCCATCTCTTC
AGTGTGTGATTACACGGTTTCTCCAGACCTCATGGTTGGACATGATTTTCTGCTGTTAGA
TTACTTTTCCTTTAATTTTCCACAGAACATGACTTTTGAAAGCACTTTCTGATCTGTTCT
TGTCTGATTGTCACAGCCCTGAGCAGCAGGGGTGTTCAGTAACTCCCCAGGTGGCACAGC
CAGGAATCCACAAGGGGGCCCCATAGCCATGCCCACTGGTTTCAAGGCAGAGTTGTTCTA
TATTACCAAAAATGTCTCTACGGGGAGAGTCCTAGCCTCTCTCCTGGGCTGACTTTTCAG
AAAAACCAAGTCTGTTCTTTCCATGATGCTTTTTTGCATCCGTTAAGAGTGTACAAAATA
AAGGTTCTGTTTGTGGTTAAGCTCACACCACTGGTTGGCAAGTGTTATTAACTGAGGAAG
GTGCAGGCAAACGTTTGTTTTGAAGGACATTTAAATTGTCCAAATTAGCATTTTCTTTGA
GGAAGATGACAGGCATATGAATTCATTGTTTACCATGTGCGATTCTTTCTCAGCTTGAGG
AAGAGAAGAGACGGCAGAAGATTGAAATGTGGGACAGCATGCAAGAAGGAAAAAGCTACA
GAGGAAACGCCAGAAAGCCTCAGGTGCCTGTGGACACAGTCCTGCTTGACAGCTTTCAAG
GAGATAAAGATTTTTTGAGTAGAGTGTTTTTAAATAGATTCTTAAGCCTGTGTGTGTTCC
CACAGGAAGAAGACAACCCTGGGCCTTCTACTTCATCAGTTCTCCCGAAACGTAAACCTG
ACAGAAGGCCGTTGCGGGGAGGCGGTACGTGCCAAATGACCCCTAATGTGAAAGGATTCT
GAACAGTCAGTTACGGGATATACTTTAGAAAACTAGGTTCTGTTTCATTGTTTTACCATC
TGTAAATCGAGACTAATTCCTACGTTTAGAACTGTGGCGATGAAGTAAAGGAAACTGGCA
TAAAGCATCTGCGAGGCACTCAGGCGATCCCTTGATGGTTGGGGTTGTACTTTCCTATTC
TCAATTGATCCCACAATGGCAAGTGAGTGGAGAAGTCAGTAGGATAAGGACAGTATGCCC
ATTTTGCAGCGGAGTGTCAAGAGGCCAGAACACAGTGTGTTGTGTCTTTTCAGTCCGGGC
TTTCTTATTTTCTGCGGACATCTTTCTCAAGGACACGTGGGCAAATGTTCCCTCTGAGCT
TTGTCTGTGTGCAGCCCCACCTAGGCCTCTCAGGTCATACGCCAGCAAGGCTGTCTTCAT
CCCATTAGGGAGGGTTTGTGAATCCCTTTGGAGAGATTGGTCACACACAAATGAAATAAA
TAATCCTTTATGATTTGAAGGAATCTTGGCCTTCAGTGCGGAGCTGTAATTCCCTTTGTG
TCGGAAAGCACGGCGGGCTTGCCGTAGGAGAATGAGGTGTCTGAAAGAAGCTGTGTTCTA
AAACCTTCCCTTGCTGGAAGTCTATTTTGAAAGCAGCCAGTGGTGAAACCTAGGAGAGGA
GTGCAGACCGTGGAAAGTGGAGCGCCTGCCAGGCGAATTGGCACAGCCTCTTTCAGTGTT
CCCCACAGTCTTGAGACAGGCTGGGACTCGCCTGGTTTTACAAATAAGGAAACTGAGGCA
CAGGGGGCTGCTGCCCAGAGTTCCGACAGCAAGTCAGAAGCAACCCTGGGCCTCATTTAA
GGTCTGGCTGACAAGAGCTTGAGCACTCGTCCAAGTCCCTAGATGCCCATTGACCGCTTT
GGGAAGCTTATGGCGGGGGTGAGGAGAAGGTAGATCGCCCAGTTAGGTCCTGCTGGAAGT
GGCAGGTCACATTCTGTTTGTTTTTTTTTTAATATTTTGTAGCTTGAACTGCCCTTATTT
AAATGTCTCTATTAAGCGCTGCAGTAGGAGCCCTCATGTACTTAAATTGGGCCATTTTCA
AAGGTTTTTGGTAAATTTTTTCCGTGTATATTTTTGTGTATTTTGAGAAGTTAGGACCAA
GAAGCTGAACAGCTTGTTTTCTTCCCACTGATGTCAATTTAGATTGCACTCGCTATATCA
AGTTTTTTTTTTCATATGGTGACTAAATGTTTTGTAAAAACTTCCTCGAACATAGAATCC
ATATCTTTGTAGTGCTTTGCATGTCGAGGTCCTAAGTTTATTTTTGATATAAAACATTCC
CAGGTTTTCACTGCAGATAAACGCTTTCTTTCTGTCGTCTCAGGTTACAACCCTCTGTCT
GGTGAAGGAGGTGGCACATGCTCCTGGAGGCCTGGGCGCCGAGGACCGTCGTCTGGCGGA
TGAGGCTAAGAGTCTTGTTAGTGTCGTCTGACATTAGCAAGATGAGCCTGAACCCGCGAG
TCAATTGCCTTACGCACGCTTTTCACAGTGACTAGCCCTGGAGAGCTGGGGGTTATTTCT
GTTCTTCCCTGTGTCTGCAGATTTAAGGGTTTAAGTCAGCAAAAGGTGTAGACAGCGCCG
CTGGGCGTTAGGCCAGTGGTCACAATCCACTTAATGATGATGACTGCCTCTGCCGATTTC
CAGGTGAATTGCTAGCTAGTATGTAAAGGCCTCCAGATGATGAACAATCTTGAGAAGAGA
GGCCGAGTGGTGATTTTCTACAGTAAAAATCCTTGCTGATGGAATAGTCTCTGTGACAGG
GTGCGTTGAATGATGTCTTCCTTATAAATGGTGAACCCACCAGTGAGGATTACTGATAAT
AGACAGTTGATG
Chart Advanced