SelenoDB
Release 2.0
Chart Advanced
Transcript Report for SPT00001793_2.0
Identity
TranscripttRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43)
SpeciesOchotona princeps (Pika)
Transcript IDSPT00001793
Transcript release2.0
External IDNone
Gene SPG00001698_2.0
Annotation
Prediction method(s)
(Selenoprofiles, Ensembl 68) [Report annotation error]
OrientationForward
Structure gene structure

FeatureCol PromoterCol Coding exonCol Non coding exon (UTR)Col IntronCol SECIS
ResidueCol SecCol Cys or Other

ToolboxFull length   Spliced   5UTR   CDS   3UTR    
Sequence
>SPT00001793_2.0 # Transcript # tRNA Sec 1 associated protein 1 (SECp43) # Pika (Ochotona princeps) # Full length # Forward
GGCACCGGCGAGGCCCCGGCGATGGCCGCCAGCCTGTGGATGGGAGACGTGAGTGAGCGC
GGCCGCGGCGCAGCGACGGAGGAATCTCGGGGTCGGGAGGGAGATCGCGTCTGAGAGGGA
GGGGACTCGGGATCCCCATCGGGTAGAAAGGAACAGCGAGAAGGTTCCTTCTGGCGACGG
CGGAGGGGCGGGCCGGGGGGCTTCTCGAAGGGCGAAGGGAGGCGCTGAGGAGGAGAGGCC
TCGCGGGATGGCCGAGCGCTGTGGCGTGCGGAGTCGGGTGCGGGGAGCGGAGCGGGGGAA
GAAGCCGGCGCGAGCCGCTCTGCTCTGGTTGGCGCAGCTCGAGCCCTACATGGACGAAGA
CTTCATCTCCCGAGCCTTCGCCACCATGGGGGAGACGTGATGAGCGTGAAAATTATCCGG
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TTTGTGGCCAAGGACCCTTGGTGCTGGGCTCAGAAGAAGGTTGCTAGCACTGCCTCTCTT
TCTTTTAAAACTATAAAGTATTGTCATTTAAGAATTGTGTTGTTGAGGTGTGTCTGTGGG
GGAGGGGCTTGTGCAGTTGGTGAATTTTGCCACTCACATGCTCCCTGCTGTGTCACTTGC
ACTCCCTTCAGGATGGGCACATTTCCATTGCCCCTGGAAGCCCCCTTCCTCATCCTCTGG
CCCTCTGGCTGCGCTCTTGAGTCAGCTTCCTACAAGGTGTTTATACTGTTGTGTGGTGAG
TGTCCACCATGTGGCTGATTCACTTGCATGTTAGTGATCGGAACTCTGCCGTGCATACGA
GCCACCACTGGGTTAGCCATGCGCTAGTTGATGCGCACTAATCTTATTTTCCAGTTTTTA
GATGTTATCCTTTTTGGTTTTTCTCAATGCTTTATTATAGTTTTGGCCATTACACTTTTT
TTTTAAGATTTATTTATTTTTCATTACAAAGTCAGATATACAGAGAGGAGGAGAGACAGA
GAGGAAGATCTTCCGTCCAATGATTCACTCCCCAAGTGACCGCAGTGGCCGGTGCTGCGC
CGATCTGAAGCCAGGAACCAGGAGCTTCTTCCAGGTCTCCCACACGGGTGCAGGATCCCA
AATCCTTGGACCATCCTTGACTGCTTTCCCAGGCCACAGCAGGGAGCTGGATGGGAAGTG
GAGCTACTGGGATTAGAACCGGCACCCATATGGGATCCTGGTGTGTTCAAGGCGAGGACT
TTAGCCACTAGGCCACTGCACCGGGCCCTACACATTTTTTGAAATTATTTTATTTGAAAG
ATGAACAGAGAGAGCTCCTCCATGTGCTGGTTCTCTCTCCCAGTGCTCATAACACTGAGT
ACTTGGCCAGGTCAAAGCCAGAAGTCTAGAACTCAGTGTAGGTCTTACAGTTGGGCTCGG
ACGCAAGGGTGGTAGCTGTTCCCTGCTGTCTCCCTGCTGTGCATGATCAGGAAGCTGGAA
TTAAATGGAAATAGAACATGAGACCTTGGACTCCGTGGTGTGTGTGTCCCAGCTAGCAAC
TTAACTGCTATGCCAAATGCCAGCTTGTTTTTTTTTTTTTGTAGATTTATTTTATTTTTA
TTACAAAGTCAGATATACTGAGAGGAGGAGAGATAGAGAGGAAGTGGAGCTGCCAGGATT
AGAACCAGCGGCCATGTGGGATCAAGGCCAGGACCTTAGCCACTAGGCCATGCTGCCGAG
CCCGTCTCCTTTTTAATGTATTAGATTCTTCCAGGGATCCTGCTTCAAAAGTTCGCCTCT
CACCTCTTGTACCATTGAGGTTTATATTTTTTTATCCTTTTTTTAAAAAAAGATTTATTT
TATTATAGTGTAAAGAGCAAAGTGACCCAGGGAGAGGGAAAGAAACANNNNNNNNNNNNN
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CTGCACTTCCCTGTTGCGCCGGGAGCCTCGGCCCTGGCCGCTGCTGCGGTGATGCTGTGC
GGGGTGACACTGTCGCGAGCTCCGAGAGTCGAGAGAACGGATGCTTGCAAGCAAGTGTTT
ATTCAAGCGAGCACACACCAAACAGGACGGGGGAAGCCACCGAGAGCGCCCTTGACTTCG
GTCTCGTGGAAGTCTGCTGGGCTTTGGTTCTGGCCTAGTGGGAACCTGCTGGGCTTTTGG
CTCCGGTCTCGTGGGAACCTGCTGGCTTCAGATGGAAGCCTGAGAGGTCTGGCTCCGGTC
TAGTGGGAGTCTGCTGGCTTCAGTGACTGGGACCAAGGCATGGGTTTTTATACAATTCGG
TGGGCCAATGAGCAAGCAGTCGTTACATCGTTTTGATTGGTTATTATATGTTATCTATCA
ACAACACTTGCTTTCTCTTAGTTCTGAGAAACATGTTTTTAACATATTTATCAAGACACA
TTTTCTTCTTTTATCGTTTTTGCCATAACTTGTTTTCCATGACGTGCTTACATATATTAG
AGCTTCTTAACAGGAGTGATAACCGAGGGCTTACCTACGTTGGAGTTTCTTGACAGGAGT
GACAGGAGAGGTGGCCCCATTTCACCAGTAGTTTAGGAAGATGGAGTCACCTCTTCAAAA
GCTCCAACATACACACTGTATCCATTATTAAGTCACAGCATAATTTACATAAAGGGTCTA
TTATTATAGCTATTTCTGGGTCATCAATCTCAGACGAAAGTGTAGTAATATTAAGGGTGT
AATTAAGATTATTGATAATATTATTACTAGCCATATCTCCCATAGATTCATTTTTATCTA
TACCCATATTATTGATGGAGCAGTATAGATGCAGATGGGAGTAAATAAACACTTATAACC
AGACTGTTCCTATCAGACACGTGGGGGCTTGGCCAGTGGAGTGGACCCTGTGTGGCTCGC
AGACGCGCCTCGGTTCTGTGTGCTTGGGGTCTCGTTCCCCTGGACCGTGGAAGAGGGAGT
CGTAGTGCCCAGGTCACGGAGTTAGGATGAGGCTTCACACTCAGGATCTAAAAGTGGGCC
AGGCGCCTGGGAACGCTCCACAAACAGGAGCACGACATGACCATTTGGGTGATAAGCTTT
GTAAAACCACCAAGACCTCAGACTTGGAGAAGCTCTATAATTGTCTTAAAAGTTATATGG
GCAGTGAAAGTGACATGCCAGGATTGGAATTCAGCTCCTCGAAGCCCAGAGCCACAATTA
TTCAGACAGAACCTGCTGTGTGCTGCCTGCCTGGGATGAAGGCCGCACTGAGCCAAAAAG
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GCCACCATCCACTGCTTTTGCACATGCATTGGCAGGGAGCTGGAGAGGACCCAGAGCAGC
CAGGACGGGAACCAGCACTCCAGAATGGGTTGTCAACAGGGTCACAGATGGCAGCGTCAA
CTGTGCTACCCTAACACTCCCCAGCAGTGATGTTCTAAGGCGGTTAGACTAGCTGTGTTT
TGTGATGTATTCTGGATTCTGGTCTTACAGTTTGGACCTGTTTCCTTTTTATGTTTTACT
TGCCCTGACTATGATGATTATTGTTGAATGTAAAGGTTGGTGGGGTTGTGCTAAAACTAT
TTCCAGCAGGAGCACTTCATACAGGTGATGTAATACACCAGTGAGTATTTGCTGAATTCA
CGAGACACCTTGCGTTCAGTCTGAACTGGAATGTGGCAAGGAACAAAAAAACTGGTTTCT
CCCCCCTCAGGCCATGGCTTGCTTGGGAGTCTATCACCATTCTCTTCTGTTTGCTTTCTT
TGCAGGATCCCAGCGGGCTATTGCTTTGTAGAATTCGCAGATTTGGCTACAGCAGAGAAG
TGTTTGCATAAAATTAATGGAAAACCCCTTCCAGGAGCCACACCTGTAAGGACATTTAGA
TAATGATGATGTTGCCATTCTTAGTGCCATTGACTGCCACCATTGCCTGAATCCCTACTG
GATACTTGCTCCCTACTGGATACTTGCGTCATGTCATTGAAACCCGTCACAGCCCTGAGC
AGCAGGCATTGCCTTTCACAGCTCAGGGAAATGAAATAACCTGCCCAGCGCAACACAGGT
AGTAAGTGGCAGAGCCAGGATTCAGACTAAAGATCTATTTCCCCCTGCAGGCCCATTGCC
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AGAACCTAGAGCAGGCTGGCAGCAGCCTGGACAGTATTCAAGAGAGTTCCATTTTGCTCT
TCCCCACAGTTCCCTAGCTTACAGCTGCACCAGCTGGCACACCTGGGCTGGCAGTGCCCT
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GGGGAGATGTTTTGGCCAAGGTAATTTATTCAGTTTTTATCAAATATTGTTTGGCTTTTG
AAACTCATTTCTCTGTTTTAGTTTCTTTGTTTTTAAATTTCCCAGGCAAAACGTTTCAAA
TTGAACTATGCCACATAT
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