SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001489_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesMicrocebus murinus (Mouse Lemur)
Transcript IDSPT00001489
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001393_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001489_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Mouse Lemur (Microcebus murinus) # Full length # Forward
TCTCTTGTTTTTAATCAGCTGGAACCATACATGGATGAGAACTTCATCTCCAGAGCCTTT
GCCACCATGGGGGAGACCGTGATGAGCGTCAAAATTATCCGAAACCGCCTCACTGGGTAT
GTCTCTCTTAGTTCTATCTTAATAGATCTTTCCACTGCTGTCATTCAGGAGGATGTAAAC
ATGGCAGAGTAAGGGCTTCTCACCACCTCCTAATAATTGTAATTATAATGTTATAAAAGC
TAACATTTTGAGGGCTTAATGAGTGGAAGTGTAGCATATTGCTTAAGGACAGGACTGGAG
CCAGAGTGGGTTTGAAAGCTGCGGTGAGAACTTGGGTAAGTTACTTAACCACTCTGTCTC
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GGATTAAATGAGTTAATTCACATTCAGCATGGGAACAATGTCTGACATACATGGTATATG
CTCAGTAAATATAATCAGATTCTTATCTACTAGGTAATAAGCACTTTACATTTATTATCT
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GGGTTAAAATTCTAGCATACACAAAACAGAAGTCACAGATTTGGCCCATCATTCTTCTTA
GTATCAGCAAACATTTATGGAGCTCATAGATGCTCTTCTGCTATCCCTTGGCTCAAATAC
TCTGTCCTCCCATCCCCTCATGACTGTGTGTTATTCGAACTGAATATGTAAAGGAGTATT
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GACGTTTTCAGTATAAATCTCATAGTAGGAAGGGATGTCAAAGGGTATGGCCATAGTCTC
CTATTTATGTCTCCTAGTGAAACACTTTTTTTTTGAGACAGAGTGTCACTCTGTCGCCTG
GGCTAGAGTGCCATGGTGTCAGCCTAGCTCACAGCAACCTCAAACTCTTGGGCTCGAGCA
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TGAGTCTGGGACTGGTCCAAATTGGCAATCCTTATATTGAGGCTTGTTAAATATGGCAGG
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GTCAGCTTAGCTCTCAGCAACCTCAAACTCCTGGGCTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCC
TTCTAAGTAGCTGGGACTACAGGCACATGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTCTATTTTT
AGTTGTCCAGCTAATTTTTCCCCCCTATTTTTAGTGGAGATGGTGGGTGGCAGGGTGTGT
GGCGTCTTGCTCTTGCTCATGCTGGTCTCACACTCCTGACCTCAAGTGATCCTCCCACCT
TAGCCTCCCAGAGTGCTGGCATGAGCCACCGTGCCCGGGGCTTCATCTGCGTATCTTTAA
CCATTCTTTCTCTTTCTTTCCAGAATTCCAGCTGGCTACTGCTTTGTAGAATTCGCAGAT
TTGGCTACAGCTGAGAAGTGTTTGCATAAAATTAATGGGAAACCCCTTCCAGGAGCCACA
CCTGTAAGGACATTTAGATACTGATGATGTTGCCATTTTTATTGTCATTGATTACTACCA
TATGCTGAATCCGTACTTTATACTTACATCATTTTATTTAATCCTATAATCACCCTGTAC
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TTCAGAATCCATGCCTTTCCCACTCTGCCTGCCATAACAGAAGACTTGAAACTCTAGACC
TCTTGCCTGCTTGAGAAACTAGAACAGGCTGGCAGCAGCAAGGACACGTTTCAAGAGAGT
TACATTCTGCTCTTCCCACAGTTACTTAGCTTACAGCTGCACCAGCTGGCACACCTGGGC
TCATAGAACCATGGAGCTGGCAGTGCCCTTAGCGGTCATCCGTGCAACCCCCTCATTTTA
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TTTTAAATTTCCAGGCAAAACGTTTTAAACTGAACTATGCTACTTATGGGAAACAACCAG
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GGAAGGCCAAGGCAGGAGGTTTGAAACTAACTTGAACAAGAATGAGGCCCCATCTCTACA
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ACACCACTGCACTCTAGCCTGGGTGACAAAGCAAGACCATCTTCAAAACACATACAAAAA
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ATGTGCCTTCTTTCAAGGCCATGTCTTTTCTATATGTGGCCCCTCCCTCAGCCTTCCAAT
TTATTATTCTCCACAGTATGCATGTTTTATTCTGTAAGAATTAACCTGTTGTAGCAAAAT
GAATTGGTTGGCAGTTTCAGATTGCTGTTTAAAAGCTTTAAAACAATGTATCGGACCAGG
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AGGCCTGGAGTTGGAAACCAGCCTGCACAACATGGAGACCGAGTTGCTACAAAAAGATTT
TTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTGTCACTCTGTTGCCCCATGTAGAGTACAGTGGTGTCA
TTGTAGCTCACTGCAACCTCAAACTCCTAGGCTCAAGCAATCCACCTGCCTCAAGCCTCC
TGAGCAGCTAGGACTATAGGCACACACCATGACACCCATGACAGTCAGCTAATTTTTCTA
GGTTTTAGTAGGGACAGGGGTCTTGCTCTTGCTCAGGCAGTCTTGAACTCTAGAGCTCAG
GCAATCTTCCTGCCTGGGCCTCCCAGAGTGCTAGACTTACAGGAGTGAGCCACCATGACC
ATCGAACAAAAGAAATTTTAAAAAATAGCCAGGTATGGTAGTGCATGCCTGTAGTCCCAG
CTATTTGAGAGGCTGCGGCAGGAGAATGGCTTGAGCCCAAGATTTTGAGGCTGCAGTGAG
CTGTGATCAGTTGGGCAACAGAAGGAGACCCTGTCCCTTAAAAAAAATTTGTATCAAAAG
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GACAGGAGGATTGTTTGAGCTTAGGAGTTTGAGACCAGCCTGAGCAAGAGCGAGACCCCA
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CGTGTCTAAGTAAGGCCTTCCCTGTTATTGATGCCCGTACTTTTCTCTCTCCCAGGTGGA
GATGTTATAGAGAGGCCATGTAGCATGGCAATTAAGAGCACAGGCTCTGGAGTGTGAATT
CCAGGTCCAGTGCTGGTAGGCATAGAGCAGTAAACGAGTTACTGTGCCTCTCTGACCCTA
TGTCTTCTTCTGCAAAAATGGGGCTGATTAATAGTATCTACTCATAGGGTTATGTTAGGA
TTAAAGGATATCATATAAATAAGTCACATAGGAAATTATTTATAGGTGTTTGCTATTTTA
TTATTGTTACTGAGTCTTTCAGTGTAGTTAGAAGTTTTTTACTTCAAAAATCTTAAGAAA
GGCTCATTCTTAGTCAACATAGTATTTAGAAGCTCCGGCTTTGGGAGTTTGACAGATATG
GCTTTGACTCCTGTTTCTGTTAAGACTTTCAGTGGGTTATGGAACCTCTCTGAACTTTGG
TTACCTCCTCAGTAAAATGCGGATACTACCTTCATGGAATGGTTGACCAGTTTGATCAGA
GAACCCTGGGGAAGTAGTCGGCACAGTGCCTAGGAAATAAGTGCTTGTTAACTTCAGCTG
TCATTAATTTTTCTCCCAACTAGACTATGAGCTCAGGAAAACATTAGGGCAGACTCTGTA
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AATAACAACAGTTACTTTCCAGTAGATTGGGAAGGAAGTTCCTATTTGGGAAGGAACCCC
ATGGGTAATGGTGTCAAGGAAAATGGGAAACTGAAGGTGGGAATTCTGGCAGATCTCAGG
ATCATCCTGTGTTTGAATTCTGACAGTGCTCTGTGCTCACCTCCACTAGTGGGACTGTTG
TCCCTCCCCTTAGTTTGATGGGCTCTCTTGCCCTCCTCAGCACCTTCTCCTTTCTGTATT
GCTGCCCTTCTTCCTGCCCTTCCCTCTTCTCCAATCCTCCATTCTTAGACTTCATCACAT
TTGTGATCTAATTAGTGTGTTGATTTTTTTTTTTTTTTTTCCTGCAGGGGTTATGGTTTT
GTGAAATTCACAGACGAATTGGAACAGAAGCGAGCACTGACGGAGTGCCAGGGAGCTGTG
GGACTGGGGTCTAAACCTGTGCGGCTGAGTGTGGCAATCCCTAAAGCGTGAGTTCTGTAG
GGAAGGTAGAGGGGATCTGGGCTCCCTTCCCTGCACCCCTACCTGGACACCCCTCATCTG
TTTGCTGAGAGTCAGGACATCCCCATATGGGTGGGAGACTATGAGGGAGGTTCAGTTCAA
GCCACGAGTAGCTGAATGGCTGCTGTTTCCCAGGCTGTGTCCTGGGTGTTGGACATGAAC
TAGCATAACCCGCCCCTCCAGAAGCTTATAGTTGGTGATAGGGATAGAGCTGTGATTAGG
GAAGACAGATACATTCAGACGTTGCCAGTGGCAACACTGGAAAAGCTGCGTGGCCATATA
TACCTGATGTTCTGTTTTTTTTTTTTTCTTGAGAGTCTCGCTTTGTTGTCCAGGCTAGAG
TGAGTGCCGTGGCGTCAGGCTAGCTCACAGCAACCTCAAACTCCTGGGCTCGAGCGATCC
TTCTGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGCTAAT
TTTTTATATACATATCAGTTGGCCAATTAATTTCTTTCTATATATAGTAGAGACAGGGTC
TCGCTCTTGCTCAGGCTGGTTTTGAACTCCTGACCTTGAGCAATCCGCCCGCCTCGGCCT
CCCAGAGAGCTAGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCGGCATACCTGATGTTCTTGCT
CTTTGCCCAGTAGTGCCACTGTTGGAAACTTATCTACAGAATTAATAAGAATTAAGGAAA
AGAAAAAAAATTACTTCCAATTTTAGCCTTATTTATATTAACGAGACCTTACAAACTGCC
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GTGAGGATTAAATGAGTTAATCTGCATAACGCACTTAAAACAGTCTCTGGCTACTTAATT
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GGGTAAAGCCAGTGGAATATAGTCAGATGTACAGTTACAGCTACAACCAGTATTACCAGC
AGTATCAGAACTACTATGCCCAGTGGGGCTATGACCAGAACACAGGCAGCTACAGCTACA
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Chart Advanced