SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001524_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein U2 (SelU2)
SpeciesMonodelphis domestica (Opossum)
Transcript IDSPT00001524
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001428_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001524_2.0 # Transcript # Selenoprotein U2 (SelU2) # Opossum (Monodelphis domestica) # Full length # Forward
ATGTCTATTCTACCTTCCTTCGAGCACCTCAATGACACCCTTATCCTCTATGTAGGGTAC
AACCTTCACAACGAATGGGGCCTTGACACATCAGTTTGTCTTTTGTCATCAATGTGATGG
GTATGAGATGAAACATCAGAGTTATTTTAATATTCATTTGCCTTATTATTCATGGTGTGA
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TAACCTTTATGTTTCATCTGCTGACTTTTCACAAATTTTAACTTTTTACTTCTTTTAACT
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TTTTTGATATTTTTTCTTCATTAAGAAGGCTCTTTCTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
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TTCATTCATTCCCTCTAAGTGCAGAATATATCCATTATTATCCCAGGAATAAATGCCCTT
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GCTGAGGCCACACGGCTACCGTGTGTCAAAGATGAAGCTGGAACTGAACTATTCTTGATG
CCAAACCTCTACCCATTCTATTTATCATGTCGAAGTGGGGGAGTGAACGTTTTGGGGTGA
AAGACTTCACTTTATGCATTTCTGAGTTTCTAAACTGGTTCTGTGTTGTCTGCTAGCCTT
TGCTTATCTGCAGCTTCAGCTGTGTTTTAAAAAGCTTCTGGTGCGGCGGACGCACCAACA
TTTCTCTTTCCTTTTGCTGAAATTTACATCCCACTGTTTTTCGTAATTCCAGCCAGCCCA
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AAGGCCAGCCCTCTCTCTCGCAGCCCCTCTGACTCCACCCCCGCAGGCTCAAGGGAAGAC
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CACCCCACCCCACCCTTTCCCTACGCACCCCAAGCTTCCCACGGGACGAAGGAGTGGCAG
CGTCACGCGGGACGCCCCTATGGCCAGTTCCACGTCCCAAGCGGACGAGATTCTGGTCAC
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GGCGGAGGACGTGGCCGAGCTGTCCGTGCAGGATGCCTCCGGCAAAGGGATCCCGTTTGG
AGAGCTCTTCCGGGAGCGCCGGGCTATCGTCGTGTTCGTGCGGGTGAGACCAGGCGGCAA
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TGTCAAAATATTTTTTCAAACCAGAAGTTCATGGTGCCACCCTGCCTAGGGAGGGAAGCC
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TTTAGCTTGACCAGTCCCCACCCCATAACACCTTTGGCCAAACACTGAATTTGTTGTAAA
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AAGCAAAGTAACATCTTCCACATGAGAGTCCTTCAAATTCTACTTACAGACAGATATTTC
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AAGTAACTTGCCTTCAATGATCAAAAAAGAATAAGCTTGTCTCTTACTTCATTCTTACTT
ACCTTGGATTTCAAGTCACTTAACCATTTTTGTTCCGTCCTTCCTAGTCTGAAGATAATC
TCAGAGCCTCTTTTTTACAGGCTGAGGAGCTTGTCCTAGAGTCTAGAAGATCTGGGTCTG
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AAGTGGCGATTTGGAGAAATCTTTTGCTTCAAAGATAGAGATGCAAATTTTATTTTCCCA
AATTTAAACCTCAGTACTTTATGTTCAGCAAAAGTACATTTAAAGCTTCTTCATTGATTG
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TGATAAGTTTCTTTTGACATAGAAGATACTTCCCAACAAACAACAAATAACTCCTTCCCA
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ATTCTTCCCTGTCCCTCTATTGATCATCCCTAAAATCCCATGGACTAATTTCCCTGCTGA
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TGAGATAATATTTGTAAAATACTTAGCACAGTGCTTGGTACTTCTCTTTCCCCTCTTTCC
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TGACCTTAGGCAAGTCACTTACTCTCACCAACCTTCAGTTTCCAAATCTATAAAATGAGA
GAACTGGAGTGGGTGACCTTGAAGGGCTTTTGTAGCTCCAAATCTGTGATGTGATCTGTG
TTTTTTGTTTTGTTTTGGCTGCTTAATGAGATGTTTACTAAAACTTTGGAGTTTGTCAAA
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CACTCTCTTTGATCATGAATTTCTTTCTTTTTGGAAGTTATTAGATTATTAAATTATGGC
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TGATTTCTTCTACTAATTTTAATCCTTTTATTTGGTGGCAAATATCTCCTCAAAATGGCG
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TTGTGTCCTTAGGGATAAGTTGTTTTTATTTATTTGTAGGGGTCCTACATGTTCTTCCAA
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TTTCATGGTCACATCTTTTTTTCCTCTCTCTCCAAGGATGCTAATGTCACACTAATAGTT
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TCTCTTAAACCAAATCTGAGATTACATTGATGTAGGGACTTTCCAGTGTGGGAATTCCTT
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TCTATGTCGACACTGAGAGAAAAATTTATAGGAAACTTGGAATGAACAAAGGTGAAGGAA
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GCAGCATCTACAATATTAATAATAACAATTAACATGTATATATAGTGCACACTGTGCTAA
GCACTTTATAATTATTGTCACTGGTCTCACAACAATCCTGAGAGGTAGCTATTATTATTC
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TGCCACTTAGCTGCCCCAAATCTTCAATATTGATTATCTCCATCTTCTTGTCTTTGCTAA
TTTTCTGGGCTCAAGGTGAAACCTCAAAGTTCTTTGATTTGCACGGTGATGCCTATGTCT
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TATTGACTCCCAGGAATTTTATTTTCTATGAGACTTCTCTTTCCATTATTCCCCTCAAAT
CAGGGACTTTAAATTATTATTTTATGAAGGATAATAATTTCTTATTTGAAGTTAGATGTT
CCATCTTCATTTAGGATCTTAGTACCCAAAATAGTAGTTCTTACGTAGAGGGGTTGGGAG
GCAGAGCTGAGGCAGGTGTGAGTGGAGGAGTATCGTATGAATCATGACCATGACATTTTT
AGTGCATCGTTCCTGTGCTCTTTGAAAATCTCAATAGACTCTACATTCATAGAGCTCTGT
AATTAGAATCGTAGGTTCATGGACAGAAATGAAAGGGACCCTCTAATCCAACCCCTTCAT
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GGGTTCTCCCTTTCCTAACAGCTTCAGCTCTGTGCTCCCACAAACCAATTCATCTGGTAG
GAAAGTAACATTTTTCTCTGTCTGGCTCTGCTCTCATCCTGCAGTAGAACTACAGTGAAA
TTTCTAGAACAATCTTTAAGTATAACCCATGTCTAGAGTACCGTCTCAAAAAGTCATAAA
TAAACATGGAGATGCATCTAAGGCAGCTGCTTTTATCTTTTATCCTGGAAAATATGAAAG
ATGCTGAGGATTCAACAGTACATGAAGAAATAGCAAAAATGTAACATTTCAAATGCTACT
CATTCCAGTCCTCATGGAAATCCATGATATCTCCAACAGAATTCAGATCTCCTCACCAGC
CAGGACATGGTTTTCTTTGATTGTTTGACTATGGGATGATCATGGTGATGCTTCTATCTT
CCTATGAGAAGTTTCTCATCCTGTGGTTGACCAGTGGACCAATCTCAAATTCAGTAACTC
TCAATCTAGGAGGCTAAGTAGCTGGCAAGATTGAAAAATGGTCCATTTATCAGAATTGCT
GATTTTCTGTGCTCCGGAAAGGAAAGAGGAGGGATTTAAGGTCCAGTCTCATGGACTGGT
CTGCTATGTGTTTGTAATTTCCATTGCCACTGGGAGGCAGTGGGGATATCAAGAAAGAAA
AATCTTCTTCCCTTCCCTCCTCTAACCCTGCTACAAGTGAGAAAGTGCTGGAAGTCTTAA
AAGAAGATCCAAGAGAGACAGAGACATTGTTTATCATTTGTCCTATAGACCAGCATAGGC
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TCATTCCAGTAAAGAACATCACTCAGCAAAGAGAACATATAATCCAGTTCTGTGGGATGT
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AATTGTTTATGCAGCTCATAAGCTTTGAAAGTCCTTAGCCACATTCTCAGAGATGATTCA
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GTGCCATTGTCTTGAGCTCCCTCTTATGTGCTTCACCTCAAGACTATCAGTGGAGGATCA
TATCAGACAATTCCCTTTTAGAAAGGAGTGTTTCTATAGTGATAATAGTTGGTAGAAATC
ATTCCCACAGAGACATAGTCTTATAAACAAGTACATGTAGAGTGCCAAGGAAAGTATGCT
CAAACTTGGATTTCAGTGTGGCAAAGGAATAACTCTCAGCTCCTCGGTATTGGAAATCTT
TATATCCCATTTGTGGGGTGCTCAAGAAATCTCCCTTAGGCATGACATTGGTTCTCTGCT
AAGTTCCTCATAGAGCTGTAAATTTCTGTCCAATTTGTCCTTGACTCCTGGTACAGATGC
TGCTAGGACACCAATAGGAAACCAGAAAGTACAAAGTCCTCGGTACCCTTTGAAACTCAC
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CCAGAGACCCGTCCTCCCCACACCATTGCCAGACAGCACTCTTCCAGGGTTTTATTGGGA
AGCCATACTTGCTCCAAATTCTCTAATGACCCTACTTCTAAACTAGCTTGACAGTTTATA
AGTAGATGACTCCAGGAATAGCACCAGGACTCTGACCTAATCAAAGCTTACTTCCTGTGC
AATGTATTTCCAATTCCAAGTATTTTTAGTACTTAGTCTAAAGCCTATGACTGATATTCA
TTAAGCCTCTTATCACTTAAAGTGACTTGACTGAATAAATTTGTCACCCCATTCATACTT
TCACAGGCAATTTGGTGTAGGGAATTTAGATTTAGAAGACCTTAGTTTGAATCCCGACTT
TAATGCTTGCCACTTATGTGGCAGCACAAAGTCACTTATTATTTCTTTAACTCAGTTTCA
TTATCTGTAAAATAAGGGGGTTAGACAAGATGACATCCAAGTTTTTTTTTTTCCAACACT
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CAAAAGCAAATCATTCTGTTTGTTATAAAGGAAATATAAAAGTAAACTTTTGATTTAGAG
AGAGTTAAGCCAGTGAAAAGATATGAGATGAAACAAGTTAACCATGAAAGGAGAATGGTT
TGAAAAGTGATAAATGTGAGAAATTTTATGCATAAATAGCGAATGAAAGTAGTCCAGGTA
GAACTATAACTGACAAACAGGATTATTAAATACTAGAATCAGTAACAAAAAGAGTTAAAG
AATTATCTTCCTTTGGACATCTGTGAAAACCAAATAGATACTAAATCTCTAAAGCAGTAA
ATCTATTCTAGGGTGGACACATGTAAATGTTTTAGATGAGAACTATATGTCAATTTTATT
CTGTTAAAAAAAACATTCTATCTGTGAAAAAAATTCTGTTGAAAAAGTATGGAGAAAATA
TTTATTACCTATCATTTATTAATATTATTTAGAACTACTTTTACGTGGGTAGACAACCCA
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GCTTAGATCCTATGCAATGCTTATTGAGGGTCTGCTCAGGTCTTATTCTGGGTTCATCCA
AAGCTCGTGTTTGGCTCCACCAAATTAGGTTAACCTATCAGCTGATATACATCTCATCCT
ACCTCTCTGGAGATCACCTACAGCCAATCAGGAAATATCCTTCTGCCCTTGTCTGAACTC
TATATACTATATATACCCAAAGACTCAAGGAGGGTACCAGCCCTTCTTTCTGGCTCTCTC
CATACCAAATGAACTAATGAACTTCTTTCCAAAACTATTTCAGATTTTGGGATTCATTCT
CATACAAAAATAAAAGTAGAATTAGTAAAATTTACATATGCCAACAGGTCTGTACTACAA
ATCCTAGGCAGTCAAGGACAAAGGAAGGACAAAAATAAGTATGATCAAGGAAAAGACTTG
TTAGAAATAGACTTTTTTTTTTAAAAGGCTTAGTGATCAGATGTATGATATAGTGGAAAA
GTCACCAAACTTAGGGTCAGGAGATTTAGGTTCAAATTCCACTTCCTGCCACAGTAGTTG
TGTGATACTGAACAATTTCTTTACCTTTGGGCTACAGTTTTCTTCATCTGTCTAATGAGA
TGGTTGGATAAGATGATTTTAAATGTCTCTTCCTTATGTGATTCAATTATGAACCAAGTA
AAAAGCTACAATCATAAATGGAAAGGCTAAGGAAGGGAATACAAAAGGATAAAGAGACCA
AATTTAGAGAGTGAAGGAAGGAAGTTTTATTCCAGCAGTAGCTGGAAAGGGGGAAAAAAA
AGTTGACTAACAAGTAAAATACAAAAAGTAATACTTGGGAAAGACTTTGTGGTAGGAGTG
AATTTGAGAATGGAACAAACCAAATAATGAGGGAAAAAATTCTGGCCTCCCTTGTAACAA
TTAAAACATTAAAAAAAACCTGGTACAATGAACAATTTGATGTGATGCAATGTTCCCTAC
CTGTCTGCTGGGAAGACAAAAATGTATTTCATGATCTGTTCTCTGGGAATATTATTGGTT
TTCATCTCCTCAAAGTTTGTTGTTATACAATAACAGTATGTTGGCACTGCCTGTCTTTCC
ACAGAGAGACTAATGAATTTTGACCAAAATTTTATGAAATATGTTTATGTAACCAAAAGA
TGAACATTAAATATTTTAGAGCAGAGTCCGCATGTGAAATCCAACCTACTCTCAGGAAGC
ATTCAAAGTCTGTGGAGAGCCGTGACTGGCCCTGCCTTTGATTTTCAAGGAGATCCAGCT
CAACAAGGTGGAACACTCATTTTGGGTCCTGGTAAGCCTCCGTTTTAAAACCAAGTAGCT
TCGTTACTTTCTGCAGCTCTTCTTTACTTTTATTTCAATCCAGTGGCCATTCTCCACATG
GGCACTATTACTTCTCTTCTAACATAAATCTTTGCTTTGCTGGTGCATAGTAAATGCTTA
ATAACTGACTGGTTAATCTAGTGACTTCATTTTTTTAAAATTTGGAAAATATATCAAAAC
TTTTCTTTCTAATGTTTAATTTAATTTGATACTCTCAATACTCAGAAAAGCAAATAATGC
CAAATCACTGAGATTATAGGGATAAATAAAGATTTAAACTAATATAATTCTGGTTTAGTG
ACTTAGACATTTTACATGACACTCTCCAGTTCCAGAGCTCATAAGATCATAATTAAATTA
AATAAATGTTTATTATGCCTTATTATTTTATTATTATTATTATGCCTGCTCGGCACTGTG
CTAAGCCACTGAGGATGCAAAGAGTAAGAAGAAAGATAATCCCTGCCATCAAGGAGTTTA
TAGTAGGGGAAGTTGATACACAAAAGGAAGCTGAAAAGTGAGGAGTAGACTGGTTTGGTG
GCATGTTGTCTGTGGAGTCAAAACCAGAGTTATAGATCTGTGAAGTTTTTAAAGTTCTGA
GTCCTCTTTAAAGGAAGACTTTGGGAAGTAGAGTTTATTGCTTTTTTTTTTCCAACCCTT
CATTCAGAGCCCATAGGGATCTAAGGGAATTGACAAAGTGTTGAGTATCAAAAACTGATT
CAATTAGCATGGTGATGAGATTTCAGATTATCAGCTTACCCTTGGGTGAGGCATGATATT
CCATGGAGTAAAAATCCAGAGGAGCTACTGATGGAAAATTGAGACTTACCATAGATTTGG
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