SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001754_2.0
Identity
TranscriptSelenoprotein K (SelK)
SpeciesOchotona princeps (Pika)
Transcript IDSPT00001754
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001659_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward (Reverse in the original sequence)
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR         Forward   Reverse
Sequence
>SPT00001754_2.0 # Transcript # Selenoprotein K (SelK) # Pika (Ochotona princeps) # Full length # Forward
ATGGTCTACATCTCGAACGGTGAGTCGCAGGGAGCTGAGAGGAAAGCGCCCTCCCGGGCT
TCGGTGGCCTGCGTGCGCTTCCTCCGGCTGATCTCCGGGCGGCCGGTGATGCGGAGTCGG
CGTGGCCGTTCAGCCTGAGTGGAATCCCGCCGGCCTCGCCCCGGTGATGGCGAGCTGCCT
CGGCTCGTGGTCGTGGGGCGGGTCAGTGGCCAGCGGCGCCAGCGATGTCCACACGGGCTA
CGCAGCGGCGCTGACCCCTTGCTGGTGGCCGCGCTGTCCGGAGGGAGGCTAACAGGCATT
CAGTGGCCGGCTCGGCGTTGTCGGGGTAGTTTGTGGAGGAGTCGGGGTTCGAACCCAGGT
GGGCTTGACGCAGGCGGCGGTGTTGTTGTCAAGAGCTGCACAGACGCTTTCTGTGACGTG
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AAGTCCCAGCTGCTGCAGTTTTTAAAAAAATTTTTATGTTATGCTGCTCCACTCCTATTA
GTGTGCCTGGGAAGGCAGCGGAGGACAGCCCAGATCTTGGGCCCCTGTCACCCATGTGGG
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CCCATGGAGATTATCTCTGATAACAGATTTCTTCTGGGGAATAGCGGAGTTTGTGGTTTT
GTTGTAAGTATCCTGGTGTTCTCGAATGCCCTGATCTTTAAGTTAACGGAAGCACATTAG
GTACACTGTGACGGTAGTTAAAACCATGGAAGTATGCTTTGTAATTAAAAGTGGTGCTTC
TTGTCTTCCACCCCATGTTTCAGTTTCAAAACTTTGCTTCAGCAAGATGTGAAAAGAAGA
AGAGGTTACGGAAGCTCTTCCGACTCCAGATATGATGATGGAAGAGGGTACAGCCTTTTC
TGTTGATTTAGTTGCTTTTACCCCTTCGAAGATTGTAACCACACGAGGCATTTTTAGATG
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GGTTCGGCCTTGTATTGGCACCTGTCAGGTCAGCTGGGGTGGCCTCTCAACGGATGCAGG
TGGCAGCTACTAATCAGTCAGGCTCCCTGTGCAAGATGCTTCCTTCCTGTGCATTCCGAG
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TGGTGGATGAGGAAGGTAACAAGCTCTCCCAGTATCCCACGGGAGCTCACCGCGAGAAAG
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TAACATGCCAGATACTAGGTTTTTTTTCCCCATTACTGATGCCCACGATGCTTTCTTTCA
GGTAAACGTCTGCTCTAAGAAGCAGACAACTGGGTGTGCACGTCCACGGCAGAAGGAGAC
CATCTGGAGACGGAGCTGGCCGAGCCGGCCCTCCTGGATGGATGTGTGCACCCCCACCAG
AACTGCCCTGTGACCTCACAGATGAATGATGTCAGGCTGGGAACTCCCCCTGCAGGGATC
TGGCCTGGCTGAGCTGTGGTTCCATA
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